Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A9 F2 I0 R1
|
193 |
6708.0 |
8620653 |
98.5% |
8491343 |
136.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
1,706,032 |
G→T |
9.6% |
intergenic (‑642/‑13) |
yqgB ← / → metK |
acid stress response protein YqgB/methionine adenosyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 1,706,032 | 0 | G | T | 9.6%
| 414.5
/ 2.1
| 186 | intergenic (‑642/‑13) | yqgB/metK | acid stress response protein YqgB/methionine adenosyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (91/70); new base T (23/2); total (114/72) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.36e-04 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 197 total aligned reads displayed.
CTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAGCACGCGTTGCTTGC > NZ_CP022686/1705893‑1706170
|
cTAAAATAGCAATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGTCTGCCAGTGTTTTTACCCTGCAGAGTCTTGGTAGGATCCGCTACCAAAGAAAATCAACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAg < 2:450830/140‑1 (MQ=255)
tAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAgg < 7:992206/140‑1 (MQ=255)
aaaTAGCCATCCAGATGTTAATCCAGCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTg < 5:821812/140‑1 (MQ=255)
tAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTTAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGata < 5:22795/140‑1 (MQ=255)
tAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGata < 1:353382/140‑1 (MQ=255)
tAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGata < 3:709422/140‑1 (MQ=255)
tAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGGGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGata < 2:336160/140‑1 (MQ=255)
aacccATCCCGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGCCTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGata < 3:921888/137‑1 (MQ=255)
aaGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGata < 5:707566/139‑1 (MQ=255)
gCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTTGGATACGCTACCACCTAAAATCCACACAACAGTTTGAGCATACCAAATTCTCTTTAGGTGATAtt > 7:695095/1‑140 (MQ=255)
gCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAAAACACACAACACTTTTAGCTAACCAAAATATCTTTAGGTGATAtt > 7:87261/1‑140 (MQ=255)
ccAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGGAGGATCCGCTACCACAGAAAATACCCACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTATCTTTAGGTTATATTAAata > 2:98112/1‑140 (MQ=255)
aTGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTACCCTGCAGAGTCGTGGTAGGCTCCGCTACCCCAGAAAATACACACCACAGTTTGAGCTAACCAAATTATAGTTATGGGAGTTTAAAAATGGc > 7:508059/1‑140 (MQ=255)
aTGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGGAGGTTCCGCTACCACAGAAAAAACCCCAAAAAGTTTGAGCTAAACAAAATCTCTTTAGTTTATATTATATATggg > 5:642749/1‑139 (MQ=255)
gTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGTATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTTAGCTAACAAAATTATATTTATGTGATATTAAATATGGCaa > 5:626791/1‑140 (MQ=255)
aaTCCATCGATTCCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGGAGTGGCGGGGTAGTCTCGGCTACCTCAGAAAATCCACTCAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCaatag < 7:924260/140‑4 (MQ=255)
aaTCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAac > 4:415759/1‑140 (MQ=255)
aaTCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGGAGGCTCCGCGACCACAGAAAATACCCCCAACAGTTTGGGCGAACCAAATTCTATTTATGTGATATTAAATATGGGAAAac > 1:395292/1‑140 (MQ=255)
accatccctCCCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAacac < 6:816573/139‑1 (MQ=255)
atccatACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTGGGCTCACCGAACACACAAAATACACACAACCTTTTGTGCTTAACAAATTAACTTTATTTGATAATAAATAATGAAAAAccccat > 2:173993/1‑138 (MQ=255)
atccatACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCCCGTCCCCACAAAAAACCAACAACAGGTTGAGCTAACCAAATTATCTTTTGGGGATTATAAATATGGCAAAAccccag > 6:583316/1‑138 (MQ=255)
tccatACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCGACCACAGAAAATACACACAACAGGTTGAGCGAACCAAATTATGTTTAGGTGTTATTAAATATGGGAAAACACCttt > 2:216965/1‑140 (MQ=255)
tccatACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCGAACACAGAAAATCCACACCAAAGTTTGAGCTAACCAAATTATCATTAGGTGTTATTAAAAATGGCTAAAAACCttt > 4:288272/1‑140 (MQ=255)
tccatACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGGTGGGTCCGGGACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGTGCTAACGAAGTTCTCTTTTGGTTATTTTAAATATGGCAAAACACCatt > 6:732833/1‑140 (MQ=255)
ccatACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCGACCACAGAAAATACACCCAACAGTTTTAGCTAACCAAAATATCTTTAGGTGATTTTAAATATTGCAAAACACCattt > 6:377866/1‑140 (MQ=255)
gATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAAACCACACAACAGTTTTAGCAAACCAAATTATCTTTAGGTGTTATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTcc > 4:883400/1‑140 (MQ=255)
aTTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTTGGATCCGCGAACCCAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGGTAACCAAATTATCTTTTGGGGATATTAAATATGGCAAAACCCCTTTTTACGTccc > 3:618504/1‑139 (MQ=255)
aTTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTTGGATACGCTACCACACAAAAAACACCCAACAGTTTGAGCTAAACAAATTGTATTTATGTTATATTTAAAATTTGAAAAAACAGTTTTAGGTCCg > 2:946869/1‑140 (MQ=255)
aTTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTATGGTCCGCGACCCCAGAAAAAACACCCAACAGGTTTAGCGAAACAAAATATCGTTATGGGATATTAAATATGGAAAAACACCTTTTTACGTccc > 4:211158/1‑139 (MQ=255)
aTTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTTAGCTAAACAAATTATCTTTAGGTGATATTAAATATTGCAAAACACCTTTTTAAGTCCg > 4:1031621/1‑140 (MQ=255)
aTTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGGTGGCTCCGCGACCACACAAAATCCACCCAACACGTTTAGCGAACAAAATTGTCGTTAGGTGAAATTAAAAATTGCAAAACACCATTTTACGTCCg > 7:1010116/1‑140 (MQ=255)
aTTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGGAGGCTACGGTACCCCAAAAAATCCACACAACAGTTTGTACTAAACAAATTCTATTTAGGTTAAATTAAATAATGGAAAAAACCgtttttagtgca > 5:186342/1‑133 (MQ=255)
aTTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGGAGGATCCGCTACCCCAGAAAATCAACACAAAACTTTGAGCGAAACAAATATTCTTTATGTGATATTAAATATTGCAAAACACCTTTTTACCTccc > 3:50841/1‑139 (MQ=255)
aTTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGGAGGATCCGCCACCCCACAAAATACACACCACAGTTTTATCGAAACAAAATATCTTTATGTGATATTAAAAATTTCAAAAAACCATTTTAAGTccc > 1:673145/1‑139 (MQ=255)
aTTAACACTCAGACTGCCAGTGTTATTAACCTGCAGAGTCGAGGGACGAAGCCCCACCCCAGCACATCCACCAAAAAAGGTGATCTAAACAAAATATCATTAGGGGCAAATAAATAAATCAAAACACCATTTtacgtacg > 4:532721/1‑140 (MQ=255)
ttAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTTGGGTACGCTAACACAGAAAAAACACACAACAGATTGAGCTAACCAAAATATGTTTATGTGTTATTAAATATTGCAAAACAACTGTTTAAGtacca > 3:734748/1‑136 (MQ=255)
ttAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTATGGTCCGCTACCACAGAACATACACCCAAAAGTGTGAGCTAACCAAATTCTAGTTAGGTGATATTAAAAATGGGAAAACACCTTTTTACggacga > 8:713058/1‑135 (MQ=255)
acacTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTGGGGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACTACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGTCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTc < 3:858612/140‑1 (MQ=255)
acacTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTc < 1:126695/140‑1 (MQ=255)
acacTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAAACCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTc < 4:933037/140‑1 (MQ=255)
cacTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTcc < 1:388083/140‑1 (MQ=255)
cacTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATACCCGAACACACAAAAAACAAACAACAGTTTGCGCTTAACAAATACTCTTTTGGTGATATTTAATATTGAGAAAAACCTTTTTACATCCGAGtac > 8:361736/1‑138 (MQ=255)
acTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCg < 3:1031622/140‑1 (MQ=255)
tCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATACGCTACCACAGAAAATCCACCCAACAGTTTGAGCTAACCAAATTATAATTATGGGATATTTAATATTGCAAAAAAACTTTTTTCGTACGAATACGtc > 8:1000044/1‑140 (MQ=255)
tCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGGAGGAGCCGCTACCACACAAAATCCACACAACAGGTTGTGCGAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATTGGAAAAAACCGTTTTAAGTTCGAGTCGGtc > 7:211587/1‑140 (MQ=255)
aGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTTGGGTGCGCTACCACCCAAAATCCACACAACAGTTTGTGCTAACCAAATTCTCGTTTTGTGTTATTTAAATTGTGAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGgctg > 2:591858/1‑139 (MQ=255)
aGACTGCAAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGCTCCGCTAAACCACAAAATCCACACAACAGTTTTATCTAACCAAATTAGCTTTAGGTGGTATTAAATATTGCAAAACACCTTTTTACGTCAGAGTACGtctc > 6:687646/1‑140 (MQ=255)
ttttAACCTGCAGAGTCGTGGAAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCt < 1:61024/140‑1 (MQ=255)
gTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTTAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCa < 4:576779/140‑1 (MQ=255)
aTCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATctctt > 3:398301/1‑139 (MQ=255)
aTCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTg > 5:582959/1‑140 (MQ=255)
aTCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTg > 3:1045047/1‑140 (MQ=255)
aTCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTg > 1:748024/1‑140 (MQ=255)
aTCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTATCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTg > 6:159246/1‑140 (MQ=255)
aTCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACAAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTg > 1:645176/1‑140 (MQ=255)
aTCCGCTACAACAGAAAATCCACACAACAGTTTGCGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACCCCTTTTTACGTCAGAGTCCGTCTCGGAAGGGCATACATACAAAATTGATGACCAAATCTCTg > 1:106063/1‑140 (MQ=255)
ccGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGAt > 1:93680/1‑140 (MQ=255)
cGCTACCACAGAAAATCCACACAAGAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATg < 2:814315/140‑1 (MQ=255)
cGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATg > 1:1029862/1‑140 (MQ=255)
cGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATg < 4:734748/140‑1 (MQ=255)
cGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATg > 4:697675/1‑140 (MQ=255)
gCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGc < 7:438804/140‑1 (MQ=255)
cTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGcc > 2:76343/1‑140 (MQ=255)
atACCACAGAAAATAAACACAAGAGTTTGAGCTTACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGTAAAAACACATTTTTACGGCCGAGTCCGTCTCTGAATGGCATCCTGACAAAATTTCTGACCAATTCTatgatgag > 5:676572/2‑138 (MQ=255)
ccACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGtt > 5:971558/1‑140 (MQ=255)
caGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTa > 1:823960/1‑140 (MQ=255)
aaTCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGAcgc < 8:418351/140‑1 (MQ=255)
aaTCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGAcgc < 8:402535/140‑1 (MQ=255)
aaTCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGAcgc < 7:894261/140‑1 (MQ=255)
acaGTTTGATCTAACCAAATTCTCTTTAGTTGATATTAAATATGGAAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCTATCCTCGaa < 4:993631/140‑1 (MQ=255)
acaGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTTATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGaa < 8:991447/140‑1 (MQ=255)
acaGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGaa < 8:7021/140‑1 (MQ=255)
acaGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGaa < 2:1029862/140‑1 (MQ=255)
acaGGTTGAGCTAACAAACTTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACAACTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGAGCCTCGaa < 1:479374/140‑1 (MQ=255)
tttGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAgg > 6:389232/1‑140 (MQ=255)
tGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGCCGCGATCCTCGAACAGGAt > 5:108520/1‑140 (MQ=255)
tGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGAt > 1:517410/1‑140 (MQ=255)
gCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCg > 6:364521/1‑140 (MQ=255)
gCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCg > 5:919138/1‑140 (MQ=255)
gCTAACCAAATTCTCTATAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTATTACGTCCGAGTCCGTGTCTGAAGGGCATCCTGACAAATTTGCTGTCCAAATCTCTGATGCCGCTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCg < 8:635804/140‑1 (MQ=255)
tAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGCCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGGTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGaa > 2:193258/1‑140 (MQ=255)
aaCCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGAGATCCTCGAACAGGATCCGaaa > 6:28735/1‑140 (MQ=255)
aCCAACTTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAg < 2:893695/140‑1 (MQ=255)
aCCAAATTCTCTTTATGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGATTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGGTGACCAACTATCTGATGCCGTTTTAGACGCAATCCTAGCACAGGATCCGaatg > 2:672457/1‑138 (MQ=255)
aCCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAg > 2:1072240/1‑140 (MQ=255)
aCCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAg > 2:319651/1‑140 (MQ=255)
aTTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAGCAcgc > 8:7600/1‑140 (MQ=255)
aTTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAGCAcgc > 4:816809/1‑140 (MQ=255)
tctTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAGCACGCGttg < 8:340697/140‑1 (MQ=255)
tctTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAGCACGCGttg < 3:333381/140‑1 (MQ=255)
tctTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGGCCGAGTCCGTCTCTGACGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAGCACGCGttg < 1:167104/140‑1 (MQ=255)
actTTAGGTGATATTAAATATCGCAAAACACATTATTACGGCCGAGTCCGTCTCTGAATTTCATCCTTACAAAATTGCTGACCAATTCTCTGATTCCGTTTTATACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAGCACGCGttg < 2:1067463/139‑1 (MQ=255)
ctTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACCCCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAGCACGCGttgc < 8:962481/140‑1 (MQ=255)
ctTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAGCACGCGttgc > 4:205777/1‑140 (MQ=255)
ctTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAGCACGCGttgc > 3:230237/1‑140 (MQ=255)
ctTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACAAATTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATACTGACAAAATTTCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAGCACGCGttgc > 6:869982/1‑140 (MQ=255)
tttAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTGTCTGAATGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGACGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAGCACGCGttgct > 2:514753/1‑140 (MQ=255)
tttAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGCACAGGATCCGAAAGCACGCGttgct > 1:312712/1‑140 (MQ=255)
tttAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAGCACGCGttgct > 4:614956/1‑140 (MQ=255)
aGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAGCACGCGttgcttgc < 8:205515/140‑1 (MQ=255)
|
CTAAAATAGCCATCCAGATGTTAATCCATCCATACCGATTAACACTCAGACTGCCAGTGTTTTTAACCTGCAGAGTCGTGGTAGGATCCGCTACCACAGAAAATCCACACAACAGTTTGAGCTAACCAAATTCTCTTTAGGTGATATTAAATATGGCAAAACACCTTTTTACGTCCGAGTCCGTCTCTGAAGGGCATCCTGACAAAATTGCTGACCAAATCTCTGATGCCGTTTTAGACGCGATCCTCGAACAGGATCCGAAAGCACGCGTTGCTTGC > NZ_CP022686/1705893‑1706170
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
