Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F10 I0 R1
|
85 |
228.3 |
8665814 |
85.8% |
7435268 |
149.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
234,994 |
G→T |
21.7% |
S77* (TCA→TAA) |
ykfM ← |
lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 234,994 | 0 | G | T | 21.7%
| 304.6
/ 27.3
| 158 | S77* (TCA→TAA) | ykfM | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (57/61); new base T (14/26); total (71/87) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.98e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
GCAGGGGTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAA > CP009273/234846‑235142
|
gCAGGGGTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATg < 1:1453593/149‑1 (MQ=255)
ggggTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGAtt < 2:3867583/149‑1 (MQ=255)
gggTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGAttt > 2:3736478/1‑149 (MQ=255)
gggTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGAttt < 2:3658917/149‑1 (MQ=255)
gggTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGATATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTAttt > 2:3736610/1‑149 (MQ=255)
tGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTttat > 2:4201938/1‑149 (MQ=255)
tGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTttat < 2:236595/149‑1 (MQ=255)
tGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTttat > 2:2748943/1‑149 (MQ=255)
aaTTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGTTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATc < 1:2411210/149‑1 (MQ=255)
aaTTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATc > 1:3224477/1‑149 (MQ=255)
aaTTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATc < 1:3459974/149‑1 (MQ=255)
aaTTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATc < 1:2410453/149‑1 (MQ=255)
aTTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCg < 2:2612690/149‑1 (MQ=255)
aGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCgtaa < 1:4176382/149‑1 (MQ=255)
gTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATAgtaag > 2:2160566/1‑149 (MQ=255)
gTATTGACATAGCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCgtaag < 2:2256586/149‑1 (MQ=255)
aTTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCgtaagta < 2:2489241/149‑1 (MQ=255)
gACATATCCAGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTaaaa < 2:3767740/149‑1 (MQ=255)
aCATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAAt < 1:1503643/149‑1 (MQ=255)
atatCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGACTGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTa > 2:145629/1‑149 (MQ=255)
tCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACAt < 1:820651/149‑1 (MQ=255)
gtgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAat < 1:2580823/149‑1 (MQ=255)
gACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAatat > 2:987768/1‑149 (MQ=255)
gACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAatat < 1:152964/149‑1 (MQ=255)
gACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAatat < 1:154107/149‑1 (MQ=255)
aaaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTaa < 1:459864/149‑1 (MQ=255)
aaaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTaa < 1:459865/149‑1 (MQ=255)
aaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTaaa < 2:3487966/149‑1 (MQ=255)
aGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTaaaa < 2:898913/149‑1 (MQ=255)
aGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTaaaa < 2:898848/149‑1 (MQ=255)
gCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGa < 1:3896678/149‑1 (MQ=255)
cTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGaa < 2:1479010/149‑1 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGaaaa > 2:701248/1‑149 (MQ=255)
ggTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAATAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAATTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAAAGACAt > 1:3811826/1‑149 (MQ=255)
ggTGATATTACTATAGATATTAGTAAAAATATAATTTTTTGCTGTTTTGTTTTGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGATTTATTTTATTATCGTAATTAAATTTACATTAATATTTAAAATGGAAAACGACAt < 2:1933244/149‑1 (MQ=255)
gTGCTATTACTATAGCTATTATTAAAAATATAAGATTTAGCTTTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGATTGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATg < 2:250640/149‑1 (MQ=255)
gTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATg > 2:3320181/1‑149 (MQ=255)
ttACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAAATACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAAACg > 1:3560635/1‑149 (MQ=255)
tACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATATTAAATAAAAATAAAAGAAAATTTAAAAAAGGAAACGAAAAGaaaaaca > 1:1135881/1‑145 (MQ=255)
cGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAAACACAATAAACCCAAg > 2:4009308/1‑149 (MQ=255)
tttatattatTAAAAATATATGTGTTCGGTTTTTTTTTATTTGTGTGGCTAAATTTATTACCTTGTTTTTTTTTATTAACATTTTTTTTTTTATCTTAATAAAATTTAATTTAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGcac < 1:3519253/145‑1 (MQ=255)
tAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACAAGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATGAAACCCAAGcac > 2:2942885/1‑149 (MQ=255)
cTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAATAATGATTTTATTATATTAAGTAAAATTAAAAGAATGTTTAAAAATTAAAAAGACAAGAAACCGAAGCACAGa > 1:830000/1‑149 (MQ=255)
tttattaAAAATATATTATTTAGGTTTTTTGTTATTTGTGTGGCTAATTTGACTACTTTCTTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCGAAATAAAAATTACATTAATATTTAAAATGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAAt < 2:1833574/148‑1 (MQ=255)
ttAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTTAGAATGATTTTATTTTAGTTAATAAAAATAAATGAATAATTAAAAAGGAAAACGACAAGAAAACCAAGCACAAAAta > 1:23596/1‑148 (MQ=255)
ttAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTGTTTTAAAAATATTTTATTATAGGAACTAAAAATAAAAGAAAATTTAAAAAAGAAAAACACCAGAAACCCAACCACAGAATc > 1:22659/1‑149 (MQ=255)
tAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAATGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCa > 2:2135041/1‑149 (MQ=255)
aGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCaa > 1:2061946/1‑149 (MQ=255)
gTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGTCATGAAACCGAAGAAAAGAATAAAc > 1:291170/1‑149 (MQ=255)
tAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTGCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACa < 2:3577544/149‑1 (MQ=255)
aaaaTATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATAGTAATTAAAATTAAATGAATATTTAAAAATGAAAAAGACATGAAACCGAGGACCAGAATCAAAAtt > 2:2306179/1‑149 (MQ=255)
aaaTATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGAAATGAAAACGAAGCACAGAATAAACAtaa > 2:3285221/1‑147 (MQ=255)
atatAAGATTTAGTGTTTTTTTTTTGTCTGGGGCTAATTTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAATATTTTTTTTATTATCTTAATAAAATTTAAATTAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATtctc < 1:265751/149‑1 (MQ=255)
tataAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAATCACAGAATAAACATTATcc > 2:2084008/1‑149 (MQ=255)
atagTTATCTTTATTTTTATTTCTGTGGATAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATCTTAAGTAAAATTAATTTAATATTTAAAAATGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATc < 2:1295714/147‑1 (MQ=255)
agagTTAGGTGTATTGTTTTGTCTGTGGCTAATTTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATCTTATGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATc < 2:1099147/149‑1 (MQ=255)
gagTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATGAAACAGAAGCACAGAATCAAAATTATCCAATCa > 2:2984325/1‑149 (MQ=255)
gagTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAAAGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACCTGAATATTTAAAAAGGAAAACGACAAGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCa > 2:2721385/1‑149 (MQ=255)
tttAGCTTTTTTTTTTGGTGTGTGGATAAATTGACTACGTTCTTTTTTTTTTTTAATATTTTTTTTATTATCGTAATTAAAATTAATTTAATATTAAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATa < 1:1840238/148‑1 (MQ=255)
tggtgttttgtttTTTCTGGGGCTAATTTGACTACTTTCTTTTTTTTGATTATGATTTTTTTTATTATCGTATTTAAATTTACATTAATATTTAAAATGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATaaaa < 1:3190011/146‑1 (MQ=255)
gCTGTTTTGTTATGTGTGTGGCGAATTTGACTACGTTCTTTTTTTTTATTAAGATTGTTTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAat < 2:1933851/149‑1 (MQ=255)
cTGTATTGTTATGTCTGTGGCTAAATTTACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCGTAATTAAAATTAAATGAATATTAAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAata < 2:3185521/149‑1 (MQ=255)
cTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAAATAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACTAAAAGAAAACCCAGCAAAGAAACAAAAATATCCAATAAAAAAata > 1:2044735/1‑149 (MQ=255)
tttATTGTTTTGTCTGTGGCTAAATTTACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATTATTTTATTATCTTAAGTAAAATTAAATTAATATTTAAAATGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAatat < 1:2028032/147‑1 (MQ=255)
tATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACAAGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTATCCAATCATAAAATAttt > 1:3928413/1‑149 (MQ=255)
tGTTTTGTCTGTGGCTAATTTGACTACATTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTTTTATCGTAAGTAAATTTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCg < 1:701861/149‑1 (MQ=255)
tGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAAAATTCAACAATAATAAAATATTTACg > 2:796183/1‑149 (MQ=255)
tGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAAAATTTAAAAATGAAAAAGACAAGAAAACGAAGCACAGAAACAACAATATACAAAAATAAAATATTTGCGTggtg > 1:3894480/1‑147 (MQ=255)
tCTGTGGATAATTTTACTACTTTGTTTTTTGTTATTATGATTTTTTTTATTTTCGTAATTAAATTTACTTGAATTTTTAAATTGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCa < 1:510021/149‑1 (MQ=255)
tgtgcataaaTTCACTCCCTTCTTTTTTTTCATTAAGAATTATTTTATTATCTTAATTAAAATTAAATTAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtt < 1:4005753/142‑1 (MQ=255)
tgtgTCTAAATTGACTAACTTCTTTTTTTTTATAAATTTTTTTTTTATTATCGATATTAAAATTAAATTAATTTTAAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtt < 1:378321/149‑1 (MQ=255)
tgtgGATAATTTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGATTTTTTTTATTATTTTAATAAAATTTAATTTAATTTTTAAAAATTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtt < 1:4005475/149‑1 (MQ=255)
gtgGCTAAATGGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATCGTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAttt < 1:276871/149‑1 (MQ=255)
tgGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtttt > 2:3598191/1‑149 (MQ=255)
tgGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtttt > 2:655351/1‑149 (MQ=255)
taatttGAATACATTCTTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTATGTAAAATTAAATGAATATTAAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTttatta < 1:1770884/145‑1 (MQ=255)
taaaTTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAATAATTATTTTTTTATCTTAATTAAAATTACATGAATTTTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTttatta < 2:2637332/148‑1 (MQ=255)
taaaTTGACTACATTCTTTTTTTTTATTAATAATTATTTTTTTATCGTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTttatta < 2:3386531/148‑1 (MQ=255)
gAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTttatta > 2:343221/1‑149 (MQ=255)
aaaTTTACTACATTCTTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATCTTAATTAAAATTACATTATTATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTtattat < 2:2902006/149‑1 (MQ=255)
aaTTGACTGCCTTCTTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATCTTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTattatt < 2:1496120/149‑1 (MQ=255)
aaTTGACTACCTCCGTTTTTTTGATAAAGATTGATTTTATTATCTTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTattatt < 2:2637999/149‑1 (MQ=255)
aaTTGACTACATACTTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAATTAAATGAATATTAAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTattatt < 2:551519/149‑1 (MQ=255)
aTTGAATACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTg < 2:2780999/149‑1 (MQ=255)
gACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAATTACATGTATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAat > 2:2775627/1‑149 (MQ=255)
aCTACCTTCTTTTTTTTGATTAACAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAata < 2:83037/149‑1 (MQ=255)
cTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAATTTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAatat < 2:1866235/149‑1 (MQ=255)
tACCTTCTTTTTTTTTATTAACAATTATTTTATTTTCTAAATAAAAATAACATTAATATTAAAAACGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAAtata < 1:3323058/149‑1 (MQ=255)
ccTTCGTGTTTTTGATTAAGAAAGAATTTAATATCCTAAGTAAAAATACAAGAATATTTAAAAAGGAAAACCACAAGAAAACCAAGCACACAAACAACAATCTCCAAAAAAAAAAAAATTACGTGGCGCAATTTATTATTTAATATaga > 2:1908296/1‑149 (MQ=255)
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taataaTGATTTTATTATCGTAATTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTaa < 2:595929/149‑1 (MQ=255)
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aGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTaaaa > 1:4041153/1‑149 (MQ=255)
|
GCAGGGGTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAATTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAACAA > CP009273/234846‑235142
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
