Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A8 F35 I0 R1
|
304 |
9232.4 |
10623078 |
98.3% |
10442485 |
135.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
4,905,170 |
T→G |
16.4% |
V99G (GTT→GGT) |
CIW80_RS24815 → |
coenzyme F390 synthetase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 4,905,170 | 0 | T | G | 16.4%
| 201.3
/ 6.7
| 126 | V99G (GTT→GGT) | CIW80_RS24815 | coenzyme F390 synthetase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (46/56); new base G (22/2); total (68/58) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.24e-05 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 127 total aligned reads displayed.
TTTAATCAGTGGCCAATGATGGATAAAGCGTTAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGTCGTC‑GTGGGCTTTTTGTTGTTAGCCCGCACGAGCAACAGATGTGGGCCGCCGGTGTGCTGGCAAAAGTGTTGCCCGACGGTTTATTTGCCAAAGAGC > NZ_CP022686/4905034‑4905307
|
tttAATCAGTGGCCAATGATGGATAAAGCGTTAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGtt < 3:1238926/138‑1 (MQ=255)
ttacaaaGTGGCCAATGATGGATAACGCGTTAATGAAGACGCACATCGATGAGATGAAAACCTCAGGTTTAAAGCGCGACGCACTTCTCGATTGAGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTTCGTTGGc < 6:243647/134‑1 (MQ=255)
ttAATCAGTGGCCAATGATGGATAAAGCGTTAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTg < 3:1079124/138‑1 (MQ=255)
ttAATCAGTGGCCAATGATGGATAAAGCGTTAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGc < 7:884586/140‑1 (MQ=255)
ttAATCAGTGGCCAATGATGGATAAAGCGTTAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGc < 7:829642/140‑1 (MQ=255)
ttAATCAGTGGCCAATGATGGATAAAGCGTTAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGc < 6:768840/140‑1 (MQ=255)
ttAATCAGTGGCCAATGATGGATAAAGCGGTAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTg < 4:854985/138‑1 (MQ=255)
cAGTGGCCAATGATGGATAAAGCGTTAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGtt < 8:973318/140‑1 (MQ=255)
cAGTGGCCAATGATGGATAAAGCGTTAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGtt < 8:675411/140‑1 (MQ=255)
cAGTGGCCAATGATGGATAAAGCGTTAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGtt < 2:695072/140‑1 (MQ=255)
aGTGGCCAATGATGGATAAAGCGTTAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTAAAAACCAGCGTTTGctcgtta > 1:1025043/1‑134 (MQ=255)
gTGGCCAATGATGGATAAAGCGTTAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGGTATGAAAACCCGCGTTGGCACGttag > 1:927835/1‑138 (MQ=255)
tGGCCAATGATGGATAAAGCGTTAATGATTAAGCACTTCGATGATATGAATACCGAAGGTTTAAAGAGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTAAAAACCAGCATTGGCAGGTTCat > 7:1255153/1‑139 (MQ=255)
tGGCCAATGATGGATAAAGCGTTAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGTTTTCAAACCCAGCGTTGGGAGGtgcgg > 7:950765/1‑136 (MQ=255)
tGGCCAATGATGGATAAAGCGTTAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGGTTTCAAACCCGGAGTTGGGAGGTTCAg > 5:1176398/1‑140 (MQ=255)
tGGCCAATGATGGATAAAGCGTTAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGGTTTAAAAACCATCGTTGTCAGGTTCAg > 7:564296/1‑140 (MQ=255)
tGGCCAATGATGGATAAAGCGTTAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGGTGTCAAACCCAGCGGTGGGAgggtgag > 1:1294874/1‑135 (MQ=255)
tGGCCAATGATGGATAAAGCGTTAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCAGCGGTGGCAGGTTAAg > 2:1371459/1‑140 (MQ=255)
tGGCCAATGATGGATAAAGCGTTAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTAGTGATTTAAAACCCAACCTTGGCactgtaag > 8:720947/1‑133 (MQ=255)
gCCAATGATGGATAAAGCGTTAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGACGTGTTTTAAAACACTGGGTTGGCTGGtatat > 4:883332/1‑134 (MQ=255)
cAATGATGGATAAAGCGTTAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGTTCAGTGtt < 6:113100/140‑1 (MQ=255)
aaTGATGGATAAAGCGTTAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTAAAACCCAGCGGTGGCAGGTTAAggtttg > 2:402517/1‑135 (MQ=255)
gatgGATAAAGCGTTAATGATGAAGCACTTCTATGAGATGAATAACGCAGTTTTAAAGCGCGACTAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTTAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGTCAGGTTCAGTGTTGGGc < 8:1182035/140‑1 (MQ=255)
atgGATAAAGCGTTAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATAGCGCAGTTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGTTCATTGTTGGGCt < 6:1276504/140‑1 (MQ=255)
gATAAAGCGTTAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGTTTTCAAACCCGGCGTTGGGAGGGTCAGTGTTgggggtta > 8:228289/1‑135 (MQ=255)
gATAAAGCGTTAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGCTTTAAAACCCAGCGTTGGCAGGGTCAGTGTTTGGCgttg > 1:486561/1‑139 (MQ=255)
gATAAAGCGTTAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGAAGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAATGAGCAGAGTCGTGGTTAGAAACCAAGCGTTGGGAGGTGGTTTGTTGGGcgtgg > 8:348117/1‑136 (MQ=255)
aGCGTTAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGTTTTAAAAACCATCGTTTGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAg > 8:1104746/1‑140 (MQ=255)
gCGTTAATGTTTACGCACGATGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAATGCGGGACGATCTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTtcatca < 3:140641/138‑1 (MQ=255)
gCGTTAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAgg < 2:177570/140‑1 (MQ=255)
ttAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGTTTTCAAAACCAGGGTTTGGAGGTTAATTGGTGGGCTTTAATAAGGTAc > 2:908242/1‑140 (MQ=255)
ttAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCACACCATGCGTTGGGAGGGTAATGGTTGGGGTTTAAGCAGGtgg > 7:813948/1‑138 (MQ=255)
tAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACa < 8:438288/140‑1 (MQ=255)
aaTGATGCCGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGTTTTCCAACCCGGCGGTTGGTGGTTGATTGTTGGGGTTTCATCAGGTACAt > 6:644854/1‑140 (MQ=255)
aaTGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTAAAACCCAGCGTTGGCAGGGTAAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACAt > 2:1198082/1‑140 (MQ=255)
atgatgACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTAAAACCCAGCGTTTGCAGGTTCAGGGGTGTGGTTTAATAAGGTACa > 3:80512/1‑138 (MQ=255)
ttgaCGCACTTCGTTGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCggg < 7:1213000/139‑1 (MQ=255)
ttgaCGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCggg < 2:641791/139‑1 (MQ=255)
gaCGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGGTTTAAAACCCGGCGGTGTGAGGGTACGTTTTGGGGGTTAATCAGGGACAACGGgtg > 1:78501/1‑139 (MQ=255)
gaCGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGGTTTAAAAACCAGCGGTGGGAGGTTCATGGGTGGGCTTTAATAAGGTTCAACGGgtg > 7:450377/1‑139 (MQ=255)
gaCGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTGAAACACAGCGTTGTCAGGTTCAGAGTTGGGCTTTAATAATGGACCTCGGgtg > 6:1275432/1‑139 (MQ=255)
gaCGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCAGCGGTGTGAGGGTCAGTGTTTGGGTTTAATGAGGTACATGGGgtg > 6:762405/1‑139 (MQ=255)
ccTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTCAGCAGAGTCGGGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTGTCATCAGGTACATCGGGTcgtc‑gt < 5:602553/139‑1 (MQ=255)
aCTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGTcgtc‑gt < 1:329542/140‑1 (MQ=255)
cGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGCGTTCAAACCCAGCGGTGGCAGGGTGAATGTTGGGGGTGGATAAGGTTCATAGGGGCGTC‑GTgggg > 5:1286381/1‑139 (MQ=255)
gagatgaATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACTAACTTGTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGTCGTC‑GTGGGCtttt < 5:143931/140‑1 (MQ=255)
gagatgaATACCGCAGGTTTAAAGCGCGAAGAACTTCTCGATTGTGCTATGCGCAGTTAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTTGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGTCGTC‑TTTGGCtttt < 2:780409/140‑1 (MQ=255)
tgaATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGAGTTAAAAACCTGCGTGTGCAGGTTGAGTGTTGGGCGTAAATCAGGTAAAAAGGGGCGTA‑GTGGGCTTTttgtt > 6:312357/1‑140 (MQ=255)
aaTACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGTTTTAAAACCCTGCGTTGGGAGGTTGATTGTTGGGCTGTCAGGATGTACATCGGGGAGGA‑GTGGGGGTTTttttgt > 8:740805/1‑140 (MQ=255)
aaTACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTGAAACCCGGCGTTGGGAGGTTAAGGTTTTGGCTTTCATCAGGTAAATAGGGTGGTA‑GTGGGCGTtttttttt > 6:928675/1‑138 (MQ=255)
cGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGGTTTAAAACCCAGCGGTGGCAGGGTGAGTGGTGGGCGTTAATCAGGGACATAGTGTCGTC‑GGGGGGGtttttttttttt > 3:1028347/1‑136 (MQ=255)
cAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGGTTTCAAACCCTGCGGTGGGAGGGTGAGTGTTGGGCGTTAATCAGGTTCATCGGGTCGTC‑GGGGGGTTTTTTTTGTTAgtg > 4:969224/1‑136 (MQ=255)
cAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGGTTTCAAACCCTGCGGTGGCAGGTTCAGTGGTGGGGTTTAAGCAGGTTCATCGGGTCGTC‑GTGGGGGTTTTtttgtttacccc > 2:655621/1‑134 (MQ=255)
cAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGGTTTCAAAACCAGCGGTGGCAGGGTCAGGGGTGGGGGTTGAACCCGGAAATCGGGGCGGC‑GTGGGGTGTTTTTTGTTTGcccc > 6:710272/1‑139 (MQ=255)
cAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGGTGGCAGGTTAAGTGGTGGGCTGTAATCAGGTTAATCGGGTAGGA‑GTGGGGGTTTTTTTGTTAggcac > 2:1255317/1‑136 (MQ=255)
cAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTAAAACCCAGCGGTGGGCGGGTGAGTGTTGGGGTGTGATCCGGTACATAGGGTCGGC‑GGGGGGGTTTTgttgtttggccc > 6:851698/1‑134 (MQ=255)
ggTTTAAAGCGCGACGATCTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGTCGTC‑GTGGGCTTTTTGTTGTTAGCCCGCa < 1:791801/140‑1 (MQ=255)
ggTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGGTTTAAAACCCGGCGTGGGGAGGGTGAGTGTTGGGGTTTCAAAAGGGTCAAAGGGGGGGC‑GTGGGGGTTTTtttgttttcccc > 3:431274/1‑132 (MQ=255)
ggTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTTGGAGGTTGAGTGTTGGGCTTTAATCAGGTTCATAGGGTCGTC‑GTTTGGTTTTTTTTTTTATcccc > 3:1035718/1‑137 (MQ=255)
gtctAAAGCGCGACGAACTTCTAGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCGGCGGTGGGAGGTTGAGGGGTGGGCGTTGATAAGGTTGATCGGGTGGGG‑GGGGGGGTTTTGTTGTTTGGCCGcga > 8:974900/4‑138 (MQ=255)
tttAAATCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAAGGCGCAGGTAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGTCGTC‑GTGGGCTTTTTGTTGTTAGCCCGCACg < 5:655236/140‑1 (MQ=255)
tttAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGCGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGTTCAGGGTTGGGCTTTCATCAGGTACAGCGGGTCGTC‑GTGGGCTTTTTGTTGTTAGCCCGCACg < 5:655242/140‑1 (MQ=255)
tttAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGAAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGTCGTC‑GTGGGCTTTTTGTTGTTAGCCCGCACg < 7:98882/140‑1 (MQ=255)
tttAAAGCGCGACGAACTGCTCGAGTGTGCCATGCGCAGGGAGCAGAGGCGTGATTTCAAACCCTGCGGTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGGCGTC‑GTGGGCTGTTTGTTGTTAGCCCGCa < 3:17061/138‑1 (MQ=255)
ttAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGGTTTAAAAACCTGCGGTGGGAGGGTGATTGTTGGGGGTTAAACAGGTACATAGGGTCGTCGGGGGGGTTTTTTTTTTTTGccccac > 3:353454/1‑135 (MQ=255)
ttAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGGTGGCCGGTTCAGTGTTGGGGGTTCATAAGGTAAATAGGGTCGTA‑GGGGGGTTTTTTTTTTTATCCCGCaacc > 2:94091/1‑137 (MQ=255)
tAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGTCGTC‑GTGGGCTTTTTGTTGTTAGCCCGCACg < 4:596366/138‑1 (MQ=255)
agagcgACGAACTTCTCGATTGTGAAATGCGCAGTGAGCTGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTTCATCGGGTCGTC‑GTTGGCTTTTTGTTGTTAGCCCGCACGAGCaa < 1:184950/137‑1 (MQ=255)
cgacgaACTTCTCGCTTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTAAAACCCGCCGGTGGCAGGGTAAGTGTTGGGGGTTTATAAGGTACAAAGGGGGGGC‑GTGGGGGTTTTTTTTTTTTCCCCCACGAGCAACaaa > 7:723017/1‑138 (MQ=255)
acgaACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTAAAACCCAGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTTCATCGGGTCGTC‑GTGGGCGTTTTTTTGTTAGCCCGCCCCAGCAACAGa > 4:1027609/1‑138 (MQ=255)
gaccTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGTGCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGTCGTC‑GTGGGCTTTTTGTTGTTAGCCCGCACGAGCAACAGAtgtg < 5:925708/137‑1 (MQ=255)
cTTCTCGACTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGTCGTC‑GTGGGCTTTTTGTTGTTAGCCCGCACGAGCAACAGATGTGGgc < 1:7397/140‑1 (MQ=255)
cGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGGCGTC‑GTGGGCTTTTTGTTGTTAGCCCGCACGAGCAACAGATGTGGGccgccg < 5:1040699/140‑1 (MQ=255)
cGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGGCGTC‑GTGGGCTTTTTGTTGTTAGCCCGCACGAGCAACAGATGGGGgccgc < 4:779223/138‑1 (MQ=255)
cGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGAGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCTGTTCGTC‑GTGGTCTTTTTGTTGTTAGCCCGCACGAGCAACAGATGTGGGccgccg < 2:1040969/140‑1 (MQ=255)
tgtgCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAACCCCTGCGTTGGCAGGGTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGGACATCGGGTCGTC‑GTGGGCTTTTTGTTGTTAGCCAGCACGAGCAACAGATGTGGGCCGCCGgt < 4:760863/138‑1 (MQ=255)
tgtgCAATGCGCAGAGAGCAGAGGCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGTCGTC‑GTGGGCTTTTTGTTGTTAGCCCGCACGAGCAACAGATGTGGGCCGCCGgtgt < 6:303505/140‑1 (MQ=255)
ttcAATGCGCAGTGAGCAGAGTAGTTATTTAAAAAACAACATTTGGAGTTTAAGTTTTTGGCTTTAAACAAGTAAAAAGGGTAGTC‑GTGGGCTTTTTTTTTTTATACCGCACCAGCAAAAAAAGTTGGCCCCCGGggtgg > 8:211980/3‑139 (MQ=255)
tgCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGTCGTC‑GTGGGCTTTTTGTTGTTAGCCCGCACGAGCAACAGATGTGGGCCGCCGGTGTGc < 7:211980/140‑1 (MQ=255)
tgCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGTCGTC‑GTGGGCTTTTTGTTGTTAGCCCGCACGAGCAACAGATGTGGGCCGCCGGTGTGc < 8:672319/140‑1 (MQ=255)
tgCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGGCGTC‑GTGGGCTTTTTGTTGTTAGCCCGCACGAGCAACAGATGTGGGCCGCCGGTGTGc < 1:1130667/140‑1 (MQ=255)
cgcAGTGAGCAGAGTCGTGTTTTGAAAACCAGGGTTGGGAGGTTGAGTGTTGGGGTTTAATCAGGTTCATAGGGTCGTG‑GTGGGGTGTTTTTTGTTTGACCGCCCGGGCAAAACATGGGGGGCGCCGGGGTGCggggcaa > 6:1032871/1‑136 (MQ=255)
aGTGAGCAGAGTCGTGATTTAAAACCCAGCGTTGGCAGGGTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGTCGTC‑GTGGGCGTTTTGTTTTTTTCCCGCCCGAGCAACAGTTGTGGGCCGCCGGTGTGGTGGGAAAAgt > 2:140882/1‑140 (MQ=255)
gTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGTCGGC‑GTGGGCTTTTTGTTGTTAGCCCGCACGAGCAACAGATGTGGGCCGCCGGTGTGCTGGCAAAAgtg < 7:933057/140‑1 (MQ=255)
aGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCAGCGGTGGCCGGTTCAGTGTTGGGGGTTCATAAGGGAAATCGGGGCGGG‑GGGGGGGTTTTTTTGTTTTCCCCCCCGCGCAACAGATGTGGGGCGCCGGGGTGGTGGCAAAAGTGTTg > 2:274841/1‑140 (MQ=255)
agagTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGTCGTC‑GTGGGCTTTTTGTTGTTAGCCCGCACGAGCAACAGATGTGGGCCGCCGGTGTGCTGGCAAAAGTGTTGc < 4:1242656/138‑1 (MQ=255)
atgcAACCCCTGCGGTGGAAGGTTCAGTGTTTGGGTTTCATGAGTTACTTCGGGTCGTC‑GTGGGCTTTTTGTTGTTACCCCGAACGAGCAACAGATGTGGGCCGCCGGTGTGCTGGCTAAATTGTTGCCCTACGGTTTAt < 6:85946/137‑1 (MQ=255)
taaaaCCCTGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGTCGTC‑GTTGGCTTTTTTTTGTTAGCCCCCACGAGCAACAGATGTGGGCCGCCGGTGTGCGGGCAAAAGTGTTTCCCGCCGGGTTAttt > 8:331672/3‑140 (MQ=255)
aaaCCCTGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGTCGTC‑GTGGGGTTTTTTTTGTTATCCCCCCCGCGCAACAGCTGTGGGCCGGCGGTGTGCAGGCAAAAGTGTTGCCCCACGGTTTTTTTGc > 6:1235831/1‑140 (MQ=255)
aaaCCCTGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGTCGTC‑GTGGGCTTTTTGTTGTTAGCCCGCACGAGCAACAGATGTGGGCCGCCGGTGTGCTGGCAAAATTGTTGCCCGACGGTTTATTTGc > 8:949328/1‑140 (MQ=255)
aaaCCCTGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGTCGTC‑GTGGGCTTTTTGTTGTTAGCCCGCACGAGCAACAGATGTGGGCCGCCGGTGTGCTGGCAAAAGTGTTGCCCGCCGGTTTATTTGc > 6:46897/1‑140 (MQ=255)
aaaCCCTGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGTCGTC‑GTGGGCTTTTTGTTGTTAGCCCGCACGAGCAACAGATGTGGGCCGCCGGTGTGCTGGCAAAAGTGTTGCCCGACGGTTTATTTGc > 6:1013494/1‑140 (MQ=255)
tGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGTTTTTATCAGGTACATCGGGTCGTC‑GTGGGCTTTTTGTTGTTAGCCCGCACGAGCAACAGATGTGGGCCGCCGGTGTGCTGGCAAAAGTGTTGCCCGACGGTTTATTTGCCAAaga < 7:64204/140‑1 (MQ=255)
tGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGTCGTC‑GTGGGGTTTTTTTTGTTTGCCCGCCCGCGCAACAGCTGTGGGCCGCCGGTGTGCTGGCAAAAGTGTTGCCCGCCGGTTTATTTGCCAAagg > 5:41153/1‑139 (MQ=255)
tGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGTCGTC‑GTGGGCTTTTTGTTGTTAGCCCGCACGCGCAACAGATGTGGGCCGCCCGGGTGCTTGCAAAAGTGTTTCCCCACGGTTTTTTTggctggca > 2:1252331/1‑133 (MQ=255)
tGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGTCGTC‑GTGGGCTTTTTGTTGTTAGCCCGCACGAGCAACAGATGTGGGCCGCCGGTGTGCTGGCAAAAGTGTTGCCCGACGGTTTAt > 7:524041/1‑130 (MQ=255)
tGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGTCGTC‑GTGGGCTTTTTGTTGTTAGCCCGCACGAGCAACAGATGTGGGCCGCCGGTGTGCTGGCAAAAGTGTTGCCCGACGGTTTAt < 8:524041/130‑1 (MQ=255)
tGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGTCGTC‑GTGGGCTTTTTGTTGTTAGCCCGCACGAGCAACAGATGTGGGCCCCCGGTGTGCTGGCAAAAGTGTTTCCCGACGGTTTATTTTCCAAaga > 5:310262/1‑140 (MQ=255)
tGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGTCGTC‑GTGGGCGTTTTTTTTTTTGCCCGCCCCAGCAACAGATGTGGGCCGCCGGTGTGCTGGGAAAACTGTTGCCCGCAGGTTTTTTTGGCAAaga > 1:763340/1‑140 (MQ=255)
cGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGTCGTC‑GTGGGCTTTTTGTTGTTTGCCCGCACGAGCCCCAGATGTGGGCCGCCGGTGTGCTGGCAAAAGTGTTGCCCGACGGTTTATTTTCCAAAGAGc > 6:881946/1‑140 (MQ=255)
|
TTTAATCAGTGGCCAATGATGGATAAAGCGTTAATGATGACGCACTTCGATGAGATGAATACCGCAGGTTTAAAGCGCGACGAACTTCTCGATTGTGCAATGCGCAGTGAGCAGAGTCGTGATTTCAAACCCTGCGTTGGCAGGTTCAGTGTTGGGCTTTCATCAGGTACATCGGGTCGTC‑GTGGGCTTTTTGTTGTTAGCCCGCACGAGCAACAGATGTGGGCCGCCGGTGTGCTGGCAAAAGTGTTGCCCGACGGTTTATTTGCCAAAGAGC > NZ_CP022686/4905034‑4905307
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
