Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F527 I0 R1
|
1651 |
322.4 |
10661268 |
95.2% |
10149527 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
693,739 |
G→T |
100% |
H299N (CAC→AAC) |
asnB ← |
asparagine synthetase B |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 693,739 | 0 | G | T | 100.0%
| 937.8
/ ‑6.7
| 285 | H299N (CAC→AAC) | asnB | asparagine synthetase B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base T (158/126); minor base A (1/0); total (159/126) |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 304 total aligned reads displayed.
CGGACAGCACCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTGAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTCCACGCGACGGGCTGCGT > CP009273/693592‑693885
|
ggACAGCACCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAAt > 2:4704000/1‑150 (MQ=255)
gACAGCACCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAAtt > 1:3565050/1‑150 (MQ=255)
gACAGCACCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAAtt > 1:3464728/1‑150 (MQ=255)
aCAGCACCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAAttt < 1:1293435/150‑1 (MQ=255)
cACCATTTAAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGACTAGTGGTCACATCATAAGTTACGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCTTg > 2:2033644/1‑150 (MQ=255)
aCCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGa < 2:4236178/150‑1 (MQ=255)
aTTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATCAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGACGTTCATTTCGTGATGc > 1:4282198/1‑150 (MQ=255)
ttttAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCa < 2:5106722/150‑1 (MQ=255)
ttAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCAcc > 2:492676/1‑150 (MQ=255)
tAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCg > 1:1656109/1‑150 (MQ=255)
aaTGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGt > 2:242357/1‑150 (MQ=255)
aTGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTg < 2:2720549/150‑1 (MQ=255)
cccATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGccc > 2:2942999/1‑150 (MQ=255)
cccATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGccc > 1:2567128/1‑150 (MQ=255)
aTCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGa > 2:4627951/1‑150 (MQ=255)
aTCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGAGCCCAGa > 1:4646742/1‑150 (MQ=255)
cGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATg < 1:2657430/150‑1 (MQ=255)
gCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATgg > 2:541349/1‑150 (MQ=255)
ccTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGt < 2:3576818/150‑1 (MQ=255)
cTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGGAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGtt > 2:1045577/1‑150 (MQ=255)
cTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGtt < 2:4465497/150‑1 (MQ=255)
ttGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTTGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGttt < 1:1080726/150‑1 (MQ=255)
tGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTg > 2:743671/1‑150 (MQ=255)
tCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCa > 1:4679469/1‑150 (MQ=255)
ttACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGANGGTTTGCCACt < 1:2763446/150‑1 (MQ=255)
aCGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTc > 2:1717157/1‑150 (MQ=255)
cgcgACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTcc > 2:591917/1‑150 (MQ=255)
cgACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTg < 1:452676/150‑1 (MQ=255)
gACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTgg < 2:2327331/150‑1 (MQ=255)
aaaTACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGgctgct < 2:3700090/150‑1 (MQ=255)
aaaTACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGgctgct > 1:180749/1‑150 (MQ=255)
aaTACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCCTACGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGGTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCtt > 2:330667/1‑150 (MQ=255)
aTACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCttt < 2:2610542/150‑1 (MQ=255)
tACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTc < 1:1094618/150‑1 (MQ=255)
aCATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGAGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCa > 1:922727/1‑150 (MQ=255)
ggTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATcc < 2:4503118/150‑1 (MQ=255)
tgtTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCgg > 1:1004883/1‑150 (MQ=255)
gtTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGt < 2:2080729/150‑1 (MQ=255)
gtTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGt > 2:3606540/1‑150 (MQ=255)
tGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGa > 2:1666870/1‑150 (MQ=255)
tGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGa > 1:3398550/1‑150 (MQ=255)
gAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGaa < 2:935057/150‑1 (MQ=255)
aaGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAAc > 2:156879/1‑150 (MQ=255)
aGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAAcc < 1:87461/150‑1 (MQ=255)
cgAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGc > 2:3839318/1‑150 (MQ=255)
tAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGAc < 1:4610973/150‑1 (MQ=255)
aGTGGTCACATCATATGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGAcc < 1:412834/150‑1 (MQ=255)
aGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGAcc > 2:3339281/1‑150 (MQ=255)
aGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGAcc > 1:2219993/1‑150 (MQ=255)
gTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCt > 1:1580093/1‑150 (MQ=255)
cacaTCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGc > 2:5218042/1‑150 (MQ=255)
acaTCATTAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGTTGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGTAGTTAATTTCGTGTTGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCa < 1:3723968/150‑1 (MQ=255)
catcatAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCaa > 2:2140611/1‑150 (MQ=255)
catcatAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCaa > 2:1914482/1‑150 (MQ=255)
atcatAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCaaa > 1:1158853/1‑150 (MQ=255)
atcatAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCaaa > 1:3829139/1‑150 (MQ=255)
atcatAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACATTCCTGTACAGTGAAGTTAATATCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTAGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCaaa > 1:3215475/1‑150 (MQ=255)
atAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGa > 2:1417913/1‑150 (MQ=255)
aGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAgtg > 1:1954177/1‑150 (MQ=255)
gTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAgtgt > 2:4736176/1‑150 (MQ=255)
ttCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTaa < 1:3453238/150‑1 (MQ=255)
ttCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTaa > 2:4174490/1‑150 (MQ=255)
ttCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGAGTaa > 2:345184/1‑150 (MQ=255)
tCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAAc < 2:1893998/150‑1 (MQ=255)
cGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACt < 2:4081153/150‑1 (MQ=255)
cGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGACACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACATACAGCAAAGGAGTGTAACt < 2:3437044/150‑1 (MQ=255)
aTGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGc < 1:4372290/150‑1 (MQ=255)
tCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCa < 1:5305206/150‑1 (MQ=255)
cgGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCagag > 2:703575/1‑150 (MQ=255)
ggATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTCCAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGc > 2:3015510/1‑150 (MQ=255)
ggATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGc > 1:818300/1‑150 (MQ=255)
ggATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGc > 2:3056227/1‑150 (MQ=255)
ggATGGCATCCAGACATTCCTGTACAGTGAAGTAAATTACGTGATGCAACGTGCCCAGATGGATTGCCACTTCCTGGGCTGCATACAGATCCGGTGAACCCGGCAGACATACAGCAAAGGAGTGTAAATGCGGCCAACAGGCTACAGAGc > 2:636194/1‑150 (MQ=255)
gCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTcc < 2:3974739/150‑1 (MQ=255)
cATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCt < 2:1098085/150‑1 (MQ=255)
cATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCt < 2:2493483/150‑1 (MQ=255)
cAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATc < 1:2097382/150‑1 (MQ=255)
cAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATc < 1:4749892/150‑1 (MQ=255)
aGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCt < 1:1374209/150‑1 (MQ=255)
gACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCtt < 1:242357/150‑1 (MQ=255)
aCCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTc < 1:48266/150‑1 (MQ=255)
ccTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTcc < 2:282101/150‑1 (MQ=255)
ccTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTcc < 2:1368416/150‑1 (MQ=255)
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cTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTCCa < 1:1739223/150‑1 (MQ=255)
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ACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCA < SRR19973062.2207162/150‑1 (MQ=60)
ATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAA > SRR19973062.3848730/1‑150 (MQ=60)
ATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAA > SRR19973062.450990/1‑150 (MQ=60)
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ATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACATTCCTGTACAGTGAAGTTAATATCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTAGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAA > SRR19973062.3232173/1‑150 (MQ=60)
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GTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTCCACGCGACGGGCTGCGTA < SRR19973062.4607192/150‑1 (MQ=60)
GTTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTCCACGCGACGGGCTGCGTA < SRR19973062.4607053/150‑1 (MQ=60)
TTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTCCACGCGANGGGCTGCGTAT < SRR19973062.2778323/150‑1 (MQ=60)
TTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTCCACGCGACGGGCTGCGTAT < SRR19973062.133946/150‑1 (MQ=60)
TTAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTCCACGCGACGGGCTGCGTAT < SRR19973062.2121911/150‑1 (MQ=60)
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GGACAGCACCATTTTAATGCCCATCGCCTTGATCTTACGCGACATTAAATACATCGGTGTTGAAGCGCGAATAGTGGTCACATCATAAGTTTCGATGTGGTAAATCACGTCGCGGATGGCATCCAGACCTTCCTGTACAGTGAAGTGAATTTCGTGATGCACCGTGCCCAGATGGTTTGCCACTTCCTGGGCTGCTTTCAGATCCGGTGAACCCGGCAGACCTACAGCAAAGGAGTGTAACTGCGGCCACCAGGCTTCAGAGCGTTCCTGATCTTCCACGCGACGGGCTGCGTAT > CP009273/693593‑693887
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |