Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F27 I0 R1
|
83 |
86.1 |
2053078 |
89.1% |
1829292 |
215.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,697,739 |
T→G |
18.6% |
V428G (GTG→GGG) |
bcsE → |
cellulose production protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,697,739 | 0 | T | G | 18.6%
| 177.6
/ 4.0
| 89 | V428G (GTG→GGG) | bcsE | cellulose production protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (17/50); new base G (18/4); total (35/54) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.76e-06 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
TATCACTACCTTGCTGTCAATGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAG‑CTGGTGCAGATGCGCTTGCT‑TG‑CCCCAGAAC‑AATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCAAAGTTCTAAACCGGTCATCAATGCCGAGCACGATGGTCGCCACTGGCGACG > NC_000913/3697506‑3697976
|
tatCACTACCTTGCTGTCAATGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGTTGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGAGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCGGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGAAATCATGACCATTGGG‑GGGAAGCGGCAGGGG‑gtgt > 2:453509/1‑239 (MQ=255)
tGCTGTCAATGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGACGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGCAGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGAGATACTGACCATTGCC‑GGTAATCGCCTGGGG‑CAGtttacaccact > 1:359822/1‑230 (MQ=255)
tGCTGTCAATGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGACCAACCCTGGACCCTGTG‑TCCCCCTAACCGAACCGCCGTAATCATGACCATTGCC‑GGCAATAGGAGTGTG‑GTGttttgtccaatc > 1:640583/1‑230 (MQ=255)
tGCTGTCAATGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGGATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATAACCATTGGC‑GGGAAACGGCGCGGG‑CGGTTTCTCCCAttt > 1:506195/1‑238 (MQ=255)
gCTGTCAATGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCCCAtttt > 2:406743/1‑237 (MQ=255)
ttgttaattccccttcctcttaaaCTGGGTGGTTTCCAGAAGTGGGATTTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTTCCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCAGTACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTg < 1:179010/218‑1 (MQ=255)
cTGTCAATGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCCGGGG‑GGGTTTTTTTCATTTTg > 2:723671/1‑239 (MQ=255)
aTGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGGTGGGG‑CTGTGTTTCTCttttttttgggt > 2:624920/1‑230 (MQ=255)
aTGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGGGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGAt < 2:980973/239‑1 (MQ=255)
tgcccAGCCCTTCAATCTGCGTGGTTTCCAGAATTGGGATGGGTTCTTGAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCGGCCCCCGGTAAAGGGCTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTa < 1:255120/237‑1 (MQ=255)
ccctcccGCTAAAACTGCGTTGTTTCCAGAAGGGGGATTTGTTCTGTAAGGCCGGCAAAAACATGATGAATAACCCTCTATTCCCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAAc < 1:935865/234‑1 (MQ=255)
cccAGCCGCTCAAACGGCGTGGTTTCCAGAAGTGCGGTGTTTTCTGGACGGCCGTCACAAACAGTATGATCAACCCTCTATTACCTGCCCATGAGAAAGGCGTTCTGGCTCCCCGACGTCCGGTTCCGGGTATCCGCGTTGAACAGGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGCATTAAc < 1:801869/239‑1 (MQ=255)
ccAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAAc < 2:345184/238‑1 (MQ=255)
aGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATTTCATGACCATTGGC‑GGTAATCCGCCGGGG‑CTGttttttctccttctttggggtaaaga > 1:685452/1‑215 (MQ=255)
aGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGGAATCGGCTGGGG‑CTGGTTCTTTCCTTCTTTCGGTTTAACGAt > 2:986372/1‑239 (MQ=255)
aGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTCCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGAAGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGGTATCCATACCATTGGCGGGTAACCGGCGGGGG‑GTGttctttttcttttaacaacccggag > 1:115539/1‑215 (MQ=255)
cGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGAt < 2:685452/236‑1 (MQ=255)
cTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGGAATCGGGCGGGG‑CGGGTTTTCTCCTTTTTTCGGGTTTATGCTCTggg > 1:345184/1‑238 (MQ=255)
tGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑cgcg < 2:164744/239‑1 (MQ=255)
cGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTATTCGTCTGGGG‑CTTGTTCTCTCATTTTGTTGGATTTTCGATCCGGATAc‑ctc > 2:845526/1‑234 (MQ=255)
gTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCCGCTGGTG‑CTGTTTTCTTCATTTTGTCGGGTTAACGATATGGGTAc‑ccggttt > 2:744723/1‑233 (MQ=255)
gTTTCCAGAAGGGGGATGTGGTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATTACCCTCTATTTCCTGCCCAGGGTTAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAt < 2:647812/239‑1 (MQ=255)
aGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCGCGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTc < 2:168498/239‑1 (MQ=255)
tGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGAACCGGCGAAATCATGACCATTGGC‑GGGAATCGGCTGGGG‑CTGGTTTTCTCATTCTTTTGGATTTAAAAATTCGATAC‑CGCCGTGAAT‑AACATTTTtcc > 1:662269/1‑239 (MQ=255)
gggagtgtttCTGTAATGCCGTCAACCACATTATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCa < 2:810728/231‑1 (MQ=255)
ggATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTGCCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCa < 2:562809/238‑1 (MQ=255)
tGTAATGCCGGCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCCCGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCAt < 2:549467/229‑1 (MQ=255)
tAATGCCGTCAAAAAAAAGATGAATACCCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCGGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGc < 1:234268/238‑1 (MQ=255)
ccGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTACAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGGG‑GCGTTTCTTCCCTTCTGTCGGGTTTACCGACTGGGTAC‑CGGCGTGGTT‑AATATTTTCTCAtttctcactcggcgcaat > 1:229524/1‑223 (MQ=255)
ccGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATc < 1:621877/192‑1 (MQ=255)
ccGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATc > 2:621877/1‑192 (MQ=255)
tCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATAACCATTGGC‑GGTAATAGGCTGGGG‑CCGGTTTTTTCATTTTTTCGGGTTAACGCACTGGGAACGCCCGTGGAAC‑CATATTTTCACAttccatcaggccgttccgct > 1:549467/1‑221 (MQ=255)
aacaacATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGGG‑CTGTTTTTCTCATTCTGTCGGGTTAAAGAACTGGATAC‑CCCGTTGAAT‑CATATTTTCCCCTTGCCTACttggtccatttttt > 2:234268/1‑225 (MQ=255)
cccacattttatattaCCCTTTTTTCCCTGCCCCCGGTAAAGGCGTTTTGGTTGCCCTGCGTCCGTTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATCCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCa < 1:406743/224‑1 (MQ=255)
aacaTGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCaaa < 2:506195/239‑1 (MQ=255)
tgaATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTTATCGGCCGGTG‑CGGTTTTTCCCTCTCTTTCGGGATTACGAACTGGGTAC‑CCCCTTTTATCCATTTTTTCCC‑TTACCTACTAGGCG‑CCTTTTTTCaaaaccaatg > 1:29334/1‑232 (MQ=255)
taTAACCGTCTAGTTCCTGCCCACGGTTAGTGCGTTGAGGGTGCAGTACGGCCCGTCTGGGGTATCCGAGTTGAACAAGCGCTGTCTGTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCAGGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTGTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATTTGGATAC‑CGCGTGGAAT‑CACATTTGCCCATTGCCCACT‑GGCGACACTTTCTCAACCCCCATGGt < 1:300522/238‑1 (MQ=255)
attccccTCTATTCCCTCCCCGCCGTAAAGGTCTTCTGGTGGCCCTAAGTCCGTTACCGGGTATCCGCGTTAAACACGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCTATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGAGCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATGGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTc < 1:859893/235‑1 (MQ=255)
tAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAAGCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCATACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTc < 2:191875/238‑1 (MQ=255)
ccTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTTTGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTCAT‑GGCGACATTTTTTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGaaattgt > 2:259730/1‑234 (MQ=255)
gCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTTGGG‑CTGTTTCTTCCATTCTGTCGGAGTAACGATCTGGGTAA‑CCCGTTTGAT‑CATCTTTTTCCCTTGCCTACC‑TGCGACCATTTTTCAAACCCGAAGTGCTGGTTTTAAgatgaaaa > 1:360512/1‑236 (MQ=255)
cccACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTTTCGGGTTAACGATCTGGGAAC‑CCCGTTGTAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑TGCGGCATTTTCTCCAACCCCATGGGCTGGGTTTAAGATGTTCaa > 2:580907/1‑239 (MQ=255)
cccACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGCTAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTTCCTACT‑GGGGACATTTTCTCAAACCGTATGGGTCGGTTTGAAAATGTTCaa > 2:868072/1‑239 (MQ=255)
ctgtgTAAAGGCGTTTTTTTCCCCCTTAGGCCGGTGTCGGGTTTCCGCGATGGACATCCCTTGACGCTGGG‑TCGCCCTAAGCGTACCTGCGATATCATGGCCATTGGC‑TGTAATCCGCTGGTG‑CGGTTTCGCTCATTCTGTCGGATTAGCGATCTGGTTAT‑CTCGTTGAAA‑CATATTGTACCATTGCCTACA‑GGCGACATTATCTCAAACCTTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAAt < 1:453509/235‑1 (MQ=255)
cACGGTAAAGGCGTTCTGGTTCCCCTGCGGGCGGTACCGGGTTACCGCGGTGAACAAGCCCTGGCGGTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGTGAGATCAGTACCATTGGC‑GGTAAGCGGCTGGGG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAAt < 1:192994/239‑1 (MQ=255)
tAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCaa < 2:842636/203‑1 (MQ=255)
aaaGGCTTTCTGGTTGCCCTTCTGCCGGTTCCGGGTTTCCGGGTTGAACAAGCCCCGACGCTGTG‑TCCCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTg < 1:358212/238‑1 (MQ=255)
aGGCTTTTTGGTTGCCCTTCGGCCGGTACCGGGTATCCCCGTTGAACAAGCCCTGACGCTTTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCg < 1:723671/239‑1 (MQ=255)
ttCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTGCCTGTTT‑TCTCATTTTTTCGGGTTTACGGTCTGGATAA‑CGCGTTTGAA‑CCTATTTTCCCCTTTCCTACC‑TGCGACATTTTTCCAAACCGTCTAGTCTGGGTTTAAgtagactaaaaaaaggcagcgagc > 1:159718/1‑216 (MQ=255)
ttCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGGTTAACGATCTGGGTAC‑CGCGTTTAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑TGCGCCATTTTCTCCAACCGTATGGTCTGGTTTTACGAGTGTCAAATCAGTGCCGGG‑Ctt > 2:346227/1‑238 (MQ=255)
ttCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAAc > 2:675523/1‑137 (MQ=255)
ttCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAAc < 1:675523/137‑1 (MQ=255)
cccgtccccggtttcccttttGAACAAGCCCTGGCCCTGTG‑TTGCCCTAACCGTTCCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAG‑CTGGTGCAGATGCgcttgct < 1:868072/220‑1 (MQ=255)
ccGGGACCGGGTTCCCGGGTGGAACAAGCCCTGAGGC‑GTGTTCGCCCTAACCGTGCCGTCGATAACATGCCCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCCGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAG‑CTGGTGCAGATGCgcttgct < 1:624920/239‑1 (MQ=255)
ccGGGACCCGGTATCCGCGTTGAACAATCCCTGACGTCGTG‑TCGCACTAACCGTACCGGAGATGACATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATCC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCGCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAG‑CTGGTGCAGATGCgcttgct < 1:986372/239‑1 (MQ=255)
cGGTACCGGGGAGCCGCGTTCAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAG‑CTGGTGCAGATGCgcttgct < 2:229524/238‑1 (MQ=255)
tACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCGGACGCTGGT‑GCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTGCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGc < 1:200971/211‑1 (MQ=255)
tccGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTTTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCAGGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGGG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTGGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAG‑CTGGTGCAGATGCGCTTGCT‑TG‑ccc < 2:181521/238‑1 (MQ=255)
tccGGGGATCCGCTTTGAACAAGCCCTTGCGCTGTT‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAG‑CTGGTGCAGATGCGCTTGCT‑TG‑ccc < 1:681549/238‑1 (MQ=255)
ggagatgtttataagggacaGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAG‑CTGGTGCAGATGCGCTTGCT‑TG‑CCCCa < 2:356001/220‑1 (MQ=255)
gggTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGt < 2:238123/175‑1 (MQ=255)
tGAACAAGCCCTTGCCGTGTG‑GCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCAGTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGGTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAG‑CTGGTGCAGATGCGCTTGCT‑TG‑CCCCAGAAC‑AATGGGGc < 2:29334/238‑1 (MQ=255)
gACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTTTCGGATTAAc > 2:261048/1‑88 (MQ=255)
gACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAAc < 1:261048/88‑1 (MQ=255)
gACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAG‑CTGGTGCAGATGCGCTTGCT‑TG‑CCCCAGAAC‑AATGGGGCATGCCGCTGCCtt < 2:359822/239‑1 (MQ=255)
tg‑tCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTTTCTCCTTTTTTCGGGTTAACGATCTGGATAC‑CCCGTTGGAT‑CACATTTTCCCATTGCCTACT‑TGCGCGATTTTTTTCAACCGTATGGCCTGGTTTTGAAATAGTCAAATAAAGACCGTG‑CTCGTTCAGAAGCGCTTGCTCTG‑CCCCGAAAA‑AAGggggggtcttttttacacctctt > 1:356001/1‑219 (MQ=255)
gg‑tCGCCCTACTCGTGCGGGTGATATCATGACCTTTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGGTTCTCTCAGTCGGGCGGATTAACGATGTGGATAC‑CGCGTGGAAT‑CATATTTGCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAG‑CTGGTGCAGATGCGCTTGCT‑TG‑CCCCAGAAC‑AATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCa < 1:430898/238‑1 (MQ=255)
ttgcGCCCTAACCGTACCGGCGATTTCATGGCCATTGGC‑GGTAATCGGTGTGTT‑CTGTTTCTCTCATTCTGACGTATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAG‑CTGGTGCAGATGCGCTTGCT‑TG‑CCCCAGAAC‑AATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCa < 2:464278/236‑1 (MQ=255)
gttcccccTTACCGTCCCGGGTATATCATGTCCCTTGGC‑GGTAAGCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAG‑CTGGTGCAGATGCGCTTGCT‑TG‑CCCCAGAAC‑AATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCa < 1:861656/234‑1 (MQ=255)
gttCGCCCTAACCCTACCGGCGATATCATGGCCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTGCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAG‑CTGGTGCAGATGCGCTTGCT‑TG‑CCCCAGAAC‑AATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCa < 2:108374/237‑1 (MQ=255)
ggtcccttttgctgtgccGGGGATTTCATTGCCATTGGT‑GCTAGTGGGTGGGTG‑CTGTTGCTCTCATTCTGGCGGATTAACGACCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTGTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAG‑CTGGTGCAGATGCGCTTGCT‑TG‑CCCCAGAAC‑AATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCa < 1:62046/223‑1 (MQ=255)
g‑tCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGGCCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAG‑CTGGTGCAGATGCGCTTGCT‑TG‑CCCCAGAAC‑AATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCa < 2:735343/238‑1 (MQ=255)
caccccccTACCCGTTCCGGCGATTTCATGCCCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTTTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAG‑CTGGTGCAGATGCGCTTGCT‑TG‑CCCCAGAAC‑AATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCa < 1:180878/234‑1 (MQ=255)
tCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCCGGGG‑CTGTTTCTCTCATTTTGTCGGATTAAAGAGCTGGAGAA‑CGGGGTGGAT‑TATTTTTTCCCATTGCCTCAT‑GGCGACAATTTTTTAAAACGTTTTGTCCGGTTTTGAGTTGGACAAAGCAGTGCACAGCCGGGGGCAGAT‑CGACTGCT‑TG‑CCCCCGAACAAATggggaagcccggggcctaaacaccaa > 1:977298/1‑217 (MQ=255)
ccgaaCCGGTCCGGCGATTTCAGGTACATTGGG‑GGTTAGCGGCTGGGT‑CTTTTTCTCTCATTCTTGCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATAGTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAG‑CTGGTGCAGATGCGCTTGCT‑TG‑CCCCAGAAC‑AATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCAAAGtt < 2:252688/235‑1 (MQ=255)
aCCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCTTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAG‑CTGGTGCAGATGCGCTTGCT‑TG‑CCCCAGAAC‑AATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCAAAGTTCTAAACCGGt < 2:664873/239‑1 (MQ=255)
ccGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGGG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTTCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAAACGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAG‑CTGGTGCAGATGCGCTTGCT‑TG‑CCCCAGAAA‑AATGGGGCCTGCCGCTGCCTTTAACGCCAAGTTCTaaa > 2:180878/1‑233 (MQ=255)
gCGATATCATGACCATTTGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTTGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAG‑CTGGTGCAGATGCGCTTGCT‑TG‑CCCCAGAAC‑AATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCAAAGTTCTAAACCGGtcatc < 2:856265/239‑1 (MQ=255)
cATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGGG‑CTGTTTCTCTCATTCTTTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGTAT‑CCTATTTTTCCATTGCCTACT‑GGCGGCATTTTTTCAAACCGTATTGTCTGGTTTTAAGATGATACAATCAGTGCCCCG‑CTGGTGCAGATGCCCTTTCT‑TGCCCCCAGAA‑‑AATGGGGGATGCCCCCGCCCTTAACGCCAAGATCTAAACCCGCCACCAAAGCCg > 1:55960/1‑239 (MQ=255)
aCCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑cgcg < 1:752065/66‑1 (MQ=255)
aCCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑cgcg > 2:752065/1‑66 (MQ=255)
ttaggtccgggTTATGGGGTGGGG‑TTGTTTCTCTTTTTTGGTCGGATTAACGATCTTGATCC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAG‑CTGGTGCAGATGCGCTTGCT‑TG‑CCCCAGAAC‑AATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCAAAGTTCTAAACCGGTCATCAATGCCGAGCa < 1:389492/230‑1 (MQ=255)
ggCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATTTTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAG‑CTGGTGCAGATGCGCTTGCT‑TG‑CCCCAGAAC‑AATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCAAAGTTCTAAACCGGTCATCAATGCCGAGCACGATGGTCGCCACTgg < 2:662269/239‑1 (MQ=255)
ggCTGGTG‑CTGTTGCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGAGAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCGACT‑GGCGACAGTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAG‑CTGGTGCAGATGCGCTTGCT‑TG‑CCCCAGAAC‑AATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCAAAGTTCTAAACCGGTCATCAATGCCGAGCACGATGGTCGCCACTgg < 2:489979/239‑1 (MQ=255)
gTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAG‑CTGGTGCAGATGCgcttgct > 2:188609/1‑149 (MQ=255)
gTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAG‑CTGGTGCAGATGCgcttgct < 1:188609/149‑1 (MQ=255)
gTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAG‑CTGGTGCAGATGCGCTTGCT‑TG‑CCCCAGAAC‑AATGGGGCa > 2:984048/1‑169 (MQ=255)
gTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAG‑CTGGTGCAGATGCGCTTGCT‑TG‑CCCCAGAAC‑AATGGGGCa < 1:984048/169‑1 (MQ=255)
gTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAG‑CTGGTGCAGATGCGCTTGCT‑TG‑CCCCAGAAC‑AATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCAAAGTTCTAAACCGGTCATCAATGCCGAGCACGATGGTCGccctgcctcttt > 2:389492/1‑229 (MQ=255)
|
TATCACTACCTTGCTGTCAATGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTG‑TCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGC‑GGTAATCGGCTGGTG‑CTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAAT‑CATATTTTCCCATTGCCTACT‑GGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAG‑CTGGTGCAGATGCGCTTGCT‑TG‑CCCCAGAAC‑AATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCAAAGTTCTAAACCGGTCATCAATGCCGAGCACGATGGTCGCCACTGGCGACG > NC_000913/3697506‑3697976
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
