Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F15 I1 R2
|
781 |
700.4 |
23289492 |
98.5% |
22940149 |
138.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
RA |
NZ_CP025268 |
320,615 |
(G)6→7 |
intergenic (+482/‑44) |
rclR → / → ykgE |
reactive chlorine‑specific transcriptional regulator RclR/heterodisulfide reductase‑related iron‑sulfur binding cluster |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | NZ_CP025268 | 320,609 | 1 | . | G | 98.1%
| 3064.8
/ 41.7
| 891 | intergenic (+476/‑50) | rclR/ykgE | reactive chlorine‑specific transcriptional regulator RclR/heterodisulfide reductase‑related iron‑sulfur binding cluster |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (7/10); new base G (271/603); total (278/613) |
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.29e-01 |
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 944 total aligned reads displayed.
AGCGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGT‑GGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGAAAAAC > NZ_CP025268/320470‑320743
|
gCGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTAGTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGT‑g < 2:9712226/140‑1 (MQ=255)
cGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGT‑gg < 2:2778895/140‑1 (MQ=255)
cGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGT‑gg > 2:11160973/1‑140 (MQ=255)
cGATGCCGAAAGAAATAAAATGAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGT‑gg < 2:1264537/140‑1 (MQ=255)
aTGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATAGTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGT‑ggg‑g > 2:4379755/1‑140 (MQ=255)
aaTAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCg > 1:5033938/1‑140 (MQ=255)
aaTAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCg > 2:457143/1‑140 (MQ=255)
tAAAATTAGTTCTTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCCTACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGAGCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCggg < 2:9114948/140‑1 (MQ=255)
tAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATaaa < 2:6062505/140‑1 (MQ=255)
tAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATaaa < 2:3708519/140‑1 (MQ=255)
aGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGTTTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAAt > 1:2820811/1‑140 (MQ=255)
ttGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCa < 1:11228733/140‑1 (MQ=255)
ttGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCa < 1:2488660/140‑1 (MQ=255)
ttGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCa < 2:303805/140‑1 (MQ=255)
tGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCAt > 1:9675194/1‑140 (MQ=255)
gCATTTGACGTTTGGATGAAATATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATg < 1:2123590/140‑1 (MQ=255)
gCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATg < 1:6572361/140‑1 (MQ=255)
tttGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAg < 2:1711116/140‑1 (MQ=255)
gACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTaa < 1:3174330/140‑1 (MQ=255)
gACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTaa < 1:4402287/140‑1 (MQ=255)
gACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGT‑GGG‑GGGTAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTaa < 2:1006817/140‑1 (MQ=255)
aCGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAAt < 1:2688573/140‑1 (MQ=255)
aCGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAAt < 2:10259357/140‑1 (MQ=255)
aCGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAAt < 2:11292850/140‑1 (MQ=255)
aCGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAAt < 2:8477565/140‑1 (MQ=255)
cGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATg > 2:5510641/1‑140 (MQ=255)
gTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATgg < 1:3721278/140‑1 (MQ=255)
gTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATgg < 2:10774944/140‑1 (MQ=255)
gTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATgg < 2:5033938/140‑1 (MQ=255)
ttGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAg > 2:1559976/1‑140 (MQ=255)
tGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGt > 2:1988840/1‑140 (MQ=255)
ggATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTa < 1:5751712/140‑1 (MQ=255)
ggATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTa < 1:8747039/140‑1 (MQ=255)
gAAAGTTTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGACATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAg < 2:2091598/140‑1 (MQ=255)
aTCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAAt > 2:1820280/1‑140 (MQ=255)
tGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAAt > 2:4000862/1‑140 (MQ=255)
gTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAAtt < 2:1448440/140‑1 (MQ=255)
gTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAAtt < 2:530948/140‑1 (MQ=255)
cATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTc < 2:2470699/140‑1 (MQ=255)
aTACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCt < 1:5246099/140‑1 (MQ=255)
tACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTaa > 2:9194938/1‑110 (MQ=255)
tACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCtt > 2:3420090/1‑140 (MQ=255)
tACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCtt > 1:1816079/1‑140 (MQ=255)
aCAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTCTTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCttt < 2:8672572/140‑1 (MQ=255)
aCAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCttt < 1:2975991/140‑1 (MQ=255)
aCAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCttt < 2:9539435/140‑1 (MQ=255)
aaaTGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGt < 2:7720182/140‑1 (MQ=255)
aaaTGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGt < 2:6617749/140‑1 (MQ=255)
aaaTGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAAATAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGt < 2:8017105/140‑1 (MQ=255)
aaTGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTc < 2:11482070/140‑1 (MQ=255)
aaTGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTc < 1:7142252/140‑1 (MQ=255)
aaTGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTc < 2:5676141/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCATTTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 1:468900/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 2:2588760/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 1:9228217/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 1:7738226/140‑1 (MQ=255)
gAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAcc > 1:5595533/1‑140 (MQ=255)
aGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCt < 2:10352030/140‑1 (MQ=255)
aGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCt < 1:1356471/140‑1 (MQ=255)
gggTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTaa < 1:1630320/100‑1 (MQ=255)
gggTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGt > 1:2316196/1‑140 (MQ=255)
ggtggaATGATCCTACCAAATTAAAAAAGAACGCCATATAAATTGATGATAGATCCCC‑CATT‑GGGCGTG‑AAACATCGCGCATAAATCGGCATGAAGTAATGCAGTATTATTTATGAAAGACAATTTCTTTGACaaattta > 2:10624584/1‑134 (MQ=255)
tggtATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTAtt > 1:8076484/1‑140 (MQ=255)
tGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGa < 1:7440590/140‑1 (MQ=255)
tGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGa < 2:4908024/140‑1 (MQ=255)
ttGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATCTTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACg < 2:6887137/140‑1 (MQ=255)
ttGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACg > 2:7574724/1‑140 (MQ=255)
gcgaGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGcc < 1:6462055/137‑1 (MQ=255)
gCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGcc < 1:6004342/140‑1 (MQ=255)
gCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGcc < 1:10799258/140‑1 (MQ=255)
gCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGcc < 2:7116344/140‑1 (MQ=255)
cTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGt < 2:473519/50‑1 (MQ=255)
cTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGccc > 1:8983621/1‑140 (MQ=255)
cTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGccc > 1:1987660/1‑140 (MQ=255)
cTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGccc > 1:7325947/1‑140 (MQ=255)
aGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTg > 2:5873795/1‑140 (MQ=255)
aGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTg < 1:11047013/140‑1 (MQ=255)
aGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTg < 1:1052879/140‑1 (MQ=255)
gaaaaTAAAAAAACAAAGCCAAATTTATAGATGATAGATCCCCATGAT‑TGC‑GGT‑AAACATCTGTCATAAATGGTAATGAATTAAAGAAGTATTAGTTGTTAAAGTAAATTTCTTTTTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGa > 2:4231810/4‑140 (MQ=255)
gCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAAt < 1:7571091/85‑1 (MQ=255)
gCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc > 2:2320451/1‑120 (MQ=255)
gCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGa > 2:10937433/1‑140 (MQ=255)
aTTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 1:10338784/116‑1 (MQ=255)
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aaaaGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCC‑CGGTGGGG‑GGG‑AAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGaa < 1:3087505/140‑1 (MQ=255)
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CCCCC‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGAAAAACTCGGCTGT > SRR14920161.9399556/1‑151 (MQ=60)
GGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGAAAAACTCGGCTGTCGCGTAAATT < SRR14920161.1474550/151‑1 (MQ=60)
GGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGAAAAACTCGGCTGTCGCGTAAATTTCC > SRR14920161.200451/1‑151 (MQ=60)
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ATGTGAGCGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGT‑GGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGAAAAACTCGGCTGTCGCGTAAATTTCC > NZ_CP025268/320465‑320764
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |