Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R2
|
781 |
700.4 |
23289492 |
98.5% |
22940149 |
138.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
2,033,768 |
(C)5→6 |
pseudogene (190/920 nt) |
yedA → |
drug/metabolite exporter YedA |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 2,033,763 | 1 | . | C | 98.5%
| 2302.5
/ 21.5
| 669 | pseudogene (185/920 nt) | yedA | drug/metabolite exporter YedA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (8/2); new base C (316/341); total (326/343) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.71e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 731 total aligned reads displayed.
TTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑T‑CCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGCC > NZ_CP025268/2033624‑2033897
|
gTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑T‑cc > 1:5857129/1‑140 (MQ=255)
gTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑T‑cc > 2:2826387/1‑140 (MQ=255)
gTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTAATGCGCGGACACAA‑AC‑T‑cc > 2:11200414/1‑140 (MQ=255)
tataTCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑T‑ccc < 1:1402227/140‑1 (MQ=255)
atatCATTTTGGGCACAACCAATGTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGATCGATTCCTGGCAGCAGGTCTTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGCACACCA‑CC‑T‑cccc > 2:6223012/1‑140 (MQ=255)
atatCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGACTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACCCAA‑TC‑T‑cccc > 2:7817692/1‑140 (MQ=255)
ttGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTAc < 1:2170084/140‑1 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGTCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCAATTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGt > 2:8651604/1‑140 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTCCTGCGCGGACACAATAT‑A‑CCCCCGCTACGt > 2:3601988/1‑140 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGt > 2:4011412/1‑140 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGt > 1:4361519/1‑140 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGt > 1:7807529/1‑140 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGt > 2:5895662/1‑140 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGt > 2:6422439/1‑140 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGt > 2:7230161/1‑140 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGt > 2:9784100/1‑140 (MQ=255)
ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGATAGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGATGGCATTTTTGCTACTGCTCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGt > 2:10034307/1‑140 (MQ=255)
ggggCCCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGt > 1:7609717/1‑140 (MQ=255)
ggCTCAACCCATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTcc > 1:7042932/1‑140 (MQ=255)
gCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCg < 2:2124646/140‑1 (MQ=255)
gCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCg < 1:4279403/140‑1 (MQ=255)
tCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCgct > 1:10427165/1‑140 (MQ=255)
cAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCgctg > 1:7280703/1‑140 (MQ=255)
aaCCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCgctgc > 1:5550589/1‑140 (MQ=255)
gTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCcgc < 1:933416/140‑1 (MQ=255)
gTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCcgc < 1:6526064/140‑1 (MQ=255)
tCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCcgcg < 1:6056412/140‑1 (MQ=255)
cGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGAt < 1:8628761/140‑1 (MQ=255)
aTTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTgg < 2:3856913/140‑1 (MQ=255)
ttGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGc < 1:7981211/140‑1 (MQ=255)
tGGCGTGGACAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGAATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGcc < 2:2426460/140‑1 (MQ=255)
cGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGAGTGGCCTGt > 1:3231837/1‑140 (MQ=255)
gAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTAtt > 2:3340019/1‑140 (MQ=255)
cTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctgg > 1:3955601/1‑140 (MQ=255)
cTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctgg < 2:10179139/140‑1 (MQ=255)
ggCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctggct < 1:10629975/140‑1 (MQ=255)
ggCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctggct < 2:6881237/140‑1 (MQ=255)
ccTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGt < 1:4638594/140‑1 (MQ=255)
cTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCg > 1:8795934/1‑98 (MQ=255)
cTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCg < 2:8795934/98‑1 (MQ=255)
ccGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCgg < 1:693520/140‑1 (MQ=255)
cGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑t < 2:10340375/79‑1 (MQ=255)
cGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGt > 2:3735150/1‑140 (MQ=255)
cGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGt < 1:4969887/140‑1 (MQ=255)
gTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTa < 1:8994209/140‑1 (MQ=255)
ttAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTaa < 1:27821/140‑1 (MQ=255)
atgatgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATgg < 2:11573328/140‑1 (MQ=255)
tgatgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGc < 2:7405573/140‑1 (MQ=255)
tgatgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGc < 2:1431603/140‑1 (MQ=255)
tgatgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGc < 1:11066606/140‑1 (MQ=255)
gatgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATGTGAGTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGAGTGGCGTGTTCTTGCTGGCTGTCGGTAAGGGCa > 2:9609596/1‑140 (MQ=255)
tgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATg < 2:4852710/140‑1 (MQ=255)
ggcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTcatggcatgg > 2:7016236/1‑140 (MQ=255)
ggcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGc < 2:8974077/136‑1 (MQ=255)
ggcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATgg > 2:4132654/1‑140 (MQ=255)
ggcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATgg > 1:3815557/1‑140 (MQ=255)
ggcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTAATGCTGGCTGTCGGTAATGGCATgg > 1:8537917/1‑140 (MQ=255)
ggcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGGATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATgg > 1:9635245/1‑140 (MQ=255)
gcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGt < 1:5295693/140‑1 (MQ=255)
gggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGa < 1:3042594/140‑1 (MQ=255)
ttCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGCTGCCGa < 1:2722277/140‑1 (MQ=255)
tCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGaa < 1:10240804/140‑1 (MQ=255)
tGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACAt > 1:10846334/1‑140 (MQ=255)
ggCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATc > 2:8523351/1‑140 (MQ=255)
ggCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATc > 1:1168833/1‑140 (MQ=255)
ccGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAAAGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATTGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAAt > 1:2490257/1‑140 (MQ=255)
ccGGGAGTTTATTGCTGGCATTTTTGCTCCTGCGCGGACACAA‑ACGC‑CCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCGTGTTATTGCTGGCTGTCGGTACTGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAAt > 2:5025458/1‑140 (MQ=255)
gTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGtt < 2:5672040/140‑1 (MQ=255)
aTTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGttcc > 1:11221093/1‑140 (MQ=255)
aTTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCg > 2:10834752/1‑140 (MQ=255)
cTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCAt > 1:4849635/1‑140 (MQ=255)
cTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCAt > 1:6216987/1‑140 (MQ=255)
cTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCAt > 1:1735616/1‑140 (MQ=255)
cTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCAt > 1:1581147/1‑140 (MQ=255)
ggCATTTTTGCTACTGCGCGGCCACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCGGGTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACTTCATCATGTTCGTTCCGGCATcg > 2:11458290/1‑140 (MQ=255)
ggCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctgg < 2:4740283/83‑1 (MQ=255)
ggCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGATGCCGAACATAAAAATGTTCCTTCCGGCATcg > 2:1730279/1‑140 (MQ=255)
gCATTATAGCTACAGCGCGGACACCA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCACACTGCCTCGCTGATGGGCCTGTAATTCCTGGCTGTCGCTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATcgc < 2:9253205/140‑1 (MQ=255)
cATTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAAGGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAAAGTTCCTTCCGGCATcgcc < 1:1001125/140‑1 (MQ=255)
aTTTTTGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATcgccg < 1:11527926/140‑1 (MQ=255)
tttGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGccgccg < 2:1282302/140‑1 (MQ=255)
tttGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGccgccg < 2:7609717/140‑1 (MQ=255)
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tGCTACTGCGCGGACACAA‑AC‑TCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTa < 2:2533809/140‑1 (MQ=255)
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ATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAAT > SRR14920161.7039050/1‑151 (MQ=60)
ATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAAT < SRR14920161.3362553/151‑1 (MQ=60)
TTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATG < SRR14920161.1446746/151‑1 (MQ=60)
TTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGCTGCCGAACATCAAAATG < SRR14920161.2740536/151‑1 (MQ=60)
TCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGT < SRR14920161.10309353/151‑1 (MQ=60)
CTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTC < SRR14920161.4578907/151‑1 (MQ=60)
TGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCC > SRR14920161.11296143/1‑151 (MQ=60)
CGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGC < SRR14920161.10360496/151‑1 (MQ=60)
GGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCA > SRR14920161.5993613/1‑151 (MQ=60)
gccttatacTGCTGGCATTAGTGCGACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCCCTACGTCCGCTCCTCACTGCCGCGCTGATGGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCAT < SRR14920161.11657707/142‑1 (MQ=60)
GTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCAT < SRR14920161.4351797/151‑1 (MQ=60)
GTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCAT > SRR14920161.5604483/1‑151 (MQ=60)
GTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCAT > SRR14920161.1747147/1‑151 (MQ=60)
GTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCAT > SRR14920161.6452045/1‑151 (MQ=60)
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ATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCG > SRR14920161.1950997/1‑151 (MQ=60)
GGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTG < SRR14920161.11432717/151‑1 (MQ=60)
CATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGT > SRR14920161.4094394/1‑151 (MQ=60)
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TTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTG > SRR14920161.843740/1‑151 (MQ=60)
TTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTG > SRR14920161.2504597/1‑151 (MQ=60)
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GCGCGGACACAAACTCCCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGCCC > SRR14920161.661466/1‑151 (MQ=60)
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|
GCGTTGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACT‑CCCCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGCCCCTCTTTACCCTGTGCTTCAG > NZ_CP025268/2033621‑2033918
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |