Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F5 I184 R1
|
278 |
29.6 |
1166432 |
97.3% |
1134938 |
124.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP009273 |
960,653 |
T→C |
M293T (ATG→ACG) |
ycaI → |
ComEC family protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP009273 | 960,653 | 0 | T | C | 100.0%
| 134.4
/ NA
| 41 | M293T (ATG→ACG) | ycaI | ComEC family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (18/23); total (18/23) |
TTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATGGATCCTGTTGCCATTCTCTCGCAAAGTTTATGGCTCTCTGCCGCTGCGGTCGCGGCATTG > NZ_CP009273/960520‑960786
|
tttCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCtt < 1:544296/138‑1 (MQ=255)
cTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCttaagttaag > 1:318959/1‑139 (MQ=255)
gcgcTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTggg < 2:569459/139‑1 (MQ=255)
gcgcTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTggg < 1:234853/139‑1 (MQ=255)
cACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACagtgga < 2:119981/139‑1 (MQ=255)
aCTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACagtggag < 1:48571/139‑1 (MQ=255)
cAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCt > 2:430287/1‑139 (MQ=255)
aTACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTggg < 2:520644/139‑1 (MQ=255)
aTACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTggg < 2:318959/139‑1 (MQ=255)
aTACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTggg < 1:486750/139‑1 (MQ=255)
ttAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACagtggag < 1:21486/125‑1 (MQ=255)
ttAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACagtggag > 2:21486/1‑125 (MQ=255)
ttAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTAt > 1:275313/1‑139 (MQ=255)
ttGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGat < 1:344037/139‑1 (MQ=255)
cGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACagtgga > 1:108298/1‑116 (MQ=255)
cGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACagtgga < 2:108298/116‑1 (MQ=255)
tCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACagtggag < 1:382048/112‑1 (MQ=255)
tCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACagtggag > 2:382048/1‑112 (MQ=255)
tgtgctgCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAACGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTggcgg > 2:322843/1‑139 (MQ=255)
ctTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAAtttt > 2:477901/1‑139 (MQ=255)
ccTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATGGa < 1:477901/139‑1 (MQ=255)
ggTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTggg > 2:327109/1‑96 (MQ=255)
ggTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTggg < 1:327109/96‑1 (MQ=255)
gTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTCTGTGGGGAACGCTTAAGTTACGTGGGCGACAGAGGAGTGGCTGGGATGTATGGATAGGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATGGATccg > 1:282897/1‑138 (MQ=255)
ttGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATGGATCCTg < 2:135544/139‑1 (MQ=255)
ctcctGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATGGATCCTGTTGCCATTCTCTCGCa < 2:48811/139‑1 (MQ=255)
cATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATGGATCCTGTTGCCATTCTCTCGCAAAGtt > 1:529221/1‑138 (MQ=255)
tGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATAGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATGGATCCTGTTGCCATTCTCTCGCAAAGTTTATg > 2:289348/1‑139 (MQ=255)
gCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGat < 1:323028/78‑1 (MQ=255)
gCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGat > 2:323028/1‑78 (MQ=255)
cGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATGGATCCTGTTGCCATTCTCTCGCAAAGTTTATGGc > 2:440840/1‑139 (MQ=255)
cGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATGGATCCTGTTGCCATTCTCTCGCAAAGTTTATGGc > 1:39989/1‑139 (MQ=255)
cGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATGGATCCTGTTGCCATTCTCTCGCAAAGTTTATGGc > 2:180923/1‑139 (MQ=255)
ccATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGATAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATGGATCCTGTTGCCATTCTCTCGCAAAGTTTATGGctct < 1:302364/138‑1 (MQ=255)
tggtggCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATGGATCCTGTTGCCATTCTCTCGCAAAGTTTATGGCTCTCTGc > 2:270527/1‑139 (MQ=255)
tggCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCt > 1:492506/1‑91 (MQ=255)
tggCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCt < 2:492506/91‑1 (MQ=255)
caaCGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGAGATGTATGGATATGTTGTCTGGCAGCAATTTTGCTAATGGATCCTGTTGCCATTCTCTCGCAAAGTTTATGGCTCTCTGCCACTGCGGTcg < 2:282897/136‑1 (MQ=255)
cTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATGGATCCTGTTGCCATTCTCTCGCAAAGTTTATGGCTCTCTGCCGCTGCGGTcg < 2:529221/138‑1 (MQ=255)
cTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATGGATCCTGTTGCCATTCTCTCGCAAAGTTTATGGCTCTCTGCCGCTGCGGTcg < 1:373583/138‑1 (MQ=255)
gggAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATGGATCCTGTTGCCATTCTCTCGCAAAGTTTATGGCTCTCTGCCGCTGCGGTCGCGGCATTg < 1:270527/139‑1 (MQ=255)
|
TTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATGGATCCTGTTGCCATTCTCTCGCAAAGTTTATGGCTCTCTGCCGCTGCGGTCGCGGCATTG > NZ_CP009273/960520‑960786
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
AATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATGGATCCTGTTGCCATTCTCTCGCAAAGTTTATGGCTCTCTGCCGCTGCGGTCGCGGCATTGATATTTTGGTA > NZ_CP009273/960516‑960797
|
AATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGT > SRR3722139.322899/1‑151 (MQ=60)
TTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGG < SRR3722139.550564/150‑1 (MQ=60)
GGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAG < SRR3722139.237752/151‑1 (MQ=60)
atgtgtataagagacagAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATG < SRR3722139.386608/134‑1 (MQ=60)
acagGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATG < SRR3722139.21715/147‑1 (MQ=60)
CACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATG < SRR3722139.49131/151‑1 (MQ=60)
GGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATG > SRR3722139.278799/1‑151 (MQ=60)
AATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATA < SRR3722139.492413/151‑1 (MQ=60)
cgtgggctcggagatgtgtataagagacagTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATA < SRR3722139.331122/118‑1 (MQ=60)
CCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATctgtctcttatac > SRR3722139.109623/1‑138 (MQ=60)
atacgagatctagtacggtctcgtgggctcggagatgtgtataagagacagCCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGG < SRR3722139.327010/100‑1 (MQ=60)
ATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGG < SRR3722139.348210/151‑1 (MQ=60)
TTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTCTGTGGGGAACGCTTAAGTTACGTGGGCGACAGAGGAGTGGCTGGGATGTATGGATAGGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATGGATCCgt > SRR3722139.286457/1‑149 (MQ=60)
GCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATGGATCCTGTTGCCA < SRR3722139.483479/151‑1 (MQ=60)
GCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATGGATCCTGTTGCCATTCTCTCGCAAAGTTT > SRR3722139.535313/1‑150 (MQ=60)
CTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATGGATCCTGTTGCCATTCTCTCGCAAAGTTTATGGCT > SRR3722139.40431/1‑151 (MQ=60)
GCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATGGATCCTGctgtctcttatacacatctccgagcccacgagaccgt > SRR3722139.498208/1‑113 (MQ=60)
TACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACctgtctcttatacacatctccgagcccacgagaccgtactagatatcgtatgccgtcttctgcttgaaaaaaaaaaaaaatcgtttgtatcaaagagactc > SRR3722139.129882/1‑50 (MQ=60)
ACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGATAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATGGATCCTGTTGCCATTCTCTCGCAAAGTTTATGGCTCTCTGCCGCTGCG < SRR3722139.306125/150‑1 (MQ=60)
GCTACGTGGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATGGATCCTGTTGCCATTCTCTCGCAAAGTTTATGGCTCTCTGCCGCTGCGGTCGCGGCATTGATA < SRR3722139.378062/150‑1 (MQ=60)
GGGGAACGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATGGATCCTGTTGCCATTCTCTCGCAAAGTTTATGGCTCTCTGCCGCTGCGGTCGCGGCATTGATATTTTGGTA < SRR3722139.273965/151‑1 (MQ=60)
|
AATTTTTCTGCCTGGGCGCTGGATCCACTGGCAAATACCATTAATTGGCGGAATCTGCTGTGCTGCTTTTTATGCCTGGTTGACGGGAATGCAACCTCCTGCATTGCGTACCATGGTGGCGCTTGCTACGTGGGGAATGCTTAAGTTAAGTGGGCGACAGTGGAGTGGCTGGGATGTATGGATATGTTGTCTGGCGGCAATTTTGCTGATGGATCCTGTTGCCATTCTCTCGCAAAGTTTATGGCTCTCTGCCGCTGCGGTCGCGGCATTGATATTTTGGTA > NZ_CP009273/960516‑960797
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
