Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A10 F48 I1 R1
|
14 |
80.1 |
2614210 |
97.0% |
2535783 |
148.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| JC JC |
NC_000913 |
3,890,075 |
IS5 (–) +4 bp |
coding (1346‑1349/1416 nt) |
tnaA → |
tryptophanase/L‑cysteine desulfhydrase, PLP‑dependent |
|
| |
seq id |
position |
reads (cov) |
reads (cov) |
score |
skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
| * |
? |
NC_000913 |
= 2290113 | NA (NA) | 106 (1.320) |
72/296 |
0.1 |
100% |
noncoding (1/1195 nt) |
IS5 |
repeat region |
| ? | NC_000913 |
3890075 = |
0 (0.000) | coding (1346/1416 nt) |
tnaA |
tryptophanase/L‑cysteine desulfhydrase, PLP‑dependent |
| * |
? |
NC_000913 |
3652036 = | NA (NA) | 71 (0.880) |
54/296 |
0.5 |
100% |
noncoding (1195/1195 nt) |
IS5 |
repeat region |
| ? | NC_000913 |
= 3890078 |
0 (0.000) | coding (1349/1416 nt) |
tnaA |
tryptophanase/L‑cysteine desulfhydrase, PLP‑dependent |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
CGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289966‑2290113
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTC > NC_000913/3890075‑3890219
CGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 1:695982/149‑1
CGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 2:680986/149‑1
ggtACAAGAAATTCTCTTTTCTGGTCTGAGGGCGCTTAGTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTATGTTGATGACTCATGATGATCCATGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCTGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT < 2:132007/146‑1
GGGACAATAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGTCGCTTACTGCTGAATTCACTTTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATTAACCCTGTTCTATGGAGCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT < 1:1279968/149‑1
GGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTGTGACGGCGCCTACTGCTGACTTCACTGTCGGCGAAGGTTAGTTGATGACTCATGAAGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT < 2:1132557/149‑1
GGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT > 2:960801/1‑149
GGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT < 2:660278/149‑1
GGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 1:23987/149‑1
GGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 2:473701/149‑1
GGACAAGAAAATCTCATTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 2:520139/149‑1
GACATGAACATCTCTTTTCTGGTCAGACGGCGCTTACTGCTGAATTCCCTGTCTGCGATGGTAAGTTCATGACTCTTTATGAACCCAGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGTGACTTGTTCGCACCTTCCTTAt < 2:894746/149‑2
GACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACTAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCAACTTGCTTAA > 1:359178/1‑149
ACAAGAAAATGTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCAGTGTCTGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAA < 1:1288789/149‑1
ACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTTACGCCGCGTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAA < 1:973137/149‑1
ACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGTTAACTTGATGAATCATGATTAAGCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATGTCATATCAGGGACTTGTGAGCACCATCCTTAtg > 2:725963/1‑147
ACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAA > 2:269709/1‑149
ACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAA > 2:764649/1‑149
AAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGG > 1:171617/1‑149
AAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGG > 2:1138057/1‑149
AAGAAAATCTCTATTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGGTGAATACACTGTCGCCGAAGGTAATTTGATGAATCATGATCACCCCTGTTCTATGGATCAAGATCACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAcc > 1:514360/1‑147
AGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGA < 1:613558/149‑1
AAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATT < 2:1061941/149‑1
AAATCTCTTTTCTGGTCTAACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTA < 1:1054695/149‑1
TTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTAC < 1:37319/149‑1
GTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGA > 1:257469/1‑149
CTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAAC < 1:278506/149‑1
CGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACTTTTACGTACGAACCGAA < 2:916187/149‑1
GGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAA < 1:187903/149‑1
CGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGT < 2:635944/149‑1
TTACTGCTGATTTCACTTTCGGAGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAATGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATT < 1:332653/149‑1
TGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGT > 2:928080/1‑149
GCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGCCAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTGTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTC > 1:1038785/1‑149
GCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCGTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTC > 2:1113311/1‑149
CTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCA > 1:445387/1‑149
GAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGCACCGAAAGTATTTCGTCCCT > 1:890763/1‑149
TTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCA > 2:1131037/1‑149
TCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATTGCTCCAGATGACAAACATTATCTCATATCAGGGACATGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCAC > 2:1125548/1‑149
CACTGTAGGCGAAGGTAAGTTTATCAATAATGATGATCCATGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAATGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTTCGTCACTTCACC < 2:124986/149‑1
ACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATCAACCCTGGTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTAAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCG > 1:900059/1‑149
TGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCA > 1:931088/1‑149
GTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAA < 2:409264/149‑1
TCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAA < 1:1101790/149‑1
GCGAAGGTAAGTTGATGACTCATTATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACT < 1:325218/149‑1
GAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTA < 1:564989/149‑1
AAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACACGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAATGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAA < 2:343926/149‑1
AGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAA < 1:524285/149‑1
TTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGATCCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTT > 1:1222834/1‑149
GATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGATCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAA < 1:96156/149‑1
ATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAAT < 1:207926/149‑1
ACTGATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGAAAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAA < 2:1009049/149‑1
CTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAAT < 2:579639/149‑1
TCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCAGTTCACCGCAAAACTTAAAGAATTTTAATTAATA > 1:863848/1‑149
GATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTAC > 2:137023/1‑149
CCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTG > 1:1056780/1‑149
CCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTG > 1:135015/1‑149
CCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTG > 1:735298/1‑149
TGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCT > 2:563840/1‑149
GTTCTAAGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCATCCTTAAAGGATTAAGCTTTACGTACGCACCGAAAGTATTGCGTCACTTCAGCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTA < 2:410924/149‑1
TTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTAT < 2:735298/149‑1
TATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCAACTTCCTTAAAGGATTAACATTTAAGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCAACGCATAACTTAATGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTTGCTATAAG < 1:268193/149‑1
GGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGAT < 1:269709/149‑1
GGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGAT > 1:921466/1‑149
tcaAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGATACTATTGCGTCACTTAACCGCAAAAATTATAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTT > 1:655432/4‑149
TCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGAATTGTTCGCACCTTCATTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCTAAAGTATTTCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTT < 2:220818/149‑1
TCCAGAAGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAATGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTTATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTT > 1:1232692/1‑149
CCAGATGACACACAAGATCTCACATCAGGCACTTGTTCGCACCTTCCTTCAAGGATTACCCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCCAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATCAGGAAGTca < 2:1185877/149‑3
CAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTTCGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGGTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAG > 2:1143349/1‑149
CAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATAAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAG > 2:907511/1‑149
atATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGC < 2:1094828/147‑1
CAAACATGATCTCCTATCAGGGACTTGGTCGCACCTTACTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAAGCGACAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCT < 2:863304/149‑1
AAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTa > 1:70886/1‑148
AAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGATATAAGGATGTTAGCCACTCTC > 1:358414/1‑149
AAACATGATATAATATCAGGGACTTCTTCGCACCTTCATTAAAGGATTAACCTTTACGTACTAAACGAAAGTATTTCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATAATACATAGTGTCTATAACTATGTTAGCCACTCaa > 2:1099776/1‑147
CATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTA > 2:111957/1‑149
CATGATCTCATATCAGGGACTTGATCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTA < 2:257469/149‑1
TGATCTCATATCAGGTACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACC < 2:1177536/149‑1
ATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAATACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATC > 1:73080/1‑149
ATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATC > 1:989901/1‑149
TATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTACCCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCC > 1:971572/1‑149
ATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGAT > 2:373245/1‑122
ATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGAT < 1:373245/122‑1
ATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCATAAAGAATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCT < 2:609652/149‑1
TCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAGAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTC > 2:1088245/1‑149
TCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAATGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCGTACATCCTC > 2:781172/1‑149
TCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCAACTCTCTTACACTACATCCTC > 2:928400/1‑149
TCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCAATAAGGATGTTATCCTCTCTCTTAGCCTAagtcgtc > 2:554760/1‑142
AGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAA < 2:687758/149‑1
ACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAAACTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGATTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGTATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATACTCAATtaa > 2:872108/1‑146
CTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAAGCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTTGAAGGAGGGTGGCCACGCTCTTACCCTACAGCCTCAAGAACA > 2:1200134/1‑149
TTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGGTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATATCAA > 2:1146466/1‑149
TTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGTCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAA > 1:1270888/1‑149
TTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAA < 1:1125548/149‑1
TTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAA > 2:1297525/1‑149
CGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTATACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTTAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAATAATA < 2:1164297/149‑1
GCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAATGAAGTTTAAGTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACATAAATAG > 1:846215/1‑149
CACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGC < 1:928080/149‑1
CACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCATACATCCTCAATAACAAAAATAGC > 1:842372/1‑149
ACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCC < 1:1203735/149‑1
TTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCCCCGCACAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACCGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTC > 1:1010649/1‑149
TTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTC < 2:171617/149‑1
CGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289966‑2290113
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTC > NC_000913/3890075‑3890219
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
|---|
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
N/A
