Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F15 I1 R4
|
781 |
701.7 |
22683696 |
98.1% |
22252705 |
139.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
RA |
NZ_CP025268 |
320,615 |
(G)6→7 |
intergenic (+482/‑44) |
rclR → / → ykgE |
reactive chlorine‑specific transcriptional regulator RclR/heterodisulfide reductase‑related iron‑sulfur binding cluster |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | NZ_CP025268 | 320,609 | 1 | . | G | 94.4%
| 1532.6
/ 81.0
| 467 | intergenic (+476/‑50) | rclR/ykgE | reactive chlorine‑specific transcriptional regulator RclR/heterodisulfide reductase‑related iron‑sulfur binding cluster |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (15/11); new base G (180/261); total (195/272) |
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.03e-01 |
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 490 total aligned reads displayed.
AGCGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑T‑G‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGAAAAAC > NZ_CP025268/320470‑320743
|
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aGCGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑t > 2:6001581/1‑140 (MQ=255)
cGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGTGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCAAATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑T‑g‑g < 1:8562506/140‑1 (MQ=255)
cGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑T‑g‑g < 2:11091624/140‑1 (MQ=255)
aTGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑T‑g‑gg‑g > 2:1066042/1‑140 (MQ=255)
gCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑T‑g‑gg‑gg‑g > 1:6936782/1‑140 (MQ=255)
agaaaTAAAATTAGTTAGTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACa < 2:3060275/140‑1 (MQ=255)
gaaaTAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACAt < 1:6709033/140‑1 (MQ=255)
acaTAAATTTAGTGAGTTCTTTTGACGTTTGGATGAAAGCTTCTGATTTGGCTTACAAATGAGGGGTGGTTTGTTGCTTGCCAATTAAAATAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CA‑GGAG‑G‑GG‑GG‑GAAACATc < 2:5441549/138‑1 (MQ=255)
aaaTAAAATTATTTATTGCAATTTACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGATATCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATTATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATc < 2:4505060/140‑1 (MQ=255)
aaaTAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATc < 2:927926/140‑1 (MQ=255)
aaaaTTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑T‑G‑GGTGG‑GAATCATCGGGc < 2:4908473/140‑1 (MQ=255)
aGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAAt > 1:8759144/1‑140 (MQ=255)
aTTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGc < 1:8263173/140‑1 (MQ=255)
ttGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCa < 2:2277197/140‑1 (MQ=255)
ttGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCa < 1:5863443/140‑1 (MQ=255)
tGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCAt > 2:6202844/1‑140 (MQ=255)
gCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATg < 2:483708/140‑1 (MQ=255)
ttGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAAATAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGt > 1:8447951/1‑140 (MQ=255)
tGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTa > 2:9015629/1‑140 (MQ=255)
gACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTaa < 2:1834836/140‑1 (MQ=255)
gACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTaa < 1:9734316/140‑1 (MQ=255)
gACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTaa < 1:1340360/140‑1 (MQ=255)
gACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTaa < 2:428503/140‑1 (MQ=255)
aCGTTTGGATGAAAGAGTATCATGTGTCATACACATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATAGGGATGGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GACACCTCGGGCATACAGGGGCATGAAGtcct < 2:1599099/140‑4 (MQ=255)
aCGTCTGGATGACAGATTATCCATTGTCCTACCAATGAGGGGAGGTAGGGAGCTCGCCAATTAACCAACAACGCCAGCTTTCTTGATGTTTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCAGGAAGTAAt < 2:9939962/140‑1 (MQ=255)
gTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATgg < 1:11130432/140‑1 (MQ=255)
gTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATgg < 1:6328107/140‑1 (MQ=255)
tGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGt < 2:3469846/140‑1 (MQ=255)
ggATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTa < 2:9741698/140‑1 (MQ=255)
aTGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTAtt < 1:7332214/140‑1 (MQ=255)
gAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAg < 1:2718346/140‑1 (MQ=255)
ttATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGa < 2:4172890/140‑1 (MQ=255)
atATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATTTTTATTGATGATTGCTCCC‑CC‑TG‑T‑GTGG‑GT‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGa < 2:6788315/139‑1 (MQ=255)
cATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGt < 2:79891/140‑1 (MQ=255)
aTTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTc < 1:1496675/140‑1 (MQ=255)
gTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAAtt < 1:1726416/140‑1 (MQ=255)
gTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAAtt > 2:2082627/1‑140 (MQ=255)
gTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAAtt > 2:3615520/1‑140 (MQ=255)
aTACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCt < 1:9041535/140‑1 (MQ=255)
aCAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCttt > 1:10036724/1‑140 (MQ=255)
aCAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCttt < 2:10808302/140‑1 (MQ=255)
aCAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCttt > 2:7535707/1‑140 (MQ=255)
aCAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCttt < 1:245167/140‑1 (MQ=255)
cAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTg < 1:863849/140‑1 (MQ=255)
aaaTGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGt < 2:9575871/140‑1 (MQ=255)
aaaTGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGt < 1:2128238/140‑1 (MQ=255)
aaTGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTc < 1:4063818/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATCAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 2:7637720/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGTAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 1:5626950/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGGAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 1:4196900/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 1:8871665/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 2:5276725/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 1:4498556/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 1:4941035/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 2:8644076/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 2:8044650/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 1:943143/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 1:7810795/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTAATGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 2:8228128/140‑1 (MQ=255)
gAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAcc < 2:6665804/140‑1 (MQ=255)
gAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAcc > 1:1039982/1‑140 (MQ=255)
gAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAcc > 1:2968646/1‑140 (MQ=255)
gAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTGATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAcc < 2:9400672/140‑1 (MQ=255)
aGGGGTGGTATGTTGCGAGCCAATGAAAAAAGAACGCCATCTTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GGAG‑G‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGCAGTAAGAGTTGTGAATGTCAAGTTCTTGGTCACCt < 2:6379557/140‑1 (MQ=255)
ggggTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTg > 2:4623452/1‑140 (MQ=255)
gtggtATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTAt < 1:9329723/140‑1 (MQ=255)
tggtATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTAtt > 1:4716472/1‑140 (MQ=255)
gtATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGTTTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTgg > 2:2454545/1‑140 (MQ=255)
gtATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GGAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTgg > 1:6087804/1‑140 (MQ=255)
gtATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAAt < 1:3937577/82‑1 (MQ=255)
gtATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTgg > 1:3626646/1‑140 (MQ=255)
gtATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTgg > 2:1930560/1‑140 (MQ=255)
tGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGa < 1:3415740/140‑1 (MQ=255)
ttGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACg > 2:7846097/1‑140 (MQ=255)
gCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGcc < 2:6589525/140‑1 (MQ=255)
gCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGcc < 2:6936782/140‑1 (MQ=255)
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aGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCC‑CC‑GG‑TGG‑GG‑GG‑GAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTg < 2:3783281/140‑1 (MQ=255)
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ATGTGAGCGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GG‑T‑GGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGAAAAACTCGGCTGTCGCGTAAATT > NZ_CP025268/320465‑320761
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |