Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A13 F20 I0 R1
|
89 |
60.0 |
1338914 |
94.3% |
1262595 |
140.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP000730 |
367,644 |
G→T |
100% |
intergenic (‑96/‑20) |
nanA ← / → nagC |
N‑acetylneuraminate lyase/possible transcriptional regulator |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP000730 | 367,644 | 0 | G | T | 100.0%
| 257.7
/ ‑6.5
| 79 | intergenic (‑96/‑20) | nanA/nagC | N‑acetylneuraminate lyase/possible transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base T (48/30); minor base A (0/1); total (48/31) |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
CGAGTAACGCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTAGTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCAAATTAAATCGGCAGTTATTGATAAGCAATTGAATAT > CP000730/367509‑367776
|
cGAGTAACGCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTATGGACCAAGTGGGAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCatt > 1:126302/1‑140 (MQ=255)
aGTAACGCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAAAGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATAtt > 1:596490/1‑141 (MQ=255)
gTAACGCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATAttt > 2:555177/1‑141 (MQ=255)
gTAACGCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGAAACGCCACAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAAGATCTATTTGAAAATTGTATTCATAttt > 1:387634/1‑141 (MQ=255)
aaCGCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTAt > 2:499058/1‑141 (MQ=255)
aCGCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATg < 1:475915/141‑1 (MQ=255)
aCGCTGCATATAAACATTTTAAATCTATGTTCATCATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCTTAAAATGTAACAATATCTTTTTGCAAATTGTATTCATATTTATg < 1:405548/141‑1 (MQ=255)
tGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATACTCTAGTTTACAGCTATAATTGTAAAAGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAACATTGTATTCATATTTATGtata > 2:74297/1‑141 (MQ=255)
aCCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGaa > 1:56230/1‑141 (MQ=255)
cTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGaaaa < 2:559929/141‑1 (MQ=255)
ttAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGt > 1:653269/1‑141 (MQ=255)
ttAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGt < 2:584591/141‑1 (MQ=255)
tAAATCTTTGTTCATTATGAATTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGtt < 2:349357/141‑1 (MQ=255)
tAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGCTAATATCGACCAAATCGATAATTGATTCTCCTAACATAAAATGTAACAATATCTTACTGAAACTTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGtt > 1:321320/1‑141 (MQ=255)
aaagcgttGTTCATGATGAAGGCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGttt < 2:666694/135‑1 (MQ=255)
aaTCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGtttt > 2:152648/1‑141 (MQ=255)
aaTCTTTGTTAATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGtttt < 2:268462/141‑1 (MQ=255)
agcgttGTTCATTAAGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGttttt > 2:146416/5‑141 (MQ=255)
aTCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAATCGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGttttt < 2:11957/141‑1 (MQ=255)
tGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCaaaa > 1:115233/1‑141 (MQ=255)
tGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTACAATTAATGAAAATGTTTTTCaaaa > 1:560915/1‑141 (MQ=255)
gTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAAt < 1:555177/141‑1 (MQ=255)
ttCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATc > 1:124192/1‑141 (MQ=255)
tCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATCATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCa > 1:478297/1‑141 (MQ=255)
tCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCa > 1:316428/1‑141 (MQ=255)
cATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCaa < 1:499058/141‑1 (MQ=255)
ttATGAAGTCCTTCCAAATATCATTTGATAATATAGTTTGAAGCTATAATTGTAAAAGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATa < 2:178059/141‑1 (MQ=255)
tATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAg > 2:55745/1‑141 (MQ=255)
tGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGaa < 1:420125/141‑1 (MQ=255)
gAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGaaa > 1:530601/1‑141 (MQ=255)
gAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGaaa > 1:530499/1‑141 (MQ=255)
gAACTCCATCCGAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTCTAATTGTAAATGCTATCATAAACAGTAACTATATCTTTTAAAAAAATTTAATCGTAATGAAGTATAATGAATGAAAATGTTTTTGCACATCAATAGaaa < 2:307125/141‑1 (MQ=255)
cccTCCAAAAAACATTTGATAATATAGGTTAAAGCTATAATAGTAAACGTTATCATAACAAGTTACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCACATTTATGTATAATTACGGGAAATGTTTTTCAAAATCCATATaaaacgag > 2:55495/1‑136 (MQ=255)
ccTTCAAAAATCCTTTGATAATATAGTTTATAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTTAAAATTGTATTCATATTTATGGATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGgagt < 2:35109/141‑1 (MQ=255)
ccTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGgagt < 1:667687/141‑1 (MQ=255)
ccTCCAAAAATCATTTGATAAGATATTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTGTTTCAAAATCAATAGAAATGgagt < 2:390183/141‑1 (MQ=255)
cTCCAAAAATCATTTTATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGgagtg < 1:137867/141‑1 (MQ=255)
cTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGgagtg < 1:560769/141‑1 (MQ=255)
ccAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGgagtgag > 2:178274/1‑141 (MQ=255)
aaaaTCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTCTGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAATAGGAATGAGTaa > 2:27612/1‑141 (MQ=255)
tCATTTGATAATATGGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGgtg < 2:585953/141‑1 (MQ=255)
tCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCATATTCAATAGAAATGGTGTGAGTAGGgtg > 2:326725/1‑141 (MQ=255)
cATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGgtgt > 2:136947/1‑141 (MQ=255)
cATTTGAATATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGgtgt < 1:61946/141‑1 (MQ=255)
tttGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATCAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATTGAACTGGAGTGCAAAAGGTGAAt > 1:366310/1‑141 (MQ=255)
gTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATc > 2:133100/1‑141 (MQ=255)
gTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATc < 1:144686/141‑1 (MQ=255)
tACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTTTTTATTTTTTTCATATTTATGTATAATTAATAAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTTGATCGCAATCgct > 2:512164/1‑139 (MQ=255)
tACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGat < 1:148514/141‑1 (MQ=255)
tACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGat > 2:475619/1‑141 (MQ=255)
tACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAAGGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGat < 1:310548/141‑1 (MQ=255)
aCAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGGAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGata < 2:580984/141‑1 (MQ=255)
aCAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGata > 1:558942/1‑141 (MQ=255)
cAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGatat < 1:639071/141‑1 (MQ=255)
cAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGatat > 2:254470/1‑141 (MQ=255)
cAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGGCAGCTGTATTACATCGCAAtaggggt > 2:627637/1‑135 (MQ=255)
gttataATTGTAAACACTAACGTAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATAGTATTAATATTTATGTATAAGCAATGAAAACGTCATACAAAATCATTAGAAATGGAGCTAGTAAGGTGTATTACATCGAAACTGATATTg > 2:245252/3‑141 (MQ=255)
gCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGCGCAAGGAGTATTACATCGCAATCGATATTg > 1:618798/1‑141 (MQ=255)
gCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTg > 1:559567/1‑141 (MQ=255)
gCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATAGCAATCGAGATTg > 1:216931/1‑141 (MQ=255)
gCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGCAAGGTGTCTTACATCGCAATCGATATTg > 2:497273/1‑141 (MQ=255)
gCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATAAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGGTATTg > 1:274434/1‑141 (MQ=255)
gCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATGCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTg > 2:367723/1‑141 (MQ=255)
acTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAAGATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTg < 2:590439/140‑1 (MQ=255)
cTATAATTGTAAACGCGATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTgg > 1:398577/1‑141 (MQ=255)
tataATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCATTAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGa > 1:27700/1‑141 (MQ=255)
ataATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCGTATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAg > 1:444074/1‑141 (MQ=255)
aTTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCa > 2:162139/1‑141 (MQ=255)
tGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACt > 1:373746/1‑141 (MQ=255)
aaaCGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATAAATAGAAATAGAGTGAGTAAGGTGTAGTACATCGAAATCGATCTTGGAGGCACTcga > 2:107844/1‑139 (MQ=255)
aaCGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCaaa < 1:565864/141‑1 (MQ=255)
aaCGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCaaa < 2:142323/141‑1 (MQ=255)
aTAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATCTTGGAGGAACTCAAGTAAAATcag > 1:662857/1‑139 (MQ=255)
aTAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCAAATTAAATCgg < 2:123454/141‑1 (MQ=255)
aaaTGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTGAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCAAATTAAATCGGCAg > 2:238521/1‑141 (MQ=255)
aaTGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCAAATTAAATCGGCAGt < 1:435357/141‑1 (MQ=255)
gTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCAAATTAAATCGGCAGTTAt > 1:560893/1‑141 (MQ=255)
tttGAAAATTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCAAATTAAATCGGCAGTTATTGATAAGCAATTg < 2:251847/141‑1 (MQ=255)
aaaTTGTATTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCAAATTAAATCGGCAGTTATTGCTAAGAAATTGAatat > 2:364335/1‑141 (MQ=255)
|
CGAGTAACGCTGCATATAAACCTTTTAAATCTTTGTTCATTATGAAGTCCCTCCAAAAATCATTTGATAATATAGTTTACAGCTATAATTGTAAACGCTATCATAAAATGTAACAATATCTTTTTGAAAATTGTAGTCATATTTATGTATAATTAATGAAAATGTTTTTCAAAATCAATAGAAATGGAGTGAGTAAGGTGTATTACATCGCAATCGATATTGGAGGCACTCAAATTAAATCGGCAGTTATTGATAAGCAATTGAATAT > CP000730/367509‑367776
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
