Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A10 F48 I0 R1
|
217 |
96.9 |
3144200 |
97.2% |
3056162 |
148.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| JC JC |
NC_000913 |
3,890,075 |
IS5 (–) +4 bp |
100% |
coding (1346‑1349/1416 nt) |
tnaA → |
tryptophanase/L‑cysteine desulfhydrase, PLP‑dependent |
|
| |
seq id |
position |
reads (cov) |
reads (cov) |
score |
skew |
freq |
annotation |
gene |
product |
| * |
? |
NC_000913 |
= 2290113 | NA (NA) | 110 (1.210) |
89/276 |
NT |
100% |
noncoding (1/1195 nt) |
IS5 |
repeat region |
| ? | NC_000913 |
3890075 = |
0 (0.000) | coding (1346/1416 nt) |
tnaA |
tryptophanase/L‑cysteine desulfhydrase, PLP‑dependent |
| * |
? |
NC_000913 |
3652036 = | NA (NA) | 93 (1.030) |
69/276 |
NT |
100% |
noncoding (1195/1195 nt) |
IS5 |
repeat region |
| ? | NC_000913 |
= 3890078 |
0 (0.000) | coding (1349/1416 nt) |
tnaA |
tryptophanase/L‑cysteine desulfhydrase, PLP‑dependent |
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
CGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289966‑2290113
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTC > NC_000913/3890075‑3890222
cggcaacAGAAAATCACTTTTCTGGTCTGACGTCGGTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAATTTGATGACTCATGATGAACCCTTTTATATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 2:300946/142‑1
CGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 2:1374554/149‑1
CGGGACAAGAAAATCTCTTATCTGGTCAGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCT < 2:1231966/149‑1
gtGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAAGTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGTTGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCTCCTTCCTT < 2:1170560/147‑1
GGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTT > 2:1135812/1‑149
gtaaAAGAAAATCTCTTTTCTGGGCTGAAGTCTCTTAATGCTGATTTCACTGTCTGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTACAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 1:843908/145‑1
GGACCACAAAATCTCAGTTCTGGTCTGACGGCGCTTCCTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGGTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCCGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 2:286448/149‑1
GGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGGCGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTTAGTTGATGACTCATGATGAACCATGGTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATTTCAGGGTCTTGTTCGCCACTTCCTTA > 2:132195/1‑149
GGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGGCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTA < 1:912250/149‑1
GACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAA > 2:539796/1‑149
GACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAA < 1:1135367/149‑1
AAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGG > 1:1565329/1‑149
AAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGG > 1:1440464/1‑149
AAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGG > 1:1517981/1‑149
AGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAAATCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGA < 2:408402/149‑1
AAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTTCTGCTGAATTCAGTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATT < 1:243509/149‑1
AAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGTCAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATT < 1:912131/149‑1
AAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATT < 2:674082/149‑1
AATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAA < 2:590935/149‑1
ATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCTCTTACTGATTAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTTATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGTCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAAC < 1:1033394/149‑1
ATCGCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCTTGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATTTCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAAC < 2:968641/149‑1
CTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCT > 1:1199424/1‑149
CTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTT < 1:822477/149‑1
TTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTA > 2:1506991/1‑149
TTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTTATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTAC < 2:652742/149‑1
TCTGGGCTGACGGCGCTTACTTCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGT < 2:1365464/149‑1
CTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTCCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTA < 1:1159557/149‑1
GTCTGAGGGCGCTTACTGCTGAATTCTCTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGACCCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTGGCCCCTTCCTTAAAGGAATAACCTTTAAGTACGc > 1:853864/1‑148
TGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACC > 1:384806/1‑149
TGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACC > 1:623443/1‑149
TGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACC > 1:413851/1‑149
GCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAG > 2:667336/1‑149
TGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGT > 1:402624/1‑149
TGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCAC < 2:1565329/149‑1
GAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGACCCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACACACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCCCCTTCCTTAAGGGATTAACCGTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACg > 2:491164/1‑148
GAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACT > 2:373400/1‑149
AATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTT > 2:953499/1‑149
AATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACAAGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTAAGAACCGAAAGTATTGCGTCACTT > 2:1487951/1‑149
ATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTAATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGCTGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCATTACCTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTC > 2:1488054/1‑149
TTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCc > 2:802125/1‑148
TTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCA < 2:190124/149‑1
CTGTAGGCGAATGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGC < 1:1322752/149‑1
GTCGGCGAAGGTAAGTTGCTGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAA < 2:1040842/149‑1
CGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATTACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGATAGTATAGCGTCACTTCACCGCAAAA < 1:1410647/149‑1
cGCGAAGGCAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAAAATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTATAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGAAAAAC < 1:202791/148‑1
GAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACCTCACCGCAAAACTTA > 1:940810/1‑149
AGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAA < 2:1124584/149‑1
GGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAG < 1:1519242/149‑1
GTTGATGACTCATGATGTACCCTGTTATTTGGCTCCCGAGGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTT < 2:840031/149‑1
GTTGATGACTCATGATGAACCCTTTTCTCTGGCTCAAGATGACAAACATGAGCTCATATCATGGACTTGTTCGCACCTTCCTTACAGGATTAACCTTTACGTACTAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAACGAAGTT < 2:736855/149‑1
GTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTTAAGAAGTT > 2:637517/1‑149
ATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAAT < 1:826551/149‑1
GACTCATGATGAACACTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACATTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTA > 1:884166/1‑149
ACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTGCGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAA < 2:86097/149‑1
ACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAA > 2:163542/1‑149
CTCATGATGAACCCTGGTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCGCCTTCGTTAAAGGATTAACCTTTACGGACGAACCGAAAGTATTGCGGCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAGGTGTACTTtca > 2:1443136/1‑146
CATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATAC < 1:640533/149‑1
ATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACT > 2:765696/1‑149
TGAGGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGCTGACAAACATGATCTCATCTCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTACAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCCCCCCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTA < 2:1099915/149‑1
GATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCCCCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAACACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTAC > 2:1203113/1‑149
GATGAACCCTGTTCTAAGGCTCCAGAAGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCCCACCTTCCTTAAACGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATAGCGTCACGTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTAC > 1:1063162/1‑149
ATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACA < 1:547536/149‑1
AACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCCCTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAG > 1:84906/1‑149
CCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGG < 2:1517981/149‑1
CCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCAAATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGG < 1:1006939/149‑1
GTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTA > 1:1260231/1‑149
TTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTAT > 2:69988/1‑149
TCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGATATA > 1:956835/1‑149
TATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAG > 2:519081/1‑149
ATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCATGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACATCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGG > 2:442998/1‑149
GCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTAATGCGTCACTTCACCGCAAAACTAAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCAATAAGGATG > 2:103201/1‑149
CCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTA < 1:1301657/149‑1
CCACATGACAAACATGATCTCATAGCAGGGACTTGTTCGCACCATCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTA < 2:436466/149‑1
CAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAG > 2:482429/1‑149
TGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCAC > 2:699126/1‑149
GACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTACTTAAAGGATTATCCTTTACGTACGTACCGAAAGTTTTGCGTCACTTCACCCCAAAAGTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACTGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACT < 1:952698/149‑1
ACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGCACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTTGCCACTC > 1:261837/1‑149
CAATCATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCT < 2:1144787/149‑1
ACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTT < 2:842978/149‑1
ATGATCTCATATCCGGGACTTGTTCGCACCTTCCATAAAGGATTAACCATTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGATGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTAC < 2:1199424/149‑1
TGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGAACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACC < 1:442007/149‑1
CTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTAC < 1:510136/149‑1
atcTCAGGTACTTGATCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCAATACGTACGAACCGAAAGCATTGCGTCACTTCACCGCAAAACATAAAGAAGATTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACCTC < 2:1534733/146‑1
ATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATC < 1:953499/149‑1
ATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCAACTCTCTTACCCTACATCCg > 1:1131011/1‑148
ATCAGGGACTTGTTCGCAACTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGATAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCT < 2:1248880/149‑1
AGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAA < 1:254184/149‑1
AGGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAA > 1:1556013/1‑149
GGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAAT < 1:464139/149‑1
GGGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTATACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACGTCACAGAAAAACTTAAAGAAGTTTAAATAATAATACAGAGTGGCTATAAGGATGTTATCCAATCTCTAACCATACAACCTCAAT > 2:912486/1‑149
GGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATA > 2:664273/1‑149
GGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATA > 2:1289462/1‑149
GGACTTGTTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATA > 1:1331884/1‑149
GGACTTGTTCGCACATTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACAGCAAAAATTAAATAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTAACCCTACATCCTCAATA > 1:708606/1‑149
TTCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAA > 1:1093679/1‑149
TCGCACCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACTTCCTCAATAACAAAAAT > 2:482399/1‑149
CACCTTCCTTAAAGTATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGC < 1:1506991/149‑1
CCTTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCT < 2:419170/149‑1
TTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTC < 2:1260231/149‑1
TTCCTTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGACGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTC < 1:667336/149‑1
CGGGACAAGAAAATCTCTTTTCTGGTCTGACGGCGCTTACTGCTGAATTCACTGTCGGCGAAGGTAAGTTGATGACTCATGATGAACCCTGTTCTATGGCTCCAGATGACAAACATGATCTCATATCAGGGACTTGTTCGCACCTTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/2289966‑2290113
‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAAAGGATTAACCTTTACGTACGAACCGAAAGTATTGCGTCACTTCACCGCAAAACTTAAAGAAGTTTAATTAATACTACAGAGTGGCTATAAGGATGTTAGCCACTCTCTTACCCTACATCCTCAATAACAAAAATAGCCTTCCTC > NC_000913/3890075‑3890222
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
|---|
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |
GATK/CNVnator alignment
N/A
