Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R3
|
782 |
676.6 |
23254289 |
97.6% |
22696186 |
138.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
2,033,768 |
(C)5→6 |
pseudogene (190/920 nt) |
yedA → |
drug/metabolite exporter YedA |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 2,033,763 | 1 | . | C | 96.3%
| 1891.7
/ 59.1
| 571 | pseudogene (185/920 nt) | yedA | drug/metabolite exporter YedA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (13/8); new base C (254/289); total (272/299) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.88e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 639 total aligned reads displayed.
TTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑CCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGCC > NZ_CP025268/2033624‑2033897
|
gTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑cc > 2:2506732/1‑140 (MQ=255)
gTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑cc > 2:7169522/1‑140 (MQ=255)
gTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATGTTTGATACTGCGCGGACACAAAC‑T‑cc > 2:6866861/1‑140 (MQ=255)
atctcctttGGGGCACAACCTATCTGGTCCTTCGGAATGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAAAGATGGCGGGCGTTCGATGCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑cccc < 2:8093614/134‑1 (MQ=255)
atatCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑cccc > 2:5174299/1‑140 (MQ=255)
tttGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑cccc‑ccgcta > 2:10158056/1‑135 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGACAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGt > 2:8523841/1‑140 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACga > 1:3410974/1‑139 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGt > 1:5217878/1‑140 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGt > 1:7907500/1‑140 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGt > 2:1534031/1‑140 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑cccc‑ccgct > 1:1912743/1‑132 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑cccc‑ccgct < 2:1912743/136‑5 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAAAGATGGCGGGCGTTCGATTCATGGCAGCCGGTATTTTATTGCTTGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGt > 2:2129909/1‑140 (MQ=255)
ggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTcc > 1:9174609/1‑140 (MQ=255)
ggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTcc > 1:11292574/1‑140 (MQ=255)
gCTCAACCTATTTTGTCCTTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCg < 2:5031314/140‑1 (MQ=255)
cAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCgctg > 2:3651205/1‑140 (MQ=255)
aCCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCgctgct < 1:10727912/140‑1 (MQ=255)
ttttGTCAGTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑CCCC‑CAGCTACGTCCGCTGCTCAATg < 1:701026/140‑1 (MQ=255)
gTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCcgc < 1:1039289/140‑1 (MQ=255)
gTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCcgc < 2:3940323/140‑1 (MQ=255)
gTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATATTATTGATGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCGGCTCAATGCcgc > 1:429831/1‑140 (MQ=255)
tCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCcgcg < 1:4952229/140‑1 (MQ=255)
cATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCgcgc > 1:3624307/1‑140 (MQ=255)
cATTCGGAGTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCgcgc < 1:151752/140‑1 (MQ=255)
aTTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTCTTGTAGTGCTGGCATTTTTGCGACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTCCGCCCGCTGCTCACTGCCGCGCt > 2:11310496/1‑140 (MQ=255)
ttCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTg > 1:10880637/1‑140 (MQ=255)
ttCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTg > 1:8263028/1‑140 (MQ=255)
gATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTg < 2:8346787/140‑1 (MQ=255)
ttGGCGTGGACAGCTGGCCTCCGGTAATGATGGCGGGCGTTCGATGCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTGGCTACTGCGCGGACACAAACGC‑CCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATGGGc < 2:4841149/140‑1 (MQ=255)
ttGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTACTGAGGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCACTGCCGCGCTGATTGGc < 2:9544951/140‑1 (MQ=255)
tGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGcc < 2:6960681/140‑1 (MQ=255)
ggCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCt < 1:10132631/140‑1 (MQ=255)
gCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTg < 2:7378532/140‑1 (MQ=255)
gAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTAtt < 1:11582980/140‑1 (MQ=255)
aaaGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTg < 1:10976565/140‑1 (MQ=255)
aGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGGTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTTCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgct < 1:9485411/140‑1 (MQ=255)
cTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctgg < 2:550240/140‑1 (MQ=255)
cTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctgg > 2:1646906/1‑140 (MQ=255)
cTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctgg < 1:8018584/140‑1 (MQ=255)
cTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTAGTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctgg < 2:2696329/140‑1 (MQ=255)
ggCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTTGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGATACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctggct < 2:2339235/140‑1 (MQ=255)
ggCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctggct < 1:4124476/140‑1 (MQ=255)
ccTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGt < 1:6558060/140‑1 (MQ=255)
ccTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGAGTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTCGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTAGTGCTGGCTGt < 2:8946746/140‑1 (MQ=255)
cTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTc < 2:1377786/140‑1 (MQ=255)
cGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGt > 1:10245610/1‑140 (MQ=255)
gTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTa < 2:410694/140‑1 (MQ=255)
ttAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTaa > 1:632256/1‑140 (MQ=255)
atgatgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATgg > 1:5515948/1‑140 (MQ=255)
atgatgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATgg < 2:1042650/140‑1 (MQ=255)
tgatgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGc < 1:3848517/140‑1 (MQ=255)
tgatgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGc > 1:1752791/1‑140 (MQ=255)
tgatgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGc < 2:7576636/140‑1 (MQ=255)
ggcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATgg > 1:7529815/1‑140 (MQ=255)
ggcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATgg > 2:6532145/1‑140 (MQ=255)
ggcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATgg < 2:6298000/140‑1 (MQ=255)
ggcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATgg > 2:6128515/1‑140 (MQ=255)
ggcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATgg > 1:6851198/1‑140 (MQ=255)
ggcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATgg > 2:5930303/1‑140 (MQ=255)
ggcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATgg > 1:10580435/1‑140 (MQ=255)
cgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATg > 2:5346493/1‑137 (MQ=255)
ttCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGATGGCTTTTTTGCTTCTGCGCGGACACAAAA‑T‑CCCCAC‑GCTACGTCCGATGCTCAATGCCGCGCTGCTTGGCGTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGGATGGAGACGGtt > 2:8030253/1‑140 (MQ=255)
ttCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGa < 1:6641759/140‑1 (MQ=255)
cTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACACAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGACCGCGGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGGTAGTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGCCGGTTGCCGAACa < 2:3070132/140‑1 (MQ=255)
tGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACAt < 1:1138413/140‑1 (MQ=255)
ccGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAAt > 2:10808644/1‑140 (MQ=255)
ccGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAAt > 2:4345294/1‑140 (MQ=255)
ggTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGt > 1:8537876/1‑140 (MQ=255)
aTTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATgg < 1:3046390/102‑1 (MQ=255)
aTTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCg > 1:5929965/1‑140 (MQ=255)
cTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCAt > 1:3158119/1‑140 (MQ=255)
cTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCAt > 2:8699497/1‑140 (MQ=255)
ggCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATcg > 1:2296834/1‑140 (MQ=255)
ttGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGt < 1:2685336/140‑1 (MQ=255)
tGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTa < 1:903372/140‑1 (MQ=255)
tGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTa < 1:1117049/140‑1 (MQ=255)
tGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTa < 1:8110067/140‑1 (MQ=255)
cTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGt < 1:4362123/140‑1 (MQ=255)
cTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑C‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGt < 1:4657750/140‑1 (MQ=255)
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GCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACT‑C‑CCCC‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGCCCCTCTTTACCCTGTGCTTCAG > NZ_CP025268/2033621‑2033918
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |