Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F50 I0 R1
|
26 |
138.6 |
6843716 |
94.5% |
6467311 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| JC JC |
NC_000913 |
3,793,843 |
IS2 (–) +5 bp |
100% |
intergenic (‑160/‑140) |
yibB ← / → hldD |
YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding |
|
| |
seq id |
position |
reads (cov) |
reads (cov) |
score |
skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
| * |
? |
NC_000913 |
= 3187426 | NA (NA) | 134 (1.090) |
76/178 |
NT |
100% |
noncoding (1331/1331 nt) |
IS2 |
repeat region |
| ? | NC_000913 |
= 3793847 |
0 (0.000) | intergenic (‑164/‑140) |
yibB/hldD |
YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding |
| * |
? |
NC_000913 |
3793843 = | 0 (0.000) | 144 (1.170) |
84/178 |
NT |
100% |
intergenic (‑160/‑144) |
yibB/hldD |
YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding |
| ? | NC_000913 |
4498181 = |
NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) |
IS2 |
repeat region |
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
TAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3187328‑3187426
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGATAAT < NC_000913/3793847‑3793750
TAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACTGTAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAATTGATAACAGATGTCTTGAAATATAGGGGCAAATCCAC < 1:3051229/100‑1
AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACn < 1:2914847/100‑2
AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACT < 1:3281168/100‑1
AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACT < 2:2915765/100‑1
AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACT < 2:1113750/100‑1
AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACT < 2:3313335/100‑1
GTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTA > 2:3155339/1‑100
GTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTA > 2:3321854/1‑100
GTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTA > 1:3369785/1‑100
TGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGAGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAG > 2:2007741/1‑100
GCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCC < 1:443475/100‑1
CTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGACATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCT > 2:2831037/1‑100
CTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCT > 1:592141/1‑100
GGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTC < 2:1685880/100‑1
GGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCA < 1:1296410/100‑1
GGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCA < 1:1142716/100‑1
GGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCA < 1:106208/100‑1
TATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGG > 1:1800126/1‑100
TATCGCGCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGG < 2:641075/100‑1
atgGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGGAGCGGGCGTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCA < 1:106250/93‑1
ATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGC > 1:3147236/1‑100
GCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGA > 2:2253327/1‑100
GCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGA < 2:3147254/100‑1
GCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGA > 1:1835568/1‑100
CTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGAT > 2:1589244/1‑100
CTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGG < 1:978794/98‑1
CGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGT > 1:882454/1‑100
CCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTG > 1:2629951/1‑100
CCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTG > 1:1679748/1‑100
CACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGG > 2:3099194/1‑100
CACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGG < 1:1323028/100‑1
ACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGT < 1:3307998/100‑1
GGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTT < 1:67568/100‑1
GAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTG < 1:1878291/100‑1
GAATACCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTG < 2:2128507/100‑1
AATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGC < 2:645932/100‑1
ATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCA < 2:2975163/100‑1
ATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCA < 2:944350/100‑1
ATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCA < 2:2557732/100‑1
CTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTG > 2:2719493/1‑100
TGCGGCAGCGGGCTTGTAATGAGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGA > 1:3316127/1‑100
GCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAG < 1:1256117/100‑1
CGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAAGAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCT > 2:2075672/1‑100
gatcTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTT < 2:33535/96‑1
GGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTT < 1:293340/100‑1
GGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTT > 2:1846464/1‑100
GCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTA < 2:2340551/100‑1
TTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGT > 1:2722464/1‑100
TGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTA > 1:524936/1‑100
GTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGatc > 1:33535/1‑97
GTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTAT > 1:1603046/1‑100
GTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTAT > 2:1357662/1‑100
TAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATC > 1:524043/1‑100
ATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAA < 1:2423/100‑1
ATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAA < 2:1228725/100‑1
TGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAAT < 1:2790610/100‑1
TGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAAT < 2:1484541/100‑1
GGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATA < 1:1883563/100‑1
GGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAAT < 2:1863416/99‑1
GGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATAT > 1:2218404/1‑100
GGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATA > 1:72816/1‑99
GTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATT > 2:135107/1‑100
GTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGATGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATT > 1:862844/1‑100
GTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGAT > 1:152706/1‑100
GTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCG > 2:2457101/1‑98
TGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCTGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATG < 2:72816/100‑1
ATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTA > 2:3355968/1‑100
TAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGCTGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTAT > 1:2619085/1‑100
TAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTAT > 1:2359808/1‑100
AGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATA < 1:1319586/100‑1
tctTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATA < 2:2604968/97‑1
GTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATA > 1:1686345/1‑100
GTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATA > 1:271681/1‑100
aTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCAAGTGAATAGTGGTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAAC > 1:1095173/2‑100
CTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAAC > 2:3241090/1‑100
TGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAAga > 1:2604952/1‑98
TGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACG > 2:654414/1‑100
TGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACG > 1:2517622/1‑100
TGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACG < 1:2305800/100‑1
TGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACG > 2:2129043/1‑100
TGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACG > 2:1036875/1‑100
TGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACG > 2:1510123/1‑100
AAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCAGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTACTATCAATATTCCCATGTATGATAAATAACGGA < 1:3107732/99‑1
ATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGC > 1:195476/1‑100
AGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTT > 1:2924494/1‑100
GGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGGTGTATGATAAATAACGGAAGCATTTG > 2:1330240/1‑100
GGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTG > 2:2596789/1‑100
GGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTG < 2:1075677/100‑1
GGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTG < 1:2129032/100‑1
GGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAA > 2:115111/1‑100
GGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAA > 1:455701/1‑100
CAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATG < 1:2847713/100‑1
CAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATG > 2:772933/1‑100
CAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATG < 1:2970193/100‑1
CAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGGTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAAT > 2:3011565/1‑99
ATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGAT > 2:514908/1‑100
TCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGAT > 1:2591977/1‑99
CCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGATA < 1:1379858/99‑1
CACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGATAAT < 2:1988704/100‑1
CACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGATAAT < 2:2423246/100‑1
TAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3187328‑3187426
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGATAAT < NC_000913/3793847‑3793750
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
|---|
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
N/A
