Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A15 F177 I1 R1
|
35 |
90.2 |
1937232 |
96.2% |
1863617 |
139.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP000730 |
367,644 |
G→T |
intergenic (‑96/‑20) |
nanA ← / → nagC |
N‑acetylneuraminate lyase/possible transcriptional regulator |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP000730 | 367,644 | 0 | G | T | 100.0%
| 310.0
/ NA
| 87 | intergenic (‑96/‑20) | nanA/nagC | N‑acetylneuraminate lyase/possible transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (45/42); total (45/42) |
AACGAGTAACGCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTAGTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGC‑ACTCAAATTAAATCGGCAGTTATTGATAAGCAATTGAATATGTTTG > CP000730/367507‑367781
|
aaCGAGTAACGCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCa > 2:391101/1‑141 (MQ=255)
aCGAGTAACGCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTCCACGCTATCATCAAATGTGACAATATCTTGTTGAAAATTGTATTCat > 1:522351/1‑141 (MQ=255)
cGAGTAACGCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCata > 2:536184/1‑141 (MQ=255)
ttAACGCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATTAAGTTCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATAttt < 2:174393/140‑1 (MQ=255)
gTAACGCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATAttt > 2:542323/1‑141 (MQ=255)
gTAACGCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAAGTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATAttt > 1:676208/1‑141 (MQ=255)
tAACGCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTa < 1:391492/141‑1 (MQ=255)
aCGCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATg < 1:794373/141‑1 (MQ=255)
cGCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGt > 2:57122/1‑141 (MQ=255)
cGCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGt < 2:160859/141‑1 (MQ=255)
gCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGta > 2:758527/1‑141 (MQ=255)
gCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGta < 1:250092/141‑1 (MQ=255)
gCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTAtaa < 2:878504/141‑1 (MQ=255)
cATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTAtaat > 1:859653/1‑141 (MQ=255)
atatAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTAtaatt < 1:93541/141‑1 (MQ=255)
taAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCGCCTTTAGTGAtaattaat < 1:954751/141‑1 (MQ=255)
aaaCCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTAGAATTAATg > 1:596005/1‑141 (MQ=255)
ccTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGaaa < 2:83813/141‑1 (MQ=255)
tttAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAGATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATg < 1:897942/141‑1 (MQ=255)
ttAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCAATTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGt > 1:511999/1‑141 (MQ=255)
ttAAATCTTTGTTCATCATGACGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGt > 2:875853/1‑141 (MQ=255)
tAAATCTTTTTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATTTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATTAAAATGtt < 2:901700/141‑1 (MQ=255)
tAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGtt < 1:71169/141‑1 (MQ=255)
tAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGtt < 2:472356/141‑1 (MQ=255)
aaTCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGtttt > 1:671038/1‑141 (MQ=255)
aaTCTTTGTTCATTATGAAGAAAAAAAAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGtttt < 2:119898/141‑1 (MQ=255)
ttGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCaaa > 2:164372/1‑141 (MQ=255)
ttCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGATTATTTTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATc > 2:933395/1‑141 (MQ=255)
cATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCaa > 2:247817/1‑141 (MQ=255)
tATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAg > 1:526692/1‑141 (MQ=255)
aTGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGa < 1:343714/141‑1 (MQ=255)
tGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGaa < 2:446111/141‑1 (MQ=255)
tGAAGTCCCTCCAAAAATCACTAGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATTTAACAATATCTATTTGAAAATTGTATTGATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGaa < 2:798760/141‑1 (MQ=255)
gAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGaaa < 1:651401/141‑1 (MQ=255)
aaGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAAt > 1:937545/1‑141 (MQ=255)
aGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATg > 2:715337/1‑141 (MQ=255)
aGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATg > 2:743035/1‑141 (MQ=255)
gTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATgg < 1:872424/141‑1 (MQ=255)
tCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGga < 1:968352/141‑1 (MQ=255)
cTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGgagtg > 2:108568/1‑141 (MQ=255)
aaTCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAgg < 1:776455/141‑1 (MQ=255)
tCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGgtg < 2:443813/141‑1 (MQ=255)
tCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGgtg < 1:246668/141‑1 (MQ=255)
cATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGgtgt > 2:633820/1‑141 (MQ=255)
aTTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTa > 1:367453/1‑141 (MQ=255)
ttGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTAtt > 1:357073/1‑141 (MQ=255)
ttGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTAtt > 1:873058/1‑141 (MQ=255)
ataGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCa > 1:471287/1‑141 (MQ=255)
gTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATc < 1:76301/141‑1 (MQ=255)
tttACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCg < 1:458420/141‑1 (MQ=255)
tttACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCg < 2:310216/141‑1 (MQ=255)
tACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGat > 2:657001/1‑141 (MQ=255)
cAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGatat < 1:436932/141‑1 (MQ=255)
cAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGatat < 2:258498/141‑1 (MQ=255)
aTTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTGCATCGCAATCGATATTGGAGGC‑a < 1:743035/141‑1 (MQ=255)
tGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGC‑ACt > 1:347198/1‑141 (MQ=255)
tGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGC‑ACt > 2:450408/1‑141 (MQ=255)
ttAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGC‑ACTc < 2:535003/140‑1 (MQ=255)
gTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGC‑ACTc < 2:534973/141‑1 (MQ=255)
aaaCGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTGAATATTTATCTAAATGTAGAGAGTAAGGTGTATTACATCACTGTCGAT‑TTGGGGGCAACTCaa > 2:233373/1‑141 (MQ=255)
cGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAATTTCATTAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATAGATATTGGAGGC‑ACTCAAAtt > 2:658877/1‑141 (MQ=255)
gCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTTTATATTGTTTTCATATTTATGTATAATTAATGAAACTGTTTTTCAAAATAAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCACAATCGATATTGGAGGC‑ACACAAATTa > 2:472181/1‑141 (MQ=255)
gCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGC‑ACTCAAATTa < 2:333565/141‑1 (MQ=255)
cTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGC‑ACTCAAATTaa > 1:98722/1‑141 (MQ=255)
tATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGC‑ACTCAAATTaaa < 1:424253/141‑1 (MQ=255)
aTCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGC‑ACTCAAATTAAAt > 1:968167/1‑141 (MQ=255)
tCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATCTTTATTTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGC‑ACTCAAATTAAATc > 1:221384/1‑141 (MQ=255)
cATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGC‑ACTCAAATTAAATCg < 1:44605/141‑1 (MQ=255)
cATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGC‑ACTCAAATTAAATCg < 1:651789/141‑1 (MQ=255)
cATAAAATGTAACAATATCTTTGTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGC‑ACTCAAATTAAATCg < 2:525122/141‑1 (MQ=255)
cATAAAAGTTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGC‑ACTCAAATTAAATCg < 2:911988/141‑1 (MQ=255)
aTAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGC‑ACTCAAATTAAATCgg > 2:908496/1‑141 (MQ=255)
tAAAATGTAACAATATCTTTTTTTTTTTTTTTTTTATATTTATGTATAATTAATGAAAATTTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCACAATCAATATTGGAGGC‑ACTCAAATTTAATcttt > 2:641651/1‑138 (MQ=255)
tAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGC‑ACTCAAATTAAATCGGc < 2:367453/141‑1 (MQ=255)
aCAATATCTTTTTTTTTTTTTTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTAAATCGAAATAGATCTTTTTGGT‑TCTCTAATTAAATCGGCAGTTATTGa > 2:732701/1‑141 (MQ=255)
aCAATATCTTTTTGAAAATTGTTTTCATATTTAAGTAGAATCAATGAAAATGTTTTTGAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGTC‑ACTTAAATTAAATAGACAGTTATTgc > 2:54787/1‑140 (MQ=255)
aCAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGC‑ACTCAAATTAAATCGGCAGTTATTGa > 1:755557/1‑141 (MQ=255)
aCAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGC‑ACTCAAATTAAATCGGCAGTTATTGa > 1:405274/1‑141 (MQ=255)
atatCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGC‑ACTCAAATTAAATCGGCAGTTATTGATaa > 1:150907/1‑141 (MQ=255)
tCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGC‑ACTCAAATTAAATCGGCAGTTATTGATAAGCa < 2:754706/141‑1 (MQ=255)
tCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGC‑ACTCAAATTAAATCGGCAGTTATTGATAAGCa > 1:40861/1‑141 (MQ=255)
tttGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGC‑ACTCAAATTAAATCGGCAGTTATTGATAAGCAATTg < 1:869814/141‑1 (MQ=255)
tttGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGC‑ACTCAAATTAAATCGGCAGTTATTGATAAGCAATTg < 1:406990/141‑1 (MQ=255)
ttGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCTAAATTTATAAAAATGCAGTCAGTAAGCAGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGA‑ACTGAGATTATATCGGCATTTATTGATAAGCAATTGattttatt > 2:588880/1‑134 (MQ=255)
ttGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGC‑ACTCAAATTAAATCGGCAGTTATTGATAAGCAATTGAATATGtt > 2:113728/1‑141 (MQ=255)
tGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTACAAAATCAATAGAAATGAAGTGAGTAAGGTCTAGTACATCGCAATCGATATTGGAGGC‑ACTCAAATTAAATCGGCACATATTGATAAGCAAGTGAATATGttt > 2:656611/1‑141 (MQ=255)
gTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGC‑ACTCAAATTAAATCGGCAGTTATTGATAAGCAATTGAATATGTTTg < 2:350941/141‑1 (MQ=255)
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AACGAGTAACGCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTAGTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGC‑ACTCAAATTAAATCGGCAGTTATTGATAAGCAATTGAATATGTTTG > CP000730/367507‑367781
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
