Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R4
|
781 |
701.7 |
22683696 |
98.1% |
22252705 |
139.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
2,033,768 |
(C)5→6 |
pseudogene (190/920 nt) |
yedA → |
drug/metabolite exporter YedA |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 2,033,763 | 1 | . | C | 96.0%
| 1934.1
/ 65.9
| 577 | pseudogene (185/920 nt) | yedA | drug/metabolite exporter YedA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (19/4); new base C (229/324); total (249/328) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.24e-04 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 636 total aligned reads displayed.
TTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑CCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGCC > NZ_CP025268/2033624‑2033897
|
gTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑cc > 2:5141270/1‑140 (MQ=255)
gTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑cc > 2:1324546/1‑140 (MQ=255)
atatCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑cccc > 2:9821444/1‑140 (MQ=255)
atatCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑cccc > 2:11195236/1‑140 (MQ=255)
atatCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑cccc > 2:6050102/1‑140 (MQ=255)
tttGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑cccc‑ccgcta > 1:8558400/1‑135 (MQ=255)
tttGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑cccc‑ccgcta > 1:3225404/1‑135 (MQ=255)
tttGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑cccc‑ccgcta > 2:252992/1‑135 (MQ=255)
ggtgCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCTTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTAGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGAGCGGACACAAAC‑T‑CCCCACGCTACGt > 2:2400092/4‑140 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTCTGTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGt > 2:2677918/1‑140 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGt > 2:3323641/1‑140 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGt > 1:4607677/1‑140 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGt > 2:5595832/1‑140 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGt > 1:6853214/1‑140 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGt > 2:2271420/1‑140 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCATTGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGt > 2:1878914/1‑140 (MQ=255)
gggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTc < 1:9591031/140‑1 (MQ=255)
ggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTcc > 1:8835528/1‑140 (MQ=255)
gcacAACCTATTATGACATGCTGATTGTCGTGGAAAGCTGGCCGCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTCTCAGCCGCTATTATATTGATGGCAGTTTAGCTACTGAGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCAACGTCCg > 2:2720490/4‑140 (MQ=255)
gCTCATCCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCg < 2:7674721/140‑1 (MQ=255)
gCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCg < 1:4094280/140‑1 (MQ=255)
gCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCg < 1:5745942/140‑1 (MQ=255)
tCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCgct > 1:3856986/1‑140 (MQ=255)
cAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCTTGGAATGATGGCCTCCGTTAATGATGGAGGGCGTTCGAGTCCTGGCAGACGGTAATGTATATATGGCCTGTTTGCTACTGCTCGGACACAAACAC‑CCCC‑CGCTAAGTCCgctg > 2:6346921/1‑140 (MQ=255)
cAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGAGTCGAAAGCTGGCCGCCGTTAATGATGGCCGGCGTTCGATTCCGCGCAGCCGGTATTTTATTGCTGTCATTTTTGCTACAGCGCTGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCGACGTCCgctg > 2:5884293/1‑140 (MQ=255)
cAACCTATTATGTCATTCGGATTGGAGTGGAAAGATGGCCTCCGTTAATGATGGAGGGCCTTCGATTCCTGGCCGCCGGTATTTGAGAGCTGGCATTTTTGCTACGGCGCGGTCACAAAC‑TCCCCC‑CGCTCCGTCCgctg > 2:10030985/1‑140 (MQ=255)
aaCCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTGATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATATTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCgctgc > 2:3577890/1‑140 (MQ=255)
aaCCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCgctgc > 1:2965643/1‑140 (MQ=255)
ttGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGcc < 2:8381111/140‑1 (MQ=255)
tCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGa < 2:4645918/140‑1 (MQ=255)
cGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGAt > 1:6169729/1‑140 (MQ=255)
cGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGAt < 1:10041591/140‑1 (MQ=255)
cGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGAt > 1:3755354/1‑140 (MQ=255)
cGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGAt < 2:866888/140‑1 (MQ=255)
cGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGAt > 1:2452552/1‑140 (MQ=255)
cGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGAt < 1:1318817/140‑1 (MQ=255)
aTTGGCGTGGAATGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTCGTGTATTGCTGGCCTTTTTGCTACTGCGCGGACCCAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCGGATTgg > 2:9403723/1‑140 (MQ=255)
aTTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTgg < 2:857823/140‑1 (MQ=255)
ttGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGc < 1:4434579/140‑1 (MQ=255)
gCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTg < 1:6649477/140‑1 (MQ=255)
aaGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgc < 1:9817511/140‑1 (MQ=255)
aaGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgc < 1:1158373/140‑1 (MQ=255)
cTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctgg > 1:192975/1‑140 (MQ=255)
cTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctgg < 1:10881491/140‑1 (MQ=255)
cTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTAGTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctgg < 2:6821335/140‑1 (MQ=255)
gCCACCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATATTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCAGCGCTGGGTGGGCGGTTATTgctggcgg > 1:1056418/1‑138 (MQ=255)
ccTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGt > 2:2896616/1‑140 (MQ=255)
cGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGt < 1:5290639/140‑1 (MQ=255)
ttAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTaa > 1:9012853/1‑140 (MQ=255)
atgatgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATgg < 2:10830230/140‑1 (MQ=255)
tgatgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGc < 1:2809354/140‑1 (MQ=255)
tgatgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGc < 1:9101150/140‑1 (MQ=255)
tgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATg < 1:10184974/140‑1 (MQ=255)
ggcgggcgTTCGATTCCTGGCCGCCGGTTTGTTAGTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACTCAAAC‑T‑CCCCGCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGGGCTGATTGGGCGGTTATTGCTGGCTGACGGTAATGGCATgg > 2:922836/1‑140 (MQ=255)
ggcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATgg > 1:7441934/1‑140 (MQ=255)
ggcgggcgTTCGATTCATGGCAGCCGGTCTTTTATTGCGGGCAGTTTTGCTACTGCGCGGACAGAATG‑TCCCCC‑CGCTCCGTCCGCTGCTCTATGCCGCGCGGAGTGGCGTGGTCTGGGGGGCTGTCGGTCAGGGctggg > 2:7829706/1‑136 (MQ=255)
cgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTAGTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAA‑TACCCC‑CGCTACGGCCGCTGCTCCATGCCGCGCTGATGGGCCTGTTATTGCTGGCGGTCGGTAATGGCATGGTg > 1:7285072/1‑140 (MQ=255)
gggcgTTCGCGTCCGGGCAGCCGGTATTGTATTGCTGGCATTTTTGCGACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCGACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTGAGTGCTGGCTGGCGGTACTGGCATGGTGa < 2:1442290/140‑1 (MQ=255)
aTTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCg < 1:4871555/140‑1 (MQ=255)
cTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACa < 2:4351985/140‑1 (MQ=255)
gCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCa > 1:11158551/1‑140 (MQ=255)
ccGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAAt > 1:1666958/1‑140 (MQ=255)
ccGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCAGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAAt > 2:3093860/1‑140 (MQ=255)
ggTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGt > 1:3620036/1‑140 (MQ=255)
gTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGtt < 2:7172052/140‑1 (MQ=255)
tttATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGttcctt < 1:8243465/140‑1 (MQ=255)
cTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCTGctt > 2:10405701/1‑138 (MQ=255)
cTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCAt > 1:2100388/1‑140 (MQ=255)
cTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCAt > 2:613213/1‑140 (MQ=255)
gCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACGC‑CCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATcgc < 2:8791179/140‑1 (MQ=255)
cATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATcgcc < 1:6283767/140‑1 (MQ=255)
aTTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATcgccg < 1:6380928/140‑1 (MQ=255)
tGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCCGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTa < 1:10293816/140‑1 (MQ=255)
cTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGt < 1:6972012/140‑1 (MQ=255)
aCTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTgg > 2:4778050/1‑140 (MQ=255)
cTGCGCGGACACACAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGt < 1:7074935/140‑1 (MQ=255)
gcgcGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTg > 2:11329184/1‑140 (MQ=255)
gcgcGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTg < 1:1497033/140‑1 (MQ=255)
gcgcGGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCAGCTCAATGCCGCGCTGATTCGCCTGATATAGCTGGCAGTCGGTAATGGCATGGAGACGGTAGCCCAACATCAAAAAGTACCTACCCGCATCGCCGCCGAAGTCGTTg > 2:402771/1‑140 (MQ=255)
cgcgGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGc > 1:2182585/1‑140 (MQ=255)
cgcgGACACAAAC‑TCCCCC‑CGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGc > 2:1621149/1‑140 (MQ=255)
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AAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCC‑‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGT < SRR14920199.1163271/151‑1 (MQ=60)
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TGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCC‑‑GCTACGCCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAAC < SRR14920199.6072670/151‑1 (MQ=60)
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CTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCC‑‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCG < SRR14920199.9063758/151‑1 (MQ=60)
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GACACAAACTCCCCCC‑‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGCCCCTCTT > SRR14920199.6447077/1‑151 (MQ=60)
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|
TTGCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACT‑CCCCC‑‑GCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGCCCCTCTTTACCCTGTGCTTCAG > NZ_CP025268/2033619‑2033918
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |