Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A18 F4 I5 R1
|
74 |
1140.6 |
72036873 |
99.2% |
71460578 |
99.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
AE015451_phaM1 |
6,011,161 |
T→C |
intergenic (+90/+20) |
xpt CDS (Xanthine phosphoribosyltransferase) → / ← PP_5266 CDS (putative acetyl‑CoA hydrolase family protein) |
–/– |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | AE015451_phaM1 | 6,011,161 | 0 | T | C | 98.9%
| 1706.9
/ ‑4.6
| 454 | intergenic (+90/+20) | xpt CDS (Xanthine phosphoribosyltransferase)/PP_5266 CDS (putative acetyl‑CoA hydrolase family protein) | –/– |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (341/108); minor base A (3/2); total (344/110) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.99e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 454 total aligned reads displayed.
GGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCTGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCAT > AE015451_phaM1/6011045‑6011302
|
aagaaaCGCGACACCTACTTCGCGGACACGCCCGCTCCCACGGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGGGTGA‑GCGGGCGTGCCCGCGa < 6:15827983/96‑1 (MQ=21)
aaTAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCTGGCGTGCCCGCGa < 5:12605615/99‑1 (MQ=255)
aaCGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGAACAGGTCTCGAACGTGGTGCCGTACTTGTGGGG‑GCTGGCGTGCCCGCGAATgg < 5:30010499/99‑1 (MQ=21)
gtgggCATGCACCCTCCCACGGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGTTGTGCCGTACTTGGGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCt < 5:29153395/97‑1 (MQ=21)
cccACTCCCTCTCCCAGAGGTGAAGCACAGGTCTCGAACGTTGTGCCGCA‑TTGGGGGAGGCGGCCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGt < 5:27147691/97‑1 (MQ=255)
gCACGCCCGCTCCCACAGGTGCCGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GAGGGCATGCCCACGAATGGCCACAACCCCTTTATCTGGtt > 6:4317212/1‑99 (MQ=25)
cACGCCCTCTCCCACGGGTACAGCACAGGTCCCGAACTTTGTACCTTCCCGGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCACGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGtcg < 6:19316220/99‑3 (MQ=19)
aCGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTgc > 6:2233224/1‑99 (MQ=255)
cGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCTGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATc > 6:25315635/1‑91 (MQ=255)
cGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGAA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTgag > 6:27147689/1‑97 (MQ=38)
gCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTgccg > 6:9928486/1‑99 (MQ=255)
ccGCTCCCACAGGTGCAGCACGGTTCTCGAACGTTGTGCCGTACTTGGGGGA‑GTGTGCGTCCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTgccgcc < 5:9184650/99‑1 (MQ=255)
cGCTCACACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCa > 6:28379061/1‑99 (MQ=255)
gCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAg > 3:22194/1‑99 (MQ=255)
gCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCAGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAg > 6:27962046/1‑99 (MQ=255)
cTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGTGTGCCCGCGa < 5:13561396/65‑1 (MQ=37)
tCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGcc > 6:4920849/1‑99 (MQ=255)
gccACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTNTCTGGTTGCCGCCAGccc > 5:7416294/2‑99 (MQ=255)
cccACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGccc > 6:33305333/1‑99 (MQ=255)
cccACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGccc > 5:7514385/1‑99 (MQ=255)
ccACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATgg < 5:21335030/66‑1 (MQ=255)
ccACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGcccc > 5:20165849/1‑99 (MQ=255)
cacaGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCg > 5:21798919/1‑99 (MQ=255)
cacaGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCg > 5:12357725/1‑99 (MQ=255)
acaGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGcccagc > 5:9882944/1‑96 (MQ=255)
acaGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGc > 6:21858068/1‑99 (MQ=255)
acaGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGc > 6:6831905/1‑99 (MQ=255)
caGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCTGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGcc > 5:27936177/1‑99 (MQ=255)
caGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGcc > 5:13945061/1‑99 (MQ=255)
aGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTTGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCca > 6:11099497/1‑99 (MQ=255)
ggTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCcaa > 6:1332483/1‑99 (MQ=255)
gTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCcaac > 6:35125561/1‑99 (MQ=255)
tGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCcaaca > 5:11534383/1‑99 (MQ=255)
gcagcaCAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCcaacaa > 6:6501018/1‑99 (MQ=255)
gcagcaCAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCAAGCCCCGCcaacaa > 6:23961411/1‑99 (MQ=255)
cagcaCAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCcaacaac > 6:8517604/1‑99 (MQ=255)
gcaCAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCAAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCcaacaacaa > 5:16034032/1‑99 (MQ=255)
cacaGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAAAAAg > 6:17932572/1‑99 (MQ=255)
caGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGAGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTCTCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAgcg > 6:1467936/1‑99 (MQ=38)
aGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGACTGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAgcgc > 5:33686514/1‑99 (MQ=255)
aGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAgcgc > 6:26038932/1‑99 (MQ=255)
aGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAgcgc > 6:19622569/1‑99 (MQ=255)
gttctaGAAGGCTGTTCTGTACTGGGGGGA‑TCGGCCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCt < 6:30823542/97‑1 (MQ=255)
ggTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCt > 6:27637183/1‑99 (MQ=255)
gTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTAt < 5:19737268/64‑1 (MQ=255)
gTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTg > 6:16963285/1‑99 (MQ=255)
gTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTg > 5:23537110/1‑99 (MQ=255)
tctcGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTgg > 6:13920819/1‑99 (MQ=255)
ccaaaCGTTGGGCTGGACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTa < 6:6250813/96‑1 (MQ=37)
cGACCGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCCACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCCACAACAAGCGCTGGTaa > 6:11783619/1‑99 (MQ=37)
cGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTaa > 5:34553298/1‑99 (MQ=255)
aaCGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAg > 5:29731998/1‑99 (MQ=255)
aCGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGt > 6:27345500/1‑99 (MQ=255)
aCGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCAAACAACAAGCGCTGGTAAAGt > 6:33420745/1‑99 (MQ=255)
cGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGAGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGtt > 6:10786251/1‑99 (MQ=255)
cGCTGTGCCGTACCGGTGGGA‑GCGGGTGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGtt < 6:9294948/99‑1 (MQ=255)
cGCTGTGCCGTACCGGGGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGtt < 6:12960629/99‑1 (MQ=255)
cTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTTGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGttct > 6:20708/1‑99 (MQ=255)
cTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGttct > 5:23835663/1‑99 (MQ=255)
tgtgCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTTCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGttctt > 6:31762858/1‑99 (MQ=255)
tgtgCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGttctt > 6:18930125/1‑99 (MQ=255)
gtgCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGttcttc > 5:8667401/1‑99 (MQ=255)
gtgCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGttcttc > 5:25989942/1‑99 (MQ=255)
tgCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTtcttct < 5:11163766/99‑1 (MQ=255)
tgCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTtcttct > 6:24941215/1‑99 (MQ=255)
tgCCGGACTTGGGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTtcttct < 6:21367014/99‑1 (MQ=38)
gCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTcttctt > 5:4318257/1‑99 (MQ=255)
ccGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCttt > 5:2878810/1‑99 (MQ=255)
cGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTa < 5:17409155/99‑1 (MQ=255)
cGTACCTGGGGGA‑GCGGGCGTGCCCGAGAAGGGCCGCAACCCTGTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTa < 6:18312053/99‑1 (MQ=38)
tACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGt < 6:23775979/83‑1 (MQ=255)
tACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAg > 5:33383340/1‑99 (MQ=255)
tACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAg > 5:12161890/1‑99 (MQ=255)
tACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAg > 5:3054410/1‑99 (MQ=255)
aCCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGc > 6:1371214/1‑99 (MQ=255)
aCCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGc > 6:34286906/1‑99 (MQ=255)
aCCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGc > 6:32643252/1‑99 (MQ=255)
ccTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGcc > 5:1478355/1‑99 (MQ=255)
ccTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGcc > 6:20250713/1‑99 (MQ=255)
ttgggggA‑GGGGCCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGccc < 5:18344722/95‑1 (MQ=255)
cTGTGGGA‑TCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAATccc < 6:14589001/99‑1 (MQ=39)
tgtgGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGcccc > 5:23121783/1‑99 (MQ=255)
tgggggA‑GCGGGTGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGcccc < 5:9572635/96‑1 (MQ=255)
gtgGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCt > 6:20046940/1‑99 (MQ=255)
tgGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTg > 6:29188121/1‑99 (MQ=255)
tgGGA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTg < 5:16963286/99‑1 (MQ=255)
gggA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGc > 6:22919634/1‑99 (MQ=255)
gggA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGc > 6:5365993/1‑99 (MQ=255)
gggA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGc > 5:32077537/1‑99 (MQ=255)
gggA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTAGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACACCAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCtac > 6:22919749/1‑97 (MQ=39)
ggA‑GCTGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCg > 6:14959496/1‑99 (MQ=255)
gA‑GCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCgg < 5:22886064/99‑1 (MQ=255)
cGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTg > 5:5928537/1‑99 (MQ=255)
ggCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGcc > 5:13000472/1‑99 (MQ=255)
ggCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGcc > 5:1477469/1‑99 (MQ=255)
ggCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGcc > 5:8338185/1‑99 (MQ=255)
gCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGccc > 5:25365829/1‑99 (MQ=255)
gCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGccc > 5:25263573/1‑99 (MQ=255)
gCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCAt > 2:106783/1‑149 (MQ=255)
tGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCaa > 5:19409668/1‑99 (MQ=255)
|
GGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGA‑GCGGGCGTGCCTGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCGGTGCAT > AE015451_phaM1/6011045‑6011302
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
Only 200 of 309 total aligned reads displayed.
ATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCTGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAC > AE015451_phaM1/6011063‑6011283
|
ATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGAACGCCCGCTCCCCCAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1238:27860:4797/1‑101 (MQ=60)
ATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGAACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1238:27888:4813/1‑101 (MQ=60)
ATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGAACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1238:27851:4781/1‑101 (MQ=60)
gactggagttcagacgtgtgctcttccgatctCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGTGTGCCCGCGAAT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1249:36690:11222/69‑1 (MQ=60)
AATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCTGGCGTGCCCGCGAAT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1239:49117:5646/101‑1 (MQ=60)
tgggagacactcttccttccacgttgtcaccgcgggtcccgaacctTGTGCCTTACCTGTGGGAGGGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2154:38160:19826/55‑1 (MQ=46)
tgactggagttcagacgtgtgctcttccgatctAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2119:12678:11238/68‑1 (MQ=60)
gtgggcatgcaccCTCCCACGGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGTTGTGCCGTACTTGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGG < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2230:7805:4236/88‑1 (MQ=60)
ggggaacgcccgctcccgcgggtgcagcgtggttttcgaattttgtttcttccttgtggggttggtCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCC < LH00444:90:22JGJLLT3:8:1136:7047:12985/85‑1 (MQ=60)
ggaacgacagctcaagggggggagaaacgggtctgaaacgttgtacggtatttgggggggcggtCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTG < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1168:14906:18368/37‑1 (MQ=60)
gctattccttttccggggggtgcggagtgtttctggagtgttgtgctgggttggggggggtgggtGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTG < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1277:35423:5310/36‑1 (MQ=60)
GCACGCCCACTCCCACAGGTGCAGCACAGGCCTCGAACGCGGTGCCGTACTTGTGGGAGTGGGCGTGTCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGC < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1243:48997:14314/101‑1 (MQ=60)
ACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCG > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1128:9238:5054/1‑101 (MQ=60)
tctCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAG < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1181:46010:12632/98‑1 (MQ=60)
CCGCTCCCACAGGTGCAGCACGGTTCTCGAACGTTGTGCCGTACTTGGGGGAGTGTGCGTCCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAG < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1202:35368:18096/101‑1 (MQ=60)
CCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAG > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1241:24439:27773/1‑101 (MQ=60)
CCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAG > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1187:50689:23111/1‑101 (MQ=60)
CCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAG > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2204:32113:11142/1‑101 (MQ=60)
CCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAG > LH00444:62:22GH52LT3:8:1150:5605:15292/1‑101 (MQ=60)
CGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCagatcggaagagcacacgtctgaactcc > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2176:39824:23639/1‑73 (MQ=60)
GCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2233:14277:12151/1‑101 (MQ=60)
cccccaaggggaaaccccggttcgagaatgctgtccctgccttggggggccgctCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCC < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2245:46038:4156/47‑1 (MQ=60)
CTGCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTNTCTGGTTGCCGCCAGCCC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1181:16922:1064/1‑101 (MQ=60)
CTGCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTNTCTGGTTGCCGCCAGCCC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1181:16931:1080/1‑101 (MQ=60)
CTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1115:34656:14266/1‑101 (MQ=60)
CTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1182:22645:3227/1‑101 (MQ=60)
ccgggggggtgaggacctgtttaggacttttgttctgtttttgggggggtgttCGTGCCCGCGAATGTCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCC < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2109:50901:1721/48‑1 (MQ=60)
ccaagcgggggaagcgcgggtttggagtgttgtgctgtgttggggggggtGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCC < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1131:29210:10565/51‑1 (MQ=60)
TCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2113:29857:20884/1‑101 (MQ=60)
TCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCAC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1290:26649:12248/1‑101 (MQ=60)
TCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCAC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1290:26658:12264/1‑101 (MQ=60)
cccatggttccggcggggttcgggaacgctgttccggcttggtggggtCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCG < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2172:37568:15051/53‑1 (MQ=60)
CCCACCGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCG > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1265:45927:13417/1‑101 (MQ=60)
CCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCG > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2143:19446:10565/1‑101 (MQ=60)
CCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCG > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1236:46482:15949/1‑101 (MQ=60)
CCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGCATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCAGC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1210:25502:3371/1‑101 (MQ=60)
CCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2186:5965:4156/1‑101 (MQ=60)
CCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCAGC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1210:25493:3387/1‑101 (MQ=60)
CACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCTGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2216:39704:7024/1‑101 (MQ=60)
CACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCTCCAGCCCCGCC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1250:18790:22726/1‑101 (MQ=60)
CACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1253:33574:15212/1‑101 (MQ=60)
CACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2121:26094:19906/1‑101 (MQ=60)
agggggggagcaaaggtcgcgaacgcggtcctgcACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAAC < LH00444:90:22JGJLLT3:8:2228:16506:1369/117‑1 (MQ=60)
CAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAA > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1113:8240:13642/1‑101 (MQ=60)
AGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAAC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2228:43227:5246/1‑101 (MQ=60)
GGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACA > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1227:10727:23303/1‑101 (MQ=60)
GTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAA > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1263:2785:15949/1‑101 (MQ=60)
ggggggatgggttgggggggttttgctggcttggggggggtgtttGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAAC < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1224:30588:15772/56‑1 (MQ=60)
ggaagaacgggtttggaaggttgtgccgtcctggggggggcggttGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAAC < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1172:16524:19762/56‑1 (MQ=60)
TGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAAC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2126:47184:21524/1‑101 (MQ=60)
TGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAAC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2158:37587:9604/1‑101 (MQ=60)
TGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAAC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1205:45686:24825/1‑101 (MQ=60)
ggagacgggttttcgactgtttttccttctttgggggggtgtctGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACA < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1126:49746:4653/57‑1 (MQ=60)
gaagaagggtgctagagcgctgttctgtattgggGGGAGCGGCCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACA < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1163:15017:27885/67‑1 (MQ=60)
GCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACA > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2161:5022:13545/1‑101 (MQ=60)
gggagtgggttggggatgtggttctgtgtttgggggggtggctGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAA < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1256:39094:22502/58‑1 (MQ=60)
CAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAA > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1195:24208:25129/1‑101 (MQ=60)
CAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAA > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1195:24217:25145/1‑101 (MQ=60)
CAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCAAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAA > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1275:28239:28013/1‑101 (MQ=60)
CAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCAAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAA > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1275:28258:28013/1‑101 (MQ=60)
ggagggtgcgggaggtgtggtttggtctgggtgggggtggctGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAG < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1292:36625:4124/59‑1 (MQ=60)
AGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAG > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1227:50254:27837/1‑101 (MQ=60)
ggacgggtgtggaaggtttttctgggtttgggggggggtgtGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGC < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1183:21868:18224/60‑1 (MQ=60)
gcagggttcgagggtgtttttccgccttggggggggtgtttGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGC < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2202:12650:15965/60‑1 (MQ=60)
ccacagcccccaaaccctgtcccctaccggcgggacgcacgGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGC < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2221:1240:15164/60‑1 (MQ=60)
acacggtccccgaccgcttttccttacctgtggggctggtCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGC < LH00444:62:22GH52LT3:8:1174:9303:22438/61‑1 (MQ=60)
GCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCACCAACAACAAGC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2210:13630:24264/1‑101 (MQ=60)
CACAGTTCTCGAACGTTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCTCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCG < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1255:50781:10485/101‑1 (MQ=60)
CACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCG > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2284:1666:19169/1‑101 (MQ=60)
ACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGACTGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2281:24069:16173/1‑101 (MQ=60)
ACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2101:31734:9492/1‑101 (MQ=60)
ACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2241:35349:19570/1‑101 (MQ=60)
ACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1109:28886:24809/1‑101 (MQ=60)
ACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1177:37337:3019/1‑101 (MQ=60)
ACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2241:35322:19586/1‑101 (MQ=60)
cggttctcgagtgttgttttgccttTGTGGGAGCGGCCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2131:38401:15821/76‑1 (MQ=60)
agtttcgagacttcttttccgcccttgggggagtgtGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2131:38410:15837/65‑1 (MQ=60)
aggttctcgactcctgttccgccttggggggggcgtcCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2210:8915:21989/64‑1 (MQ=60)
NAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCT > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2102:48054:28799/1‑101 (MQ=60)
ggttttggggtgttgttccgtatttggggggGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTG < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1127:49598:18112/70‑1 (MQ=60)
AGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTG > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2163:23403:8707/1‑101 (MQ=60)
AGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTG > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2163:23422:8675/1‑101 (MQ=60)
AGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTG > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2163:23431:8691/1‑101 (MQ=60)
tttctagagtgttgtcctgtgtttgggggggtggctGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGG < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1117:14657:18448/65‑1 (MQ=60)
ttccccaacctttgtcccgtcctTGTGGGGGCGGCCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1261:52103:21589/78‑1 (MQ=60)
tgtttcgactgttttgttgtcttggggggggggttCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGG < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1125:33667:14795/66‑1 (MQ=60)
tttgggggcttttttgcgcgtgggggggggtgtGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2123:30292:15965/68‑1 (MQ=60)
tttgagagggcgggtccgtactgggggggttggttGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1158:43800:19410/66‑1 (MQ=60)
ttctagaacgttgggccgcacttggGGGAGGGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1262:38410:19810/76‑1 (MQ=60)
gtctggaatgttgtttcggactTGTGGGAGCGGGCGTGCCCACGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2182:42071:15484/79‑1 (MQ=60)
GTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGT > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1234:49662:4156/1‑101 (MQ=60)
CTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAA > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2291:32344:21316/1‑101 (MQ=60)
CTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAA > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2291:32354:21332/1‑101 (MQ=60)
CTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAA > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2153:51992:21653/1‑101 (MQ=60)
CTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAA > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2291:32381:21316/1‑101 (MQ=60)
ccgggtttttttttttctttgggggagctgtCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAA < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2131:16432:22037/70‑1 (MQ=60)
CGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAG > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2236:12123:19730/1‑101 (MQ=60)
gactgttttttcgtcttttggggcgcgctCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2206:42968:28062/72‑1 (MQ=60)
GAACGTTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGTCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2130:5447:20275/101‑1 (MQ=60)
GAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGT > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1203:17800:14571/1‑101 (MQ=60)
GAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGT > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1261:26603:19057/1‑101 (MQ=60)
aggtttgtgcggggtgggggggggtggtCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1176:21471:8691/73‑1 (MQ=60)
AACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTT > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2115:11716:26780/1‑101 (MQ=60)
gggtggtgcggggggggggggggtgggtGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTC < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1216:21545:16381/73‑1 (MQ=60)
atgctgttccttacttggGGGAGCGGGCGTGCCAGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTC < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2264:51382:27100/83‑1 (MQ=60)
atgctgggctggcctgggggagggggcCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTC < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2265:16746:24633/74‑1 (MQ=60)
CGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCTGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCT > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2238:33010:14010/1‑101 (MQ=60)
CGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCTGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCT > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2238:33001:13994/1‑101 (MQ=60)
CGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCT > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2166:11522:21316/1‑101 (MQ=60)
tggtctcgcccttgggggcgcggcCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTC < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2273:2516:17855/77‑1 (MQ=60)
CTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1194:28369:21156/1‑101 (MQ=60)
CTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1194:28359:21140/1‑101 (MQ=60)
CTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2191:49746:14555/1‑101 (MQ=60)
tttcctgtacttgggggatcgttCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2146:48238:26267/78‑1 (MQ=60)
tgttctctctttggggaaggggctGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2224:6409:17615/77‑1 (MQ=60)
tgggctgtattggggggggtGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2231:32261:20467/81‑1 (MQ=60)
gtttccgtatttggGGGAGCGGCCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2224:6400:17599/87‑1 (MQ=60)
ggtaccggctttgggggggcggcCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2268:7204:7008/78‑1 (MQ=60)
TGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2118:29219:2250/101‑1 (MQ=60)
TGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCT > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1222:13038:21220/1‑101 (MQ=60)
TGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCT > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2209:37346:27869/1‑101 (MQ=60)
gcgctgcgctggggggagcgttCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAC < LH00444:58:22357VLT4:2:1213:50484:23903/129‑1 (MQ=60)
TGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1223:36108:24857/101‑1 (MQ=60)
TGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTT > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1131:23875:23976/1‑101 (MQ=60)
TGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1223:36126:24857/101‑1 (MQ=60)
TGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1238:15017:29231/101‑1 (MQ=60)
GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTA > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2192:9719:20275/1‑101 (MQ=60)
GCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTA > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2113:14999:24905/1‑101 (MQ=60)
CCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAA > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1115:14194:27164/1‑101 (MQ=60)
CCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCACGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAA > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2139:43754:21989/1‑101 (MQ=60)
CGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGatcggaagagca > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2166:39815:1801/1‑89 (MQ=60)
CGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAG > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2278:40259:2090/1‑101 (MQ=60)
CGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAG > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1234:37818:13754/1‑101 (MQ=60)
gccctgggggggttggttGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGC < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2128:33676:19201/83‑1 (MQ=60)
GTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGTGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTTGTAAAGTTCTTCTTTAAGC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1107:23144:25466/1‑101 (MQ=60)
GTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1138:37199:27517/1‑101 (MQ=60)
GTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2122:48691:7954/1‑101 (MQ=60)
tcctgggggggggtacttTGCCTGTGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCC < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1217:12400:11463/83‑1 (MQ=60)
TACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1116:11984:25482/1‑101 (MQ=60)
ACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2240:4902:24360/1‑101 (MQ=60)
ACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1290:34295:18352/1‑101 (MQ=60)
ACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1290:34286:18336/1‑101 (MQ=60)
CCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2158:36191:14875/1‑101 (MQ=60)
ttggGGGAGCGGTCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2135:22867:7169/97‑1 (MQ=60)
CTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCT > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1208:2100:12744/1‑101 (MQ=60)
tgggggggtttcCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTG < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2168:43301:11463/89‑1 (MQ=60)
TGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTG > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1144:27213:5823/1‑101 (MQ=60)
TGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTGTAAGCCCCTG < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2144:21767:1673/101‑1 (MQ=60)
TGGGGGAGCGGGTGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTG < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1206:30005:22774/101‑1 (MQ=60)
ggggggccggatGTGCCTGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGC < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1153:37726:11414/89‑1 (MQ=60)
GTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1114:20602:11094/1‑101 (MQ=60)
GTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1106:6390:11142/1‑101 (MQ=60)
ggggggtggtCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCG < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1128:26603:23127/91‑1 (MQ=60)
TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCNCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCG > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2254:8684:22197/1‑101 (MQ=60)
TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCG > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1267:2387:16958/1‑101 (MQ=60)
TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCG < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1285:7398:25578/101‑1 (MQ=60)
TGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCG > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1222:51586:2170/1‑101 (MQ=60)
GGGAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGG > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2230:23893:7922/1‑101 (MQ=60)
tcaCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2137:2812:27789/98‑1 (MQ=60)
GAGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2155:28877:22934/101‑1 (MQ=60)
AGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTG < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2118:30902:15132/101‑1 (MQ=60)
AGCGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTG > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1164:27019:16766/1‑101 (MQ=60)
ctcGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCC < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2283:32612:2714/98‑1 (MQ=60)
CGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1243:29580:11655/1‑101 (MQ=60)
CGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1191:30782:2362/1‑101 (MQ=60)
CGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1243:29561:11655/1‑101 (MQ=60)
CGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1191:30791:2378/1‑101 (MQ=60)
CGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1116:50883:25210/1‑101 (MQ=60)
CGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1254:10940:15789/1‑101 (MQ=60)
CGGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1116:50864:25210/1‑101 (MQ=60)
GGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2183:40111:7601/1‑101 (MQ=60)
GGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2280:8073:6944/1‑101 (MQ=60)
GGGCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2183:40093:7601/1‑101 (MQ=60)
CTTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAA < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1236:6270:3339/101‑1 (MQ=60)
CGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAA > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2115:48238:18448/1‑101 (MQ=60)
CGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAA > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1118:21184:27709/1‑101 (MQ=60)
GTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAAC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2124:44734:28430/1‑101 (MQ=60)
GTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAAC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2247:38373:16894/1‑101 (MQ=60)
GTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAAC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2247:38364:16878/1‑101 (MQ=60)
GTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCAAAC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1292:49773:6784/1‑101 (MQ=60)
TGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2265:19788:18881/101‑1 (MQ=60)
TGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1181:47693:21348/101‑1 (MQ=60)
TGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1136:20556:29664/101‑1 (MQ=60)
TGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2229:12854:26251/101‑1 (MQ=60)
GCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTG < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2166:4865:5102/101‑1 (MQ=60)
CCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2277:47730:15901/1‑101 (MQ=60)
CCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1262:20574:23159/1‑101 (MQ=60)
CCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1287:13103:5086/1‑101 (MQ=60)
CCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGC > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2163:33075:29632/1‑101 (MQ=60)
CCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTTCCGCCAGCTCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTTCCCCAACTGCA > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1245:5919:15196/1‑101 (MQ=60)
CCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCatagatcggaagagcacacg > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1151:40915:6015/1‑81 (MQ=60)
CCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTagatcggaagagcacacg > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2259:6030:11254/1‑83 (MQ=60)
CCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCA > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1271:42247:11238/1‑101 (MQ=60)
CCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCA > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1270:28997:1929/1‑101 (MQ=60)
CGCGAATGGCCGCAGCCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCAG < LH00444:96:22JGLYLT3:3:2202:8924:13994/101‑1 (MQ=60)
CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCAT > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1146:13196:17455/1‑101 (MQ=60)
CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCAT > LH00444:96:22JGLYLT3:3:2135:9858:10774/1‑101 (MQ=60)
CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCAT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1172:19280:25338/101‑1 (MQ=60)
CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCAT > LH00444:96:22JGLYLT3:3:1211:36838:17759/1‑101 (MQ=60)
CGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCAGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCAT < LH00444:96:22JGLYLT3:3:1162:41609:13401/101‑1 (MQ=60)
|
ATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGGCGTGCCTGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAC > AE015451_phaM1/6011063‑6011283
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
