Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A13 F191 I0 R1
|
47 |
68.0 |
1456600 |
97.2% |
1415815 |
140.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP000730 |
638,614 |
G→T |
100% |
T14K (ACA→AAA) |
thiD ← |
phosphomethylpyrimidine kinase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP000730 | 638,614 | 0 | G | T | 100.0%
| 189.6
/ ‑6.5
| 68 | T14K (ACA→AAA) | thiD | phosphomethylpyrimidine kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/3); new base T (31/34); total (31/37) |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
CATCCATTGGTAATGGTGTAACATCGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTGTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGAAAAATATTAAGCATTCAATATTTGATGATTGT > CP000730/638477‑638744
|
cATCCATTGGTAATGGTGTAACATCGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTtttg > 2:131423/1‑140 (MQ=255)
aTCCATTGGTAATGGTGTAACATCGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTttgt < 1:607479/140‑1 (MQ=255)
ccATTGGTAATGGTGTAACATCGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGAGGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGAACTTTTATCa > 2:624430/1‑140 (MQ=255)
aTTGGTAATGGTGTAACATCGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGa > 1:430942/1‑140 (MQ=255)
aaTGGTGTAACATCGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGc > 1:241448/1‑140 (MQ=255)
tGGTGTAACATCGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAATGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCaa < 1:39099/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTAACATCGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCTTGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCaa < 2:60789/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTAACATCGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCAGGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCACCACTTTGGTCAGAACCGGCaa < 2:498152/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTAACATCATGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCaa < 2:523106/140‑1 (MQ=255)
gtAACATCGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATTTGATTGCATACCTGCGCCACAACTTTTTTCAGAAACGGCAATTGt > 2:117641/1‑140 (MQ=255)
gtAACATCGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCCGCGCGCGTGTCAGAACCGGCAATTGt < 2:701168/140‑1 (MQ=255)
aaCATCGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTa > 1:692632/1‑140 (MQ=255)
aCATCGTTTCACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTaa < 2:186505/140‑1 (MQ=255)
aCATCGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTaa < 1:436845/140‑1 (MQ=255)
aTCGTGTGACCATTTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTaaaa < 1:22794/140‑1 (MQ=255)
cGTGTGATCATGTATCTTTATCCATAGTACCGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAAct < 1:16863/140‑1 (MQ=255)
cGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCTATTATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTATAAAATCTGCTTGCATACCCGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAAct < 1:242813/140‑1 (MQ=255)
cGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGAACATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATATGCTTGCATAACTGATCCAGCACATTTGTCAAAAACGGCGATTGTTCAAGct > 1:263072/1‑140 (MQ=255)
tttaCCATGTTTCTTTATCCATAATAACGATGGCTGTTAAAGAGACTATGCCATACGTATCTAATTCTTGGCACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGACAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAActttc < 1:161271/137‑1 (MQ=255)
gtgACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAActttc < 1:422268/140‑1 (MQ=255)
gACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCCCTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAActttctt > 1:451563/1‑140 (MQ=255)
aCCATGTTTTTTTATCCATAGTAACGATTGCAGTTAAATCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTTCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAActttcttt < 1:117641/140‑1 (MQ=255)
aCCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAActttcttt < 1:455727/140‑1 (MQ=255)
tATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGcc < 2:416639/140‑1 (MQ=255)
tttATCTATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTGATTCTTTGACCGGTTTCAAATCGGCTTGCGTACCTGCGCCATCACTTGTGTCAGATCCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTg < 2:185272/140‑1 (MQ=255)
ttATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGa < 1:537122/140‑1 (MQ=255)
tATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTACTTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCCGCCCTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATCGAg > 2:667633/1‑140 (MQ=255)
tATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCCTACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAg > 2:609842/1‑140 (MQ=255)
ccATATTAACTATTGCATTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCtt < 1:664937/140‑1 (MQ=255)
ccATAGTTTCGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCTTACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCtt < 1:661883/140‑1 (MQ=255)
ccATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCCTTGAGCtt > 2:250247/1‑140 (MQ=255)
ccATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCtt < 1:664953/140‑1 (MQ=255)
cATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTc < 1:529393/140‑1 (MQ=255)
cATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTc < 2:558522/140‑1 (MQ=255)
aTAGTAGTGATTGTATTTAAAGCGGTCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTTTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCa < 2:62192/140‑1 (MQ=255)
aTAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCa < 1:236988/140‑1 (MQ=255)
aGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGACATTGAGCTTAACt > 1:430929/1‑140 (MQ=255)
cGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTAc > 2:191026/1‑140 (MQ=255)
ggCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTTTTAGAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTAACTCCTACatat > 1:133964/1‑139 (MQ=255)
gCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGTACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAAAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACataat > 1:108502/1‑140 (MQ=255)
gCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCAATTGAGCTTCACTCCTACataat > 1:160676/1‑140 (MQ=255)
gCAGTTAAAGCGACAATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACataat > 1:474076/1‑140 (MQ=255)
gTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACataataat < 1:110562/140‑1 (MQ=255)
ttAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACatagtaata > 1:544556/1‑140 (MQ=255)
tAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGCGCTTCATTTCTACATAATAatat < 2:186857/140‑1 (MQ=255)
tAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACataataatgt > 2:394880/1‑138 (MQ=255)
tAAAGCGACCATGCCATAAGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCATTCCTACATAAAAatat > 2:29343/1‑140 (MQ=255)
aaaGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATAtt > 1:22981/1‑140 (MQ=255)
gCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCGTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAGTAATATTCTa > 2:539702/1‑140 (MQ=255)
cATACGTATCTGATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATCATAATATTGTATTCatcttat > 2:9950/1‑140 (MQ=255)
cATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCatcatat < 2:692632/140‑1 (MQ=255)
aTACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCatcatatc < 2:454572/140‑1 (MQ=255)
tACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCatcatatca < 1:230634/140‑1 (MQ=255)
cGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGCACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCAtt > 1:457311/1‑140 (MQ=255)
cGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCAtt > 1:296474/1‑140 (MQ=255)
aTTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCt > 2:103680/1‑140 (MQ=255)
cTTGGAATGTTTTCATATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTGTGTCAGATCCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATGGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAAt < 1:128841/140‑1 (MQ=255)
cTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCATCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAAt < 2:273755/140‑1 (MQ=255)
aCGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGaaaa > 1:73910/1‑140 (MQ=255)
ttttCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTATCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTAAAAActa > 1:260619/1‑140 (MQ=255)
tgtgcAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGAAAAata < 2:371174/136‑1 (MQ=255)
tttCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCTAGCACTTTTATCAGAACCGGCAGTTGTTAAAACTTTCTTTGAAGCCATTGAGCTTCACCCCTACATAATAATCTTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGagaacttt > 2:200777/1‑136 (MQ=255)
atgcgattCTGCCTGCATACCTGCGCCATCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAACCTTTCTTTAAAGCCATCGTGCTTCCCTCTTACACAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAGCATAAGTGAAAAatag < 2:539765/133‑2 (MQ=255)
cAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGAAAAATATTaa < 2:276001/140‑1 (MQ=255)
cAAATCTGCTTCCATACCGTCGCCAACACATTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTATTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGAAAAATATTaa < 2:656451/140‑1 (MQ=255)
cATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGAAAAATATTAAGCATTCAATAtt > 1:12479/1‑140 (MQ=255)
cATACCTGCGCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATAATTATTAAACAAATTAAAAAATATTAAGCATTCAATAtt > 1:101509/1‑140 (MQ=255)
cTGCTCCAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGAAAAATATTAAGCATTCAATATTtgatg < 1:81096/140‑1 (MQ=255)
ccAGCACTTTTGTCAGAACCGGCAATGGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGAAAAATATTAAGCATTCAATATTTTATGAttgt > 2:452486/1‑140 (MQ=255)
caaGCATTTTTGTCATAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCAGCATATCATTTTTAACCTAATTGAAAAATATTAAGCATTCAATATTTGATGAttgt < 1:667633/138‑1 (MQ=255)
|
CATCCATTGGTAATGGTGTAACATCGTGTGACCATGTATCTTTATCCATAGTAACGATGGCAGTTAAAGCGACCATGCCATACGTATCTAATTCTTGGAACGTTTTCAAATCTGCTTGCATACCTGCGCCAGCACTTGTGTCAGAACCGGCAATTGTTAAAACTTTCTTTAAAGCCATTGAGCTTCACTCCTACATAATAATATTGTATTCATCATATCATTTTTAACCTAATTGAAAAATATTAAGCATTCAATATTTGATGATTGT > CP000730/638477‑638744
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
