Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F342 I0 R1
|
1331 |
225.9 |
7641038 |
95.8% |
7320114 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
3,830,311 |
G→T |
100% |
intergenic (+395/‑2) |
yicT → / → setC |
pseudogene/putative arabinose efflux transporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 3,830,311 | 0 | G | T | 99.5%
| 696.2
/ ‑4.3
| 211 | intergenic (+395/‑2) | yicT/setC | pseudogene/putative arabinose efflux transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base T (110/100); total (111/100) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.95e-01 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
AATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGAACTGAAAGCCCG > CP009273/3830166‑3830455
|
aataatCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAgaataa > 1:2538928/1‑148 (MQ=255)
aataatCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAgaataa > 1:2429116/1‑148 (MQ=255)
aataatCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAgaataa > 2:1109500/1‑148 (MQ=255)
aataatCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAgaataa > 2:2902304/1‑148 (MQ=255)
taatCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATg < 1:3346754/148‑1 (MQ=255)
aatCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGc > 1:1403205/1‑148 (MQ=255)
atCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCa > 1:3568948/1‑148 (MQ=255)
tctcAATTGCTGGCCCTATAATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCaa > 2:838486/1‑148 (MQ=255)
tctcAATTGCTGGCCCTATAATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATATTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCaa < 2:2141744/148‑1 (MQ=255)
tcAATTGCTGGCCCTATAATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCaaaa < 1:625359/148‑1 (MQ=255)
cAATTGCTGGCCCTATAATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCaaaaa < 1:1541234/148‑1 (MQ=255)
aaTTGCTGGCCCTATAATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCaaaaaa > 2:139713/1‑148 (MQ=255)
aTTGCTGGCCCTATAATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAAc > 2:1611183/1‑148 (MQ=255)
ttGCTGGCCCTATAATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACg > 2:384169/1‑148 (MQ=255)
cTATAATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACt > 1:2898476/1‑148 (MQ=255)
tataATATTGAGCTAGCTTTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGAAACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTTTTTGTAACTCATTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTc < 1:433296/148‑1 (MQ=255)
tataATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTc > 2:1203191/1‑148 (MQ=255)
ataataTTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACACTACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTcc < 2:2410881/148‑1 (MQ=255)
aaaataTTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCAATcc > 2:3161875/3‑148 (MQ=255)
taattTTGAGCTAGCATTGCTTTCTGTTTTTATCAGCTATACTAAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCa < 1:549048/148‑1 (MQ=255)
taataTTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTAAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCa < 1:1502457/148‑1 (MQ=255)
atatTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATc > 2:2379826/1‑148 (MQ=255)
ttGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCaaa > 2:3045477/1‑148 (MQ=255)
tgagatAGCATTGCTTTGTGGTTTTATCAGCTATACTCAAAAATTATTAATACAATACTCATTCGACTGGTAATTATTTGTAACTCATTTATATTTTTTCGCCGGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCaaaa < 1:791966/143‑1 (MQ=255)
gcTAGCTTTGCTTTCTGGTTTTATCAGAGATAATAAAAAATTCTAAAAAAAATAAACATTCTAGTGGTACTTATTTTTAAATAATTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCACAATAATCAAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATa < 1:8281/148‑1 (MQ=255)
cTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATAc > 2:2644731/1‑148 (MQ=255)
cATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGa < 1:2430833/148‑1 (MQ=255)
aaTTGCTTTCTGTTTTTATCAGCTAAAATCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTAGTTATTTGTAACTCATTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCATAATATTGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGa < 1:1740750/147‑1 (MQ=255)
aTTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGAt < 1:3118975/148‑1 (MQ=255)
ttGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGAtc > 2:28979/1‑148 (MQ=255)
tGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGAtct > 2:1647637/1‑148 (MQ=255)
gCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGAtctc < 2:2823073/148‑1 (MQ=255)
gCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGAtctc < 2:910191/148‑1 (MQ=255)
gCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGAtctc > 1:1535857/1‑148 (MQ=255)
cTTTCTGGTTGTATCAGCTATACTAAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCa < 1:2117521/148‑1 (MQ=255)
cTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCa < 2:525573/148‑1 (MQ=255)
tttCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCAc > 1:1232537/1‑148 (MQ=255)
tCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTg < 2:2290922/148‑1 (MQ=255)
tCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTg > 2:2836103/1‑148 (MQ=255)
tCTGGTTGTATCAGCGATACTAAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTg < 2:366896/148‑1 (MQ=255)
ggTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCcg > 2:3488817/1‑148 (MQ=255)
tGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCgg > 2:1156875/1‑148 (MQ=255)
tATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTAGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCa < 1:2421692/148‑1 (MQ=255)
tATCAGCGATACTAAAAAATTCTTAATACAATACTCATTAGACTGGTAATTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGAAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCa < 1:1045589/148‑1 (MQ=255)
cAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCAttt > 2:594423/1‑148 (MQ=255)
aGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCAtttt > 1:970663/1‑148 (MQ=255)
gATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTAc < 1:936037/148‑1 (MQ=255)
aTACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACt > 2:199515/1‑148 (MQ=255)
aTACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACt > 2:1807964/1‑148 (MQ=255)
aTACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACt > 2:1527042/1‑148 (MQ=255)
tACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACtt > 1:2469446/1‑148 (MQ=255)
aCTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTg > 2:808453/1‑148 (MQ=255)
aCTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTg > 2:1626045/1‑148 (MQ=255)
aCTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTg < 1:3800876/148‑1 (MQ=255)
ctaaaaaaTTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGt < 1:804947/145‑1 (MQ=255)
aaaaTTCTTAATACAATACTCTTTCGACTGTTACTTATTTGTAACTCATTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGcc < 1:709352/148‑1 (MQ=255)
aaaaTTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGcc < 1:2628751/148‑1 (MQ=255)
aaaaTTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGcc < 1:3052229/148‑1 (MQ=255)
aaaTTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCt < 2:3432046/148‑1 (MQ=255)
tCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCt > 1:2403419/1‑148 (MQ=255)
cTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTg < 1:1570018/148‑1 (MQ=255)
caatacTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTa > 1:1401960/1‑148 (MQ=255)
caatacTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTa < 2:2194755/148‑1 (MQ=255)
tacTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTg > 1:2294230/1‑148 (MQ=255)
tacTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTg > 2:496421/1‑148 (MQ=255)
acTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGc > 1:1718924/1‑148 (MQ=255)
acTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGc > 2:3236453/1‑148 (MQ=255)
cTCATTCTACTTGTACTTATTTTTAACTCAGTTATATTTTGACGCCCGTTGATTCATATTAATCCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCg < 1:676898/148‑1 (MQ=255)
cATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCCCTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCggg < 1:1183291/148‑1 (MQ=255)
cATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCggg < 1:1278656/148‑1 (MQ=255)
ttCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCCCTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGgcg < 1:3479938/148‑1 (MQ=255)
ttCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGgcg < 1:2787961/148‑1 (MQ=255)
tCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTATTTCTCCCGGTGATTCAGAATAATGAAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCAATGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCATACTGGTATTGCGGgcgc > 2:1748991/1‑148 (MQ=255)
cGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGct < 2:1579558/148‑1 (MQ=255)
aCTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATTATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGctct < 2:392333/148‑1 (MQ=255)
aCTGGTAATTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAACACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGctct < 1:981841/148‑1 (MQ=255)
cTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCtt < 1:2757539/148‑1 (MQ=255)
tGGTACTTATTGGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTc < 2:3593611/148‑1 (MQ=255)
gTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCCCTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAg < 1:1102034/148‑1 (MQ=255)
gTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAg > 1:3670486/1‑148 (MQ=255)
ttATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATTCTTTATCTCACTGACGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTc < 1:2870596/148‑1 (MQ=255)
ttATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTc < 2:2977626/148‑1 (MQ=255)
tATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTcc < 2:2111505/148‑1 (MQ=255)
tATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTcc > 1:1943870/1‑148 (MQ=255)
aCTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTaa > 1:1361530/1‑148 (MQ=255)
gTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGtata > 2:1483869/1‑148 (MQ=255)
gTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGtata > 2:3090569/1‑148 (MQ=255)
gTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGtata > 2:3087874/1‑148 (MQ=255)
ttATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTCTTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTatat > 2:3524112/1‑148 (MQ=255)
tatTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTcc < 2:3654316/148‑1 (MQ=255)
atTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCt < 1:1109500/148‑1 (MQ=255)
cccGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGa > 2:1071184/1‑148 (MQ=255)
cGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGAAc > 2:2058252/1‑148 (MQ=255)
ggTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGAACt < 2:1583517/148‑1 (MQ=255)
gTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGAACTg > 1:2452363/1‑148 (MQ=255)
gTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGAACTg < 1:1647637/148‑1 (MQ=255)
aTTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGAACTGaaa > 1:465709/1‑148 (MQ=255)
tCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCCCTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGAACTGAAAGc < 1:3598790/148‑1 (MQ=255)
tCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACGTGTCGCCTTTCTGCCGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGAACTGAAAGc < 2:815290/148‑1 (MQ=255)
gaataaTGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGAACTGAAAGCCCg > 2:1355749/1‑148 (MQ=255)
|
AATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGAACTGAAAGCCCG > CP009273/3830166‑3830455
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
TACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGAACTGAAAGCCCGTCC > CP009273/3830162‑3830458
|
TACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAT > SRR19973069.1901300/1‑150 (MQ=60)
ACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATA < SRR19973069.2381410/150‑1 (MQ=60)
ACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATA > SRR19973069.1594254/1‑150 (MQ=60)
CTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAA > SRR19973069.2555739/1‑150 (MQ=60)
CTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAA > SRR19973069.2445616/1‑150 (MQ=60)
CTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAA > SRR19973069.2445500/1‑150 (MQ=60)
ATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGC > SRR19973069.2968604/1‑150 (MQ=60)
ATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGC > SRR19973069.1412996/1‑150 (MQ=60)
TAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCA > SRR19973069.3592193/1‑150 (MQ=60)
TAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCA < SRR19973069.3368658/150‑1 (MQ=60)
TCAATTGCTGGCCCTATAATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAA < SRR19973069.629513/150‑1 (MQ=60)
CAATTGCTGGCCCTATAATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAAC < SRR19973069.1551797/150‑1 (MQ=60)
AATTGCTGGCCCTATAATATTGAGCTATCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATTCTCAAAAATTCTTAATACAATAATCATTCGACTTGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACG < SRR19973069.2248866/150‑1 (MQ=60)
AATTGCTGGCCCTATAATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACG < SRR19973069.1097130/150‑1 (MQ=60)
CCCTATAATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACT > SRR19973069.2917612/1‑150 (MQ=60)
TATAATATTGAGCTAGCTTTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGAAACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTTTTTGTAACTCATTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCA < SRR19973069.436476/150‑1 (MQ=60)
TAATTTTGAGCTAGCATTGCTTTCTGTTTTTATCAGCTATACTAAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATC < SRR19973069.552891/150‑1 (MQ=60)
TAATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTAAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATC < SRR19973069.1512865/150‑1 (MQ=60)
AATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGTTTGTATCAGCTATAATCAAAATTTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCA < SRR19973069.828790/150‑1 (MQ=60)
AATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCA > SRR19973069.2584776/1‑150 (MQ=60)
AATATTGAGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCA > SRR19973069.3326449/1‑150 (MQ=60)
tgagaTAGCATTGCTTTGTGGTTTTATCAGCTATACTCAAAAATTATTAATACAATACTCATTCGACTGGTAATTATTTGTAACTCATTTATATTTTTTCGCCGGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAAT < SRR19973069.797589/145‑1 (MQ=60)
tcaGCTAGCATTTATTTCTGGTTGTATCAGATATACAAAAAAATTCTTAATACAATACTCTTTGTACTGGTACTTATTTGTAAATCTGTTATATTTTTTCGCCCTGTGTTTCAGAATAATGCAAAACACGGCTACCACTCCATCAAAAAT < SRR19973069.798588/147‑1 (MQ=60)
gatagaattgctttgtttTTGTATCAGCTATAATAAAAAATTCTTAATACAATACTCTTTCTACTGTTATTTATTTGTAAATCTGTTATATTTTTTCGCCGGGTGATTCATAATATTGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACT < SRR19973069.712554/132‑1 (MQ=60)
GCTAGCTTTGCTTTCTGGTTTTATCAGAGATAATAAAAAATTCTAAAAAAAATAAACATTCTAGTGGTACTTATTTTTAAATAATTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCACAATAATCAAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACT < SRR19973069.8408/150‑1 (MQ=38)
AGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGA > SRR19973069.2736164/1‑150 (MQ=60)
CATTGCTTTGTGGTTTTATCCGCTATAATCAAAAATTATTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCTGTTATTTTTTTTCGCCCGGTTATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATC < SRR19973069.1752532/150‑1 (MQ=60)
CATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATC > SRR19973069.466329/1‑150 (MQ=60)
CATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATC < SRR19973069.2447228/150‑1 (MQ=60)
CATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTAAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATC < SRR19973069.2468225/150‑1 (MQ=60)
AATTGCTTTCTGTTTTTATCAGCTAAAATCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTAGTTATTTGTAACTCATTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCATAATATTGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATC < SRR19973069.1752962/150‑1 (MQ=60)
ATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCT < SRR19973069.3139472/150‑1 (MQ=60)
TTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTC > SRR19973069.1547916/1‑150 (MQ=60)
TTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTC > SRR19973069.1546395/1‑150 (MQ=60)
TGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCA > SRR19973069.2126063/1‑150 (MQ=60)
GCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCAC > SRR19973069.1240934/1‑150 (MQ=60)
CTTTCTGGTTGTATCAGCTATACTAAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACT < SRR19973069.2132115/150‑1 (MQ=60)
CTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTAAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACT < SRR19973069.875040/150‑1 (MQ=60)
CTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCCCTGCCG < SRR19973069.3055517/150‑1 (MQ=60)
TATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTAGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATT < SRR19973069.2438047/150‑1 (MQ=60)
TATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTAGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATT < SRR19973069.2438039/150‑1 (MQ=60)
TATCAGCGATACTAAAAAATTCTTAATACAATACTCATTAGACTGGTAATTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGAAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATT < SRR19973069.1052851/150‑1 (MQ=60)
TCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTT > SRR19973069.977142/1‑150 (MQ=60)
GATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTT > SRR19973069.2486017/1‑150 (MQ=60)
GATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTT < SRR19973069.942377/150‑1 (MQ=60)
GATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACGTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTT > SRR19973069.591006/1‑150 (MQ=60)
GATACTAAAAAATTATTAATACAATACTCATTCGACTGTTAATTTTTTGTAACTCATTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGAAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCCCTGCCGCGGCATTTTTACTT < SRR19973069.1661795/150‑1 (MQ=60)
TACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGT < SRR19973069.2257834/150‑1 (MQ=60)
ACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTC < SRR19973069.3825493/150‑1 (MQ=60)
CTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCG > SRR19973069.467719/1‑150 (MQ=60)
CTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCG > SRR19973069.3390345/1‑150 (MQ=60)
CTAAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCG < SRR19973069.810655/150‑1 (MQ=60)
AAAATTCTTAATACAATACTCTTTCGACTGTTACTTATTTGTAACTCATTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTT < SRR19973069.714332/150‑1 (MQ=60)
AAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGTTACTTATTTGTAACTAATTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGAAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTT < SRR19973069.714326/150‑1 (MQ=60)
AAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTT < SRR19973069.3072426/150‑1 (MQ=60)
AAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTT < SRR19973069.2646350/150‑1 (MQ=60)
AAAATTCTTAATAAAATACTAATTCGACTGGTAATTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCATAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTT < SRR19973069.752378/150‑1 (MQ=60)
AAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTT > SRR19973069.1528016/1‑150 (MQ=60)
AATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACATGTCTCCTTTC > SRR19973069.434053/1‑150 (MQ=60)
ATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCT > SRR19973069.2419683/1‑150 (MQ=60)
CTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGAC < SRR19973069.1575013/150‑1 (MQ=60)
CTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGAC < SRR19973069.1580704/150‑1 (MQ=60)
TTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACG < SRR19973069.1211465/150‑1 (MQ=60)
TACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTA > SRR19973069.1411738/1‑150 (MQ=60)
TACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTA > SRR19973069.1411746/1‑150 (MQ=60)
AAAATACTCATGCGACTGTTAATTATTTTTAACTCTTTTATTTTTTTGCGCCCGGTGATTCAGAATAATCCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTAT < SRR19973069.1303700/150‑1 (MQ=60)
CAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCATTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCCCTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATT < SRR19973069.1375498/150‑1 (MQ=60)
AATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTG > SRR19973069.2309820/1‑150 (MQ=60)
ATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGC > SRR19973069.1730974/1‑150 (MQ=60)
TACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCG > SRR19973069.3634756/1‑150 (MQ=60)
CTCATTCTACTTGTACTTATTTTTAACTCAGTTATATTTTGACGCCCGTTGATTCATATTAATCCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGG < SRR19973069.681587/150‑1 (MQ=60)
CATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCCCTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCG < SRR19973069.1286683/150‑1 (MQ=60)
CATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCCCTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCG < SRR19973069.1191464/150‑1 (MQ=60)
CATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCG < SRR19973069.1287229/150‑1 (MQ=60)
CATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCG > SRR19973069.2553511/1‑150 (MQ=60)
ATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGC > SRR19973069.1282241/1‑150 (MQ=60)
TTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCCCTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCT < SRR19973069.3502420/150‑1 (MQ=60)
TTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCT < SRR19973069.2806511/150‑1 (MQ=60)
CGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCCCTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCT < SRR19973069.2445877/150‑1 (MQ=60)
ACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTC > SRR19973069.2393851/1‑150 (MQ=60)
ACTGGTAATTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAACACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTC < SRR19973069.988474/150‑1 (MQ=60)
CTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCA < SRR19973069.2775948/150‑1 (MQ=60)
TGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAG > SRR19973069.3694505/1‑150 (MQ=60)
GTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCCCTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGAC < SRR19973069.1109735/150‑1 (MQ=60)
GTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATACATAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGAC < SRR19973069.3794924/150‑1 (MQ=60)
TACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACT < SRR19973069.1427577/150‑1 (MQ=60)
ACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTC > SRR19973069.2445448/1‑150 (MQ=60)
CTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCC > SRR19973069.1957274/1‑150 (MQ=60)
TTATTTTTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATTCTTTATCTCACTGACGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCT < SRR19973069.2889451/150‑1 (MQ=60)
ATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTAC > SRR19973069.3611948/1‑150 (MQ=60)
ATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTAC > SRR19973069.657235/1‑150 (MQ=60)
TGTAACTCATTTATATTTTTTCGCCCGGTTATTCATAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCT < SRR19973069.520861/150‑1 (MQ=60)
GTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTA > SRR19973069.917384/1‑150 (MQ=60)
TAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAA > SRR19973069.98800/1‑150 (MQ=60)
TAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAA > SRR19973069.1370540/1‑150 (MQ=60)
TAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAA > SRR19973069.1370990/1‑150 (MQ=60)
AACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCCCTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAG < SRR19973069.2867241/150‑1 (MQ=60)
AGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATAT > SRR19973069.2795754/1‑150 (MQ=60)
TATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCC > SRR19973069.2674192/1‑150 (MQ=60)
ATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCT < SRR19973069.1618274/150‑1 (MQ=60)
ATTTTTTCGCCCTGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCG < SRR19973069.1117375/150‑1 (MQ=60)
ATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCG < SRR19973069.1117240/150‑1 (MQ=60)
TTTCGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGA > SRR19973069.947850/1‑150 (MQ=60)
TCGCCCGGTGATTCACAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATG < SRR19973069.3167/150‑1 (MQ=60)
CGCCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGA < SRR19973069.1914506/150‑1 (MQ=60)
CCCGGTGATTCAGAATAATGCAAAACACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGAAC < SRR19973069.1454185/150‑1 (MQ=60)
CGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGAACTG > SRR19973069.2468859/1‑150 (MQ=60)
CGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGAACTG > SRR19973069.2468856/1‑150 (MQ=60)
CGGTGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCGAAGTATATTCCTCGCAGATGAACTG > SRR19973069.2913982/1‑150 (MQ=60)
GTGATTCATAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGAACTGAA < SRR19973069.1659002/150‑1 (MQ=60)
TGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGAACTGAAA > SRR19973069.1116968/1‑150 (MQ=60)
TGATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGAACTGAAA > SRR19973069.469111/1‑150 (MQ=60)
GATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGAACTGAAAG < SRR19973069.3511323/150‑1 (MQ=60)
ATTCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGAACTGAAAGC > SRR19973069.3567646/1‑150 (MQ=60)
TCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCCCTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGAACTGAAAGCCC < SRR19973069.1717777/150‑1 (MQ=60)
TCAGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCCCTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGAACTGAAAGCCC < SRR19973069.3622280/150‑1 (MQ=60)
AGAATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGAACTGAAAGCCCGT > SRR19973069.3363405/1‑150 (MQ=60)
AATAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGAACTGAAAGCCCGTCC > SRR19973069.3696306/1‑150 (MQ=60)
|
TACTAATAATCTCAATTGCTGGCCCTATAATATTGCGCTAGCATTGCTTTCTGGTTGTATCAGCGATACTCAAAAATTCTTAATACAATACTCATTCGACTGGTACTTATTTGTAACTCAGTTATATTTTTTCGCCCGGTGATTCAGAAGAATGCAAAAAACGGCTACCACTCCATCAAAAATACTTGATCTCACTGCCGCGGCATTTTTACTTGTCGCCTTTCTGACGGGTATTGCGGGCGCTCTTCAGACTCCTACCCTAAGTATATTCCTCGCAGATGAACTGAAAGCCCGTCC > CP009273/3830162‑3830458
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
