Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F218 I0 R1
|
1506 |
278.7 |
9275112 |
94.5% |
8764980 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
151,620 |
C→A |
54.2% |
K98N (AAG→AAT) |
htrE ← |
putative outer membrane usher protein |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 151,620 | 0 | C | A | 54.2%
| 15.0
/ inf
| 212 | K98N (AAG→AAT) | htrE | putative outer membrane usher protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (44/53); new base A (78/37); total (122/90) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.30e-03 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 214 total aligned reads displayed.
AGACGTTGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGTACCGGCTGAGA > CP009273/151471‑151767
|
aGACGTTGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATAAATATGAAACTGCAATAAATTc > 2:2899747/1‑150 (MQ=255)
aCGTTGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCtt < 2:3181659/150‑1 (MQ=255)
cGTTGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCttt < 1:3017379/150‑1 (MQ=255)
cGTTGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTAttt > 2:2647066/1‑150 (MQ=255)
gTTGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTa < 1:3232164/150‑1 (MQ=255)
gTTGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTa > 2:3723663/1‑150 (MQ=255)
gATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAAtg < 2:1798060/150‑1 (MQ=255)
gTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGAt > 1:4538469/1‑150 (MQ=255)
tAACTTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCTTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCTTTATTTATATCGGGATAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATAc < 2:2440534/150‑1 (MQ=255)
gTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGc > 2:4536961/1‑150 (MQ=255)
gTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGc > 2:3306701/1‑150 (MQ=255)
gTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGc > 2:4001066/1‑150 (MQ=255)
tCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGcc > 2:1367215/1‑150 (MQ=255)
tCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGcc > 2:3814297/1‑150 (MQ=255)
aTAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTg > 2:244574/1‑150 (MQ=255)
tAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTgg < 2:2743034/150‑1 (MQ=255)
gAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGt > 1:3665806/1‑150 (MQ=255)
aCAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTc < 1:4347207/150‑1 (MQ=255)
aCAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTc > 1:1479482/1‑150 (MQ=255)
aGAATCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCtt > 2:1536329/1‑150 (MQ=255)
aGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCtt > 2:2992254/1‑150 (MQ=255)
gAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCttt < 2:2580424/150‑1 (MQ=255)
aaGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCtttt < 1:2674224/150‑1 (MQ=255)
aGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCttttt < 1:3390692/150‑1 (MQ=255)
aGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCttttt > 2:3678468/1‑150 (MQ=255)
ccTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTc > 1:226135/1‑150 (MQ=255)
cTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTcc < 2:3722953/150‑1 (MQ=255)
tGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCt < 1:2794392/150‑1 (MQ=255)
aTAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAAtt > 2:195100/1‑150 (MQ=255)
tAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTg < 1:1186016/150‑1 (MQ=255)
tAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGACGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTATTTATTTATATCGGGAGAATTAATATTAAACTGAAATAAATTATTTAATGTGATACAATAATGTGAGTAATTTTTTCCTTCAATTg > 2:1359928/1‑150 (MQ=255)
aTTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCg < 2:3269428/150‑1 (MQ=255)
aTTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCg < 1:2048008/150‑1 (MQ=255)
ttCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGAc > 1:361054/1‑150 (MQ=255)
tCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGACTTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGCTACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGAcc > 1:556430/1‑149 (MQ=255)
gTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAAt > 1:678762/1‑150 (MQ=255)
gTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAAt < 1:520499/150‑1 (MQ=255)
aaaTTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTa < 1:948377/150‑1 (MQ=255)
aaTTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTaa < 1:211799/150‑1 (MQ=255)
tGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAATCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATAc > 1:513715/1‑150 (MQ=255)
gAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACt < 1:2494191/150‑1 (MQ=255)
gAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACt > 2:2351342/1‑150 (MQ=255)
gAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACt > 1:2024513/1‑150 (MQ=255)
aGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACtt < 1:4242622/150‑1 (MQ=255)
gCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAATTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAAt < 1:3600158/150‑1 (MQ=255)
gCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAACGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAAt < 1:4563380/150‑1 (MQ=255)
ccGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATg < 2:3056716/150‑1 (MQ=255)
cGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGa < 2:2388181/150‑1 (MQ=255)
cGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGAttgg < 2:3980432/150‑1 (MQ=255)
ttCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGAttggttg > 1:188821/1‑150 (MQ=255)
aTCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATtggttggta < 1:2330256/150‑2 (MQ=255)
cTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGttt < 1:4114566/150‑1 (MQ=255)
tGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTa < 1:3768328/150‑1 (MQ=255)
cAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACAt < 2:743855/150‑1 (MQ=255)
aGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAaca > 1:3874235/1‑150 (MQ=255)
gAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAacac > 1:3652323/1‑150 (MQ=255)
gAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAAGGATTGGTTGGTCGTTTACATAAacac > 1:2939608/1‑150 (MQ=255)
aaCGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACt > 2:3676800/1‑150 (MQ=255)
aCGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTg < 1:1623507/150‑1 (MQ=255)
cGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGa < 2:4329522/150‑1 (MQ=255)
cGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGa < 1:1593067/150‑1 (MQ=255)
gCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGAcg > 2:3127948/1‑150 (MQ=255)
cTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTAATTTTTACTTCAATTTAGACAAATTTAATAATTTGGTTAATGTTTGGTTGGTCGTTTAAAAAAacaaatacgt > 1:841818/1‑143 (MQ=255)
ttttCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGAcgtcg < 1:3080231/150‑1 (MQ=255)
tttCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGAcgtcgt > 2:3787970/1‑150 (MQ=255)
cGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTaaa < 1:1914712/150‑1 (MQ=255)
gTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAac < 1:4175421/150‑1 (MQ=255)
gTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAac > 2:2539028/1‑150 (MQ=255)
gTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTGTACATAAACACTGACGTCGTAAac > 1:1837316/1‑150 (MQ=255)
ttatttatATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCAGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTCATACTTTGGTTAATGATGGGTTGGTCGGTTACATAAACACGGACGTCGTAAaca > 2:2555503/1‑150 (MQ=255)
tatttatATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTAAATAAACACTGACGTCGTAAacac > 1:3214939/1‑150 (MQ=255)
atttatATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACAcc < 2:524307/150‑1 (MQ=255)
atttatATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACAcc < 1:4215377/150‑1 (MQ=255)
tttatATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGACTGGGCGTACTTTTTTCCATCAAAAGCGACAAATGAAATAATTTGGTGAATGATTGGTTGTTCGTTTACATAAAAACTGACGTCGTAAACAacc > 1:3818610/1‑150 (MQ=255)
tatCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGta > 1:4596605/1‑150 (MQ=255)
tatCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGta > 2:1161640/1‑150 (MQ=255)
atCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGtat < 1:686350/150‑1 (MQ=255)
tCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGtata > 1:4566964/1‑150 (MQ=255)
gggAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGc < 1:288718/150‑1 (MQ=255)
gggAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGc > 2:1659086/1‑150 (MQ=255)
agaATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCggg > 2:206363/1‑150 (MQ=255)
agaATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCggg > 2:206419/1‑150 (MQ=255)
gaATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCgggg > 2:4633674/1‑150 (MQ=255)
gaATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCgggg > 2:3569669/1‑150 (MQ=255)
aTTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGtt > 2:3894974/1‑150 (MQ=255)
tAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTAc > 2:1270644/1‑150 (MQ=255)
aaTATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTAcc > 2:1032796/1‑150 (MQ=255)
atatGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCt > 1:3234904/1‑150 (MQ=255)
atGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTc < 1:2463658/150‑1 (MQ=255)
gAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCAc > 2:1339515/1‑150 (MQ=255)
gAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCAc > 1:761512/1‑150 (MQ=255)
aaaCTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACt > 1:4575725/1‑150 (MQ=255)
aaaCTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACt > 2:2109802/1‑150 (MQ=255)
aCTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGt > 1:4456707/1‑150 (MQ=255)
aCTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGt < 1:1254763/150‑1 (MQ=255)
cTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGTa > 1:169892/1‑150 (MQ=255)
tAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGGCGTTTTCATAAAAACTGAAGTCGTAAAAACCCGGTATAGCGGGGTTACCATCACTGTACCGGCt > 1:1735996/1‑150 (MQ=255)
tAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTATTTTTTCCTTAAAATGCGACAAATTTAATACTTTTGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTAAATAAAAACTGACGTCGTAAAAACCCGGTATAGCGGGGTTAACTTAACTGTACCCGCt > 1:1735330/1‑150 (MQ=255)
aaTTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGTACCGGCTga > 2:1599411/1‑150 (MQ=255)
ttCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGTACCGGCTgaga < 1:2637608/150‑1 (MQ=255)
|
AGACGTTGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGTACCGGCTGAGA > CP009273/151471‑151767
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
ACGTTGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGTACCGGCTGAGA > CP009273/151473‑151767
|
ACGTTGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATT < SRR19973073.2309466/150‑1 (MQ=60)
CGTTGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTT < SRR19973073.3023490/150‑1 (MQ=60)
GTTGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTA < SRR19973073.3238686/150‑1 (MQ=60)
GTTGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTA < SRR19973073.3238726/150‑1 (MQ=60)
GTTGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTA < SRR19973073.4604491/150‑1 (MQ=60)
TCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTG < SRR19973073.2326116/150‑1 (MQ=60)
GTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGAT < SRR19973073.4633707/150‑1 (MQ=60)
GTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGAT > SRR19973073.4547622/1‑150 (MQ=60)
GTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGAT > SRR19973073.4547569/1‑150 (MQ=60)
GTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGAT < SRR19973073.1552751/150‑1 (MQ=60)
TTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATA > SRR19973073.3399339/1‑150 (MQ=60)
AACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGG > SRR19973073.3135317/1‑150 (MQ=60)
AACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGG < SRR19973073.650604/150‑1 (MQ=60)
GAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGT > SRR19973073.3673353/1‑150 (MQ=60)
GAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGT > SRR19973073.3673158/1‑150 (MQ=60)
AACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTT < SRR19973073.2094389/150‑1 (MQ=60)
ACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTC < SRR19973073.4355904/150‑1 (MQ=60)
ACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTC > SRR19973073.1482570/1‑150 (MQ=60)
AGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTT < SRR19973073.3226607/150‑1 (MQ=60)
AGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTT > SRR19973073.1686206/1‑150 (MQ=60)
AAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTT < SRR19973073.1610656/150‑1 (MQ=60)
AAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTT < SRR19973073.2679695/150‑1 (MQ=60)
AAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTT < SRR19973073.3938930/150‑1 (MQ=60)
AGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTT < SRR19973073.3397503/150‑1 (MQ=60)
GCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTT < SRR19973073.440543/150‑1 (MQ=60)
CCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTC > SRR19973073.226656/1‑150 (MQ=60)
CTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCC < SRR19973073.4494743/150‑1 (MQ=60)
TGAGGGNTAATTTCCNTCAAATTGNGGCAATTGNCGAGCGTTTNATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCT < SRR19973073.3102153/150‑1 (MQ=60)
TGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCT < SRR19973073.2800120/150‑1 (MQ=60)
GAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTACTT > SRR19973073.4027507/1‑150 (MQ=60)
ATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATT > SRR19973073.1905103/1‑150 (MQ=60)
TAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTG < SRR19973073.1188468/150‑1 (MQ=60)
ATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCG < SRR19973073.2052264/150‑1 (MQ=60)
TTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGAC > SRR19973073.2999704/1‑150 (MQ=60)
TTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGAC > SRR19973073.361777/1‑150 (MQ=60)
TTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGAC > SRR19973073.361445/1‑150 (MQ=60)
TCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGACTTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGCTACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACC > SRR19973073.557630/1‑150 (MQ=60)
GTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAAT < SRR19973073.521623/150‑1 (MQ=60)
GTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAAT < SRR19973073.3454986/150‑1 (MQ=60)
GTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAAT > SRR19973073.680177/1‑150 (MQ=60)
GTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAAT > SRR19973073.680175/1‑150 (MQ=60)
GTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAAT < SRR19973073.521575/150‑1 (MQ=60)
CAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGT < SRR19973073.2043358/150‑1 (MQ=60)
AAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTA < SRR19973073.950352/150‑1 (MQ=60)
AATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAA < SRR19973073.212298/150‑1 (MQ=60)
TGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAATCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATAC > SRR19973073.514818/1‑150 (MQ=60)
GAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACT < SRR19973073.2499345/150‑1 (MQ=60)
GAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACT > SRR19973073.2028532/1‑150 (MQ=60)
GAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACT > SRR19973073.2028720/1‑150 (MQ=60)
AGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTT < SRR19973073.4251020/150‑1 (MQ=60)
CAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACATTGG > SRR19973073.2782112/1‑150 (MQ=60)
GCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAATTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAAT < SRR19973073.3607381/150‑1 (MQ=60)
GCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAACGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAAT < SRR19973073.4572515/150‑1 (MQ=60)
CCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATG > SRR19973073.2911061/1‑150 (MQ=60)
AGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATT < SRR19973073.2607697/150‑1 (MQ=60)
TTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTG < SRR19973073.3330944/150‑1 (MQ=60)
TTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTTATACAATCCTGGGCGTTCATTTTTACTTAAATTTCGACAAATGTAATAATTTGGTTAATGATTTGTTG > SRR19973073.572349/1‑150 (MQ=60)
TTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTG > SRR19973073.189264/1‑150 (MQ=60)
CATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTAGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGAGATAAAAGCCTGGGCGATCTTTTTTACTTAAAATGAGAAAAATCTAATAATTTGGTTAATGATTtttttgt > SRR19973073.282902/1‑143 (MQ=60)
ATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTA < SRR19973073.2335010/150‑1 (MQ=60)
CTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTT < SRR19973073.4122801/150‑1 (MQ=60)
TGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTA < SRR19973073.3775883/150‑1 (MQ=60)
GGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTAC < SRR19973073.3052975/150‑1 (MQ=60)
AGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAA > SRR19973073.1872278/1‑150 (MQ=60)
AGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAA > SRR19973073.4563935/1‑150 (MQ=60)
CAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAAC < SRR19973073.730975/150‑1 (MQ=60)
CAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAAC > SRR19973073.4341297/1‑150 (MQ=60)
AGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACA > SRR19973073.3881913/1‑150 (MQ=60)
GAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACAC < SRR19973073.525718/150‑1 (MQ=60)
GAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACAC > SRR19973073.3659655/1‑150 (MQ=60)
GAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACAC > SRR19973073.3659650/1‑150 (MQ=60)
GAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAAGGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACAC > SRR19973073.2945613/1‑150 (MQ=60)
ACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTG < SRR19973073.1626858/150‑1 (MQ=60)
CGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGA > SRR19973073.4578846/1‑150 (MQ=60)
CGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGA < SRR19973073.1596357/150‑1 (MQ=60)
GGCTTTTTCGTTATTTATATCGTGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGAC < SRR19973073.858568/150‑1 (MQ=60)
GGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGAC > SRR19973073.3861495/1‑150 (MQ=60)
CTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTAATTTTTACTTCAATTTAGACAAATTTAATAATTTGGTTAATGTTTGGTTGGTCGTTTAaaaaaacaaatacgt > SRR19973073.843553/1‑135 (MQ=60)
TTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCG < SRR19973073.3086415/150‑1 (MQ=60)
CGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAA < SRR19973073.1918613/150‑1 (MQ=60)
GTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAAC < SRR19973073.4183720/150‑1 (MQ=60)
GTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAAC < SRR19973073.4183735/150‑1 (MQ=60)
GTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAAC < SRR19973073.4183791/150‑1 (MQ=60)
GTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTGTACATAAACACTGACGTCGTAAAC > SRR19973073.1841100/1‑150 (MQ=60)
TATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTAAATAAACACTGACGTCGTAAACAC > SRR19973073.3221427/1‑150 (MQ=60)
TATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATAATTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGAAGTCGTAAACAC > SRR19973073.2448230/1‑150 (MQ=60)
ATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACC < SRR19973073.4223744/150‑1 (MQ=60)
ATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACC < SRR19973073.4223888/150‑1 (MQ=60)
TTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCC > SRR19973073.3826104/1‑150 (MQ=60)
TTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGACTGGGCGTACTTTTTTCCATCAAAAGCGACAAATGAAATAATTTGGTGAATGATTGGTTGTTCGTTTACATAAAAACTGACGTCGTAAACAACC > SRR19973073.3826216/1‑150 (MQ=60)
ATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGT > SRR19973073.3670031/1‑150 (MQ=60)
TATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTA > SRR19973073.4605789/1‑150 (MQ=60)
ATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTAT < SRR19973073.1811251/150‑1 (MQ=60)
ATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTAT < SRR19973073.687778/150‑1 (MQ=60)
ATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTAT < SRR19973073.1811235/150‑1 (MQ=60)
TCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATA > SRR19973073.4576100/1‑150 (MQ=60)
TCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATA > SRR19973073.4576103/1‑150 (MQ=60)
GGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGC < SRR19973073.289339/150‑1 (MQ=60)
ATATGAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCT > SRR19973073.3241430/1‑150 (MQ=60)
ATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTC < SRR19973073.2468756/150‑1 (MQ=60)
GAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCAC > SRR19973073.2907419/1‑150 (MQ=60)
GAAACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCAC > SRR19973073.763043/1‑150 (MQ=60)
AAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACT > SRR19973073.1261182/1‑150 (MQ=60)
AAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACT > SRR19973073.4584874/1‑150 (MQ=60)
AACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTG > SRR19973073.2470238/1‑150 (MQ=60)
ACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGT < SRR19973073.1257384/150‑1 (MQ=60)
ACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGT > SRR19973073.4465662/1‑150 (MQ=60)
ACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGT < SRR19973073.1257385/150‑1 (MQ=60)
ACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTAAATTTCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATTATTTGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGGATAGCGGGGTTACCTTCACTGG > SRR19973073.2133502/1‑150 (MQ=60)
ACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGT < SRR19973073.77963/150‑1 (MQ=60)
ACTGCAATAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCATCAATTTCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAAAACAGACGTCGGAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCAATGT > SRR19973073.976315/1‑150 (MQ=60)
CTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGTA > SRR19973073.170293/1‑150 (MQ=60)
CTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGGCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGTA > SRR19973073.170348/1‑150 (MQ=60)
GCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGTACC < SRR19973073.2666326/150‑1 (MQ=60)
TAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTGCTTCAATTGCGACAAATGTAATACGTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTTACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGTACCGGCT > SRR19973073.1738948/1‑150 (MQ=60)
TAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGGCGTTTTCATAAAAACTGAAGTCGTAAAAACCCGGTATAGCGGGGTTACCATCACTGTACCGGCT > SRR19973073.1739604/1‑150 (MQ=60)
TAAATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTATTTTTTCCTTAAAATGCGACAAATTTAATACTTTTGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTAAATAAAAACTGACGTCGTAAAAACCCGGTATAGCGGGGTTAACTTAACTGTACCCGCT > SRR19973073.1738936/1‑150 (MQ=60)
AATTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTAATTTTTCCTTCAAatgcgtcaaaggtaaaaattttgttaaagaattgttggtcgtttaaaaaaaaaaagaattagtaaaaaaccggtaaagcggggttacaatcacagtaacgcctta > SRR19973073.3434303/1‑45 (MQ=50)
TTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGTACCGGCTGAGA < SRR19973073.2643017/150‑1 (MQ=60)
TTATTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGTACCGGCTGAGA > SRR19973073.3015432/1‑150 (MQ=60)
|
ACGTTGATCGTTAACGTCATAACGAACAGAAGCCTGAGGGATAATTTCCGTCAAATTGAGGCAATTGCCGAGCGTTTCATCCCTGGCAAGCAGAACGGCTTTTTCGTTATTTATATCGGGAGAATTAATATGAAACTGCAATAAATTCTTTAATGTGATACAAGCCTGGGCGTTCTTTTTTCCTTCAATTGCGACAAATGTAATACTTTGGTTAATGATTGGTTGGTCGTTTACATAAACACTGACGTCGTAAACACCCGGTATAGCGGGGTTACCTTCACTGTACCGGCTGAGA > CP009273/151473‑151767
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |