Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F50 I1 R1
|
14 |
141.9 |
7085095 |
93.3% |
6610393 |
99.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| JC JC |
NC_000913 |
3,793,843 |
IS2 (–) +5 bp |
intergenic (‑160/‑140) |
yibB ← / → hldD |
YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding |
|
| |
seq id |
position |
reads (cov) |
reads (cov) |
score |
skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
| * |
? |
NC_000913 |
= 3187426 | NA (NA) | 165 (1.170) |
99/198 |
0.1 |
100% |
noncoding (1331/1331 nt) |
IS2 |
repeat region |
| ? | NC_000913 |
= 3793847 |
0 (0.000) | intergenic (‑164/‑140) |
yibB/hldD |
YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding |
| * |
? |
NC_000913 |
3793843 = | 0 (0.000) | 153 (1.090) |
93/198 |
0.2 |
100% |
intergenic (‑160/‑144) |
yibB/hldD |
YibB family protein, function unknown/ADP‑L‑glycero‑D‑mannoheptose‑6‑epimerase, NAD(P)‑binding |
| ? | NC_000913 |
4498181 = |
NA (NA) | noncoding (1/1331 nt) |
IS2 |
repeat region |
Only 100 of 165 total aligned reads displayed.
TAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3187328‑3187426
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGATAATA < NC_000913/3793847‑3793749
TAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAC < 1:3537449/100‑1
TAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCAC > 1:1560257/1‑100
AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCTGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACT < 2:1086829/100‑1
AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACT < 2:2020440/100‑1
AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACT < 1:2426817/100‑1
AGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCGGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACg < 2:2389182/100‑2
GTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTA > 1:2412882/1‑100
GCGCTGGGTTATCGCTCGGCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGT < 2:3408857/100‑1
CGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTC < 1:1254759/100‑1
GCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCC > 2:583679/1‑100
CTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCT < 2:442639/100‑1
CTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCT > 1:1449396/1‑100
CTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCT < 2:2222752/100‑1
GGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTC > 1:2327964/1‑100
GGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCA > 2:2622081/1‑100
GGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCA < 2:475761/100‑1
GTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCAT > 2:2905573/1‑100
TATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGG < 1:3478213/100‑1
ATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGC > 2:2135263/1‑100
TCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCG < 2:1404967/100‑1
GCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGA > 2:3136018/1‑100
CTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGAT > 2:3216015/1‑100
CGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGT > 2:1986452/1‑100
GCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTT > 2:1171061/1‑100
CCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTG > 2:800493/1‑100
CACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGG < 1:973812/100‑1
CACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGG < 2:2884459/100‑1
GGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTT < 1:2503313/100‑1
GGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTT < 2:798096/100‑1
GGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTT < 2:589714/100‑1
GGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTT > 2:1221015/1‑100
acTATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGC < 1:2151284/98‑1
ATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCA < 1:1292666/100‑1
ATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATG > 1:2247984/1‑100
ATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATG < 1:2790294/100‑1
CTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTG > 2:668336/1‑100
CTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTG < 1:384678/100‑1
GCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAA > 2:2058410/1‑100
GCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGGGATAACAGAGGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAA > 2:2265607/1‑100
CGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAAT > 2:1520349/1‑100
GGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATA > 1:6872/1‑100
GCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAG < 1:814093/100‑1
GGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTT > 2:2106855/1‑100
GGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTT > 1:3529986/1‑100
GCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAAGGGCAAATCCACTAGTCCTGCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTA > 1:1934464/1‑100
ttccgatctGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAG < 2:1607534/91‑1
CTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAG < 1:1323368/100‑1
TGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTA < 2:960979/100‑1
TGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGT > 1:1221300/1‑99
TGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGACGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTA > 2:1765458/1‑100
GTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTAT > 2:2493249/1‑100
TAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATC < 2:1588042/100‑1
AATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCA > 1:2430832/1‑100
AATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCA < 1:761687/100‑1
ATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAA < 1:1986440/100‑1
GTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGAT > 2:1036500/1‑100
tgcTAACAGATGGCTGGAAATATATGGGCACATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAAGAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATG < 2:3264496/97‑1
TGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATG > 1:3459017/1‑100
GATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGT > 2:3150334/1‑100
ATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTA < 2:2820672/100‑1
gcgcggTGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGG‑TTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGA > 2:2400252/7‑100
CAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGAT > 1:558631/1‑100
GATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAA > 1:2195249/1‑100
ATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAA < 1:81862/100‑1
TGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAAT < 1:1625122/100‑1
TCTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAA > 2:546446/1‑100
CTGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAAC > 2:1552495/1‑100
TGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACG > 1:1165552/1‑100
TGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACG > 2:2361629/1‑100
TGGAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACG < 2:355738/100‑1
GAAATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGA > 1:872830/1‑100
AATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAG < 1:2058397/100‑1
AATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAG < 2:1449402/100‑1
AATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAG > 1:3318516/1‑100
ATATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGC < 2:2252094/100‑1
atgGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCAT > 1:2339988/4‑100
ATAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATTGCGGATGTCGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCA > 2:3540016/1‑99
TAGGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATT > 2:3073884/1‑100
GGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTG > 2:2595764/1‑100
GGGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTG < 2:1565062/100‑1
GGGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGA > 1:3121280/1‑100
GGCAAATCCACTAGTTCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTTCGTTGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGA > 1:1957881/1‑99
GGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAA > 1:1133280/1‑100
GGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAA > 2:47401/1‑100
GGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAA > 2:1469918/1‑100
GGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAA < 1:3097982/100‑1
GGCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTCCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAA > 1:2184297/1‑100
GGCAAATAAACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGAATGTAAATAGTGCTTTAGTCTCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGA < 1:3176762/99‑1
GCAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAAT < 1:2047107/100‑1
CAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATG < 1:445150/100‑1
CAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATG < 1:472008/100‑1
CAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATG < 1:1520343/100‑1
CAAATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATG > 1:1369578/1‑100
AATCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGA > 1:2590323/1‑100
ATCCACTAGTCCTTCATGACGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGAT < 1:1765449/100‑1
TCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGATA < 1:529987/100‑1
TCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGATA > 1:1667514/1‑100
TCCACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGATA > 1:1595791/1‑100
CACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGATAAT > 1:2279193/1‑100
CACTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGATAAT > 1:2027562/1‑100
TAGTGCGCTGGGTTATCGCTCGCCACGGGAATATCTGCGGCAGCGGGCTTGTAATGGGTTAAGTGATAACAGATGTCTGGAAATATAGGGGCAAATCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3187328‑3187426
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CTAGTCCTTCATGGCGGATGTTGGTTTTGCATGTGAATAGTGCTTTAGTATCAATATTCCGATGTATGATAAATAACGGAAGCATTTGAATGGATAATA < NC_000913/3793847‑3793749
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
|---|
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
N/A
