Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F15 I1 R3
|
782 |
676.6 |
23254289 |
97.6% |
22696186 |
138.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
RA |
NZ_CP025268 |
320,615 |
(G)6→7 |
intergenic (+482/‑44) |
rclR → / → ykgE |
reactive chlorine‑specific transcriptional regulator RclR/heterodisulfide reductase‑related iron‑sulfur binding cluster |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | NZ_CP025268 | 320,609 | 1 | . | G | 97.7%
| 3195.2
/ 54.5
| 931 | intergenic (+476/‑50) | rclR/ykgE | reactive chlorine‑specific transcriptional regulator RclR/heterodisulfide reductase‑related iron‑sulfur binding cluster |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (6/15); new base G (274/636); total (280/651) |
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 983 total aligned reads displayed.
AGCGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑T‑GGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGAAAAAC > NZ_CP025268/320470‑320743
|
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gATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑T‑ggg > 1:8722267/1‑140 (MQ=255)
tGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑T‑ggg‑gg > 1:8011887/1‑140 (MQ=255)
tGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑T‑ggg‑gg > 2:7913133/1‑140 (MQ=255)
gCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCCTTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑T‑ggg‑ggg > 2:2273719/1‑140 (MQ=255)
agaaaTAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACa < 2:567787/140‑1 (MQ=255)
agaaaTAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACa < 1:2459265/140‑1 (MQ=255)
agaaaTAAAATTAGTTATTGCACTGGACGTTAGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACa < 1:3907558/140‑1 (MQ=255)
gaaaTAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACAt < 2:3786900/140‑1 (MQ=255)
aaaTAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATc < 1:3602802/140‑1 (MQ=255)
aaTAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCg > 1:1260104/1‑140 (MQ=255)
aaTAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATAGTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCg > 2:6652253/1‑140 (MQ=255)
tAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATaaa < 2:8928943/140‑1 (MQ=255)
tATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATggg < 2:2908811/140‑1 (MQ=255)
ttGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCa < 1:7287869/140‑1 (MQ=255)
ttGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCa < 2:10148001/140‑1 (MQ=255)
tttGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCa < 2:8180527/135‑1 (MQ=255)
tttGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAg < 1:10941785/140‑1 (MQ=255)
tttGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAg < 2:1410061/140‑1 (MQ=255)
gACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTaa < 1:2234959/140‑1 (MQ=255)
gACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTaa < 2:6456064/140‑1 (MQ=255)
aCGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAAt < 2:2162978/140‑1 (MQ=255)
gTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATgg < 1:3035506/140‑1 (MQ=255)
gTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATgg < 1:1517823/140‑1 (MQ=255)
ttGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAg < 1:6205178/140‑1 (MQ=255)
ttGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAg > 1:8272339/1‑140 (MQ=255)
ggATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTa < 2:8356112/140‑1 (MQ=255)
ggATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTa < 2:2514199/140‑1 (MQ=255)
gATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTAt < 2:7732735/140‑1 (MQ=255)
aTGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTAtt < 1:7441324/140‑1 (MQ=255)
aTCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAAt > 1:8902074/1‑140 (MQ=255)
cATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGt < 1:7157269/140‑1 (MQ=255)
cATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGt < 2:6925604/140‑1 (MQ=255)
cATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGt < 1:4041477/140‑1 (MQ=255)
tGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAAt < 2:404528/116‑1 (MQ=255)
tGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAAt > 1:9817627/1‑140 (MQ=255)
tGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAAt > 2:584753/1‑140 (MQ=255)
gTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAAtt < 1:7676451/140‑1 (MQ=255)
gTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAAtt < 1:1838093/140‑1 (MQ=255)
aTACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTCAATGTCAATTTCt < 1:10015862/140‑1 (MQ=255)
aCATATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATGGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACCTCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCttt < 2:10524883/140‑1 (MQ=255)
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aCAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCttt < 2:9710120/140‑1 (MQ=255)
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aCAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCttt < 1:9643679/140‑1 (MQ=255)
aCAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCttt < 2:8631543/140‑1 (MQ=255)
aCAAATGAGGGGTGGTATGTTGCGAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATCTTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGCGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCttt < 2:7183198/140‑1 (MQ=255)
aaaTGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGt < 2:10630765/140‑1 (MQ=255)
aaaTGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGt < 1:9372237/140‑1 (MQ=255)
aaTGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCTGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTc < 2:7355434/140‑1 (MQ=255)
aaTGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTc < 1:7835746/140‑1 (MQ=255)
tgtggggTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTT‑GGG‑GGGCTCCATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAAGGGAGTAATAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 1:7569965/137‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTTCTAGCCAAGTAAAAAAGAACGCCATATTTTTTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 2:11564710/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTACTGGAGTAGTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 2:9047626/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 1:2296703/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 1:2930503/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 2:4984456/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 1:171214/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 1:4460431/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 2:1535109/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 1:6522433/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 1:5988578/140‑1 (MQ=255)
gAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAcc < 1:11102691/140‑1 (MQ=255)
gAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAcc > 1:3370466/1‑140 (MQ=255)
gAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAcc < 2:3195635/140‑1 (MQ=255)
gAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAcc < 2:3552561/140‑1 (MQ=255)
aGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCt < 1:5806204/140‑1 (MQ=255)
ggggTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTg > 2:10913811/1‑140 (MQ=255)
ggtggtATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTa > 1:10735817/1‑140 (MQ=255)
gtggtTTGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACTCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑T‑GGGTGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTGGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTAt < 1:5480449/140‑1 (MQ=255)
gtATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGTCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTgg > 2:9326555/1‑140 (MQ=255)
gtATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTgg > 1:6675464/1‑140 (MQ=255)
gtATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTgg > 2:8782600/1‑140 (MQ=255)
gtATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATAGTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTCTTAGGTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTgg > 1:4923316/1‑140 (MQ=255)
atccAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTg < 2:11090678/138‑1 (MQ=255)
aGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAAt > 1:11228337/1‑72 (MQ=255)
aGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTaa < 1:839069/85‑1 (MQ=255)
aGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTg < 2:5147357/140‑1 (MQ=255)
aGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTg < 1:11459123/140‑1 (MQ=255)
aGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTg < 1:5702804/140‑1 (MQ=255)
aGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTg < 1:3162636/140‑1 (MQ=255)
aGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTg > 1:6912139/1‑140 (MQ=255)
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gCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑TGGGG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGa > 1:2795143/1‑140 (MQ=255)
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G‑GGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGAAAAACTCGGCTGTCGCGTAAATT > SRR14920200.10383257/1‑151 (MQ=60)
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ATGTGAGCGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGG‑T‑GG‑GGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGAAAAACTCGGCTGTCGCGTAAATTTCC > NZ_CP025268/320465‑320764
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |