Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F21 I1 R2
|
777 |
572.4 |
18918554 |
98.5% |
18634775 |
138.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
1,598,952 |
(C)9→8 |
pseudogene (3955/5423 nt) |
CXP41_RS08400 ← |
ECSE_1600 family autotransporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 1,598,944 | 0 | C | . | 95.1%
| 2320.4
/ 103.2
| 548 | pseudogene (3963/5423 nt) | CXP41_RS08400 | ECSE_1600 family autotransporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (11/15); new base . (195/313); total (207/341) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.85e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 594 total aligned reads displayed.
AACGTCATCAGGCCATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGCCCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTCCCCCCCCA > NZ_CP025268/1598805‑1599077
|
aaCGTCATCAGGCCATTGTTTCCTGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCACCCCGTCGCTATTCTTTTGAACCGTGCCGCCAATCTCCAGGTTGCCGCCGAGAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGc > 2:6572229/1‑140 (MQ=255)
aCGTCATCAGGCCATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGcc < 1:4662386/140‑1 (MQ=255)
cGTCATCAGGCCATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGGTTCCCCCCTTCGCTATTCATGTGAAGCGTGCCGCCATTCTCCGGGTTGCCGGCGATAGTGGTTGTTGCGTGACGCCGTGcgc > 1:1390176/1‑138 (MQ=255)
catcaGGCCATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGcccccc < 2:3735387/140‑1 (MQ=255)
atcaGGCCATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGccccccc < 1:9360874/140‑1 (MQ=255)
tcaGGCCATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGcccccccc < 1:8191870/140‑1 (MQ=255)
tcaGGCCATTGTTTCCGGTATAGTATCCGTAAACGTTCAGTACATTCCCCGGGTTCCCACCTTCGCTATTCATTTTAACCGTTCCGCCATTCTCAATGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGcccccccc < 2:2750449/140‑1 (MQ=255)
aGGCCATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGccccccccag < 1:2889024/140‑3 (MQ=255)
cATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGCACCGTGCCGCCAGTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCAt < 2:9059610/140‑1 (MQ=255)
cATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCNATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCAt < 1:6275273/140‑1 (MQ=255)
cATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACACTCCCCGGTTTCCCCCCATCGCTATTCAGTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGGTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCAt < 2:3559433/140‑1 (MQ=255)
aTTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATa < 1:6828234/140‑1 (MQ=255)
ctggttCCTGTATAGTAGCCGTTACCGGACCGTACAGTCCCCGGGTTCCCCCCTACGCTATTCCTTTGAACCGCGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCAGATACTATTTTTAGCGACACTCCGTG‑CCCCCCCCAGGCATaa < 2:2059346/136‑1 (MQ=255)
gTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACg < 1:5906450/140‑1 (MQ=255)
gTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACg < 1:1797671/140‑1 (MQ=255)
ccGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCa > 2:6739358/1‑140 (MQ=255)
cGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCat < 1:3662514/140‑1 (MQ=255)
cGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCat < 1:1089963/140‑1 (MQ=255)
ggTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCGTCGCTATTCAGTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGAGAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑GCCCCCCCGGGCGTAACGTTCgta > 1:2363221/1‑140 (MQ=255)
gTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTAAATACCCCGGTTACCCCACATCGCTATACATTTCAACCGATCCGCCAATCTCCAGGAATACGCCGATAGAGTTATTAGCTACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCatat > 2:6959509/1‑140 (MQ=255)
ttGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATGCCTTTGTACCGTGCCGCCCTTCTCCAGGTTGCCGCCGTTAGTGGTGTTCGCGACACGCAGTG‑CGCCCCCCGGGCTTACCGTTCGTGTCACCTg > 1:5821078/1‑140 (MQ=255)
ccGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAg < 1:3359756/140‑1 (MQ=255)
gTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCTGGCATAACGTGCATATCACCTGCAgtg > 1:1591166/1‑140 (MQ=255)
gTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAgtg < 1:5704903/140‑1 (MQ=255)
aCGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCGTCGCTATGCCTTGGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGTTTGCCGCCGAGAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCCGTGGTGa < 2:5918844/140‑1 (MQ=255)
tCAGTACATTCCCCGGTCTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCCGTG‑CCCCCCCCAGGCATATCGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACAtt > 2:4392943/1‑140 (MQ=255)
cAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGTCACGCAGTGCCCCCCCCC‑GGCGTAACGGGCATATCGCCGGCCGTGGTGGCAttt > 1:3849076/1‑140 (MQ=255)
ggacagaccccGGTTTCCCCCCCTCGCTATACACTTCACCCGTGCCGCCATACTCCAGGTAGCCGCCGAGAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCACGCATACCGTTCAGATCACCTCCAGTGGTGACCTGTcc < 2:8506788/133‑1 (MQ=255)
gTACATGCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATCGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTcc < 1:5432951/140‑1 (MQ=255)
gTACAGTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTcc < 1:1006427/140‑1 (MQ=255)
ttCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCATGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGTTGACATTTCCCGACa < 2:7214919/140‑1 (MQ=255)
tCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACAt > 1:6493443/1‑140 (MQ=255)
tCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTAATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACAt < 2:7624717/140‑1 (MQ=255)
tCCACGGATACCCCACTTCTCTATTCATTTTAAACTTTACGCCATTCTACAGGTTGCCGCAGAAAGTGCTTTTAGCGACACGCAGTG‑AAACACACAGGCAAAACGTTCATATCACATGCAGTGGTGACATTTCCAGACAt > 2:6311218/1‑140 (MQ=255)
ccccGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCCTTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCTTTACGGTCATATCACCTGCTGTGGTGACAGTTCCCGACagc > 2:1798813/1‑138 (MQ=255)
ccccGGTTTCACCCCTTCGCTATTCATTTGAAACGTGCAGCCGTTCTCCAGGTTGCCGACGATATTGGTTTTTGCGTAACGCATTG‑CACACCCCAGGAATAACGTTCATATCAACTGCAGTGGTGACATTTCCCGAAATc > 2:3250200/1‑140 (MQ=255)
cccGGTTTCCCCCCTCCGCTATTCAATTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGATTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACCTca < 1:2183676/140‑1 (MQ=255)
cGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATcaca < 1:2805099/140‑1 (MQ=255)
gggttCCCCCCTGCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATGCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTGTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATCCCGTTCAGAGCCCCTGCAGGGGTGACATTTCCCGACATCacac > 2:3005204/4‑140 (MQ=255)
ggTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGTACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGAGAGTGGGTTTAGCGACACGCTGTG‑CCCCACCAAGGCATTACGGTCATATCACGTGCAGTGGTGACCTTTACAGACATCacac > 2:1762931/1‑140 (MQ=255)
ggTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGCCCCCCCCC‑GGCATAACGTTCATATCACCTGCa > 1:3197901/1‑115 (MQ=255)
ggTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTc < 1:3708532/103‑1 (MQ=255)
ggTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCacac < 1:5997990/140‑1 (MQ=255)
ggTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCacac > 2:8269739/1‑140 (MQ=255)
ggTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGGTCATATCACCTGCCGTGGTGACATTTCCCGACATcaccc > 1:3520351/1‑138 (MQ=255)
ggTGTCCCCCCGTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCTTTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCacac < 2:9210198/140‑1 (MQ=255)
tttCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCg < 1:5286684/140‑1 (MQ=255)
tttCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCg < 1:8696398/140‑1 (MQ=255)
tttCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCg < 1:3028281/140‑1 (MQ=255)
tttCCCCCCTGCGCTATTCCTTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGCTAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGCCCCCCCCC‑GGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCg < 2:3417737/140‑1 (MQ=255)
tgtCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCAGTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACCCGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGCCATCACACCg < 2:1366590/138‑1 (MQ=255)
ttCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCAGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGc < 1:2274301/140‑1 (MQ=255)
tCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGcg > 1:417566/1‑139 (MQ=255)
ccccTTCTCAAAACATTAGAACCGTCCCCCCACTCTCCATGTATCCTCCGATAGTGGTTTTACCGACACGCAGT‑CCCCCCCCCACCCATAACGTTCAAATCACCTGCACTGGTGACATTTCCCGACATCACACCCCTGtt < 2:8059574/140‑1 (MQ=255)
ccccTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGtt < 1:6597143/140‑1 (MQ=255)
ccccTTCGCTATTCATTTGAACCGAGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTATGGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACTTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGtt < 2:8757647/140‑1 (MQ=255)
ccTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTAt < 1:441171/140‑1 (MQ=255)
tCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGa > 2:5568669/1‑140 (MQ=255)
cGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTGCATATCACCTGCCGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGag > 1:7675588/1‑139 (MQ=255)
gCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCACGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCACGACATCACACCGCTGTTATGGata < 1:8327150/140‑1 (MQ=255)
tATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATAtt < 1:8526930/140‑1 (MQ=255)
ttCATTTGAACCTTTCCGCCAATCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGAGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGTCATAACGTTCATATCACCTGCATTTGTGACATTTCCCTTCCTCACACCGCTGTTATTGATATTaa < 2:1970033/140‑1 (MQ=255)
ttCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTaa < 1:5568669/140‑1 (MQ=255)
agttGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATATCGTTCATAGCACCTGCAGTGGTGACCTGTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGAGATTAAtgt > 2:4223299/3‑140 (MQ=255)
ttGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTcc < 1:4817767/106‑1 (MQ=255)
aaCCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGa > 2:5248257/1‑140 (MQ=255)
aCCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGAc < 1:5009549/140‑1 (MQ=255)
aCCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGAc < 1:9250286/140‑1 (MQ=255)
tGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACCTCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGTCTTGc > 1:669276/1‑140 (MQ=255)
tGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACt < 1:8838339/137‑1 (MQ=255)
tGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGc > 2:5387473/1‑140 (MQ=255)
tGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGc > 1:5164690/1‑140 (MQ=255)
tGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGc > 2:5681514/1‑140 (MQ=255)
tGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑‑CCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGcc > 1:3926054/1‑140 (MQ=255)
gccgccATTCTCGTGGTTGCCTCCGATATTGGTTTTAGCGACACGCAGT‑TCCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGcc < 2:2655573/140‑1 (MQ=255)
gccgccATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCTTATCACCTGCAGTGGTTACATTTCCCGACATCACACCGATGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGcc < 1:7001454/140‑1 (MQ=255)
gccgccATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGcc < 2:9373668/140‑1 (MQ=255)
gccgccATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGcc < 1:736613/140‑1 (MQ=255)
gccgccATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGcc < 1:7399956/140‑1 (MQ=255)
gccgccATTCTCCAGGTTGCCGCCGAGAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGcc < 2:7439640/140‑1 (MQ=255)
cgccATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACCTCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCat < 1:977063/140‑1 (MQ=255)
aTTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTa < 1:2646125/140‑1 (MQ=255)
tctcCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTG‑CCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAAt < 1:7932862/140‑1 (MQ=255)
ccAGGTTGCCTCCGAAAGTTGTTTTAGCGACAAGCAGTG‑CCCCCCCCACGCATAACGTTCATATAACCTGCAGTTGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATCGATATTAAAGTGTTGACTTGCCATATTCATGGc < 2:4513198/140‑1 (MQ=255)
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GAACGTCATCAGGCCATTGTTTCCGGTATAGTTGCCGTTAACGGTCAGTACATTCCCCGGTTTCCCCCCTTCGCTATTCATTTGAACCGTGCCGCCATTCTCCAGGTTGCCGCCGATAGTGGTTTTAGCGACACGCAGTGCCCCCCCCCAGGCATAACGTTCATATCACCTGCAGTGGTGACATTTCCCGACATCACACCGCTGTTATGGATATTAATGTGTTGACTTGCCATATTAATGGCAGAGTCGGAACCGAAAGCAATTTCCCCCCCCACGATATCCGTCGTACCCTGATACGC > NZ_CP025268/1598804‑1599102
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
