Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A13 F63 I1 R1
|
24 |
99.5 |
1985454 |
97.9% |
1943759 |
148.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP000730 |
367,644 |
G→T |
intergenic (‑96/‑20) |
nanA ← / → nagC |
N‑acetylneuraminate lyase/possible transcriptional regulator |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP000730 | 367,644 | 0 | G | T | 97.6%
| 283.8
/ NA
| 86 | intergenic (‑96/‑20) | nanA/nagC | N‑acetylneuraminate lyase/possible transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/2); new base T (38/44); total (38/48) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.99e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
AAAAGGAACGAGTAACGCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTAGTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCAAATTAAATCGGCAGTTATTGATAAGCAATTGAATATGTTTGA > CP000730/367501‑367782
|
aaaaGGAACGAGTAACGCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTGACAAGATCTTTTTGAAAATTGTATTCat < 1:512474/148‑1 (MQ=255)
aaaTGAACGAGTAACGCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATAAAGTCCCTTCAAAAATCATTTGATAATACAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCata < 2:567838/148‑1 (MQ=255)
aaaGGAACGAGTAACGCTGCATATAAATCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCata > 1:605032/1‑148 (MQ=255)
aaaGGAACGAGTAACGCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCata > 1:625077/1‑148 (MQ=255)
ggAACGAGGAACGCTGCATATAAACCTTTTACATCCCTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATAttt < 1:23168/148‑1 (MQ=255)
ggAACAAGTAACGCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTATTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATAttt < 2:564822/148‑1 (MQ=255)
gAACGAGTAACGCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTa < 2:490588/148‑1 (MQ=255)
gAACGAGTAACGCTGCATATAAACCTTTTAAAGCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTa < 2:899040/148‑1 (MQ=255)
tAACTCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTAtaa < 2:928761/148‑1 (MQ=255)
aCGCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTAtaatt < 1:545902/148‑1 (MQ=255)
aCGCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTACAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTACCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTAtaatt < 2:331357/148‑1 (MQ=255)
cGCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTAtaatta < 2:668910/148‑1 (MQ=255)
cATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGaa < 2:369181/148‑1 (MQ=255)
ataAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAAt < 1:752792/148‑1 (MQ=255)
taAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATg > 1:455046/1‑148 (MQ=255)
taAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATg > 2:505603/1‑148 (MQ=255)
aaaCCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTAGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGt > 1:703333/1‑148 (MQ=255)
aaCCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGtt > 2:178101/1‑148 (MQ=255)
tttAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCa < 1:746757/148‑1 (MQ=255)
aTCTTTGTTCATTATGAAGACCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATc < 2:301755/148‑1 (MQ=255)
tCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCa > 2:901756/1‑148 (MQ=255)
tGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAACTAATGAAAATGTTTTTTAAAAtttatat > 2:138382/1‑142 (MQ=255)
tGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGAAAACGCTATCCTAAAATGTAACAATATATTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAGTGAAAATATTTTTGAAGATCAATaa > 2:28521/1‑147 (MQ=255)
tCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGaaa > 1:655864/1‑148 (MQ=255)
cATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAAt < 1:805361/148‑1 (MQ=255)
aTTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATg < 1:538644/148‑1 (MQ=255)
gAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAACTCTTTATAAATGgagtg > 2:576660/1‑148 (MQ=255)
gAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGgagtg > 1:840616/1‑148 (MQ=255)
gAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGgagtg > 1:840770/1‑148 (MQ=255)
aaGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTGCCCTTAAACTATAATAAATGAAAATGTTGTTAAAAATCAGTAGAAATGgagtga > 1:226071/1‑148 (MQ=255)
aaGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTGCAAAATCAATAGAAATGgagtga < 2:852518/148‑1 (MQ=255)
aaGACCCTCCAAAAATCATATGAAAATAAAGATTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAAAATCTTATTGAAAAATGTAATCATATTGATGTATAACTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGgagtga < 2:793671/148‑1 (MQ=255)
aGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGgagtgag > 1:33130/1‑148 (MQ=255)
tCCCTTCAAAATATATTTGATAATAAAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAATATCAATAGAAATGGAGTGAGTa < 1:500830/148‑1 (MQ=255)
cccTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGTAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGATTTTCAAATTCAATAGAAATGTAGTGAGTaa > 2:500108/1‑148 (MQ=255)
ccTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAg < 1:618873/148‑1 (MQ=255)
ccTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAg < 1:709161/148‑1 (MQ=255)
ccAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTATCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGgtg < 2:926895/148‑1 (MQ=255)
ccAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAAGTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGgtg < 1:438570/148‑1 (MQ=255)
acAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGgtg < 2:562464/147‑1 (MQ=255)
cAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGgtgt < 1:639570/148‑1 (MQ=255)
aaTCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGTATATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATAAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTa > 2:721317/1‑148 (MQ=255)
aaTCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTa < 1:943403/148‑1 (MQ=255)
aTCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTAGCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTAc < 1:857816/148‑1 (MQ=255)
tCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTAcc > 2:546098/1‑147 (MQ=255)
tCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACa > 1:298366/1‑148 (MQ=255)
cATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACAt < 1:843282/148‑1 (MQ=255)
ttGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGc < 1:837853/148‑1 (MQ=255)
ttGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTAGCATAAAATGTATCAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGc < 1:871044/148‑1 (MQ=255)
taataTAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATc > 1:753478/1‑148 (MQ=255)
taataTAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGGGAGTAAAGTGTGTTAAATCGCAATc > 1:363320/1‑148 (MQ=255)
gTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTg > 1:322379/1‑148 (MQ=255)
tttACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTTTATTCATATTTATGTATAATTAATGTAAATGTTTTTTGATATCATTTGAAATAGAGAGAGTAACGTATATACCATCGCAGTAGTTAttaa > 2:717640/1‑146 (MQ=255)
tACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCgtacttgtgg > 1:22550/1‑139 (MQ=255)
cAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGc > 1:336710/1‑148 (MQ=255)
cAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAACATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTTTGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAAAGGAGTGAAGACGGTGTGTTCCATGGCAATCGATATTGCAGGc > 2:542933/1‑148 (MQ=255)
tataATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATAAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATAGAAATAGATATAGGAGGCACTc > 2:818035/1‑148 (MQ=255)
ataATTGTAAACGATATCATAAAATGTAAGAATATCTTTTTGTAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAGTAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTAAATGGAAATTGATATTAGAGGGAcgga > 2:534564/1‑145 (MQ=255)
taATTGTAAACTCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCaa < 1:893121/148‑1 (MQ=255)
taATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAATAATTTCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCaa < 1:903956/148‑1 (MQ=255)
taATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCAATCaa > 1:102302/1‑148 (MQ=255)
aaTTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCaaa > 1:192183/1‑148 (MQ=255)
gTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTATATTTATGTGTAATTAATGTAAATGTTTTTGATTGTCATTAGATATGGAGTGGTTAAGGTGAGTTATATTGCCTTCGATATTGTAGGCACACAAAtttt > 2:451813/1‑146 (MQ=255)
gTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCAAATTaa > 1:703553/1‑148 (MQ=255)
gTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATATATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCAAATTaa > 1:520219/1‑148 (MQ=255)
aaCGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATACTTCATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAGTCGATATTGGGGGCACTCAAATTAAATc > 1:824681/1‑148 (MQ=255)
aaCGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCAAATTAAATc > 1:217411/1‑148 (MQ=255)
aCGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTTTAGTCATATTCATGTATATTTAATTAAAATGTTTGTGTAATTGATGAGTGATGTGTTGATTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTTGAGGCACTCAAGTTTATTCg < 2:306572/148‑1 (MQ=255)
cGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCAAATTAAATCgg < 2:605032/148‑1 (MQ=255)
cGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCAAATTAAATCgg < 2:625077/148‑1 (MQ=255)
aTCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCAAATTAAATCGGCAGt < 1:592328/148‑1 (MQ=255)
cATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCAAATTAAATCGGCAGTTa < 2:137932/148‑1 (MQ=255)
tAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCAAATTAAATCGGCAGTTAtt < 1:127660/148‑1 (MQ=255)
tAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCAAATTAAATCGGCAGTTAtt < 1:674671/148‑1 (MQ=255)
aaaaaTGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAGTGAGAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCAAATTAAACCGGCAGTTAtt < 1:676534/147‑1 (MQ=255)
aaTTTAACAATTTCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCAAATTAAATCGGCAGTTATTGAt < 1:347834/148‑1 (MQ=255)
tGTAACAATGTGTGTTTGGACATTGTAGTCATATTTATGTATAACTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCCATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGCATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCAAATTAAATCGGCAGTTATTGATaa < 2:385749/148‑1 (MQ=255)
atatCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAAGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCAACTTAAATAGCCAGTTATTGATAAGCAATTg > 2:184335/1‑148 (MQ=255)
tttGAACATTGTAATTATATTTATTGATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATACTTTTAAAGATTGGAGGCACTCAAATTAAATCGGCAGTTCTTGATAAGCAATTGAATATGt < 2:455046/148‑1 (MQ=255)
tttGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCAAATTAAATCGGCAGTTATTGATAAGCAATTGAATATGt < 1:505603/148‑1 (MQ=255)
ttaaaaTTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCAAATTAAATCGGCAGTTATTGATAAGCAATTGAATATGttt < 1:77173/146‑1 (MQ=255)
tGAAAATTGTATTTATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCAAATTAAATCGGCAGTTATTGATAAGCAATTGAATATGttt < 1:514259/148‑1 (MQ=255)
tGAAAATTGTATTCATATTTTTGTATTATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCAAATTAAATCGGCAGTTATTGATAAGCAATTGAATATGttt < 1:11022/148‑1 (MQ=255)
tGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATTGAAGATGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCAAATTAAATCGGCAGTTATTGATAAGCAATTGAATATGttt < 1:721317/148‑1 (MQ=255)
gAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCAAATTAAATCGGCAGTTATTGATAAGCAATTGAATATGTTTg > 1:800991/1‑148 (MQ=255)
aaaaTTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCAAATTAAATCGGCAGTTATTGATAAGCAATTGAATATGTTTGa > 1:165152/1‑148 (MQ=255)
|
AAAAGGAACGAGTAACGCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTAGTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCAAATTAAATCGGCAGTTATTGATAAGCAATTGAATATGTTTGA > CP000730/367501‑367782
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
