Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F50 I1 R1
|
782 |
316.7 |
10427156 |
97.0% |
10114341 |
138.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP025268 |
939,446 |
(A)7→8 |
intergenic (‑289/‑255) |
trxB ← / → lrp |
thioredoxin‑disulfide reductase/leucine‑responsive transcriptional regulator Lrp |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP025268 | 939,439 | 1 | . | A | 95.6%
| 934.1
/ 27.8
| 251 | intergenic (‑282/‑262) | trxB/lrp | thioredoxin‑disulfide reductase/leucine‑responsive transcriptional regulator Lrp |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (6/5); new base A (84/156); total (90/161) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.09e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 312 total aligned reads displayed.
CTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCT > NZ_CP025268/939300‑939571
|
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tGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTAGCATGTTGGACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaag‑‑a > 2:4593491/1‑140 (MQ=255)
cTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑a‑aaa < 1:484615/140‑1 (MQ=255)
ttAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑a‑aaaa < 1:2050795/140‑1 (MQ=255)
tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑a‑aaaaa < 2:5129657/140‑2 (MQ=255)
tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑a‑aaaaa < 2:4185142/140‑2 (MQ=255)
tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑a‑aaaaa > 2:3998940/1‑139 (MQ=255)
tAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑a‑aaaaa < 2:1592240/140‑2 (MQ=255)
aaaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑a‑aaaaac < 1:463836/140‑3 (MQ=255)
aaaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑a‑aaaaaa < 2:3282529/140‑3 (MQ=255)
aacttCCCGCTTTGTAAGCCGATTAAATTATGCGTGAACGTCCCTGTGAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGAGGTTTTGCTTTGAACATCCCCGGGTGCTTTGCGAAAACATTCGTGGAAG‑‑aa‑a‑aaaaaca < 2:1416348/137‑4 (MQ=255)
aaTTTCCCTCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑a‑aaaaaca < 1:935571/140‑4 (MQ=255)
aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑a‑aaaaaca < 2:843044/140‑4 (MQ=255)
aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑a‑aaaaaca < 1:754480/140‑4 (MQ=255)
aaTTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑a‑aaaaaca < 1:4344888/140‑4 (MQ=255)
tttCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑a‑aaaaacagt < 1:3594027/140‑6 (MQ=255)
tttCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑a‑aaaaacagt < 1:1237297/140‑6 (MQ=255)
tttCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑aa‑a‑aaaaacagt < 1:3535304/140‑6 (MQ=255)
ttCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTa < 1:710182/140‑1 (MQ=255)
ccGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTc > 2:2412014/1‑140 (MQ=255)
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tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTtat < 2:1734456/140‑1 (MQ=255)
tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTtat < 1:4505200/140‑1 (MQ=255)
tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTtat < 2:2963175/140‑1 (MQ=255)
tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTtat < 2:4802940/140‑1 (MQ=255)
tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTtat < 2:659112/140‑1 (MQ=255)
tataAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTatat < 1:4593925/140‑1 (MQ=255)
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aGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATgcgc < 2:3240662/140‑1 (MQ=255)
gATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATaa > 1:402262/1‑140 (MQ=255)
gATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATaa > 2:1800130/1‑140 (MQ=255)
gATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATaa > 1:817562/1‑140 (MQ=255)
aTTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTGTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAAc < 2:1393218/140‑1 (MQ=255)
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tAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTTCTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAAt < 2:2686858/140‑1 (MQ=255)
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aaCGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATAc < 1:4109407/140‑1 (MQ=255)
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tGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTa > 2:278880/1‑140 (MQ=255)
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ttAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTtat < 1:3758761/104‑1 (MQ=255)
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tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa > 1:607314/1‑140 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa > 2:1808892/1‑140 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa > 1:246705/1‑140 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTACATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa > 2:3189409/1‑140 (MQ=255)
tCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCGTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACGGTGCTAGTGa > 2:437959/1‑140 (MQ=255)
tCTGGCAGGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGa > 2:1327059/1‑140 (MQ=255)
tGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGaaa < 2:545646/140‑1 (MQ=255)
tGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGaaa < 1:3202331/140‑1 (MQ=255)
tGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGaaa < 2:4444510/140‑1 (MQ=255)
tGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGaaa < 1:1515381/140‑1 (MQ=255)
tGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGaaa < 2:803868/140‑1 (MQ=255)
gCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATGCCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATc < 1:2541771/140‑1 (MQ=255)
gCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATc > 2:4323815/1‑140 (MQ=255)
ggtgtACTCAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑AA‑ACAAAACAGTATTCTTATATGCACATAACCATGCATATAAATACCATGTTTACCGTACTAGTGAAATCTACg > 2:3345122/3‑140 (MQ=255)
ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGt < 1:3037700/140‑1 (MQ=255)
ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGt < 2:1669478/140‑1 (MQ=255)
tgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTa > 1:2090120/1‑140 (MQ=255)
tgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTa > 2:2175192/1‑140 (MQ=255)
cTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGc > 1:2594051/1‑140 (MQ=255)
cTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGc < 2:2323239/140‑1 (MQ=255)
aaaaTCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTg > 1:2704268/1‑140 (MQ=255)
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cGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAg > 1:1692893/1‑140 (MQ=255)
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tGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACg < 2:1224171/140‑1 (MQ=255)
ttttGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AA‑A‑AAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGcc < 2:578047/140‑1 (MQ=255)
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TAAATAATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAAT < SRR14920191.884477/151‑1 (MQ=60)
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AATGATGAATAAACGCACCTGTTAATGAATATCTTGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATGCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATAC < SRR14920191.5078421/151‑1 (MQ=60)
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TTTGCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTC < SRR14920191.678149/151‑1 (MQ=60)
GCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTC < SRR14920191.308397/151‑1 (MQ=60)
GCGAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTC < SRR14920191.653587/151‑1 (MQ=60)
GAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTC < SRR14920191.3999137/151‑1 (MQ=60)
GAAAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTC < SRR14920191.3999200/151‑1 (MQ=60)
AAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCAC < SRR14920191.226069/151‑1 (MQ=60)
AAACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCAC < SRR14920191.226132/151‑1 (MQ=60)
AACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACC < SRR14920191.4198975/151‑1 (MQ=60)
AACATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACC < SRR14920191.4199269/151‑1 (MQ=60)
ATTCGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCGTA > SRR14920191.1059872/1‑151 (MQ=60)
CGAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTACATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCGTAGAC < SRR14920191.3198540/151‑1 (MQ=60)
GAGGAAGA‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTGTAGGCGAATAACAATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTAGGGCGTGGACAGCCGCCATTCGTGATGTCGGTTGCTGCCACAGGGCAACGGTCTTCTCACCGTAGTCC < SRR14920191.347520/151‑1 (MQ=60)
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agaAAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCGTAGACCCAGGC < SRR14920191.5135715/148‑1 (MQ=60)
agaAAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCGTAGACCCAGGC < SRR14920191.5135703/148‑1 (MQ=60)
gaAAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCGTAGACCCAGGCA > SRR14920191.2174187/3‑151 (MQ=60)
aatA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCGTAGACCCAGGCAT < SRR14920191.4336397/148‑1 (MQ=60)
AAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCGTAGACCCAGGCATTGCGC < SRR14920191.2742295/151‑1 (MQ=60)
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CCTCTGCTACTTAAATTTCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑‑AAA‑AAAA‑CAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGTGAAATCTACGTATGGCGTGGACAGACGCCATTCGTGATGTCGATAGCTGCCACAAGGCAACGGTCTTCTCACCGTAGACCCAGGCATTGCGC > NZ_CP025268/939297‑939594
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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
