Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F218 I0 R1
|
1506 |
278.7 |
9275112 |
94.5% |
8764980 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
146,343 |
G→T |
55.5% |
T366T (ACC→ACA) |
yadC ← |
putative fimbrial‑like adhesin protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 146,343 | 0 | G | T | 55.5%
| 12.3
/ inf
| 302 | T366T (ACC→ACA) | yadC | putative fimbrial‑like adhesin protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (64/70); new base T (100/68); total (164/138) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.83e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.23e-02 |
Only 100 of 305 total aligned reads displayed.
CTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCTTCAATGAGTACGCCAACGCCTTTGGCGGCAGTGCTTCCAGTAAGCGTATTACCAAGCA > CP009273/146194‑146491
|
cGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGgtg < 1:1175208/150‑1 (MQ=255)
gTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGgtgt > 1:91674/1‑150 (MQ=255)
tATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCa < 1:2191920/150‑1 (MQ=255)
aTCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCAt > 2:1122805/1‑150 (MQ=255)
tCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATc > 1:821692/1‑150 (MQ=255)
agtgATAGGTTACCTGGAAAGTTCTGGTGGCTTTATATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTATTGCTTTATTGTTGCCTGGAAATGTAGAGGCTGTGATGTGCCGTTTCCTTGATTAGGGTAAACCCCATAGGATGTGTCATCtt < 1:140095/147‑1 (MQ=255)
gggATAGGTCACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTc > 1:2464900/1‑150 (MQ=255)
aTAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGt < 2:1805081/150‑1 (MQ=255)
aTAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGt > 2:2603311/1‑150 (MQ=255)
ggTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTc > 2:3200270/1‑150 (MQ=255)
ttACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCAt > 2:3108698/1‑150 (MQ=255)
tACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATa > 1:4107899/1‑150 (MQ=255)
aCCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATaa < 1:1683078/150‑1 (MQ=255)
aCCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATaa < 2:4493390/150‑1 (MQ=255)
aCCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATaa > 2:2947855/1‑150 (MQ=255)
aCCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATaa > 2:634334/1‑150 (MQ=255)
ccTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAAt > 2:589386/1‑150 (MQ=255)
tGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCt > 2:2973954/1‑150 (MQ=255)
tGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCt < 2:2295804/150‑1 (MQ=255)
aaGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCtatat > 2:2793617/1‑150 (MQ=255)
attACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGGAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCtatata > 2:2501071/3‑150 (MQ=255)
gtggCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGaa > 1:2602782/1‑150 (MQ=255)
tggCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAAt < 1:3956088/150‑1 (MQ=255)
ggCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGACtt > 2:13176/1‑150 (MQ=255)
gCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTc < 1:2080479/150‑1 (MQ=255)
gCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTc > 1:3882435/1‑150 (MQ=255)
tttAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGt > 1:325776/1‑150 (MQ=255)
tttAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGt > 1:3383265/1‑150 (MQ=255)
tAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTAt < 2:2769512/150‑1 (MQ=255)
tAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTAt > 2:3586019/1‑150 (MQ=255)
aaaTTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATc > 2:4005983/1‑150 (MQ=255)
ttCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCAtt < 2:4631710/150‑1 (MQ=255)
tCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTa > 1:613298/1‑150 (MQ=255)
cGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAg > 1:1554738/1‑150 (MQ=255)
cGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGtt > 1:3104415/1‑150 (MQ=255)
gggTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGttt > 1:3793264/1‑150 (MQ=255)
ggTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTTGAAATGAAGAGGCTGTTATGTGGCGTTTGCTTGATTTGGGTAAACCCCATCGGATGTTTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGtttt < 2:2175080/150‑1 (MQ=255)
ggTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGtttt > 1:1212155/1‑150 (MQ=255)
ggTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGtttt > 2:1509341/1‑150 (MQ=255)
gTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTa > 2:4356169/1‑150 (MQ=255)
gTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTa < 1:3140236/150‑1 (MQ=255)
gTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTa < 1:4450410/150‑1 (MQ=255)
ttCGATAGCAATAGTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTaa < 1:2304560/150‑1 (MQ=255)
cGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATg > 2:101593/1‑150 (MQ=255)
cGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGGATCATTAGGTTTTAATg > 2:1580916/1‑150 (MQ=255)
cGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCATGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCACATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCTTATCATTAGGTTTTAATg > 1:1988012/1‑150 (MQ=255)
aTAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTc > 1:1907787/1‑150 (MQ=255)
gCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCAtt > 1:2322478/1‑150 (MQ=255)
gCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATGAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCAtt < 2:1969479/150‑1 (MQ=255)
cAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTa < 1:3811444/150‑1 (MQ=255)
aaTATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAg > 2:2856026/1‑150 (MQ=255)
atatTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGc > 2:2711786/1‑150 (MQ=255)
tatTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCg < 1:548568/150‑1 (MQ=255)
ttCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGa < 2:4414755/150‑1 (MQ=255)
cccGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGAtt < 1:2381016/150‑1 (MQ=255)
ttGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACt < 1:3037259/150‑1 (MQ=255)
gCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTgg > 1:3222558/1‑150 (MQ=255)
cTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGt < 1:1484675/150‑1 (MQ=255)
cTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGGTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGt < 1:1011028/150‑1 (MQ=255)
aaTGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCt < 1:2389768/150‑1 (MQ=255)
gCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCt > 2:3345327/1‑150 (MQ=255)
ccTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCtt < 2:2776155/150‑1 (MQ=255)
tGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCTTCa < 1:530028/150‑1 (MQ=255)
aTGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCTTCAATGAg < 2:1167604/150‑1 (MQ=255)
aTGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCTTCAATGAg < 2:33232/150‑1 (MQ=255)
aTGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCTTCAATGAg > 1:727901/1‑150 (MQ=255)
gAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCTTCAATGAGTa > 2:1874595/1‑150 (MQ=255)
ggCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCTTCAATGAGTACGCCa < 2:4566785/150‑1 (MQ=255)
gATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCTTCAATGAGTACGCCAACGCCt > 1:4350689/1‑150 (MQ=255)
aTGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCTTCAATGAGTACGCCAACGCCtt > 1:2887940/1‑150 (MQ=255)
aTGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCTTCAATGAGTACGCCAACGCCtt < 2:1059651/150‑1 (MQ=255)
tgtgCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCTTCAATGAGTACGCCAACGCCttt > 2:3381709/1‑150 (MQ=255)
gtgCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCTTCAATGAGTACGCCAACGCCTTTg < 2:92646/150‑1 (MQ=255)
gtgCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCTTCAATGAGTACGCCAACGCCTTTg < 1:2770218/150‑1 (MQ=255)
ccGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCTTCAATGAGTACGCCAACGCCTTTggcg < 2:3182390/150‑1 (MQ=255)
cGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCTTCAATGAGTACGCCAACGCCTTTggcgg > 2:1222846/1‑150 (MQ=255)
cGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCTTCAATGAGTACGCCAACGCCTTTggcgg > 1:2423733/1‑150 (MQ=255)
ttACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCTTCAATGAGTACGCCAACGCCTTTGGCGGCa < 2:2883038/150‑1 (MQ=255)
ttACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCTTCAATGAGTACGCCAACGCCTTTGGCGGCa > 2:148870/1‑150 (MQ=255)
tACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCTTCAATGAGTACGCCAACGCCTTTGGCGGCAg > 2:849743/1‑150 (MQ=255)
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ccTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCTTCAATGAGTACGCCAACGCCTTTGGCGGCAGTg < 2:2096392/150‑1 (MQ=255)
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TCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCTTCAATGAGTACGCCAACGCCTTTGGCGGCAGTGCTTCCAGTAAGCGTATTACCA < SRR19973073.242128/150‑1 (MQ=60)
TCGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCTTCAATGAGTACGCCAACGCCTTTGGCGGCAGTGCTTCCAGTAAGCGTATTACCA < SRR19973073.2558438/150‑1 (MQ=60)
CGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCTTCAATGAGTACGCCAACGCCTTTGGCGGCAGTGCTTCCAGTAAGCGTATTACCAA > SRR19973073.1944734/1‑150 (MQ=60)
CGGATGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCTTCAATGAGTACGCCAACGCCTTTGGCGGCAGTGCTTCCAGTAAGCGTATTACCAA > SRR19973073.1944717/1‑150 (MQ=60)
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CTACGTTATCAGGGATAGGTTACCTGGAAAGTACTGGTGGCTTTAAATTCGCCGGGTTCGATAGCAATATTCCCGTCTTGCTTTAATGTTGCCTGGAAATGAAGAGGCTGTGATGTGCCGTTACCTTGATTAGGGTAAACCCCATCGGAGGTGTCATCTTCGGTTTCATAATCTATATAAACAGAATTCGTATCATTAGGTTTTAATGTCATTAGCGGATTTTTACTGGTTGCTAAACCTTCAATGAGTACGCCAACGCCTTTGGCGGCAGTGCTTCCAGTAAGCGTATTACCAA > CP009273/146194‑146488
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
