Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F488 I0 R1
|
1275 |
300.1 |
10328444 |
91.0% |
9398884 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
1,116,964 |
A→G |
100% |
intergenic (‑21/+53) |
dinI ← / ← pyrC |
DNA damage‑inducible protein I/dihydro‑orotase |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 1,116,964 | 0 | A | G | 100.0%
| 1074.3
/ ‑6.7
| 286 | intergenic (‑21/+53) | dinI/pyrC | DNA damage‑inducible protein I/dihydro‑orotase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/2); major base G (143/136); minor base T (3/1); total (147/139) |
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 288 total aligned reads displayed.
GTACCGATACGTGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCTTTCAGCAACCTGTTGCTCT > CP009273/1116817‑1117110
|
gTACCGATACGTGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCt < 1:1508543/150‑1 (MQ=255)
aCCGATACGTGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTgg < 1:4072874/150‑1 (MQ=255)
ccGATACGTGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGt < 2:4257203/150‑1 (MQ=255)
cGATACGTGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGtt < 2:3256127/150‑1 (MQ=255)
gATACGTGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGtta < 1:1395764/150‑1 (MQ=255)
aCGTGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGttattt < 1:4647269/150‑1 (MQ=255)
aCGTGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGttattt < 1:2181176/150‑1 (MQ=255)
cGTGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGttattta > 1:1218977/1‑150 (MQ=255)
gTGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGttatttat > 1:206024/1‑150 (MQ=255)
cTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAgg < 2:4353948/150‑1 (MQ=255)
tATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAAt > 1:1127208/1‑150 (MQ=255)
aTCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCNCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATa > 1:2681362/1‑150 (MQ=255)
aGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAAcc > 1:6632/1‑150 (MQ=255)
aaCGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAAt > 2:4034255/1‑150 (MQ=255)
cGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGACAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATTCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGa < 2:3216709/150‑1 (MQ=255)
aTACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGacaa > 1:856956/1‑150 (MQ=255)
aCTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGacaaca < 2:2368520/150‑1 (MQ=255)
cTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAg < 1:995135/150‑1 (MQ=255)
tGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAgg < 2:2523430/150‑1 (MQ=255)
tGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCACCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAgg < 1:3713139/150‑1 (MQ=255)
gAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGACTATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCAAAAGACAACAGGa > 1:1953939/1‑150 (MQ=255)
gAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGa > 2:3086329/1‑150 (MQ=255)
gAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGa > 2:375233/1‑150 (MQ=255)
aaTACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGaa < 2:3351022/150‑1 (MQ=255)
aTACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAg < 1:3255577/150‑1 (MQ=255)
aCGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCt < 2:2568814/150‑1 (MQ=255)
cggcggGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTa > 1:4615266/1‑150 (MQ=255)
ggcggGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTAc < 1:2950148/150‑1 (MQ=255)
ggcggGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTAc > 2:3631725/1‑150 (MQ=255)
gcggGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACg > 2:3956320/1‑150 (MQ=255)
gggAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATCACCTAATGACAACAGGAAGCTACGAt > 2:2716845/1‑150 (MQ=255)
gggAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATATATACAGGTAAAAAAACCTAATTACAACAGGAAGCTACGAt > 2:2654082/1‑150 (MQ=255)
gAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGAttt < 2:4237525/150‑1 (MQ=255)
aaaGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATGACCTAATGACAACAGGAAGCTACGAtttt < 2:1853388/150‑1 (MQ=255)
aaaGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGACGCTACGAtttt > 2:140131/1‑150 (MQ=255)
ttCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTAtt > 1:4479922/1‑150 (MQ=255)
cGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGt > 1:4209852/1‑150 (MQ=255)
gccagccaGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACACCAGGAAGCTACGATTTTTATTGtt > 2:21884/1‑150 (MQ=255)
ccagccagGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGttt > 1:3313633/1‑150 (MQ=255)
ccagccagGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGttt > 1:4941908/1‑150 (MQ=255)
cagccagGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTa < 1:2160649/150‑1 (MQ=255)
ccagGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACg < 2:3986057/150‑1 (MQ=255)
agGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGa < 2:5143423/150‑1 (MQ=255)
agGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGa < 2:4897378/150‑1 (MQ=255)
agGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGa < 2:4504441/150‑1 (MQ=255)
gggCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGAc > 2:347382/1‑150 (MQ=255)
gTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGc < 2:1517196/150‑1 (MQ=255)
aaTAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCGTAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTa < 1:1017842/150‑1 (MQ=255)
aaTAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTa < 1:2724119/150‑1 (MQ=255)
tAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTAcc > 1:2349303/1‑150 (MQ=255)
tAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTAcc > 1:2790282/1‑150 (MQ=255)
ccccAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGtt < 1:3372101/150‑1 (MQ=255)
cAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTcc < 2:47017/150‑1 (MQ=255)
aGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTTAATATTCTGGTTATTTATACATGTAAAATAACCTAATTACAACAGGAAGCTACGATATTTAATTTTTAACGGACAAGCGTACCGTTTccc > 2:747477/1‑150 (MQ=255)
gCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTcccc < 1:537965/150‑1 (MQ=255)
cTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCg > 2:2161727/1‑150 (MQ=255)
tGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCgg > 1:2442782/1‑150 (MQ=255)
tGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAAAGGACCAGCGTACCGTTTCCCCgg > 2:2220016/1‑150 (MQ=255)
gCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCAAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCg > 1:5098328/1‑150 (MQ=255)
agaAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATg < 2:3800196/150‑1 (MQ=255)
aaGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGc < 2:2858645/150‑1 (MQ=255)
aGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCa < 2:2138000/150‑1 (MQ=255)
ttttCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCAcc > 1:3882119/1‑150 (MQ=255)
ttCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAg < 1:838086/150‑1 (MQ=255)
cGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCg > 1:4961427/1‑150 (MQ=255)
cGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCg > 1:1361567/1‑150 (MQ=255)
cTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCgtg > 2:1117300/1‑150 (MQ=255)
cTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCgtg < 2:4903604/150‑1 (MQ=255)
tGGTGACTTCAATTCTCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGtca < 1:2804928/150‑1 (MQ=255)
tGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGtca < 1:1616320/150‑1 (MQ=255)
gTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGtcatc > 2:2966378/1‑150 (MQ=255)
gACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTACAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCAtcag > 2:4105087/1‑150 (MQ=255)
gACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCAtcag < 2:486334/150‑1 (MQ=255)
ttCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCAtcagtca < 2:4485859/150‑1 (MQ=255)
tCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCAtcagtcag < 1:5035899/150‑1 (MQ=255)
tCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCAtcagtcag > 1:3413309/1‑150 (MQ=255)
cAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATcagtcagt < 2:5107247/150‑1 (MQ=255)
aaTTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTg < 2:3145920/150‑1 (MQ=255)
aaTTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTg > 2:902686/1‑150 (MQ=255)
aaTTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTg > 2:1214246/1‑150 (MQ=255)
tCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGa > 2:1930057/1‑150 (MQ=255)
tCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGa < 1:3972490/150‑1 (MQ=255)
tCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGa > 1:4398659/1‑150 (MQ=255)
cGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTACAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGAt > 2:566236/1‑150 (MQ=255)
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CAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTA < SRR19973063.2167417/150‑1 (MQ=60)
CAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTGTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCAGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTA > SRR19973063.813064/1‑150 (MQ=60)
CAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGG > SRR19973063.4493353/1‑150 (MQ=60)
CAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGG > SRR19973063.4493590/1‑150 (MQ=60)
AATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCGTAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTA < SRR19973063.1020910/150‑1 (MQ=60)
AATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTA < SRR19973063.2732912/150‑1 (MQ=60)
AATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTA < SRR19973063.2732907/150‑1 (MQ=60)
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TAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACC > SRR19973063.2799262/1‑150 (MQ=60)
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AGCTGGCAATGGAGAAGTTTTAGCTATGGTGACTTCAATTAGCATAATATCCCCCAGTTGAATATTCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAAACTAATTACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCC > SRR19973063.506957/1‑150 (MQ=60)
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GCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCC < SRR19973063.643164/150‑1 (MQ=60)
GCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCC < SRR19973063.539555/150‑1 (MQ=60)
CTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCG > SRR19973063.3622340/1‑150 (MQ=60)
CTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCG < SRR19973063.339441/150‑1 (MQ=60)
TGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGG > SRR19973063.2450586/1‑150 (MQ=60)
TGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGG > SRR19973063.5018093/1‑150 (MQ=60)
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GCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCAAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCG > SRR19973063.5114734/1‑150 (MQ=60)
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GCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGT > SRR19973063.4879390/1‑150 (MQ=60)
CTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTG > SRR19973063.3802497/1‑150 (MQ=60)
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TGGTGACTTCAATTCTCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCA < SRR19973063.2813945/150‑1 (MQ=60)
TGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCA < SRR19973063.1621264/150‑1 (MQ=60)
TGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCA > SRR19973063.2109094/1‑150 (MQ=60)
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ATGCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCTTTCAGCAACCTGTTGCTCTT > SRR19973063.1971174/1‑150 (MQ=60)
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GCTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCAAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCCGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCTTTCAGCAACCTGTTGCTCTTCA > SRR19973063.3482298/1‑150 (MQ=60)
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ACGTACCGATACGTGGCCTTCATTATCAGGAAACGCATACTGAATACGGCGGGAAAGTTCGCCAGCCAGGGCGTCAATAGCCCCAGCTGGCAATGGAGAAGTTTTCGCTATGGTGACTTCAATTCGCATAATAGCCCCCTGTTGAATATACTGGTTATTTATACAGGTAAAATAACCTAATGACAACAGGAAGCTACGATTTTTATTGTTTAACGGACCAGCGTACCGTTTCCCCGGCGAGGAATGGCACCAGCGTGTCATCAGTCAGTGCGATGCTTTCAGCAACCTGTTGCTCTTCA > CP009273/1116815‑1117113
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |