Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F120 I1 R1
|
17 |
109.7 |
5388692 |
95.0% |
5119257 |
99.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| JC JC |
NC_000913 |
3,793,843 |
IS2 (–) +5 bp |
intergenic (‑160/‑140) |
yibB ← / → hldD |
YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding |
|
| |
seq id |
position |
reads (cov) |
reads (cov) |
score |
skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
| * |
? |
NC_000913 |
= 3187426 | NA (NA) | 121 (1.110) |
76/198 |
0.3 |
99.1% |
noncoding (1331/1331 nt) |
IS2 |
repeat region |
| ? | NC_000913 |
= 3793847 |
1 (0.010) | intergenic (‑164/‑140) |
yibB/hldD |
YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding |
| * |
? |
NC_000913 |
3793843 = | 1 (0.010) | 128 (1.180) |
79/198 |
0.2 |
99.2% |
intergenic (‑160/‑144) |
yibB/hldD |
YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding |
| ? | NC_000913 |
4498181 = |
NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) |
IS2 |
repeat region |
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3187329‑3187426
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGATA < NC_000913/3793847‑3793752
AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACT < 2:957155/100‑1
AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACT > 2:1522353/1‑100
AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACT < 1:1349076/100‑1
AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACT > 1:2103569/1‑100
AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACT < 2:503055/100‑1
GTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTA > 1:2625091/1‑100
GTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTA > 1:1951975/1‑100
GCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGT > 1:1250257/1‑100
GCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGT > 1:1893449/1‑100
GCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCC < 2:1970990/100‑1
GCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCC < 1:1968467/100‑1
GCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTC > 1:212571/1‑99
TGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTT > 1:429945/1‑100
GGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTC > 2:1665768/1‑100
GGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTC > 1:856030/1‑100
GTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATCACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGACCTTCAT > 1:402661/1‑100
ATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGC > 1:1531399/1‑100
ATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGC < 2:2294535/100‑1
ttGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCG < 2:1636954/98‑1
TCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCG > 1:1440216/1‑100
CGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGG < 2:1870724/100‑1
CGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGG < 2:277113/100‑1
GCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGTGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGA > 1:172172/1‑100
GCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGA < 2:2652233/100‑1
CTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGCAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGAT < 2:1448610/100‑1
CTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGCAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGAT > 1:1521084/1‑100
TCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATn < 2:2568114/100‑2
CGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGT > 1:42030/1‑100
GCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTT > 2:2668535/1‑100
CCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTG > 2:1126296/1‑100
CCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTG > 1:2183380/1‑100
CACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGG < 2:839301/100‑1
CACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGG < 2:1952717/100‑1
CACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGG < 1:1487340/100‑1
AATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGC < 1:2075278/100‑1
AATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGC < 2:856022/100‑1
ATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCA < 2:2613307/100‑1
ATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCA < 1:664727/100‑1
TCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGT > 1:642530/1‑100
CTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTG < 2:1649631/100‑1
CTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTG < 2:1598766/100‑1
TGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGA > 2:453586/1‑100
TGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGA > 2:2263006/1‑100
GCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAA > 1:710536/1‑100
GCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAA < 2:1341346/100‑1
CGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAAT < 2:646798/100‑1
GCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAG < 1:1970152/100‑1
GCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAG > 2:1215406/1‑100
GCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGC < 2:489672/100‑1
GCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGC < 2:2265413/100‑1
GCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGACAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGC < 1:909517/100‑1
GGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTT > 1:858073/1‑100
GGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTT > 1:588937/1‑100
GGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTT < 1:1522367/100‑1
GCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTA > 1:2207859/1‑100
GCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTA > 2:299334/1‑100
CTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAG > 1:1731697/1‑100
CTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAG > 1:792015/1‑100
CTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAG > 1:1446147/1‑100
GTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTAT > 2:535372/1‑100
GTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTAT > 2:1794147/1‑100
TAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATC < 1:1134118/100‑1
AATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCA < 1:1052484/100‑1
AATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCA < 1:29315/100‑1
ATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAA < 1:1717802/100‑1
ATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAA > 2:1265485/1‑100
ATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAA < 2:429938/100‑1
ATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAA < 2:788553/100‑1
TGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAAT < 1:535379/100‑1
TAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCC < 2:2100466/100‑1
AGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGA > 1:2621033/1‑100
TGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTATGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATG < 2:1440202/100‑1
GATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGT > 2:830736/1‑100
ATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTA < 1:1215415/100‑1
TAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTAT < 1:1833568/100‑1
TAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGAGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTAT > 2:257521/1‑100
AACAGATGTCTGGAAATATAGGTGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGTATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATG > 2:136720/1‑100
AACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATG > 1:671536/1‑100
AACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTA < 2:446940/98‑1
ACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGA > 1:451001/1‑100
ACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGA > 2:169464/1‑100
CAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGAT > 2:1141339/1‑100
ATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAA < 1:1663617/100‑1
TGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAAT > 1:2503616/1‑100
TGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAAT > 1:2608800/1‑100
TGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAAT > 2:727363/1‑100
TGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACG > 1:54312/1‑100
GAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGA > 1:1384727/1‑100
TATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCA > 1:2604052/1‑100
AGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGTATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTT < 2:1893427/100‑1
GGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTG > 1:594492/1‑100
GGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTG > 2:485594/1‑100
GGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTG > 1:583831/1‑100
GGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGCATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAA > 2:1203477/1‑100
GCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAAT < 2:2207836/100‑1
tAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATG < 1:1545550/99‑1
CAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATn < 2:318761/100‑2
AAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGa > 2:1545536/1‑99
AATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGGTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGA < 1:1465865/100‑1
TCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGATA < 2:2625063/100‑1
AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3187329‑3187426
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGATA < NC_000913/3793847‑3793752
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
|---|
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
N/A
