Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F368 I0 R1
|
1472 |
214.4 |
7116750 |
95.9% |
6824963 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
234,994 |
G→T |
19.7% |
S77* (TCA→TAA) |
ykfM ← |
lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 234,994 | 0 | G | T | 19.7%
| 385.7
/ 15.2
| 201 | S77* (TCA→TAA) | ykfM | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (81/69); new base T (11/38); total (92/109) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.25e-04 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 208 total aligned reads displayed.
GGGTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACA > CP009273/234850‑235141
|
gggTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGAtt < 1:989837/148‑1 (MQ=255)
gATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTttat > 1:431927/1‑148 (MQ=255)
aTAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTttatt < 2:2480248/148‑1 (MQ=255)
tAATTATTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTttatta < 2:2452053/148‑1 (MQ=255)
aaTTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTtattat > 2:2286703/1‑148 (MQ=255)
gTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCgtaa < 1:1119663/148‑1 (MQ=255)
aTTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCgtaagt > 2:1633978/1‑148 (MQ=255)
ttGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCgtaagta > 2:3167081/1‑148 (MQ=255)
tGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAAGAATGATTTTATTATAgtaagtaa > 1:1249482/1‑148 (MQ=255)
tGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTAtagttagtta > 1:958464/1‑146 (MQ=255)
tGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAgtaagtaa > 2:855970/1‑148 (MQ=255)
aCATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTaaaa < 2:776587/148‑1 (MQ=255)
aCATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTaaaa < 1:721840/148‑1 (MQ=255)
aCATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTaaaa < 1:988213/148‑1 (MQ=255)
cATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAAt > 1:1055953/1‑148 (MQ=255)
cATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAAt < 1:1555771/148‑1 (MQ=255)
atatCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTTCTATTACGATATCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAAtt < 1:3075897/148‑1 (MQ=255)
atatCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAAtt > 1:2972016/1‑148 (MQ=255)
ccTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACAt < 2:285636/148‑1 (MQ=255)
ccTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACAt < 2:3427057/148‑1 (MQ=255)
ccTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACAt < 2:2631954/148‑1 (MQ=255)
tgtgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACTATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATAGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGAATTTAATATCGTAAGTAAAATTACAAGa > 1:2376085/1‑148 (MQ=255)
tgtgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGa < 2:1804371/148‑1 (MQ=255)
tgtgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGa < 2:2110127/148‑1 (MQ=255)
gtgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGaa < 1:956678/148‑1 (MQ=255)
tgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAat < 1:2639584/148‑1 (MQ=255)
tgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATATTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAat < 2:3199160/148‑1 (MQ=255)
gACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAata < 1:1582691/148‑1 (MQ=255)
aGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTaaa > 2:3041274/1‑148 (MQ=255)
ggAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATTAATATTTaaaa > 2:1647110/1‑148 (MQ=255)
ggAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATCTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTaaaa > 2:1684360/1‑148 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 2:560144/148‑1 (MQ=255)
tAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTTATTTAGAATGATTTTTTTTTAGTAATTAAAATTAAATGAAAATTTAAAAAAGaaaaa > 1:637929/1‑147 (MQ=255)
aaaGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAATGAAAACg > 2:761582/1‑148 (MQ=255)
aaaGGTGATATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACg < 1:2022094/148‑1 (MQ=255)
gTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACAt > 2:3372293/1‑148 (MQ=255)
cttttACTATTGATATTATTAAAAATATAAGAGTTAGCTTTTTTTTTTTGTCTGTGGCTAATTTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCTTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGaa < 2:2843190/145‑1 (MQ=255)
tATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGaaa > 2:2602628/1‑148 (MQ=255)
aTTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCGTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAAc > 1:3261015/1‑148 (MQ=255)
aCGATAGATATTATTAAAAATATAAGAGTTAGCTTTATTGTTTTGTCTGTGGCTAAATTTACTACCTTCTTTTTTTTGATTAATAATGTTTTTATTATCTTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGa < 2:1103235/148‑1 (MQ=255)
cGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAATGAAAACGAAAAGAAACCGaa > 1:1885645/1‑148 (MQ=255)
gATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAg < 2:832217/148‑1 (MQ=255)
agatattatTAAAAATATATGTTTTTGCTTTATTGTTTTGTTTGTGGCTAAATTGACTACCTTGGTTTTTTTTATTAAGATTTTTTTTTTTATCTTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGcac < 2:363106/145‑1 (MQ=255)
ttataaaaaaTATAATTGTTTGGTTTTTTTTTTTGTGTGGGGCTAATTTGACCACGTTGTTTTTTTTTATTAATATTTTTTTTTTTATCTTAATTAAATTAAATTTAATATTAAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAAt < 1:722715/143‑1 (MQ=255)
gTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAAAGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACAGGAATATTTAAAAATGAAAACGACATGAAACCGAAGCCCAGAAACaa > 2:2683121/1‑148 (MQ=255)
tAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAATAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAAATAAATGAAAATTTAAAAAAGAAAACGACAATAAAACGCAGCAAacaaacaaa > 1:3452807/1‑147 (MQ=255)
aaaaaTATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTTAGAATGATTTTTTTATCGTAATTAAAATTAAATGAATATTTTAAAATGAAAAAGACATGAAAACGAAGCACAGAAacaaca > 1:2224538/1‑148 (MQ=255)
aaaaTATAAGATTTAGCTTTATTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAt < 2:1269561/148‑1 (MQ=255)
tataAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAAAATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACCTtctc > 2:1389142/1‑148 (MQ=255)
ataAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAAGAATGATTTTATTTTAGGAAGTAAAATTAAAGGAATAATTTAAAATTCAAAAGACATTAAACCCAACAACACAAAAAACAATCTcc > 1:1953005/1‑148 (MQ=255)
ataAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTATcc > 2:1434702/1‑148 (MQ=255)
taAGAGTTCGGTGTTTTTTTTTGTCTGTGGCTAATTTGAATACCTTGTTTTTTTTTATTAATATTTATTTTTTTATCGTAATTAAAATTAAATTAATTTTAAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCa < 1:102394/148‑1 (MQ=255)
taAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAAGAATGATTTTATTATAGTAACTAAAATAAAAATAATATTTAAAAATGAAAAAGACATGAAAACGAACAACACAAACAACAATCTACa > 1:1357846/1‑148 (MQ=255)
aaGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAATGAAAAAGACATGAAAACCAAGCACAGAATCAACAATATCCaa > 1:1360717/1‑148 (MQ=255)
tttgTTAGCTGTTTTTTTATTTCTGTGGCTAAATTGACTCCCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAATTTAATTGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAAt < 2:2376085/145‑1 (MQ=255)
agatTTAGCTTTATTTTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATCGTAAGTAAATTTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAAt < 2:591421/148‑1 (MQ=255)
tttttttttATGTCTGTGGCTAAATTCACTACCTTCTTTTTTTTGATTAATATTTATTTTATTATCTTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAata < 1:3488881/141‑1 (MQ=255)
tATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATAtt < 2:2203933/148‑1 (MQ=255)
tATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAAAATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGAACACAATCAACATTCTACAATAATAAAATAtt > 2:3111862/1‑148 (MQ=255)
aTTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGTATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGCAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATAttt > 2:2190934/1‑148 (MQ=255)
aTGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTgg > 2:690299/1‑148 (MQ=255)
gTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAACTAAAAATACATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATGAAACCGAAGCACAGAAACAAAATTAACCAATCATAAAATATTTCCGTGGAg > 2:3301436/1‑148 (MQ=255)
cTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCa < 2:3001559/148‑1 (MQ=255)
ggtgGCTAAATTGACTACCTTTTTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATCTTAATTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAt < 1:2532067/147‑1 (MQ=255)
tgGCCAAATTCACTACCTTTGTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATTAATATTAAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAttt < 2:3452807/148‑1 (MQ=255)
tgataaaTTGACTACATTCTTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAATTAAAATTACATGAATATTAAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtttt < 2:27023/144‑1 (MQ=255)
ggCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtttt < 2:1728757/148‑1 (MQ=255)
gCGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTtta < 2:1975714/148‑1 (MQ=255)
gAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTttatt < 2:431927/148‑1 (MQ=255)
aaaaTTCACTACCTTCTTTTTTTTTATAAAGATTCTTTTTATTATCTTAATTAAATTTAAATAAATATTAAAAAAGAAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTttatt < 1:2703711/147‑1 (MQ=255)
aaTTCACTACCTTTTTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATATTAACTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGCAACACGACATGAAACCGAAGAACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTtattat < 1:1295594/148‑1 (MQ=255)
aTTGAAGACCTTCGTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTattatt < 2:2438309/148‑1 (MQ=255)
tcaCTACCTTCTTTTTTTTTATAAACAATTATTTTATTATCTTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGTAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGa < 1:430410/146‑1 (MQ=255)
tGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAATATTTATTTTTTTATCTAAATAAAAATTACATTAATATTAAAAAAGCAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGa < 1:1633974/148‑1 (MQ=255)
cattCTTTTTTTTTATTAATAATTATTTTTTTATCTTAATTAAATTTAAATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATag < 2:957861/146‑1 (MQ=255)
cttcttTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAATTTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATaga < 1:2618540/148‑1 (MQ=255)
cTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATaga < 2:1928610/148‑1 (MQ=255)
cTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAATGAAAAAGACATGAAACCGAAGCACAGAATAAACAATCTCCAAAAAAAAAATATTTAAGTGGAGCATTTTATTATTGtatatata > 2:531217/1‑146 (MQ=255)
ttCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATTAATATTAAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATagag < 1:2654925/148‑1 (MQ=255)
tcttttttttGATTAAGAATTATTTAATTATCGTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAgg < 2:1882133/145‑1 (MQ=255)
tCGTTTTTTTTATTAACAATTTTTTTATTATCTTAATTAAAATTACATCAATATAAAAAAAGCAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAgg < 1:1646131/148‑1 (MQ=255)
ctttttttttATTAATAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAATTAAATGAATATTAAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGt < 1:2204705/146‑1 (MQ=255)
cGTTTTTTTTATTAAGATTTATTTTATTATCTTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTATCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGt < 1:854539/148‑1 (MQ=255)
ttttttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTa > 2:1757566/1‑148 (MQ=255)
ttttTATTAATATTTATTTTATTATCTTAATAAAAATTAAATTAATATTTAAAATGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAAc < 2:1546935/148‑1 (MQ=255)
ttttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAAc > 2:1624823/1‑148 (MQ=255)
ttttATTAAGAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACt < 2:1199564/148‑1 (MQ=255)
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aTGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTACCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTaaaaaa > 1:550205/1‑148 (MQ=255)
gATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACa > 1:1772369/1‑148 (MQ=255)
gATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACa > 1:3414715/1‑148 (MQ=255)
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GGGTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACA > CP009273/234850‑235141
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
