Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F15 I1 R4
|
781 |
701.7 |
22683696 |
98.1% |
22252705 |
139.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
939,446 |
(A)7→8 |
intergenic (‑289/‑255) |
trxB ← / → lrp |
thioredoxin‑disulfide reductase/leucine‑responsive transcriptional regulator Lrp |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 939,439 | 1 | . | A | 94.9%
| 2315.9
/ 95.9
| 635 | intergenic (‑282/‑262) | trxB/lrp | thioredoxin‑disulfide reductase/leucine‑responsive transcriptional regulator Lrp |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (11/21); new base A (196/403); total (208/427) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.48e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 778 total aligned reads displayed.
CTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑A‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTC > NZ_CP025268/939300‑939572
|
ctGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaag > 2:874501/1‑140 (MQ=255)
ctGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaag > 1:9234020/1‑140 (MQ=255)
tGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaag‑a > 1:4890892/1‑140 (MQ=255)
tGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaag‑a > 2:11138197/1‑140 (MQ=255)
cTACTTAAATTTCCCGCTTTTTACGCGGATTATATGATGAATAAACGCCCCTGTTTATGAATTTCTGGCATGTTGTAATATAAATAGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGAGTTTTGGGTAAACATTGGTGgaag‑aga > 2:6263509/1‑138 (MQ=255)
cTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑a‑aa > 1:10217094/1‑140 (MQ=255)
aCTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑a‑aaaa < 2:4718488/140‑1 (MQ=255)
aCTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑a‑aaaa < 1:7873605/140‑1 (MQ=255)
attAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑a‑aaaaa < 2:6122384/139‑1 (MQ=255)
tAAATTTCCCGCTTTATAATCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGTCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTATGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑a‑aaaaaaa > 1:7653421/1‑139 (MQ=255)
tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑a‑aaaaaaa > 2:10971290/1‑139 (MQ=255)
tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑a‑aaaaaaa < 1:5425353/140‑2 (MQ=255)
tAAATTTCCCGCTNTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTNCGAAAACATTCGAGGAAG‑a‑aaaaaaa > 1:5931466/1‑139 (MQ=255)
aagttCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑a‑aaaaaaaca < 1:8871805/137‑4 (MQ=255)
aaTTTCCCGCTTTATCAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATAGCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGCTGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑a‑aaaaaaaca < 2:8930241/140‑4 (MQ=255)
aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑a‑aaaaaaaca < 1:7433523/140‑4 (MQ=255)
aTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑a‑aaaaaaacag > 2:3414712/1‑136 (MQ=255)
tttCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑a‑aaaaaaacagt < 2:6708288/140‑6 (MQ=255)
tgtCCCGCTTTATACGCCGATTAAAGGAAGAAAAAACGCCCCTGTTAAAGAATATCGGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑a‑aaaaaaacagt < 1:9783144/138‑6 (MQ=255)
tgtCCCGCTTTATAAGACGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGATAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTATTGCTTTGACAATCCCCTGGAGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑a‑aaaaaaacagt < 2:4427621/138‑6 (MQ=255)
cccGCTTTATAAGCCGATTAAATGATTAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTAtt < 1:5726214/140‑1 (MQ=255)
ccGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTc > 1:1127209/1‑140 (MQ=255)
gCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAATTCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCtt < 1:10516973/140‑1 (MQ=255)
tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAACATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTtat < 1:5528732/140‑1 (MQ=255)
tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTtat < 1:4616575/140‑1 (MQ=255)
tataAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTatat < 1:3089475/140‑1 (MQ=255)
tataAGCCGATTAAATGATGAATAAAAGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTatat < 2:10765678/140‑1 (MQ=255)
aaGCCGATTAAATGATGAATAAACGACCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATgcg < 2:9015990/140‑1 (MQ=255)
gCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCa < 1:6812924/140‑1 (MQ=255)
ccGATTAAATGATGTATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATACCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCag < 2:5739623/140‑2 (MQ=255)
ccGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCAt < 2:5285557/140‑1 (MQ=255)
gATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATaa > 1:9380863/1‑140 (MQ=255)
tAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACca < 1:8560561/140‑1 (MQ=255)
attgatgaAAACACGCCCCTGTTAATGAATATCGGTCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTGTGATTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGTAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcagg < 1:11095715/138‑3 (MQ=255)
aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTTAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 1:874501/140‑1 (MQ=255)
aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 2:6879497/140‑1 (MQ=255)
aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 2:8164508/140‑1 (MQ=255)
aaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 2:5073993/140‑1 (MQ=255)
tgatgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatgca < 1:10820632/140‑1 (MQ=255)
gatgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatgcat > 1:1724380/1‑140 (MQ=255)
atgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatgcatg > 2:420662/1‑140 (MQ=255)
tgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGt < 2:2903052/140‑1 (MQ=255)
tgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGt < 2:10352675/140‑1 (MQ=255)
gaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTatat < 2:7565716/121‑1 (MQ=255)
aaTAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTaa < 2:10534473/140‑1 (MQ=255)
tAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAAt < 1:10908676/140‑1 (MQ=255)
aaCGCCCCTCTTAATGAAGATCTGGCATGATGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATGCTTATATGAGCATAACCATGCATGTAAAGAc < 2:10671706/140‑1 (MQ=255)
gCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCAt > 1:6200790/1‑140 (MQ=255)
gCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGATTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCAt < 2:7300092/140‑1 (MQ=255)
ccTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTtat < 1:2161092/108‑1 (MQ=255)
tGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTa > 2:3911396/1‑140 (MQ=255)
tGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTa > 2:1327910/1‑140 (MQ=255)
tGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTa > 2:2234295/1‑140 (MQ=255)
tGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTa < 1:7274344/140‑1 (MQ=255)
ttAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTAcc > 2:9469894/1‑140 (MQ=255)
tatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGt < 2:19187/140‑1 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTCTTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa > 2:4104933/1‑140 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa > 1:10006966/1‑140 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa > 2:4927709/1‑140 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa > 1:3286307/1‑140 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa > 1:4441056/1‑140 (MQ=255)
tGGCAAGTTGTACTACAAATCGATGTTTTGCATTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGaaa < 1:6376565/140‑1 (MQ=255)
gCATGTTGTACTAACAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATc < 1:4200157/140‑1 (MQ=255)
gCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATc < 1:2762874/140‑1 (MQ=255)
gCATGTTGTACT‑AAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCt < 2:3743586/140‑1 (MQ=255)
aTGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTa > 1:7120420/1‑140 (MQ=255)
ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGt < 1:608467/140‑1 (MQ=255)
ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATACCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCGACGt < 2:9700430/140‑1 (MQ=255)
ttgtACTAAAAATCGATGGTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGt < 1:5224941/140‑1 (MQ=255)
ttctACTAAAAATCGCTGTTGAGCTTAGACAATCCCCTGGTCTGTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGt < 2:10919413/137‑1 (MQ=255)
tACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATg > 2:7778733/1‑140 (MQ=255)
tACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATg > 1:2399736/1‑140 (MQ=255)
aCTAAAAATCGCTGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑ACAAAAAACACTCTTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTAggg < 2:2121191/140‑1 (MQ=255)
cTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGc > 1:8977963/1‑140 (MQ=255)
aaaaaTCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGt < 1:1390247/140‑1 (MQ=255)
tCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACa < 1:9919819/140‑1 (MQ=255)
cGATGTTTTGCTTTGACCATCCCCTGGTGTTTTGCGAACACATTCGAGGACGAA‑AAAAAACAGAAGTCTGATAGGCGCATAACCATGCATGGAAATACCAGGTTTACCGAGCTCGTGAACTCTACGTATGGCGTGGACAg > 2:6490924/1‑140 (MQ=255)
cGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGTATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAg > 2:10162183/1‑140 (MQ=255)
cGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGaaa > 2:11313128/1‑120 (MQ=255)
ttttGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGcc > 2:1726765/1‑140 (MQ=255)
ttGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCAt > 2:5918679/1‑140 (MQ=255)
gCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTc < 1:9657093/140‑1 (MQ=255)
ttGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTg < 2:3229574/140‑1 (MQ=255)
ttGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTg < 1:8203170/140‑1 (MQ=255)
aCAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAA‑AAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATg > 1:1247078/1‑140 (MQ=255)
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TAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑A‑A‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGC < SRR14920199.3200043/151‑1 (MQ=60)
TAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑A‑A‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGC < SRR14920199.2836895/151‑1 (MQ=60)
AAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑A‑A‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCAGGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCC < SRR14920199.5079835/151‑1 (MQ=60)
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TCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑A‑A‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCG < SRR14920199.9964883/151‑1 (MQ=60)
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CCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑AA‑A‑A‑A‑AACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCGTAGACCCAGGCATTGCGCGC > NZ_CP025268/939297‑939596
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
