Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F50 I1 R2
|
775 |
327.3 |
10718052 |
97.2% |
10417946 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
RA |
NZ_CP025268 |
320,615 |
(G)6→7 |
intergenic (+482/‑44) |
rclR → / → ykgE |
reactive chlorine‑specific transcriptional regulator RclR/heterodisulfide reductase‑related iron‑sulfur binding cluster |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | NZ_CP025268 | 320,609 | 1 | . | G | 97.3%
| 729.5
/ 10.4
| 220 | intergenic (+476/‑50) | rclR/ykgE | reactive chlorine‑specific transcriptional regulator RclR/heterodisulfide reductase‑related iron‑sulfur binding cluster |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (6/0); new base G (109/105); total (115/105) |
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.01e-02 |
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 234 total aligned reads displayed.
AGCGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGT‑‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGAAAAAC > NZ_CP025268/320470‑320743
|
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gCGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGT‑‑g > 1:764306/1‑140 (MQ=255)
cGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGT‑‑g‑g < 1:491187/140‑1 (MQ=255)
cGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGT‑‑g‑g > 2:2239551/1‑140 (MQ=255)
aTGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGT‑‑g‑ggg > 2:836576/1‑140 (MQ=255)
aTGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGT‑‑g‑ggg > 1:4248282/1‑140 (MQ=255)
aTGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGT‑‑g‑ggg > 1:237877/1‑140 (MQ=255)
tGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGT‑‑g‑gggg > 1:2299849/1‑140 (MQ=255)
gCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGT‑‑g‑gggg‑g > 1:58757/1‑140 (MQ=255)
agaaaTAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCCTACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACa < 2:626144/140‑1 (MQ=255)
agaaaTAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACa < 2:1870659/140‑1 (MQ=255)
agaaaTAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACa < 1:5077330/140‑1 (MQ=255)
aaaTAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATc < 1:103796/140‑1 (MQ=255)
aaTAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCg > 2:4005681/1‑140 (MQ=255)
aaaaTTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGc < 1:2751142/140‑1 (MQ=255)
aaaTTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCa < 1:153177/140‑1 (MQ=255)
tAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCCTATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATaaa < 1:199730/140‑1 (MQ=255)
tATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATggg < 2:3061599/140‑1 (MQ=255)
aTTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAGATGGGc > 2:4975534/1‑140 (MQ=255)
ttGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCa < 1:2106981/140‑1 (MQ=255)
ttGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCa < 1:4351431/140‑1 (MQ=255)
ttGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCa < 2:2206332/140‑1 (MQ=255)
ttGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCa < 2:2863503/140‑1 (MQ=255)
ttGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCa < 2:418170/140‑1 (MQ=255)
ttGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGCTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCa < 2:4329020/140‑1 (MQ=255)
tGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATGTTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCAt > 2:760031/1‑140 (MQ=255)
gCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATg < 2:4152941/140‑1 (MQ=255)
aTTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGaa < 2:1954584/140‑1 (MQ=255)
gACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTaa < 1:1463090/140‑1 (MQ=255)
gACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTaa > 1:1434674/1‑140 (MQ=255)
gACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTaa < 1:4009414/140‑1 (MQ=255)
gACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGGCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAATCATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTaa < 2:5114658/140‑1 (MQ=255)
gTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATgg < 2:2605272/140‑1 (MQ=255)
gTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATgg < 2:4679613/140‑1 (MQ=255)
gTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATgg < 1:2677184/140‑1 (MQ=255)
ttGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAg > 2:15700/1‑140 (MQ=255)
ttGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAg > 1:1558116/1‑140 (MQ=255)
tGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGGAGTAATGGAGt > 1:5070231/1‑140 (MQ=255)
ggATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTa < 2:3737479/140‑1 (MQ=255)
aTGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTAtt < 1:3555422/140‑1 (MQ=255)
aaGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGtt > 2:1151360/1‑140 (MQ=255)
tGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAAt > 1:5338718/1‑140 (MQ=255)
gTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAGTGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAAtt > 2:274369/1‑140 (MQ=255)
gTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAAtt < 1:3990538/140‑1 (MQ=255)
tACAAATGAGGGGTGGTCTGTTGCTAGCAAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCtt > 2:1361687/1‑140 (MQ=255)
aCAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCttt < 2:338569/140‑1 (MQ=255)
aaaTGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGt < 2:1662154/140‑1 (MQ=255)
aaaTGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGt < 2:571054/140‑1 (MQ=255)
aaTGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTc < 2:2402899/140‑1 (MQ=255)
aTGAGGGGAGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGGTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCa > 1:995981/1‑140 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 2:4660198/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 2:3651646/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 1:4025773/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 1:1151360/140‑1 (MQ=255)
gAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAcc < 2:3014997/140‑1 (MQ=255)
tggggTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCt < 1:4709610/139‑1 (MQ=255)
gggTGGGATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGG‑‑GTGGGT‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAATAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTAAATTTCTTTATCACCTGt > 2:4056260/1‑140 (MQ=255)
ggtggtATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATgg > 1:2816332/1‑102 (MQ=255)
ggtggtATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATgg < 2:2816332/102‑1 (MQ=255)
ttGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACg > 1:817388/1‑140 (MQ=255)
ttGCCAGGCAATTAAAAAAGAACGGCATATTTTTTGATTATTTATTCCCC‑GGGGGG‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGAc < 2:4417513/140‑1 (MQ=255)
tGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGc > 1:836814/1‑140 (MQ=255)
tGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCAGAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGGGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGc > 1:5133481/1‑140 (MQ=255)
gCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGTATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGcc < 1:4788847/140‑1 (MQ=255)
cTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATTCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGcgc > 1:3750558/1‑138 (MQ=255)
cTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACGTCGGGCATATATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGccc > 2:4919532/1‑140 (MQ=255)
cTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATgg > 2:2618270/1‑90 (MQ=255)
cTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATgg < 1:2618270/90‑1 (MQ=255)
cTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGCATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGccc > 1:5275364/1‑140 (MQ=255)
cTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGccc > 1:4452400/1‑140 (MQ=255)
cTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGccc > 2:183897/1‑140 (MQ=255)
cTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGccc > 1:1739866/1‑140 (MQ=255)
cTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGccc > 1:2498495/1‑140 (MQ=255)
cTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGccc > 2:1474323/1‑140 (MQ=255)
cTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTGATGGATGAGTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAGGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATGTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGccg > 2:3128702/1‑139 (MQ=255)
gCCAATTAAAAAAGAACTCCAGATTGATTGATGATTGATCCCCCGGGG‑‑G‑GGGG‑GAAACAGCGGGCATAAATGGGCCTGAAAAAATGGAGGAGTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTAGTCAACTATATTGGTGACGccgtta > 2:4839409/1‑136 (MQ=255)
gCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGa > 2:4454266/1‑140 (MQ=255)
gCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGa > 1:1650493/1‑140 (MQ=255)
gCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGa > 1:5782/1‑140 (MQ=255)
gCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGa > 2:315469/1‑140 (MQ=255)
gCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGa > 1:1911606/1‑140 (MQ=255)
gCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGTG‑G‑GGGG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGa > 2:2990080/1‑140 (MQ=255)
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TAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGA > SRR14920189.56046/1‑151 (MQ=60)
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GGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGAAAAACTCGGCTGTCGCGTAAAT < SRR14920189.838609/151‑1 (MQ=60)
GGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGAAAAACTCGGCTGTCGCGTAAATT > SRR14920189.4716378/1‑151 (MQ=60)
GGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGAAAAACTCGGCTGTCGCGTAAATTT > SRR14920189.318187/1‑151 (MQ=60)
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ATGTGAGCGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGT‑GGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGAAAAACTCGGCTGTCGCGTAAATTT > NZ_CP025268/320465‑320762
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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |