Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F67 I0 R1
|
54 |
74.6 |
1619566 |
95.7% |
1549924 |
141.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP000730 |
2,352,815 |
G→A |
100% |
A92V (GCA→GTA) |
rpsI ← |
ribosomal protein S9 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP000730 | 2,352,815 | 0 | G | A | 100.0%
| 219.4
/ ‑6.5
| 73 | A92V (GCA→GTA) | rpsI | ribosomal protein S9 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); major base A (39/31); minor base C (2/0); total (42/31) |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
TATCGTCCGACAATTAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTGCTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACATCAAATGGTTGGTTTAAGTCTAAAATTAA > CP000730/2352678‑2352954
|
tatCGTCCGACAATTAACGTTTTGAGAAATGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACtt < 1:562221/141‑1 (MQ=255)
taccGTCCGACAATTAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGATGCATTACGTCCTGGTTTATTCCCTTCTTTCTTACGTAGTTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACtt < 1:634706/138‑1 (MQ=25)
tCCTACAATTATCGTTTTGAGAATTGAGGTGATCGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCtaat < 1:542913/141‑1 (MQ=255)
tCCGACAATTAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCtaat < 2:178866/141‑1 (MQ=255)
ctaCAATTAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCtaataa < 2:758217/139‑1 (MQ=255)
cGACAATTAACGTTTTGAGAATTGATGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCtaataa < 2:37301/141‑1 (MQ=255)
cGACAATTAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCtaataa < 1:177899/141‑1 (MQ=255)
cGACAATTAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCtaataa < 2:516363/141‑1 (MQ=255)
cAATTAACGTTTTGTGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTGTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGc > 1:434709/1‑141 (MQ=255)
cAATTAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATCCGTCGGCGTCGGGGGAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTATTAATGc > 1:187702/1‑141 (MQ=25)
cAATTAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTCCTTCTAATAATGc > 1:205189/1‑141 (MQ=255)
cAATTAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGc > 1:461325/1‑141 (MQ=255)
ttAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACg < 1:347559/141‑1 (MQ=255)
tttGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGAtt < 2:657510/141‑1 (MQ=255)
tGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGCTCTACTTCTGATAATGCACGGGCGATTcc > 1:275468/1‑141 (MQ=255)
aaTTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCGCGAGTAAGTAATCCAGCGCGTCTTACAGAACCTCTGTCTTCGGGGTCTCATTGTAATAATGCACCACGGATTCCGTgt > 2:710916/1‑140 (MQ=255)
ttGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTTACg > 2:543285/1‑141 (MQ=255)
ttGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACg > 2:617937/1‑141 (MQ=255)
tGAGGTGAACGACCAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTAACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCGCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACgg < 1:258090/141‑1 (MQ=255)
gAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCAAGAGTAAGTAATACAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGa > 2:690672/1‑141 (MQ=255)
ggTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATCCGTGGGTCACGAGTAAGTAGTCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTTAGCATCTACTTCTAATAATGCACGACCGATTCGGTGACGGGTa > 2:58447/1‑141 (MQ=255)
ggTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGCCGGATa > 1:189490/1‑141 (MQ=255)
ggTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGAtg > 1:566414/1‑140 (MQ=255)
aaCGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATagctt < 2:405330/141‑1 (MQ=255)
aaCGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATagctt < 2:526391/141‑1 (MQ=255)
cgacgaGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATagcttga < 1:470666/141‑1 (MQ=255)
cgacgaGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATagcttga < 2:609992/141‑1 (MQ=255)
cgacgaGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATagcttga < 2:686086/141‑1 (MQ=255)
cgaccaGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATagcttga < 2:105960/141‑1 (MQ=255)
acgaGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATagcttgagc < 2:531766/141‑1 (MQ=255)
acgaGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATagcttgagc < 2:162958/141‑1 (MQ=255)
tAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGa < 2:218357/141‑1 (MQ=255)
aGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGaaa > 1:774781/1‑141 (MQ=255)
gTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAtccaccac < 1:507576/141‑1 (MQ=255)
tACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCGGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTACTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGaa > 2:603137/1‑141 (MQ=255)
gTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGt < 1:223281/141‑1 (MQ=255)
gTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTACAGTGAAACCACCACCATGAACGt > 1:304164/1‑141 (MQ=255)
gTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCGTGTCCAGTGAAACCACCACGATGACCGt > 1:655938/1‑141 (MQ=255)
ttttCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTaa < 1:6650/140‑1 (MQ=255)
ttCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACACCCATGAACGTTAACt > 2:41011/1‑141 (MQ=255)
cATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGTGCTTGTCCATTGAAACCACCACCATAAACGTTAACT‑aa > 2:13484/1‑141 (MQ=255)
cATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCCCCATGAACGTTAACT‑aa > 1:439377/1‑141 (MQ=255)
cATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑aa > 2:519089/1‑141 (MQ=255)
gTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAGTGGCCGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTTCCGTGAAACCACCGCCATGAGCGttgttgtaaagat > 2:203999/1‑130 (MQ=255)
gTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAAGATTAACT‑AAAAcat > 2:582568/1‑141 (MQ=255)
gggTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAAcatca < 2:793530/141‑1 (MQ=255)
gggTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAAcatca < 2:499787/141‑1 (MQ=255)
tCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAg > 1:504511/1‑141 (MQ=255)
cACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCGGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGt > 2:161545/1‑141 (MQ=255)
cACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGt < 1:454225/141‑1 (MQ=255)
cACGAGTAAGTAACACAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGt < 1:303776/141‑1 (MQ=255)
aCGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGtt > 2:113406/1‑141 (MQ=255)
gAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGTTAc < 1:671069/141‑1 (MQ=255)
agtaaTCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAACCATCATAGTTACCTTTa > 2:318177/1‑141 (MQ=255)
agtaaTCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGTTACCTTTa > 1:240186/1‑141 (MQ=255)
taaTCCAGCGCGTTTTAAAAAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTGCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTCAAACAACCACGCTGAACGCTAACT‑AAAACATCATAggttactttggt > 2:667582/1‑130 (MQ=255)
aTCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGACACCACCACCCTGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGTTACCTTTAGttt > 1:3861/1‑141 (MQ=255)
aTCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGTTACCTTTAGttt > 2:588407/1‑141 (MQ=255)
aTCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGTTACCTTTAGttt > 1:617630/1‑141 (MQ=255)
gcgcGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGCGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAACCCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACCTCATAGTTACCTTTAGGTTCAGtt > 1:287126/1‑141 (MQ=255)
gTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGCGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACTAAAAACATCATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACa < 2:402340/141‑1 (MQ=255)
gTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGCCGGATAGCTTGAGCTTGTCCAATGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAACAAGCATGATTACCTTTAGtttagattcatt > 1:253/1‑132 (MQ=255)
gTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACTAAAAACATCATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACa < 2:609979/141‑1 (MQ=255)
ttttAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCAACATGAACGTTAAGT‑AAAAAATAATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACAta > 1:636305/1‑140 (MQ=255)
tAAACAACCTCTCTATTCAGGATCTACTTCTAATAACGCACAAGCGATTCCGTGATGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACAGCATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACATCaaa < 1:71276/141‑1 (MQ=255)
ccTCTGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACATCAAAtggttgg > 2:410569/1‑141 (MQ=255)
tctGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACATCAAATggcaggtt > 2:354524/1‑141 (MQ=255)
tctGTAATCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTCGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGATAACT‑AAAACATCATAGTTTCCTTTAGTTTCAGTTACATCAAATggttggtt > 2:509890/1‑141 (MQ=255)
ctGTTTTCAGGATCTACTTTTAATAATGCAAGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAAAT‑AAAACATCATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACATCAACTggttggttg > 2:492600/1‑140 (MQ=255)
ctGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACATCAAATGGTTGGttt > 1:794223/1‑141 (MQ=255)
tGTATTCAGGATCTACTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGATACCCTTAGCTTCAGTTACATCAAACGGTTGGTTTa > 2:189935/1‑141 (MQ=255)
aTCTACTTCTAATAATGCACGAGCGCTTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGTTACCTTTCGTTTCAGTTACATCAAATGGTTGGTTTAAGTCTAAAAt > 1:444743/1‑141 (MQ=255)
tGCTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGAGTGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACACCAAATGGTTGGTTTAAGTCTAAAATTaa > 2:307705/1‑141 (MQ=255)
|
TATCGTCCGACAATTAACGTTTTGAGAATTGAGGTGAACGACGAGCTGCTTTAAGACCTGGTTTTTTACGTTCTTTCATACGTGGGTCACGAGTAAGTAATCCAGCGCGTTTTAAAGAACCTCTGTATTCAGGATCTGCTTCTAATAATGCACGAGCGATTCCGTGACGGATAGCTTGAGCTTGTCCAGTGAAACCACCACCATGAACGTTAACT‑AAAACATCATAGTTACCTTTAGTTTCAGTTACATCAAATGGTTGGTTTAAGTCTAAAATTAA > CP000730/2352678‑2352954
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
