Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R2
|
781 |
700.4 |
23289492 |
98.5% |
22940149 |
138.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
939,446 |
(A)7→8 |
intergenic (‑289/‑255) |
trxB ← / → lrp |
thioredoxin‑disulfide reductase/leucine‑responsive transcriptional regulator Lrp |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 939,439 | 1 | . | A | 96.0%
| 3591.2
/ 112.4
| 966 | intergenic (‑282/‑262) | trxB/lrp | thioredoxin‑disulfide reductase/leucine‑responsive transcriptional regulator Lrp |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (11/28); new base A (265/661); total (276/690) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 1197 total aligned reads displayed.
CTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑AA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCT > NZ_CP025268/939300‑939571
|
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tGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaa‑g‑a > 1:3016297/1‑140 (MQ=255)
tGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaa‑g‑a > 2:3372913/1‑140 (MQ=255)
tGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaa‑g‑a > 1:4492817/1‑140 (MQ=255)
tGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaa‑g‑a > 1:6926926/1‑140 (MQ=255)
tGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaa‑g > 1:2060135/1‑139 (MQ=255)
aattAATTTTCCCTCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa < 1:1477346/138‑1 (MQ=255)
tAATTTTCCCGCTGTCTAAGCCGATTAAATGATGAATAACGGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCCTGTTGTACTAAAAATCGATGTATTGCTTTTACAATCCCATGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑T‑aa‑a‑aa‑aat < 2:1760147/140‑2 (MQ=255)
tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaa < 2:139463/140‑2 (MQ=255)
tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaa > 2:3961990/1‑139 (MQ=255)
tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaa > 2:4584925/1‑139 (MQ=255)
tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaa < 2:5006784/140‑2 (MQ=255)
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tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaa < 2:6264685/140‑2 (MQ=255)
tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaa < 1:7087454/140‑2 (MQ=255)
tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaa < 2:3140199/140‑2 (MQ=255)
tAAATTGCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATATGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTTCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaa < 2:6765296/140‑2 (MQ=255)
attttACCTCTTTATAATCCGATTAATTGATGAATAAACGCCCCTTTTAATGAATATCTGGCATGCTTTACTAATAATCGATGTTTTTCTGTGACAATCCCCTGGTGTTTTTCGAAAACATTCGATGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaaca < 2:84750/138‑4 (MQ=255)
aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaaca < 1:3451506/140‑4 (MQ=255)
aaTTTCCCCGTTTTTATGCAGATTAACTGATCAATAAACTCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCTATGTTTTTCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTTCTAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaaca < 1:7356993/140‑4 (MQ=255)
aTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaacag > 1:4835583/1‑136 (MQ=255)
aTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaaca < 1:9693569/139‑4 (MQ=255)
tttCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaacagt < 1:10706942/140‑6 (MQ=255)
tttCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGACATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaacagt < 1:1843475/140‑6 (MQ=255)
cccGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTAtt < 2:10955715/140‑1 (MQ=255)
cccGATTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTAtt < 2:1457619/140‑1 (MQ=255)
ccGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaa < 1:8344045/132‑2 (MQ=255)
tttATAATACGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCACTGGTGTTTTTCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTtat < 2:8096251/140‑1 (MQ=255)
tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTtat < 2:6413823/140‑1 (MQ=255)
tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTtat < 1:5933187/140‑1 (MQ=255)
tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTtat < 1:4672139/140‑1 (MQ=255)
tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTtat < 1:2814938/140‑1 (MQ=255)
tataAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTatat < 2:2091669/140‑1 (MQ=255)
tataAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTatat < 1:6693228/140‑1 (MQ=255)
tataAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTatat < 2:6045877/140‑1 (MQ=255)
aaGCCGATTAAATGATGACTAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTATTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATgcg < 2:8971859/140‑1 (MQ=255)
aaGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATgcg < 1:781493/140‑1 (MQ=255)
aaGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATgcg < 1:4021431/140‑1 (MQ=255)
aGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATgcgc < 2:3724657/140‑1 (MQ=255)
gCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCa < 2:1977459/140‑1 (MQ=255)
gCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCa < 1:1042725/140‑1 (MQ=255)
ccGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCAt < 2:7423584/140‑1 (MQ=255)
ccGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCAt < 2:11447852/140‑1 (MQ=255)
ttAAATGATTAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCa < 1:5497459/135‑1 (MQ=255)
ttAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaa > 1:570084/1‑115 (MQ=255)
aaaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACcat > 1:8130062/1‑140 (MQ=255)
catgatgAATAAACGCCCCTGTTAATGAATCTCTGGCAAGTTGTACTAAAAATCGATGTATTGCTTAGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGATGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTAGACTTATATGCGCATAACcatg < 2:486613/139‑1 (MQ=255)
aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 2:1178742/140‑1 (MQ=255)
atgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatgcatg < 1:9286149/140‑1 (MQ=255)
aaTAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAACAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑AA‑A‑AATAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTaa < 2:10496935/140‑1 (MQ=255)
tAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAAt < 2:5623853/140‑1 (MQ=255)
aaCGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATAc < 1:2386724/140‑1 (MQ=255)
aaCGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATAc < 2:440378/140‑1 (MQ=255)
aaCGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGATTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATAc < 1:6433578/140‑1 (MQ=255)
aCGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATAcc > 1:9048882/1‑140 (MQ=255)
aCGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATAcc < 2:10807105/140‑1 (MQ=255)
tGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCAt < 1:5060239/135‑1 (MQ=255)
tGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTa < 1:5819497/140‑1 (MQ=255)
tGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTGTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGCA‑G‑AA‑ATAA‑TACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGtttc > 2:9615284/1‑139 (MQ=255)
tGTTAATGAATATCTGGCATGGTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGtata > 2:7233898/1‑140 (MQ=255)
tAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCg < 2:7703811/140‑1 (MQ=255)
tatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 1:11122732/111‑1 (MQ=255)
tatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGt < 2:5125752/140‑1 (MQ=255)
tatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGt < 1:5330269/140‑1 (MQ=255)
tatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGt < 2:2391350/140‑1 (MQ=255)
tatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGt > 2:4179079/1‑140 (MQ=255)
tatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGt < 1:11533732/140‑1 (MQ=255)
atCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTg > 1:11358988/1‑140 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCa < 2:11204268/101‑1 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTg < 1:3676724/133‑1 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa > 1:2237510/1‑140 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa > 1:3225246/1‑140 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa < 1:7963447/140‑1 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa > 1:10846948/1‑140 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑aa‑a‑aa‑aaa < 2:2942922/82‑2 (MQ=255)
tGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGaaa < 1:1000225/140‑1 (MQ=255)
tGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGaaa < 2:10291412/140‑1 (MQ=255)
ggCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGt < 2:701279/111‑1 (MQ=255)
ggCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAAt < 2:9435313/140‑1 (MQ=255)
ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGt < 1:8888432/140‑1 (MQ=255)
ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGt < 2:2262451/140‑1 (MQ=255)
ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GAAA‑A‑AA‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGt < 1:8501670/140‑1 (MQ=255)
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TCTGGCATGTTGTACTACAAATCGATGTTGTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTCTTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTAT < SRR14920161.6684476/151‑1 (MQ=60)
TCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTAT < SRR14920161.420442/151‑1 (MQ=60)
TCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTAT < SRR14920161.8017185/151‑1 (MQ=60)
TCTGGCATGTTGTACAAAACATCGATGATTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTAC < SRR14920161.3469937/151‑1 (MQ=60)
TGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGG < SRR14920161.1006952/151‑1 (MQ=60)
TGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGG < SRR14920161.5448498/151‑1 (MQ=60)
GCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCG < SRR14920161.3292868/151‑1 (MQ=60)
ATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTG > SRR14920161.4033831/1‑151 (MQ=60)
GTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGA > SRR14920161.6445507/1‑151 (MQ=60)
GTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGA > SRR14920161.9551940/1‑151 (MQ=60)
GTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGAGTGGA > SRR14920161.8158608/1‑151 (MQ=60)
GTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑‑A‑A‑AAAAAA > SRR14920161.5668997/1‑74 (MQ=60)
TTGTACTAAACATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGAC < SRR14920161.9180331/151‑1 (MQ=60)
TTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGAC < SRR14920161.11559445/151‑1 (MQ=60)
TTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGAC < SRR14920161.2020009/151‑1 (MQ=60)
TTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGAC < SRR14920161.2394867/151‑1 (MQ=60)
TTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGAC < SRR14920161.902052/151‑1 (MQ=60)
TTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGAC < SRR14920161.8558966/151‑1 (MQ=60)
TTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGAC < SRR14920161.5958793/151‑1 (MQ=60)
TTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGAC < SRR14920161.8948194/151‑1 (MQ=60)
TTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTNGACAATCNCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTANCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGAC < SRR14920161.6143459/151‑1 (MQ=60)
ACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGAC < SRR14920161.9887791/151‑1 (MQ=60)
CTAAAAATCGATGTTTTGCATTGACAATCCCCTGGTGATTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACG < SRR14920161.7022922/151‑1 (MQ=60)
TAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGC < SRR14920161.10223396/151‑1 (MQ=60)
TAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGC < SRR14920161.8679972/151‑1 (MQ=60)
GATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTG < SRR14920161.5342233/151‑1 (MQ=60)
ATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACctgtctcttatacac > SRR14920161.2166176/1‑136 (MQ=60)
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TTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGC < SRR14920161.1403777/151‑1 (MQ=60)
TGGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑‑ACA‑AAAAACAGGAGTCTTATATGCGCATAACCAGGCATGTCAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGC < SRR14920161.9386978/151‑1 (MQ=60)
GACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTG > SRR14920161.6735391/1‑151 (MQ=60)
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ATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGTAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCAC < SRR14920161.7158406/151‑1 (MQ=60)
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ATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCAC < SRR14920161.2918897/151‑1 (MQ=60)
CCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAA > SRR14920161.8859024/1‑151 (MQ=60)
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CCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑GA‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAG > SRR14920161.2140989/1‑151 (MQ=60)
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agaA‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCGTAGACCCAGGC < SRR14920161.1527324/148‑1 (MQ=60)
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A‑‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTAGATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCGTAGACCCAGGCAT < SRR14920161.3393475/151‑1 (MQ=60)
|
CCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAA‑G‑‑A‑A‑AAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCGTAGACCCAGGCATTGCGCGC > NZ_CP025268/939297‑939596
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
