Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R3
|
782 |
676.6 |
23254289 |
97.6% |
22696186 |
138.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
939,446 |
(A)7→8 |
intergenic (‑289/‑255) |
trxB ← / → lrp |
thioredoxin‑disulfide reductase/leucine‑responsive transcriptional regulator Lrp |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 939,439 | 1 | . | A | 96.8%
| 3529.5
/ 82.9
| 951 | intergenic (‑282/‑262) | trxB/lrp | thioredoxin‑disulfide reductase/leucine‑responsive transcriptional regulator Lrp |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (12/18); new base A (250/668); total (263/688) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.46e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 1182 total aligned reads displayed.
CTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCA > NZ_CP025268/939300‑939573
|
ctGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaag < 1:10603704/140‑1 (MQ=255)
tGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaag‑‑a > 1:1083946/1‑140 (MQ=255)
tGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaag‑‑a > 2:8285704/1‑140 (MQ=255)
tGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaag‑‑a > 2:1508011/1‑140 (MQ=255)
tGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaag‑‑a > 1:1786710/1‑140 (MQ=255)
tGCGACTTATATTTCCCGCTTTATAAGACGTTTAAATGATGATTAAACGAGCCTGTTAATGAATCTCTGGCTTGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTGTGACAATCCACTGGTGTTTTGCGAAAGCATTCGAGgaag‑‑a > 2:2010749/1‑140 (MQ=255)
aCTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACTCCCCTGTTAATGAATATCGGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGGTTTGCGACAACATTCGAGGACG‑‑aa‑aa‑a > 2:2822144/1‑140 (MQ=255)
aCTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑aa‑a > 2:9284902/1‑140 (MQ=255)
aCTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑aa‑a < 2:7757120/140‑1 (MQ=255)
tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑aa‑aaaa < 1:6481780/140‑2 (MQ=255)
tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑aa‑aaaa > 1:8818470/1‑139 (MQ=255)
tAAATTTCCCGCTTTATAAGCAGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAATATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑aa‑aaaa < 2:7212428/140‑2 (MQ=255)
aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑aa‑aaaaca < 2:4029616/140‑4 (MQ=255)
aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑aa‑aaaaca < 2:9565697/140‑4 (MQ=255)
aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑aa‑aaaaca < 1:8266175/140‑4 (MQ=255)
aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑aa‑aaaaca < 2:10788653/140‑4 (MQ=255)
aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑aa‑aaaaca < 2:10571342/140‑4 (MQ=255)
aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑aa‑aaaaca < 1:11488601/140‑4 (MQ=255)
aTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑aa‑aaaacag > 1:4418319/1‑136 (MQ=255)
tttCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑aa‑aaaacagt < 2:10034918/140‑6 (MQ=255)
tttCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑aa‑aaaacagt < 1:5503858/140‑6 (MQ=255)
ttCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTa < 2:1802064/140‑1 (MQ=255)
ttCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTa > 1:4851637/1‑140 (MQ=255)
ttCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTa < 1:5128377/140‑1 (MQ=255)
ttCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTa > 1:7495231/1‑140 (MQ=255)
tCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTAt > 2:5461139/1‑140 (MQ=255)
ccGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTc > 1:11070528/1‑140 (MQ=255)
tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACTATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTtat < 2:4145981/140‑1 (MQ=255)
tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTtat < 2:5822209/140‑1 (MQ=255)
ttgataATCCGATTAAATGATGATGACACGCCCATGTTAATGAATATGTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTtat < 2:6306863/137‑1 (MQ=255)
ttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTtata < 1:593321/140‑1 (MQ=255)
tataAGCCTATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTatat < 1:2321051/140‑1 (MQ=255)
tataAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTatat < 1:3753793/140‑1 (MQ=255)
tataAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTatat < 2:693640/140‑1 (MQ=255)
ataAGGCGATTAAAGGATGAATAAACGCCCCGGTTAATGAAGATCTGGCATGTTGGACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCGGGTGTTGGGGGTATACATTCGCGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATGCTTATTTg > 2:5699365/1‑140 (MQ=255)
taAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATgc < 1:1605573/140‑1 (MQ=255)
aaGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATgcg < 1:4187115/140‑1 (MQ=255)
gATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATaa > 1:7723761/1‑140 (MQ=255)
gATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGGTAATGAAGATCTGGCATGTTGTACGAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTGTGCGAAAACATTCGAGGACGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTGTTATGCGCATaa > 2:6107143/1‑140 (MQ=255)
ttAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑aa‑aa < 1:844553/114‑1 (MQ=255)
tAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACca < 2:3766157/140‑1 (MQ=255)
aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 1:7167399/140‑1 (MQ=255)
aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 2:2212511/140‑1 (MQ=255)
aaTGATGAATAAACGCACCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAACATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 2:6709817/140‑1 (MQ=255)
tgatgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatgca < 2:11070527/140‑1 (MQ=255)
tgaATACACGCCCCTGTTAATGAATATCGGGCATGTTGTACTACAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGt < 1:2623505/140‑1 (MQ=255)
tgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGt < 2:4453280/140‑1 (MQ=255)
gaATAAACGCCCCTGTTTATGAATCTCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTGTTGATTTGACAATCCCCGGGTGGTTTGCGAAAACATTCGAGGACGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCCTGCATGTa > 2:1637344/1‑140 (MQ=255)
gaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTa > 2:5309376/1‑140 (MQ=255)
aaTAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑aa‑aa > 2:1199192/1‑104 (MQ=255)
tAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAAt < 1:8610033/140‑1 (MQ=255)
tAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAAt < 1:6099233/140‑1 (MQ=255)
aaCGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATAc < 1:10158071/140‑1 (MQ=255)
gCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCAt < 1:1889580/140‑1 (MQ=255)
gCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCAt < 1:5658651/140‑1 (MQ=255)
ccccTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATg < 2:1316494/140‑1 (MQ=255)
ccTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGtt > 1:2167144/1‑140 (MQ=255)
tGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAATTACCATGTTTa > 1:8182865/1‑140 (MQ=255)
tGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTa < 2:10175380/140‑1 (MQ=255)
tGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTa < 1:919148/140‑1 (MQ=255)
gTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTAc > 2:8028225/1‑140 (MQ=255)
aTGAATCTCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAACACAGTCGAGGAAG‑‑AACAA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCCTGCATGTAAAGACCATGTTTACCGTg < 2:11426383/140‑1 (MQ=255)
tGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTg < 2:876836/140‑1 (MQ=255)
tatCTGGCTTGTTGTACTCAAATTCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGt < 2:7428572/140‑1 (MQ=255)
tatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGt > 2:11194400/1‑140 (MQ=255)
tatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGt < 2:3518048/140‑1 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTg > 1:2744856/1‑140 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTtat > 2:4629695/1‑94 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTtat < 1:4629696/94‑1 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 1:4028553/109‑1 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa > 1:6739284/1‑140 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa > 2:5085694/1‑140 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCAGGTTTACCGTGCTAGTGa > 1:9486257/1‑140 (MQ=255)
tGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGaaa < 2:901293/140‑1 (MQ=255)
tGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGaaa < 1:1440440/140‑1 (MQ=255)
tGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGaaa < 1:7896256/140‑1 (MQ=255)
gCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATc < 1:10274973/140‑1 (MQ=255)
gCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATc < 2:245330/140‑1 (MQ=255)
aTGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAAt > 2:315282/1‑112 (MQ=255)
aTGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAAt < 1:315282/112‑1 (MQ=255)
gttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACg > 1:5308732/1‑140 (MQ=255)
ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGt < 2:9737255/140‑1 (MQ=255)
ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGt < 1:11268344/140‑1 (MQ=255)
ttgtACTAAAAATCGATGTAGTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGt < 2:8548886/140‑1 (MQ=255)
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tACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑AA‑AAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATg > 1:9345816/1‑140 (MQ=255)
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ATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAA > SRR14920200.9155159/1‑151 (MQ=60)
ATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAA < SRR14920200.3069886/151‑1 (MQ=60)
ATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAA > SRR14920200.10032800/1‑151 (MQ=60)
ATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAA > SRR14920200.1186116/1‑151 (MQ=60)
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TGGCATGTTGTCCTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGG < SRR14920200.11486067/151‑1 (MQ=60)
TGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGG < SRR14920200.5477939/151‑1 (MQ=60)
TGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGG < SRR14920200.6047742/151‑1 (MQ=60)
TGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGG < SRR14920200.7949236/151‑1 (MQ=60)
TGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGG < SRR14920200.3644142/151‑1 (MQ=60)
TGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGG < SRR14920200.2829524/151‑1 (MQ=60)
TGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGG < SRR14920200.2413418/151‑1 (MQ=60)
GGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGG < SRR14920200.10445904/151‑1 (MQ=60)
GCATTTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCG < SRR14920200.1689135/151‑1 (MQ=60)
GCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCG < SRR14920200.6693085/151‑1 (MQ=60)
ATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGGTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTG > SRR14920200.10256647/1‑151 (MQ=60)
GTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGA > SRR14920200.9323463/1‑151 (MQ=60)
GTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGA > SRR14920200.11251500/1‑151 (MQ=60)
GTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGA > SRR14920200.6137758/1‑151 (MQ=60)
GTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGA > SRR14920200.6266141/1‑151 (MQ=60)
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TGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACT < SRR14920200.705943/151‑1 (MQ=60)
TGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACA < SRR14920200.8946956/151‑1 (MQ=60)
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TAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGC < SRR14920200.3297909/151‑1 (MQ=60)
AAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCAT > SRR14920200.5625905/1‑151 (MQ=60)
AATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATT < SRR14920200.4420969/151‑1 (MQ=60)
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GCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATctgtctcttatacacatctccgagcccacga > SRR14920200.4096259/1‑120 (MQ=60)
TTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGC < SRR14920200.8502163/151‑1 (MQ=60)
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GACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTG > SRR14920200.8368558/1‑151 (MQ=60)
ATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCctgtctcttatacacatctccgagcccacgagacaggcagaaatctc > SRR14920200.7619464/1‑104 (MQ=60)
CCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCAAGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTAAGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAG > SRR14920200.3536820/1‑151 (MQ=60)
CTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGANGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGC > SRR14920200.10081788/1‑151 (MQ=60)
TTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGT < SRR14920200.9495379/151‑1 (MQ=60)
AACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACC < SRR14920200.11513371/151‑1 (MQ=60)
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ACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCG > SRR14920200.8323712/1‑151 (MQ=60)
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CATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCtgtctcttatacacatctccgagcccacgagacaggcagaaatctcgtatgccgtcttc > SRR14920200.3778133/1‑92 (MQ=60)
CATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCGT < SRR14920200.10214979/151‑1 (MQ=60)
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G‑‑AAACAAAA‑CAGTATTCTTATAGGCGCATAACCATGCAAGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCGTAGACCCAGGCA < SRR14920200.9079869/151‑1 (MQ=60)
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AAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCGTAGACCCAGGCATTGCGC < SRR14920200.4004368/151‑1 (MQ=60)
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ACCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCGTAGACCCAGGCATTGCGCGC > NZ_CP025268/939296‑939596
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |