Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F488 I0 R1
|
1275 |
300.1 |
10328444 |
91.0% |
9398884 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
693,739 |
G→T |
100% |
H299N (CAC→AAC) |
asnB ← |
asparagine synthetase B |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 693,739 | 0 | G | T | 98.6%
| 756.4
/ 0.3
| 235 | H299N (CAC→AAC) | asnB | asparagine synthetase B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (2/2); new base T (136/95); total (138/97) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 248 total aligned reads displayed.
CGGACAGCACCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTGAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTCCACGCGACGGGCTG > CP009273/693592‑693882
|
cGGACAGCACCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAgtgaagttaa < 1:4196956/150‑1 (MQ=255)
cGGACAGCACCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAgtgaagttaa > 1:3940292/1‑150 (MQ=255)
gACAGCACCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAAtt < 1:181562/150‑1 (MQ=255)
aGCACCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCg > 1:1061126/1‑150 (MQ=255)
aGCACCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCg > 2:3331569/1‑150 (MQ=255)
aGCACCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCg > 2:2323346/1‑150 (MQ=255)
aGCACCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCg > 1:3248389/1‑150 (MQ=255)
gCACCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGt > 2:4507963/1‑150 (MQ=255)
gCACCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGt > 1:2363635/1‑150 (MQ=255)
cACCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTg > 1:2833676/1‑150 (MQ=255)
cACCATTTGAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTg < 2:1533967/150‑1 (MQ=255)
tAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCg > 1:1043755/1‑150 (MQ=255)
tAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCg < 2:2540846/150‑1 (MQ=255)
tAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCg < 2:1189875/150‑1 (MQ=255)
aaTGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGt < 2:3904288/150‑1 (MQ=255)
aaTGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGt > 1:4839784/1‑150 (MQ=255)
tGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGc > 1:5058206/1‑150 (MQ=255)
gCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGcc < 2:2826326/150‑1 (MQ=255)
gCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGcc > 1:2545742/1‑150 (MQ=255)
cccATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGccc > 1:3169688/1‑150 (MQ=255)
ccATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCa > 2:1215245/1‑150 (MQ=255)
cGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTTGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATg < 2:5097786/150‑1 (MQ=255)
gCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATgg > 2:673898/1‑150 (MQ=255)
gCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATgg > 2:4038365/1‑150 (MQ=255)
gCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATgg > 2:339051/1‑150 (MQ=255)
ccTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGt < 1:2002682/150‑1 (MQ=255)
ccTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGt < 1:3860151/150‑1 (MQ=255)
cTTGATCTTACGCGTCATTCAATCCATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCGTGTACAGTGTCGTTCATTTCGTGATGCACAGTGCCCAGATGGtt > 2:4821318/1‑150 (MQ=255)
cTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGtt > 2:3094220/1‑150 (MQ=255)
cTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGtt > 1:1555060/1‑150 (MQ=255)
tGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTg > 1:1038467/1‑150 (MQ=255)
gATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGc > 2:4075332/1‑150 (MQ=255)
aTCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGcc > 2:3624888/1‑150 (MQ=255)
tCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGACGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCa > 2:1827561/1‑150 (MQ=255)
cTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGAAGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCAc > 2:3438433/1‑150 (MQ=255)
ttACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACt < 1:21249/150‑1 (MQ=255)
tcgccgACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATAATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACtt < 2:5022443/146‑1 (MQ=255)
tACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCTAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACtt < 2:515573/150‑1 (MQ=255)
tACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACtt > 2:2910459/1‑150 (MQ=255)
aCGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGACTAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACCGTGAAGTTAATTTCGTGCTGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTc > 2:336352/1‑150 (MQ=255)
ttAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGgctg < 2:3179204/150‑1 (MQ=255)
aaaTACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGgctgct < 2:1707148/150‑1 (MQ=255)
aaTACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAACTCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCtt > 2:4673315/1‑150 (MQ=255)
aaTACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCtt > 2:3954897/1‑150 (MQ=255)
tACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTc > 2:4341085/1‑150 (MQ=255)
tACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTc < 1:550059/150‑1 (MQ=255)
aCATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCa > 2:1350588/1‑150 (MQ=255)
aTCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGa > 2:3894520/1‑150 (MQ=255)
aTCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGa > 1:2506397/1‑150 (MQ=255)
aGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAAcc > 2:2559759/1‑150 (MQ=255)
gAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCa < 1:3790742/150‑1 (MQ=255)
aaTAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGACCCCGGCAg > 2:636327/1‑150 (MQ=255)
tAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGAc > 2:3702239/1‑150 (MQ=255)
aGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGAcc > 1:2281230/1‑150 (MQ=255)
aGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGAcc > 1:3558907/1‑150 (MQ=255)
gTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCt < 2:2651363/150‑1 (MQ=255)
tGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTa > 2:2380226/1‑150 (MQ=255)
ggTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTAc > 1:3433701/1‑150 (MQ=255)
tCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAg > 1:1319518/1‑150 (MQ=255)
cacaTCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGc > 1:4278194/1‑150 (MQ=255)
cacaTCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGc > 1:3292583/1‑150 (MQ=255)
atAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGa < 2:3768382/150‑1 (MQ=255)
atAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTGAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGa > 1:833152/1‑150 (MQ=255)
atAAGTTTCGATATGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGa < 2:2978247/150‑1 (MQ=255)
tAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAg > 2:4981089/1‑150 (MQ=255)
tAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAg < 1:3113424/150‑1 (MQ=255)
aGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAgtg < 2:4200380/150‑1 (MQ=255)
aGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAgtg > 2:1981059/1‑150 (MQ=255)
aGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAgtg < 1:2399987/150‑1 (MQ=255)
tCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAAc < 1:4670951/150‑1 (MQ=255)
gATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTg > 2:4370262/1‑150 (MQ=255)
aTGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGc > 1:3493865/1‑150 (MQ=255)
aTGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGc < 1:4053635/150‑1 (MQ=255)
aTGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGc > 2:1209320/1‑150 (MQ=255)
tgtgGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCg < 1:2063591/150‑1 (MQ=255)
tAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGccac < 2:1573589/150‑1 (MQ=255)
gTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTc > 1:295224/1‑150 (MQ=255)
cgcgGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCag < 1:1890965/150‑1 (MQ=255)
cgGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCagag < 1:2253169/150‑1 (MQ=255)
cgGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTGAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCagag < 1:767006/150‑1 (MQ=255)
ggATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGc > 1:4650967/1‑150 (MQ=255)
ggATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGc > 1:291491/1‑150 (MQ=255)
tGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGtt > 1:2217602/1‑150 (MQ=255)
gCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTcc < 1:612336/150‑1 (MQ=255)
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CATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGG > SRR19973063.4849477/1‑150 (MQ=60)
ATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTGAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGA > SRR19973063.835560/1‑150 (MQ=60)
TAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAG < SRR19973063.527212/150‑1 (MQ=60)
TAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAG < SRR19973063.3123448/150‑1 (MQ=60)
AAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGT > SRR19973063.3081303/1‑150 (MQ=60)
AGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTG < SRR19973063.2407663/150‑1 (MQ=60)
TCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAAC < SRR19973063.4685845/150‑1 (MQ=60)
ATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGC < SRR19973063.4066632/150‑1 (MQ=60)
ATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGC > SRR19973063.3505072/1‑150 (MQ=60)
ATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGC > SRR19973063.3505035/1‑150 (MQ=60)
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TGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTACG > SRR19973063.334089/1‑150 (MQ=60)
GTTGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGG < SRR19973063.2889889/150‑1 (MQ=60)
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GTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGG > SRR19973063.2252276/1‑150 (MQ=60)
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AATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCA < SRR19973063.2441783/150‑1 (MQ=60)
ATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAG < SRR19973063.2093796/150‑1 (MQ=60)
CACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGC > SRR19973063.22865/1‑150 (MQ=60)
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GATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCG > SRR19973063.3376691/1‑150 (MQ=60)
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ATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTG < SRR19973063.3455696/150‑1 (MQ=60)
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TTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTCCACGCGACGGGCTGCGTAT < SRR19973063.4051309/150‑1 (MQ=60)
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CCGGACAGCACCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTGAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTCCACGCGACGGGCTGCGTAT > CP009273/693591‑693887
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |