Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
A1 F50 I1 R1
|
782 |
316.7 |
10427156 |
97.0% |
10114341 |
138.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
RA |
NZ_CP025268 |
320,615 |
(G)6→7 |
intergenic (+482/‑44) |
rclR → / → ykgE |
reactive chlorine‑specific transcriptional regulator RclR/heterodisulfide reductase‑related iron‑sulfur binding cluster |
|
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
* | NZ_CP025268 | 320,609 | 1 | . | G | 96.7%
| 586.3
/ 11.6
| 181 | intergenic (+476/‑50) | rclR/ykgE | reactive chlorine‑specific transcriptional regulator RclR/heterodisulfide reductase‑related iron‑sulfur binding cluster |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (3/3); new base G (87/88); total (90/91) |
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 195 total aligned reads displayed.
AGCGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGT‑G‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGAAAAAC > NZ_CP025268/320470‑320743
|
aGCGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGt > 2:2563293/1‑140 (MQ=255)
aGCGATGCCGAAAGAAATAAAACTAGTTATTGCATGTGACGGTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATAGTTATTGATGAGTGATCGCCCGGt > 2:1521572/1‑140 (MQ=255)
cGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGT‑g‑g < 1:3698957/140‑1 (MQ=255)
cGATGCCGAAAGAAATAAAATTACTTATTGCATTTTACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTACGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGT‑g‑g < 2:3925859/140‑1 (MQ=255)
tGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGT‑g‑gg‑gg > 2:3181524/1‑140 (MQ=255)
gCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGT‑g‑gg‑ggg < 2:1423262/140‑1 (MQ=255)
gCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGT‑g‑gg‑ggg > 1:50183/1‑140 (MQ=255)
gCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGT‑g‑gg‑ggg > 1:3538576/1‑140 (MQ=255)
aaagaaaTAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGT‑g‑gg‑ggggaaa > 1:568596/1‑136 (MQ=255)
agaaaTAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACa < 2:4097298/140‑1 (MQ=255)
agaaaTAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACa > 2:3249195/1‑140 (MQ=255)
gaaaTAATTTTATTTATCGCTTTCGACGTTTGGATGAAAAAATATCATTTCTCATACAAATGAGCGCTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAATAGCGCCCTATTTCTTGATGATTGATCCCCCGGT‑G‑GGCGGGAAatat < 2:1769009/140‑1 (MQ=255)
gaaaTAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACAt < 2:2642692/140‑1 (MQ=255)
gaaaTAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACAt < 2:4820022/140‑1 (MQ=255)
aaaTAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATc < 1:2286743/140‑1 (MQ=255)
tAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATaaa < 1:748519/140‑1 (MQ=255)
aGTTTTTGCATTTGACGTTTGGATTACAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGT‑GTGG‑GGGAAACATCGGGCATAAAt < 2:1581875/140‑1 (MQ=255)
aGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAAt < 2:3605845/140‑1 (MQ=255)
aGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAAt > 1:5081620/1‑140 (MQ=255)
aGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAAt < 2:1474440/140‑1 (MQ=255)
ttGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCa < 1:4688131/140‑1 (MQ=255)
ttGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCa < 1:3896991/140‑1 (MQ=255)
ttGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCa < 2:2724837/140‑1 (MQ=255)
ttGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCa < 1:875060/140‑1 (MQ=255)
ttGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCa < 2:4983861/140‑1 (MQ=255)
gCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGGCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATg < 2:2420852/140‑1 (MQ=255)
gCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATg < 2:4111706/140‑1 (MQ=255)
gCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATg < 2:2946138/140‑1 (MQ=255)
tttGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAg < 1:3163992/140‑1 (MQ=255)
tttGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAg > 2:868849/1‑140 (MQ=255)
tGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTa < 2:4813200/140‑1 (MQ=255)
gACGTTTGGATGAAAGTTTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCCATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTaa < 1:2881341/140‑1 (MQ=255)
gACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTaa < 1:3817579/140‑1 (MQ=255)
gACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTaa < 1:1519417/140‑1 (MQ=255)
gACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTaa < 2:3202388/140‑1 (MQ=255)
gACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTAGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATGTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCCTGAAGTaa < 2:3111317/140‑1 (MQ=255)
aCGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAAt < 2:1985123/140‑1 (MQ=255)
gTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATgg < 2:1652315/140‑1 (MQ=255)
gTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATgg < 1:3170093/140‑1 (MQ=255)
ttGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGAGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAg > 1:4889408/1‑140 (MQ=255)
tGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCa > 1:4947488/1‑126 (MQ=255)
tGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCa < 2:4947331/126‑1 (MQ=255)
tGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGt > 1:4231095/1‑140 (MQ=255)
ggATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTa < 2:741189/140‑1 (MQ=255)
aTCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTaa > 1:4221454/1‑121 (MQ=255)
aTCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAAt > 1:5110896/1‑140 (MQ=255)
tttGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCa > 2:3059608/1‑140 (MQ=255)
tGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAAt > 1:102462/1‑140 (MQ=255)
tGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAAt > 2:4888215/1‑140 (MQ=255)
gTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAAtt > 1:2474637/1‑140 (MQ=255)
aCAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCttt < 1:3564108/140‑1 (MQ=255)
aaTGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTc < 2:4525786/140‑1 (MQ=255)
aTGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCa > 2:5149733/1‑140 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 1:2563410/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 1:165944/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 1:2325411/140‑1 (MQ=255)
tGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc < 2:3394070/140‑1 (MQ=255)
aGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCt < 1:1542078/140‑1 (MQ=255)
gggTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGt > 1:1053792/1‑140 (MQ=255)
gtggtATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTAt < 2:271344/140‑1 (MQ=255)
gtggtATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAAGGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTAt < 2:1500896/140‑1 (MQ=255)
tggtATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTAtt > 2:2583690/1‑140 (MQ=255)
agggaTGTGGCTAGCGACTTAGACAGGAACGCCATATTTATTGATGCTGGATCCTCCAGT‑G‑GGAGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGCAGGAAAGGAGTATTAGTTGTGACTGTCAATTTCTTTGTCACATGTAtt > 2:2635358/5‑140 (MQ=255)
gtATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTgg > 1:1239770/1‑140 (MQ=255)
gtATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTgg > 1:4599076/1‑140 (MQ=255)
gtATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTgg > 1:2783999/1‑140 (MQ=255)
gtATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTgg > 2:4758204/1‑140 (MQ=255)
gcaTGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGGAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTgg > 2:4296829/3‑140 (MQ=255)
tGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGa < 1:3384441/140‑1 (MQ=255)
gCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACCTCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGAATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGcc < 2:4591833/140‑1 (MQ=255)
cTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGGTGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGGAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTAGTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAGCTGTATGGGTGACGgcc > 2:2783629/1‑140 (MQ=255)
cTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCAc > 2:4224225/1‑123 (MQ=255)
cTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGccc > 1:691719/1‑140 (MQ=255)
cTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTAGTCACCTGTATTGGTGACGccc > 1:3750746/1‑140 (MQ=255)
aGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGGAATGGAGGATTCGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTg > 2:3762464/1‑140 (MQ=255)
gCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGa > 1:3048758/1‑140 (MQ=255)
gCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGa > 1:1941413/1‑140 (MQ=255)
gCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGa > 1:4434781/1‑140 (MQ=255)
gCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGa > 2:174070/1‑140 (MQ=255)
ccAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGaa < 1:3135506/140‑1 (MQ=255)
aTTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATc > 1:2720054/1‑140 (MQ=255)
aTTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATc > 1:3256715/1‑140 (MQ=255)
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ttAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCCGGTGG‑GG‑GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCa > 1:441922/1‑140 (MQ=255)
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TGATTGATCCCCC‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGAAAAAC > SRR14920191.5134210/1‑151 (MQ=60)
GATCCCCC‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGAAAAACTCGGC < SRR14920191.94127/151‑1 (MQ=60)
ATCCCCC‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACGCCGTGCTGCTACTGGAAAAACTCGGCT > SRR14920191.4090449/1‑151 (MQ=60)
CCC‑GGTGGGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGAAAAACTCGGCTGTCG > SRR14920191.2048459/1‑151 (MQ=60)
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GGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGAAAAACTCGGCTGTCGCGTAAATTT > SRR14920191.2938873/1‑151 (MQ=60)
GGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGAAAAACTCGGCTGTCGCGTAAATTTC > SRR14920191.561682/1‑151 (MQ=60)
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ATGTGAGCGATGCCGAAAGAAATAAAATTAGTTATTGCATTTGACGTTTGGATGAAAGATTATCATTTGTCATACAAATGAGGGGTGGTATGTTGCTAGCCAATTAAAAAAGAACGCCATATTTATTGATGATTGATCCCCC‑GGT‑GGGGGGAAACATCGGGCATAAATGGGCATGAAGTAATGGAGTATTAGTTGTGAATGTCAATTTCTTTGTCACCTGTATTGGTGACGCCCTGAAATCAAGAATGGCACGAGACTCCGTGCTGCTACTGGAAAAACTCGGCTGTCGCGTAAATTTC > NZ_CP025268/320465‑320763
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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |