Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F309 I0 R1
|
1697 |
197.2 |
6627756 |
95.7% |
6342762 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
693,739 |
G→T |
85.9% |
H299N (CAC→AAC) |
asnB ← |
asparagine synthetase B |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 693,739 | 0 | G | T | 85.9%
| 394.2
/ 70.9
| 177 | H299N (CAC→AAC) | asnB | asparagine synthetase B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (13/12); new base T (86/66); total (99/78) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.71e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.71e-01 |
Only 100 of 198 total aligned reads displayed.
GACAGCACCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTGAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTCCACGCGACGGGCTGCGTA > CP009273/693594‑693886
|
gACAGCACCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAgtgaagttaa < 2:1615851/148‑1 (MQ=255)
aCAGCACCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGTTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAAt < 2:1283833/148‑1 (MQ=255)
aCAGCACCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAAt < 2:2798481/148‑1 (MQ=255)
aCAGCACCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGGTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAAt < 2:1894368/148‑1 (MQ=255)
aGCACCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAAttt < 2:2677880/148‑1 (MQ=255)
cACCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCg < 2:2662872/148‑1 (MQ=255)
cACCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTGAATTTCg < 1:2478222/148‑1 (MQ=255)
aCCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGt > 1:1570019/1‑148 (MQ=255)
aCCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGt > 1:939454/1‑148 (MQ=255)
ccATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTg > 1:2317607/1‑148 (MQ=255)
ccATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTGAATTTCGTg < 2:1288921/148‑1 (MQ=255)
cATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGa < 1:323802/148‑1 (MQ=255)
cATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTGAATTTCGTGa > 1:296636/1‑148 (MQ=255)
cATTTTAATGCCCAACGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGa < 1:1990764/148‑1 (MQ=255)
aTTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGAt > 1:2036446/1‑148 (MQ=255)
aTGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCg < 2:2341181/148‑1 (MQ=255)
cccATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGc > 1:1029218/1‑148 (MQ=255)
tCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAg < 2:1865661/148‑1 (MQ=255)
cGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGa < 1:2733182/148‑1 (MQ=255)
cTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGTATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATgg < 1:591995/148‑1 (MQ=255)
cTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATgg < 2:364856/148‑1 (MQ=255)
cTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATgg < 1:592419/148‑1 (MQ=255)
ttGATCTTACGCGACATTGAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTGAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGt > 2:50128/1‑148 (MQ=255)
ttGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGt < 1:558502/148‑1 (MQ=255)
ttGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGt > 1:259833/1‑148 (MQ=255)
ttGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGt < 1:109460/148‑1 (MQ=255)
tGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGtt < 1:1508281/148‑1 (MQ=255)
gACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCt < 2:1062241/148‑1 (MQ=255)
aCATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTg > 1:2179367/1‑148 (MQ=255)
aTTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTggg > 1:1901889/1‑148 (MQ=255)
ttAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGgc < 2:1570019/148‑1 (MQ=255)
tAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGgct > 1:1003084/1‑148 (MQ=255)
aaTACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGgctgc < 2:481476/148‑1 (MQ=255)
aTACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGgctgct > 2:2305492/1‑148 (MQ=255)
aTACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGgctgct > 2:1378565/1‑148 (MQ=255)
aTAAATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCAAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGgctgct < 1:1388411/148‑1 (MQ=255)
tACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCtt > 2:2104446/1‑148 (MQ=255)
aCATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTGAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCttt > 2:863585/1‑148 (MQ=255)
tCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAg > 2:1369059/1‑148 (MQ=255)
aaGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGa < 2:1450796/148‑1 (MQ=255)
aaGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGa > 2:721270/1‑148 (MQ=255)
aaGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGa > 2:2613337/1‑148 (MQ=255)
cgcgAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAAcc > 1:403222/1‑148 (MQ=255)
aTAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCa > 1:2444825/1‑148 (MQ=255)
tAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAg > 1:894090/1‑148 (MQ=255)
aGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGa > 2:1976899/1‑148 (MQ=255)
aGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGa > 1:1685775/1‑148 (MQ=255)
gTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGAc > 1:1649005/1‑148 (MQ=255)
tGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGAcc < 2:804734/148‑1 (MQ=255)
acaTCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAg > 2:331768/1‑148 (MQ=255)
acaTCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAg > 1:1566105/1‑148 (MQ=255)
tcatAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCaa > 1:2397862/1‑148 (MQ=255)
tcatAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCaa > 1:1638676/1‑148 (MQ=255)
catAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCaaa < 1:307844/148‑1 (MQ=255)
catAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCaaa > 2:2384119/1‑148 (MQ=255)
catAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTGAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCaaa > 2:2196646/1‑148 (MQ=255)
tAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAgg > 1:2728099/1‑148 (MQ=255)
tAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAgg < 2:2633067/148‑1 (MQ=255)
aaGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTGAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGa < 2:493571/148‑1 (MQ=255)
aaGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTGAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGa > 2:494726/1‑148 (MQ=255)
gTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAgt > 2:2817735/1‑148 (MQ=255)
gTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAgt > 1:351565/1‑148 (MQ=255)
tttCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAgtg > 2:2864481/1‑148 (MQ=255)
tttCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAgtg > 2:2495181/1‑148 (MQ=255)
ttCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAgtgt < 1:2120003/148‑1 (MQ=255)
ttCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTGAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAgtgt < 2:64829/148‑1 (MQ=255)
tCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCAGCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTa < 2:2500279/148‑1 (MQ=255)
tgGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCg > 2:1221808/1‑148 (MQ=255)
aTCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGccacc < 2:2036446/148‑1 (MQ=255)
aTCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGccacc > 1:876229/1‑148 (MQ=255)
aTCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGccacc < 2:2317607/148‑1 (MQ=255)
aTCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGccacc < 1:2539707/148‑1 (MQ=255)
tCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGccacca > 1:485106/1‑148 (MQ=255)
cACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAg > 1:2162309/1‑148 (MQ=255)
cGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGc > 1:2846822/1‑148 (MQ=255)
aTGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGc > 2:2967822/1‑148 (MQ=255)
tGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTGAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCg < 1:2196646/148‑1 (MQ=255)
cATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTc > 2:1676011/1‑148 (MQ=255)
tCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCt > 1:2407065/1‑148 (MQ=255)
ccAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTg > 1:1821244/1‑148 (MQ=255)
aGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGAt > 2:2704090/1‑148 (MQ=255)
aGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGAt > 2:272467/1‑148 (MQ=255)
aGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGAt < 2:3072957/148‑1 (MQ=255)
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gACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATc < 2:818867/148‑1 (MQ=255)
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ATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAG < SRR19973070.2556313/150‑1 (MQ=60)
TCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGG < SRR19973070.466915/150‑1 (MQ=60)
CACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGC > SRR19973070.2865256/1‑150 (MQ=60)
GGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGC > SRR19973070.161996/1‑150 (MQ=60)
TGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTGAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTT < SRR19973070.2211141/150‑1 (MQ=60)
TGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTGAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTT > SRR19973070.252094/1‑150 (MQ=60)
CATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCT > SRR19973070.2422940/1‑150 (MQ=60)
ATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTG > SRR19973070.894997/1‑150 (MQ=60)
ATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTG > SRR19973070.1833785/1‑150 (MQ=60)
CCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTGAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGAT < SRR19973070.50741/150‑1 (MQ=60)
CAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATC > SRR19973070.2993786/1‑150 (MQ=60)
CAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTGAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATC > SRR19973070.2974272/1‑150 (MQ=60)
AGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCT > SRR19973070.616843/1‑150 (MQ=60)
AGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCT > SRR19973070.2987230/1‑150 (MQ=60)
GACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTT > SRR19973070.1698622/1‑150 (MQ=60)
GACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTT < SRR19973070.675645/150‑1 (MQ=60)
GACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTT < SRR19973070.675343/150‑1 (MQ=60)
CCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTCC > SRR19973070.2176746/1‑150 (MQ=60)
TTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTCCAC < SRR19973070.747355/150‑1 (MQ=60)
TTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTCCAC < SRR19973070.2057192/150‑1 (MQ=60)
CAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTCCACGCGACGGG > SRR19973070.3154616/1‑150 (MQ=60)
CAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTCCACGCGACGGG > SRR19973070.55459/1‑150 (MQ=60)
AGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTCCACGCGACGGGC > SRR19973070.3089120/1‑150 (MQ=60)
AGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTCCACGCGACGGGC > SRR19973070.2573296/1‑150 (MQ=60)
AGTGAAGTGAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTCCACGCGACGGGC > SRR19973070.530657/1‑150 (MQ=60)
GTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTCCACGCGACGGGCT < SRR19973070.2896190/150‑1 (MQ=60)
GTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTCCACGCGACGGGCT < SRR19973070.38838/150‑1 (MQ=60)
GTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTCCACGCGACGGGCT < SRR19973070.2245896/150‑1 (MQ=60)
TGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTCCACGCGACGGGCTG > SRR19973070.227689/1‑150 (MQ=60)
GTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTCCACGCGACGGGCTGCGTA > SRR19973070.598568/1‑150 (MQ=60)
GTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTCCACGCGACGGGCTGCGTA > SRR19973070.598567/1‑150 (MQ=60)
TAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTCCACGCGACGGGCTGCGTATT < SRR19973070.2406735/150‑1 (MQ=60)
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GGACAGCACCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTGAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTCCACGCGACGGGCTGCGTATT > CP009273/693593‑693888
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |