Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
234,994 |
G→T |
19.8% |
S77* (TCA→TAA) |
ykfM ← |
lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 234,994 | 0 | G | T | 19.8%
| 441.7
/ 19.8
| 226 | S77* (TCA→TAA) | ykfM | lethality reduction protein, putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (87/84); new base T (15/40); total (102/124) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.89e-03 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
CAGGGGTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAAC > CP009273/234847‑235140
|
gggTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGAtt > 1:143831/1‑148 (MQ=255)
ggTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATACGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAGGAATGAttt > 2:2986803/1‑148 (MQ=255)
tGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTtta < 2:2419768/148‑1 (MQ=255)
gATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTttat > 1:2712982/1‑148 (MQ=255)
aTAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTttatt < 1:2966351/148‑1 (MQ=255)
aTAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTttatt < 2:2235469/148‑1 (MQ=255)
aaTTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTtattat < 1:1862943/148‑1 (MQ=255)
gTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCgtaa < 1:605192/148‑1 (MQ=255)
aTTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCgtaagt > 1:1031621/1‑148 (MQ=255)
aTTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCgtaagt < 1:1413754/148‑1 (MQ=255)
tGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAgtaagtaa > 2:2781311/1‑148 (MQ=255)
aCATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTaaaa > 2:3380238/1‑148 (MQ=255)
aCATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTaaaa < 2:238564/148‑1 (MQ=255)
atatCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATTAAAA‑tt > 1:2911560/1‑148 (MQ=255)
tatCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAA‑TTa > 2:1616541/1‑148 (MQ=255)
atCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTAc > 2:1427763/1‑148 (MQ=255)
tgtgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGa > 2:2640858/1‑148 (MQ=255)
tgtgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGa > 2:2639626/1‑148 (MQ=255)
tgtgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGa < 1:286366/148‑1 (MQ=255)
tgtgACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGa < 2:3139069/148‑1 (MQ=255)
gACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAata < 1:2804216/148‑1 (MQ=255)
aaaaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTTAGAATGATTTTATTATAGTTAGTAAAA‑TTAAATTAATAttt > 1:1968190/1‑148 (MQ=255)
aaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTaa > 2:1464211/1‑148 (MQ=255)
aaGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTaa > 2:366627/1‑148 (MQ=255)
aGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGGTTAAGAATGATTTTATTATAGTTATTAAAA‑TTAAAATAAAATTTaaa > 1:2230518/1‑148 (MQ=255)
aGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTaaa < 2:3101087/148‑1 (MQ=255)
ggAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTaaaa < 1:794985/148‑1 (MQ=255)
gAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTaaaaa < 2:1562708/148‑1 (MQ=255)
gAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTAAATGAATATTTaaaaa > 2:2035264/1‑148 (MQ=255)
aGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATA‑TTAAAAAgg < 2:802997/148‑1 (MQ=255)
tATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGTTTAATAATTATTTTTTTATAGTAATTAAAA‑ATAAATGAATATTTAAAAATGaa > 1:75545/1‑148 (MQ=255)
tATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaa > 2:3481817/1‑148 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 1:1717223/148‑1 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 2:2297687/148‑1 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 1:2507719/148‑1 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 1:750415/148‑1 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 2:2763918/148‑1 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 1:1939226/148‑1 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 1:2068896/148‑1 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaa < 1:1788078/148‑1 (MQ=255)
aTTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAATTAAAA‑TTAAATGAATATTTTAAAATGaaa > 1:1300462/1‑148 (MQ=255)
ttAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGaaaa < 2:1108274/148‑1 (MQ=255)
aGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAATGAAAACGAc > 2:3499782/1‑148 (MQ=255)
gCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGa > 2:56462/1‑148 (MQ=255)
aCGATAGATATTATTAAAAATATATGAGTTATTTTTATTGTTTTGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGTTTAATAATTATTTTATTATCGTAATTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGa < 2:1352670/148‑1 (MQ=255)
aTAGCTATTATTAAAAATATAAGATTTAGCTTTATTGTTATTTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTATTTTTTTTTTTTAAGAATGATTTAATTATCGTAATTAAAT‑TTACATCAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGc < 2:1961605/148‑1 (MQ=255)
aTAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAA‑TTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACAAGAAAACGAAGc > 1:2333509/1‑148 (MQ=255)
aGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAA‑ATAAATGAATATTTAAAAATGAAAAAGACATGAAACCGAAacac > 1:708034/1‑148 (MQ=255)
ttttttattaAAAATATTATTTTTAGTTTTTTTTTTTTTTGTGTGGCAATTTTTACTACCTTTTTTTTTTTTTTTAATATTTTTTTTTTTATGTTATTTAAAT‑TTAATTTAATTTTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGcaca < 1:3295797/144‑1 (MQ=255)
attattAAAAATATAATAGTTCGGTTTTTTTTTATGTCTGTGGCTAATTTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATCGTAATTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGaa < 2:158044/148‑1 (MQ=255)
ttattaAAAATATATGTGTTAGATTTATTTTTATGTCTGTGGAGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAATTAAAA‑TTAAATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAAt < 2:3366245/148‑1 (MQ=255)
tAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTGTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATAGTAATTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGAAATGAAACCCAAGCACACAATc > 1:1849148/1‑148 (MQ=255)
attAAAAATATAAGAGTTAGCTTTTTTTTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACATTCGTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCa < 2:1404346/146‑1 (MQ=255)
ttAAAAATATAAGTTTTAGTTGTTTTTTTTTGTCTGGGGCGAAATTTACTACCTTCGTTTTTTTGATTAATAATGATTTTATTATCTTAATTAAAT‑TTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCaa < 2:61450/147‑1 (MQ=255)
ttAAAAATATAAGATTTCGCTGTTTTTTTTTGTGTGTGGCTAATTTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTATTATTTTTTTTATTATCTTAATTAAAA‑TTAATTGAATTTTAAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCaa < 1:1108969/147‑1 (MQ=255)
gTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAATTAAAA‑TTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCaa < 2:783525/148‑1 (MQ=255)
tAAAAATATATGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAAc < 2:2211779/148‑1 (MQ=255)
tAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATTATTTTATTATAGTAAGTAAAA‑ATAAATGAATATTTAAAAATGAAAAAGACATGAAACCCAAGCACAGAAACaaa > 2:1315924/1‑147 (MQ=255)
tAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCacc > 2:2924909/1‑146 (MQ=255)
tAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAAc > 2:749434/1‑148 (MQ=255)
aaaaaTATATTTTTTCGCTTTTTTTTTTTGTCTTGGGCTATATTTACTACCTTCTTTTTTTTTATTATCATTTATTTTATTAGCTTAATAAAAT‑TTACATTAATATTAAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACa < 2:301310/148‑1 (MQ=255)
aaaTATACGCGTTCGCTGTATTTTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTAAAAATGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACAtt < 1:875524/148‑1 (MQ=255)
atatAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGAAATGAAACCGAAGCACAGAAACAACAAtct > 1:1169338/1‑148 (MQ=255)
atatAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAA‑TTACAAGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAAACGAAGCACAGAATCAACATtct > 2:716003/1‑148 (MQ=255)
tataAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAA‑TTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGAAATGAAAACGAAGCACAGAAACAAAATtctc > 1:3457068/1‑148 (MQ=255)
taAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAATTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAATGAAAAAGACATTAAACCCAAGCACAGAAAAAACAtaaacca > 1:3437078/1‑142 (MQ=255)
ttGTATTGTTATGTATGTGGCTAATTTTAATACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCTAAATTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAat < 2:3457926/147‑1 (MQ=255)
cTGTATTTTTATGTCTGTGGCGAAATTTAATACCTTATTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATCTTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAat < 2:2869471/148‑1 (MQ=255)
cTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTTTTAATAATGATTTTATTATAGTTAGTAAAA‑TTAAAATAAAATTTAAAAAGTAAAACCACAAGAAAACCAACAACAAAAAAAACAATCAACAATCaaaaaaa > 1:2763442/1‑147 (MQ=255)
aTTGTTATGTCTGTGGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATAttt < 2:867200/148‑1 (MQ=255)
tttttATGTCTGTGGCTAAATTTACTACCTTGGTTTTTTTGATTAAGAATTATTTTTTTATCTTATGTAAAA‑TTAATTTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTc < 2:1306505/145‑1 (MQ=255)
ttATGTTTGTGGCAAAATTGAAAACTTTTTTTTTTTTTATTAACATTTTTTTTTTTATCTTAATTAAAA‑TTAAATTAATATTAAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGt < 1:2417713/148‑1 (MQ=255)
ttGTCTGTGGATAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAATATTTTTTTTTTTATATTAATTAAAA‑TTAAATTATTATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTgg < 1:988397/147‑1 (MQ=255)
cTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAA‑TTAAATGAATATTTAAAAAGGAAAAAGACATGAAACCGAACCACAAAAAAAACATTATCACATCATAAAATAATTACGTGGAGCa > 1:2255066/1‑148 (MQ=255)
gtgGCTAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCAtt < 2:1011639/148‑1 (MQ=255)
cGAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCTTAATTAAAA‑TTAAATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTttat < 2:1263220/148‑1 (MQ=255)
agAAATTGACTACCTTCTTTTTTTTTATTAAGAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTttat < 2:2024182/147‑1 (MQ=255)
aaTTGACTACCTTCGTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAAGAAAAAGACAAGAAAACGAAGCACAGAAACAACATTCTACAATCATAAAATATTTGCGTGGGCCATTTtattat > 2:2099883/1‑148 (MQ=255)
aaTTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTACGTGGAGCATTTtattat > 2:1168042/1‑148 (MQ=255)
ttGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAAAGATTTTATTATAGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTg > 2:1683659/1‑148 (MQ=255)
gACCACCTTAGTTTTTTTTATTAATAATGATTTTATTATCTTAAAAAAAA‑TTAAATTAAAATAAAAAAACCAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGaa < 1:306443/148‑1 (MQ=255)
aatACCTTGTTTTTTTTTATTAATAATTATTTTATTATATTAATAAAAA‑TTAAATCAATATTAAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAat < 1:471885/146‑1 (MQ=255)
cccTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGAAAAA‑TTACATTAATATTTAAAAAGCAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAAtata < 2:3246507/147‑1 (MQ=255)
aCCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATAGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGAAATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAAtata > 2:1775547/1‑148 (MQ=255)
tcttttttttGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAATTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGTAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAgg < 2:454333/145‑1 (MQ=255)
ctttttttttATTAATAATGATTTTATTATCTTAAGTAAAA‑TTAAATGAATATTTAAAAAGTAACACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGt < 1:1712757/146‑1 (MQ=255)
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CAGGGGTGATAATTAGTATTGACATATCCTGTGACAAAAGGAGCTATTAAAGGTGCTATTACGATAGCTATTAGTAAAAATATAAGAGTTAGCTGTATTGTTATGTCTGTGGCGAAATTGACTACCTTCGTTTTTTTGATTAAGAATGATTTTATTATCGTAAGTAAAA‑TTACATGAATATTTAAAAAGGAAAACGACATGAAACCGAAGCACAGAATCAACATTCTCCAATCATAAAATATTTCCGTGGAGCATTTTATTATTGAATATAGAGGTTTAACTCCGGTAAAAAAC > CP009273/234847‑235140
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
