Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A9 F46 I1 R1
|
10 |
85.9 |
3009552 |
97.3% |
2928294 |
148.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| JC JC |
NC_000913 |
3,890,075 |
IS5 (–) +4 bp |
coding (1346‑1349/1416 nt) |
tnaA → |
tryptophanase/L‑cysteine desulfhydrase, PLP‑dependent |
|
| |
seq id |
position |
reads (cov) |
reads (cov) |
score |
skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
| * |
? |
NC_000913 |
= 2290113 | NA (NA) | 103 (1.110) |
69/296 |
0.3 |
100% |
noncoding (1/1195 nt) |
IS5 |
repeat region |
| ? | NC_000913 |
3890075 = |
0 (0.000) | coding (1346/1416 nt) |
tnaA |
tryptophanase/L‑cysteine desulfhydrase, PLP‑dependent |
| * |
? |
NC_000913 |
3652036 = | NA (NA) | 165 (1.770) |
108/296 |
0.0 |
100% |
noncoding (1195/1195 nt) |
IS5 |
repeat region |
| ? | NC_000913 |
= 3890078 |
0 (0.000) | coding (1349/1416 nt) |
tnaA |
tryptophanase/L‑cysteine desulfhydrase, PLP‑dependent |
Only 100 of 103 total aligned reads displayed.
CGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289966‑2290113
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCT‑ > NC_000913/3890075‑3890223
ctggtCAAGATAATCTCTTTTCTTGTCTGACGGCGCTTACTGATGAAATCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTCTGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 1:79284/144‑1
CGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 1:285423/149‑1
CGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 1:525928/149‑1
CGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 2:891099/149‑1
CGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCAAATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 2:693038/149‑1
CGGGACAAGAAAATCGCTTTTCTTGTCTGAAGGCGCGTACTTCTGAATTCCCTGTCCTCGTAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACATACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 2:1372877/149‑1
GGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATTACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT < 1:1243830/149‑1
GGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT > 1:1261733/1‑149
GGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAATCATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 2:1059948/149‑1
GGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCAGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTATTCGCACCTTCCTTA < 1:625468/149‑1
GACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAA < 2:1047220/149‑1
ACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAA < 1:1054320/149‑1
cacGAAAATCTCTTTTGTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGACCCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAG < 1:1306572/146‑1
AAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGG < 1:1475259/149‑1
atAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGA < 2:889128/147‑1
GAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGAT > 1:1177366/1‑149
GAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGAT > 2:1168902/1‑149
AAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGATGAAATCACTGTAGGCGAAGGTAAGTAGAAGACACATGATGAACACTGTTCAATGGCTACAGATGACAAACATGATCACATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCATTAAAGGATT > 2:1489481/1‑149
TCTCTTTTCTGGTCTGACGGAGCTTATTGCTGAATTCAGTGTCGTCGAATGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTTAAGGATTAACC < 1:1281666/149‑1
TCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTT > 2:318002/1‑149
TCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTT < 1:441697/149‑1
CTTTGCTGGTCTGACGGCGCTTACTTGTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGAGGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCAAATCAGGGACTAGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTT < 1:849554/149‑1
TTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACG < 2:1173865/149‑1
TCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGGATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCTCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGT > 2:528731/1‑149
CTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCAAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAATGATTAACCTTTACGTA > 1:1480408/1‑149
TGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGTTAATCCTTTAaggaa < 2:216270/149‑6
GTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGA > 1:389501/1‑149
TCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAA < 2:214764/149‑1
ACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACC < 2:128834/133‑1
ACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGAGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACC > 1:128834/1‑133
CGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAA < 2:163893/149‑1
GCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTA < 2:854905/149‑1
GCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTA > 1:66482/1‑149
CTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTAT < 2:546658/149‑1
TTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATT < 1:488370/149‑1
ACTGCTGAATTCACTGTCGGCTATTGTAAGTTGATGAGTTATGATGATCCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAATATGTTCTCATCTCAGTGTCTTGTTCGCACCTTCCTTTAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGC < 1:601659/149‑1
ACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGC < 1:773231/149‑1
TGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACCTGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGT < 2:331112/149‑1
TGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGT < 1:1295126/149‑1
TGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGT > 1:43695/1‑149
TGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTAACGTACGAACCGAAAGTATTGCGT < 1:1055662/149‑1
CTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCA > 1:751723/1‑149
CTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 2:9301/109‑1
CTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA > 1:9301/1‑109
CTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATAACAGGGACTTGTTAGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCA > 2:596541/1‑149
AATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTT > 2:411590/1‑149
AATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGAGGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTT < 1:1357101/149‑1
TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCA > 2:1103391/1‑149
TCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACAGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAA > 1:232468/1‑149
AAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAA > 2:637846/1‑149
AGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTGCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGTAAGTATTGCGTCACTTGACCGCAATACTTAAA > 2:889579/1‑149
GTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGA > 2:242520/1‑149
AGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCTCCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT < 2:237999/149‑1
TTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTT > 1:874023/1‑149
TTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTAAGTACGAACCGAAAGTATTTCTTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTT > 1:291920/1‑149
GATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAA > 2:713298/1‑149
GATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCATAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTAATGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGCAGTTTAA < 1:178285/149‑1
cTGACTCATGATGATCCCTGTGCTATGGCTCCAGTTGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAAT < 2:1472311/148‑1
TGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATT < 1:188663/149‑1
TCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATA > 1:1307187/1‑149
TCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATA < 2:388863/149‑1
TCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACAGCAAACAATAAAGAATTTAAATTAATA > 1:1013201/1‑149
TCAAGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAGCCGAAAGTATTGCGTCAATTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATA > 1:54452/1‑149
GAACCCTGTTCTATGACTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGA < 1:64728/149‑1
GAACCCTGTGCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGA < 1:1083716/149‑1
ACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGAGTCACTTCACCGCAACACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGT > 1:1210959/1‑149
CCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTG < 2:770054/149‑1
CCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTG < 1:1347840/149‑1
CCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGG > 2:16460/1‑149
TATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAG > 2:1044186/1‑149
TCCAGATGACAACAATGATCTCATATCAGGGTCTGGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGATCCGAAAGTATTGCGTGACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTT < 2:159602/149‑1
TCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTT < 1:1193289/149‑1
TCCAGATGACAAACATGATCTCAACTCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTT < 2:848980/149‑1
TGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCAC > 2:66907/1‑149
ACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTATCTT > 2:884220/1‑149
TGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACC < 2:874023/149‑1
CTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTAC > 1:1016906/1‑149
TCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACA > 1:123974/1‑149
ATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAAATTAAAGAAGTTTAATTAAAACTACAGATTGGCTATAAGGATGTTATCAACTCTAATACCCTACATCCT > 1:282687/1‑149
catGGACTTGTTCGCAACTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGTATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCA < 1:1322969/146‑1
AGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCataaa > 2:428116/1‑144
GGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTTCCCTACATCCTCAATA > 1:746433/1‑149
GGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATA > 2:1273604/1‑149
GGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATA > 2:1070197/1‑149
GGACTAGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATA > 1:381973/1‑149
GACTTGTTCGCACCTTCCTTAAATGATTAACATTTACGTACGAACCTAAAGTAATGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAA < 1:1089960/149‑1
ACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAAC < 2:607085/149‑1
ACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAAATTAAACAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGATAGACACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAAC > 2:496005/1‑149
TTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAA > 1:1422104/1‑149
tTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAA < 1:1310692/148‑1
TTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAA < 2:854964/149‑1
GCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAG < 1:596541/149‑1
CACCTTCCTTAAAGTATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGC < 1:889579/149‑1
CACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGC < 2:1480408/149‑1
CACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGC > 2:406755/1‑149
ACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCGATAACAAAAATAGCC > 1:873837/1‑149
ACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGAGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCC > 2:775802/1‑149
CCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTCATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCT < 1:499680/149‑1
CCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACAGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCT < 1:71302/149‑1
CTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACC‑‑ACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCTa > 1:813865/1‑148
CGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289966‑2290113
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCT‑ > NC_000913/3890075‑3890223
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
|---|
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
N/A
