Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A9 F13 I0 R1
|
142 |
350.4 |
10991664 |
98.8% |
10859764 |
149.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| JC JC |
NC_000913 |
3,890,075 |
IS5 (–) +4 bp |
100% |
coding (1346‑1349/1416 nt) |
tnaA → |
tryptophanase/L‑cysteine desulfhydrase, PLP‑dependent |
|
| |
seq id |
position |
reads (cov) |
reads (cov) |
score |
skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
| * |
? |
NC_000913 |
= 2290113 | NA (NA) | 295 (0.910) |
140/278 |
NT |
99.7% |
noncoding (1/1195 nt) |
IS5 |
repeat region |
| ? | NC_000913 |
3890075 = |
1 (0.000) | coding (1346/1416 nt) |
tnaA |
tryptophanase/L‑cysteine desulfhydrase, PLP‑dependent |
| * |
? |
NC_000913 |
3652036 = | NA (NA) | 334 (1.030) |
137/278 |
NT |
99.7% |
noncoding (1195/1195 nt) |
IS5 |
repeat region |
| ? | NC_000913 |
= 3890078 |
1 (0.000) | coding (1349/1416 nt) |
tnaA |
tryptophanase/L‑cysteine desulfhydrase, PLP‑dependent |
Only 100 of 339 total aligned reads displayed.
GCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289965‑2290113
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCT > NC_000913/3890075‑3890223
GCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 1:3770003/150‑1
GCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 2:254864/150‑1
CGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT > 1:2309251/1‑150
CGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT > 2:2608803/1‑150
CGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT > 1:1950087/1‑150
CGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT < 1:177763/150‑1
CGGGACAAGAAAATCACTTTTCTGGACTGACGGCGCTTACTGCTGAAATCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT < 2:5440093/150‑1
GGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 1:4800810/150‑1
GGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 1:3686565/150‑1
GGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAA > 1:309995/1‑150
GACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAATGTAAGTTGATGACTCATGATGAACACTGTTCTATGTCTCAAGATGACAAACATGATCACATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAA > 2:3010851/1‑150
GACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAA < 1:2440615/150‑1
AAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGA < 2:3476790/150‑1
AAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGA < 1:1617433/150‑1
AGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGAT > 1:1514048/1‑150
AGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGAT > 1:3616435/1‑150
GAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATT > 1:3240737/1‑150
GAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATT > 1:279769/1‑150
AATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAAC < 2:2312519/150‑1
AATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAAC < 1:2388680/150‑1
cTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAGGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTAC < 2:950663/149‑1
TTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTTCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTAC > 1:4142998/1‑150
TTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGT < 2:214128/150‑1
CTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCCTGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTAC < 2:816379/150‑1
TGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACG > 1:805716/1‑150
TGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACG < 2:1167505/150‑1
GGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGA < 2:4994149/150‑1
TCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAAC > 1:5353624/1‑150
CTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACC > 1:840987/1‑150
CGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAA < 2:125765/150‑1
CGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAA < 1:2072810/150‑1
GGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAG < 1:4391257/150‑1
GCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTAT < 2:3029238/150‑1
CTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATT < 1:2024623/150‑1
TACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACTTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGC < 2:4214530/150‑1
CTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGT < 2:1870523/150‑1
CTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGAGTCAC > 2:1703260/1‑150
ATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCA < 1:720268/150‑1
TTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCAC > 1:4062802/1‑150
TCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACC > 1:1911469/1‑150
TCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACC < 1:2747176/150‑1
TCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAA > 1:5471677/1‑150
TCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAA < 2:2150820/150‑1
GCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTT > 2:2215209/1‑150
GAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAA < 1:4877170/150‑1
GAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAA < 2:3240737/150‑1
AAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAA < 2:3835119/150‑1
GTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAA < 2:2420075/150‑1
GTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAACGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAA < 1:950203/150‑1
TAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAATTATTGCTTCACTTCACCGCAAAACTTAAATAAt > 2:4562319/1‑149
TAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAG > 1:329520/1‑150
AGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑T < 2:5161211/150‑1
GATGACTCATGATGAACCCTGCTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAAT < 1:1157040/150‑1
TGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTA > 2:3630385/1‑150
TCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATAC > 2:66217/1‑150
TCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATAC > 1:4334605/1‑150
CATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACT > 1:2680511/1‑150
TGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTAC < 1:2248716/150‑1
AACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCAACGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGT > 2:5104669/1‑150
CCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGG < 2:4266440/150‑1
CCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGG < 1:2197509/150‑1
CCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGG > 2:2435982/1‑150
CCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGa > 2:2768332/1‑149
CCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGC > 2:3068396/1‑150
ATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGA < 2:2001139/150‑1
TGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTAAGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGAT > 1:1414325/1‑150
GCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGT > 1:4965279/1‑150
TCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTA < 1:90552/150‑1
GACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTC < 2:5353624/150‑1
GACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTC < 2:3416060/150‑1
AAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAGAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGA‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAATGATGTTATCCACTCTCT > 2:3755645/1‑150
AAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGATAGCCACTCTCT > 2:1647921/1‑150
AACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTT > 2:2936950/1‑150
ACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTA > 2:4688442/1‑150
CATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTAC < 2:4350243/150‑1
TGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTAAGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCAACTCTCTTACCa > 1:1710676/1‑149
GATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCT < 2:4079096/150‑1
GATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGAACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTAAAAGAAGA‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCT > 2:502775/1‑150
ATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTAC < 2:3683791/150‑1
TCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTAC > 1:3403900/1‑150
TCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTAC > 1:3500151/1‑150
TCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATA > 2:1893993/1‑107
TCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTAGCCTACAT > 1:504193/1‑150
ATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTC < 2:552869/150‑1
ATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTC < 1:3989831/150‑1
TCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCA < 2:2802085/150‑1
CAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAA < 1:2996124/150‑1
AGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTGCCCTACATCCTCAAT > 1:2926314/1‑150
GACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAAC > 1:647516/1‑150
TTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAA > 1:2520223/1‑150
TTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAA > 1:1140891/1‑150
TTGTTCGCACCTTACTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAATGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAA < 1:4637213/150‑1
TTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCATCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAAT > 2:1423528/1‑150
TTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAAT > 1:1094910/1‑150
TTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACACTACATCCTCAATAACAAAAAT > 2:1062115/1‑150
TCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATA < 1:2577084/150‑1
CGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACACTACATCCTCAATAACAAAAATAG > 1:1326403/1‑150
GCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGC > 1:52090/1‑150
ACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCT > 2:3519992/1‑150
CTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCT < 1:3932078/150‑1
GCGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289965‑2290113
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGT‑‑‑‑TTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTCT > NC_000913/3890075‑3890223
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
|---|
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
N/A
