Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F17 I0 R1
|
124 |
155.2 |
3079696 |
98.3% |
3027341 |
226.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,697,739 |
T→G |
15.2% |
V428G (GTG→GGG) |
bcsE → |
cellulose production protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,697,739 | 0 | T | G | 15.2%
| 374.7
/ 7.1
| 155 | V428G (GTG→GGG) | bcsE | cellulose production protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (44/82); new base G (26/2); total (71/84) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.31e-08 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
AGATATCACTACCTTGCTGTCAATGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAATCATATTTTCCCATTGCCTACTGGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCGCTTGCTTGCCCCAGAACAATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCAAAGTTCTAAACCGGTCATCAATGCCGAGCACGATGGTCGCCACTGGCGACG > NC_000913/3697503‑3697976
|
aGATATCACTACCTTGCTGTCAATGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGTCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑Tg < 2:438934/238‑1 (MQ=255)
aCTACCTTGCTGTCAATGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTtct < 1:1168480/239‑1 (MQ=255)
ccTTGCTGTCAATGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCa < 1:434363/239‑1 (MQ=255)
cTTGCTGTCAATGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCAt < 1:1268638/239‑1 (MQ=255)
ttGCTGTCAATGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCAtt < 2:80491/239‑1 (MQ=255)
tGCTGTCAATGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATAGGCTGG‑GGCTGCTTTTCTCactt > 2:965873/1‑236 (MQ=255)
tGCTGTCAATGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGCAAATGGCTTG‑TGCTGTTtttctcct > 2:1283409/1‑235 (MQ=255)
cTGTCAATGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCAt > 1:316789/1‑235 (MQ=255)
cTGTCAATGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑GGCTGTTTTTCTCATTTTg > 2:884945/1‑239 (MQ=255)
tGTCAATGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGt < 1:657624/239‑1 (MQ=255)
gACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTa < 2:1052621/239‑1 (MQ=255)
gACCCAGCCGCTAAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTa < 1:199715/239‑1 (MQ=255)
cccAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAAc < 1:596215/239‑1 (MQ=255)
cccAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAAc < 1:1202898/239‑1 (MQ=255)
aGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCCGTTTCTTTCATTCCTTCGGAtttaagg > 2:1332159/1‑233 (MQ=255)
aGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCCGG‑GGCCGTTTTTCCCATTCTTGCGGGTTAAAGAt > 2:635647/1‑239 (MQ=255)
cGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGAt < 2:1281153/236‑1 (MQ=255)
aaaCAGCGTGGTGTTCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAAGGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCACACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAc < 2:350591/239‑1 (MQ=255)
tGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATATCCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTGCGTCCGGTACCGGTTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑cgcg < 2:1311613/239‑1 (MQ=255)
tGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑cgcg < 2:1312930/239‑1 (MQ=255)
cGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCCGGTTCTTTCCTTCTTTCGGATTTAACATCCGGATAC‑CCCGtt > 2:1198374/1‑239 (MQ=255)
cGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAAACGGCTGG‑GGCCGTTTTTTTCCTTCTGTGGGATTAACGATCTGGATAA‑CGCGtt > 1:1480485/1‑239 (MQ=255)
ggTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGaa < 1:514153/239‑1 (MQ=255)
ggTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGaa < 2:523023/239‑1 (MQ=255)
ccAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGCAATCGGCTGGCGGCTGTTGCTCT‑ATTCTGTTAGGTTAACGagcctggacccgggtttgactcat > 2:726369/1‑216 (MQ=255)
tGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑cgcg < 2:570573/222‑1 (MQ=255)
tGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑cgcg > 1:570573/1‑222 (MQ=255)
tGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑GGCTGGTTCTCTCATTTTTTCGGATTTACGATCTGGGTa > 2:1103286/1‑217 (MQ=255)
ttCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAATCATATTTTCCCATTGCCTa < 2:465527/238‑1 (MQ=255)
tAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGGTAC‑CGCGGTGAATCCTATTTTCCCATTGCCTACTGGCg > 1:774943/1‑239 (MQ=255)
tAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑GGCTGTTTCTCTCCTTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGGATTATATTTTTCCATTGCCTACTGGc > 1:759325/1‑238 (MQ=255)
ccGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTTTCTCATTTTGTTGGATTTACGATCCTGGTAA‑CGCGTTGGATCACATTTTCCCCTTTCCCTCTGGCGGCAtt > 2:1476024/1‑239 (MQ=255)
ccGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTTAATCATATTTTCCCATTGCCTACTGGCGACAtt > 1:1295608/1‑239 (MQ=255)
ccGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑GGGTGTTTTTCTCATTCTGTCGGGTTAACGATCTGGATTC‑CGCGCTGCATCCTATTTTCCCATTGCCTCCTGGCGACAtt > 1:550248/1‑239 (MQ=255)
tCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGt > 2:136227/1‑176 (MQ=255)
tCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGt < 1:136227/176‑1 (MQ=255)
aacaacATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCTGCGATATCATGCCCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTTCTTCATTCTGACGGAATAACGACCTGGTTAC‑CGCGTTTGATCATATTTTCCCATTCCCTTCTGGCGACAttttt > 1:1113749/1‑236 (MQ=255)
aacaacATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAATCATATTTTCCCATTGCCTACTGGCGACATTTtctc < 2:67673/239‑1 (MQ=255)
aacaacATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAATCATATTTTCCCATTGCCTACTGGCGACATTTtctc < 2:831268/239‑1 (MQ=255)
acaacaTGATGAATACCCCTCTAGTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGGCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAATCATATTTTCCCATTGCCTACTGGCGACATTTTCTCa < 1:965873/239‑1 (MQ=255)
caTGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑GGCTGTTTTTCTCATTCTGTCGGGTTAAAGATCTGGGTAC‑CGCGTTTAATCATTATTTCCCATTTCCTACTTGCGCAATTTTTTCAAAc > 2:1092794/1‑238 (MQ=255)
aTAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAATCATATTTTCCCATTGCCTACTGGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGt < 1:746449/238‑1 (MQ=255)
aTAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAATCATATTTTCCCATTGCCTACTGGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTc < 1:570294/239‑1 (MQ=255)
aTAACACTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCGCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAATCATATTTTCCCATTGCCTACTGGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGt < 1:807683/238‑1 (MQ=255)
ctATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑cgcg < 1:177277/177‑1 (MQ=255)
tATTACCTGCCCACGGTAAGGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGCTTAACGGTCTGGTTAC‑CGCGTTGTATCATATTTTCTCATTTCCTTCCGGCGACCTTTTCTCTAACCCTCTGGttctgttttt > 2:199815/1‑229 (MQ=255)
tATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCCTTTTTTCGGGTTTACGGTCTGGATAC‑CGCGTTGAATCATATTTTCCCATTTCCTACTGGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGac > 2:1368928/1‑238 (MQ=255)
tATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGGTTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAATCATATTTTCCCATTGCCTACTGGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGaa > 1:815777/1‑239 (MQ=255)
tATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAATCATATTTTCCCATTGCCTACTGGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGaa > 1:220939/1‑239 (MQ=255)
aTTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTGCCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAATCATATTTTCCCATTGCCTACTGGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAg < 1:869751/239‑1 (MQ=255)
aTTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAATCATATTTTCCCATTGCCTACTGGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAg < 2:910089/239‑1 (MQ=255)
ttACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑GGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTTGATCCTATTTTTCCATTTTCTTCCGGCGACATTTTTTCAAACCGTATTGGTTGGGTTTAAga > 2:739711/1‑239 (MQ=255)
ccTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTTGATAC‑CGCGTTGAATCATATTTTCCCATTGCCTACTGGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAgatga > 1:1444054/1‑239 (MQ=255)
cccACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAATCATATTTTCCCATTGCCTACTGGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAg < 1:501038/231‑1 (MQ=255)
cccACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAATCATATTTTCCCATTGCCTACTGGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCaa > 1:978040/1‑239 (MQ=255)
cccACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑GGCTTTTTCTCCCCTTCTGTCGGGTTTACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAATCata > 2:177277/1‑177 (MQ=255)
ccACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAATCATATTTTCCCATTGCCTACTGGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCaaa > 1:1251979/1‑239 (MQ=255)
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cACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAATCATATTTTCCCATTGCCTACTGGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAAt < 1:1091802/239‑1 (MQ=255)
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|
AGATATCACTACCTTGCTGTCAATGACCCAGCCGCTCAAACTGCGTGGTTTCCAGAAGTGGGATGTGTTCTGTAATGCCGTCAACAACATGATGAATAACCCTCTATTACCTGCCCACGGTAAAGGCGTTCTGGTTGCCCTACGTCCGGTACCGGGTATCCGCGTTGAACAAGCCCTGACGCTGTGTCGCCCTAACCGTACCGGCGATATCATGACCATTGGCGGTAATCGGCTGG‑TGCTGTTTCTCTCATTCTGTCGGATTAACGATCTGGATAC‑CGCGTTGAATCATATTTTCCCATTGCCTACTGGCGACATTTTCTCAAACCGTATGGTCTGGTTTGAAGATGATCAAATCAGTGCCGAGCTGGTGCAGATGCGCTTGCTTGCCCCAGAACAATGGGGCATGCCGCTGCCTTTAACGCAAAGTTCTAAACCGGTCATCAATGCCGAGCACGATGGTCGCCACTGGCGACG > NC_000913/3697503‑3697976
|
| Alignment Legend |
|---|
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Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
