Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F113 I1 R1
|
18 |
155.0 |
7745081 |
93.4% |
7233905 |
99.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| JC JC |
NC_000913 |
3,793,843 |
IS2 (–) +5 bp |
intergenic (‑160/‑140) |
yibB ← / → hldD |
YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding |
|
| |
seq id |
position |
reads (cov) |
reads (cov) |
score |
skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
| * |
? |
NC_000913 |
= 3187426 | NA (NA) | 158 (1.030) |
99/198 |
0.2 |
99.3% |
noncoding (1331/1331 nt) |
IS2 |
repeat region |
| ? | NC_000913 |
= 3793847 |
1 (0.010) | intergenic (‑164/‑140) |
yibB/hldD |
YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding |
| * |
? |
NC_000913 |
3793843 = | 1 (0.010) | 152 (0.990) |
96/198 |
0.2 |
99.3% |
intergenic (‑160/‑144) |
yibB/hldD |
YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding |
| ? | NC_000913 |
4498181 = |
NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) |
IS2 |
repeat region |
Only 100 of 158 total aligned reads displayed.
TAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3187328‑3187426
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGATAAT < NC_000913/3793847‑3793750
TAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAC > 1:3588515/1‑100
TAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAC < 2:2996898/100‑1
TAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAC < 1:3418215/100‑1
TGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAG < 1:445681/100‑1
TGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAG > 2:3343147/1‑100
CGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTC < 2:3763703/100‑1
CGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTC > 1:1608524/1‑100
CTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCT > 2:3483980/1‑100
GTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCAT > 1:730261/1‑100
GTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCAT > 1:3105349/1‑100
ATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGC < 1:2495957/100‑1
ATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGC < 1:1430912/100‑1
nCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCG > 2:1143100/2‑100
GCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGA > 1:3088793/1‑100
GCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGA > 1:1327785/1‑100
GCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGA > 1:1279495/1‑100
TCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATG < 1:3625129/100‑1
CGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGT > 1:1656795/1‑100
GCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTT < 1:1452611/100‑1
CCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTG < 1:996193/100‑1
ACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGT < 2:1846919/100‑1
CGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTT > 1:2066544/1‑100
GGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTT > 1:2184036/1‑100
GGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTT < 2:3160137/100‑1
cgatcTCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTG < 1:3330668/95‑1
GAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTG > 2:1939241/1‑100
ATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCA < 2:3665145/100‑1
TATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCAT > 2:2227829/1‑100
ATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATG > 1:3163/1‑100
TCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGT > 1:2864650/1‑100
CTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGagatcg > 2:3330651/1‑94
CTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTG < 1:2227838/100‑1
TGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGTTGTTGGTTTTGCATGTGA > 2:1647230/1‑100
GCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAA > 1:2947194/1‑100
GCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAA < 2:392966/100‑1
GGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATA > 2:1125035/1‑100
CAGCGTTCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGT > 2:765655/1‑100
CAGCGGGCCTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGT < 1:2934179/100‑1
GCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGC > 2:1802335/1‑100
GGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTT > 1:771107/1‑100
GCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTA > 2:591946/1‑100
GCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTA > 1:3673269/1‑100
CTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAG > 2:262537/1‑100
CTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAG > 2:3298786/1‑100
TTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGT < 1:2427956/100‑1
TGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTA < 1:1934528/100‑1
TAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATC < 2:1952791/100‑1
AATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCA < 2:583250/100‑1
AATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCA < 2:1266541/100‑1
AATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCA < 1:2634108/100‑1
ATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAA > 1:3516978/1‑100
ATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAA < 2:1445595/100‑1
ATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAA < 2:3828230/100‑1
TGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAAT < 1:1258788/100‑1
GGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATA < 1:2763532/100‑1
GTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGTATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATT < 2:454006/100‑1
GTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATT > 1:1103340/1‑100
TGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATG > 2:2602150/1‑100
GATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGT > 2:3218945/1‑100
GATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGT > 1:1368591/1‑100
GATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGT < 2:3088777/100‑1
ATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTA < 2:2860261/100‑1
ATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTA < 2:2370457/100‑1
TAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTAT < 2:530919/100‑1
CAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGAT < 1:3062046/100‑1
CAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGAT < 1:3483997/100‑1
AGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATA < 2:3657192/100‑1
GATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAA > 2:1860161/1‑100
TGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAAT > 1:3867626/1‑100
TCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAA > 1:179942/1‑100
CTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAAC < 2:1327782/100‑1
CTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAAC > 2:1050572/1‑100
CTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAAC > 1:3135160/1‑100
tccgatctTAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACG < 1:1062251/92‑1
TGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACG > 2:2774955/1‑100
TGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACG > 2:2079549/1‑100
TGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACG > 1:57592/1‑100
TGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGACCTTCATGGCGGAGGTTGGTTTGGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAA > 2:2253822/1‑98
GGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGG < 2:2184027/100‑1
GGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGG > 1:267936/1‑100
GAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGA > 1:2357215/1‑100
AAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAA < 1:517482/100‑1
AATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAG < 2:1636264/100‑1
TATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCA > 2:72069/1‑100
TAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGagatcgga > 2:1062248/1‑92
AGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTT < 1:1802339/100‑1
GGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAA > 1:3531787/1‑100
GGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAA > 1:3673496/1‑100
GGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAA > 1:471705/1‑100
GGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAA > 1:2125226/1‑100
AATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGA > 2:312876/1‑100
AATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGA < 1:3343164/100‑1
AATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGA > 1:3430803/1‑100
ATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGTAGCATTTGAATGGAT > 1:3799066/1‑100
ATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGAT < 2:2947179/100‑1
TCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGATA > 1:3280560/1‑100
CACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGATAAT > 1:853526/1‑100
CACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGATAAT > 2:3638796/1‑100
CACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGATAAT > 1:1555795/1‑100
CACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGATAAT < 2:2826280/100‑1
TAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3187328‑3187426
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGATAAT < NC_000913/3793847‑3793750
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
|---|
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
N/A
