Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A10 F210 I0 R1
|
188 |
159.1 |
7866933 |
93.3% |
7339848 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,410,053 |
(T)9→8 |
100% |
intergenic (+47/‑80) |
rlmB → / → yjfI |
23S rRNA mG2251 2'‑O‑ribose methyltransferase, SAM‑dependent/DUF2170 family protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,410,045 | 0 | T | . | 89.2%
| 522.6
/ 58.6
| 148 | intergenic (+39/‑88) | rlmB/yjfI | 23S rRNA mG2251 2'‑O‑ribose methyltransferase, SAM‑dependent/DUF2170 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (7/8); new base . (73/59); total (81/67) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.91e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
CCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATG > NC_000913/4409946‑4410140
|
ccTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGt > 1:2722110/1‑100 (MQ=255)
tGAACGTTTCTGTTGTGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAACCATCCAAATCTGGATGGctt < 1:947580/100‑1 (MQ=38)
tGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGttt < 1:2595306/100‑1 (MQ=255)
gAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGtttt > 2:2292458/1‑100 (MQ=255)
aaCGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGTCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAAATCTGGATGGctttt < 1:1082301/100‑1 (MQ=255)
aCGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGtttttt > 1:239912/1‑100 (MQ=255)
aCGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTACGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGtttttt > 1:2922308/1‑100 (MQ=255)
cGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGttttttt < 1:528562/100‑1 (MQ=255)
gTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAACCATCCAAATCTGGATGGcttttcat < 1:3697208/100‑4 (MQ=37)
tttCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGATGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGttttttttg < 2:862849/100‑2 (MQ=255)
tttCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGttttttttg < 2:1566699/100‑2 (MQ=255)
ttCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTTAAGCGGTGCGCCAGCTCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGtttttttttn < 1:3279562/100‑2 (MQ=255)
tCGTTTGCGACTGTAATTTGCTTATTTGATGCGGTGCGTCAGCGTAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGttttttttgtc < 1:960604/100‑4 (MQ=255)
tCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGttttttttgtc < 1:716875/100‑4 (MQ=255)
tCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGttttttttgtc < 1:2664347/100‑4 (MQ=255)
tCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCCCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGttttttttgtc < 2:2509549/100‑4 (MQ=255)
ggTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAACCATCCAAATCTGGATGGcttttcataattc < 1:1392079/100‑9 (MQ=25)
ttGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCtata < 2:119036/100‑1 (MQ=255)
gtgatcGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGTCAGCTCAGCTAATTTTTCATAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAgn < 2:2703606/95‑2 (MQ=255)
cGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCt > 1:876127/1‑100 (MQ=255)
gACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGTCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTg < 1:1105644/100‑1 (MQ=255)
gACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTATCAGAATTATGAAAAGCCATCAAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTTTATAgtt > 2:3307969/1‑97 (MQ=255)
aCCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGtttttttttttttttgtt > 2:1265120/1‑89 (MQ=255)
cgaaaTTTGATTATTTGAAGCGGTGCGTCAGCGCAGTTAATTGTTCAGAATTATGAAAAGCAATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGt < 1:2292479/97‑1 (MQ=255)
ggAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTaa < 1:2891778/100‑1 (MQ=255)
gAATTTGCTTATTTGAAGCTGTGCGCCAGCGCAGTTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTg < 1:255990/95‑1 (MQ=255)
aTTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGan < 2:387733/100‑2 (MQ=255)
tttGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATa < 2:1781187/100‑1 (MQ=255)
tttGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATa < 1:33341/100‑1 (MQ=255)
gCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAAtt > 1:1260461/1‑100 (MQ=255)
cTTATTTGAAGCGGTGCGCTAACGCATCTAATATCTCAGAATTATGAAAAGCCATACAGATTTGTATGGTTGTTATTT‑TTTATAGTTGTTAAGATaagt > 2:3789338/1‑97 (MQ=255)
cTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATTG‑TTTTTTTTGTATATAGCTGGTAAGATAATTa > 1:1891112/1‑100 (MQ=255)
cTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTa > 1:2009710/1‑100 (MQ=255)
cTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGACATCCAGAGTTGGATGGTTTTTTTTT‑TCTATAGTTGGTAAGATAttt > 2:260761/1‑99 (MQ=255)
cTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAACCATCCAGATATGGATGG‑ATTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAAtt > 1:36351/1‑99 (MQ=255)
ttATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTa > 1:3416967/1‑100 (MQ=255)
ttATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTAc < 2:754617/100‑1 (MQ=255)
tGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAtt > 2:2603528/1‑100 (MQ=255)
tGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAtt > 1:1202205/1‑100 (MQ=255)
aaGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGc > 2:186843/1‑100 (MQ=255)
agctgcgctggcgcAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCaaa > 2:2553312/11‑100 (MQ=255)
ggTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAat < 2:3625795/100‑1 (MQ=255)
gcgcCAGCGCAGCTAATTTCTCAGTATTATGAATAGCCATCCATATTTTGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATAtt < 1:68207/100‑1 (MQ=255)
gcgcCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAata > 1:2580599/1‑98 (MQ=255)
cgcCAGCGCAGCTAATTTCTCATAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTc < 1:699506/100‑1 (MQ=255)
cgcCAGCGCAGCTAATTTACAAAAAAAATAAAAAGCCAACAACATTTGGATCG‑TTTTTTTTGTCTATACCTTGTAACCTAATTACATATTGCAAat > 2:3157091/1‑96 (MQ=255)
gcCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCa > 1:1414663/1‑100 (MQ=255)
gcCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCa < 2:1994718/100‑1 (MQ=255)
ccAGCGCAGCTAATTTCTTAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCAt < 1:406361/100‑1 (MQ=255)
cAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCAtt > 1:2518813/1‑100 (MQ=255)
aGCGCAGCTAATTTTTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCAtt < 2:600977/99‑1 (MQ=255)
aGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCAttt > 1:2310409/1‑100 (MQ=255)
gcgcAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGATGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCAtttt > 2:3848903/1‑100 (MQ=255)
gcAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTTGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTttat < 2:2774286/100‑1 (MQ=255)
cAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTttat > 2:1172196/1‑99 (MQ=255)
cAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTttagt < 2:1462053/100‑3 (MQ=255)
aGCTAATTACTCAGAATTATGAAAAGACATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGATGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTttatta > 2:257365/1‑100 (MQ=255)
gttAATTTCTTAGAATTATGAAAAGTTATCTTGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTaa < 1:2349212/98‑1 (MQ=255)
gCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTaa > 1:3816006/1‑100 (MQ=255)
tAATTTTTCAGAATTATGTAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCAttt < 1:825322/92‑1 (MQ=255)
tAATTTCTCAGTATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAata < 1:1483337/100‑1 (MQ=255)
tAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAata < 1:3314283/100‑1 (MQ=255)
aaTTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAatat > 2:897505/1‑100 (MQ=255)
aTTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAatact > 2:2372614/1‑98 (MQ=255)
ttCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTa > 1:3768926/1‑100 (MQ=255)
atctgAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTaaa < 2:2142706/96‑1 (MQ=255)
cAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACt > 1:2553185/1‑100 (MQ=255)
cAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACt > 2:1611964/1‑100 (MQ=255)
aGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACtt > 2:347241/1‑100 (MQ=255)
aGAATTATGAAAAGCCATCCAAATTTGAATGG‑ATTTTTTTGTCTATAGCTGATAAGATAATTAAGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAAcat > 2:347619/1‑98 (MQ=255)
tagacaaaaaaaACCATCCAAATCTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTa > 2:1018256/9‑100 (MQ=37)
gAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTaaaagat > 1:2142725/1‑96 (MQ=255)
gAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTAGATGG‑TTTTATTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACt > 2:471162/1‑98 (MQ=255)
agacaaaaaaaACCATCCAAATCTGGATGG‑CTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTaa > 2:2922617/8‑100 (MQ=25)
gacaaaaaaaACCATCCAAATCTGGATGG‑CTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTaa > 1:421108/7‑99 (MQ=25)
gacaaaaaaaACCATCCAAATCTGGATGG‑CTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAAt > 1:1754783/7‑100 (MQ=25)
gacaaaaaaaACCATCCAAATCTGCATGG‑TTTTTTTTGTATATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAAt > 2:3020934/7‑100 (MQ=255)
acaaaaaaaACCATCCAAATCTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATc > 2:3079807/6‑100 (MQ=37)
tataAAAGGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAAATAATTACGTATTGCAAATATTCTTTTTATTAATATTTAAACTTAATCt < 2:2456495/100‑1 (MQ=255)
caaaaaaaACTATTCAGTTTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATc < 1:1778510/95‑1 (MQ=255)
caaaaaaaACCATCCAAATCTGAAAGGCTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAAATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAAt > 2:1110475/5‑99 (MQ=37)
gAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCtata > 1:3899425/1‑100 (MQ=255)
gAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCtata > 2:3397321/1‑100 (MQ=255)
aaaaaACCATCCAAATCTGTATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGTTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCtat > 2:3365937/2‑99 (MQ=255)
aaaGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATg < 2:1260447/100‑1 (MQ=255)
aaaGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATg < 2:2036148/100‑1 (MQ=255)
gtcATTCAGATTTGGATTG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATg < 1:3553941/95‑1 (MQ=255)
cATCCAGTTTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTATGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGaat < 1:1044730/99‑1 (MQ=255)
aTCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGaataa > 2:281016/1‑100 (MQ=255)
aTCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGAAAATTACTCATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGaataa > 2:1338000/1‑100 (MQ=255)
ccAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAataata > 1:283922/1‑100 (MQ=255)
ccAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAataata < 1:462327/100‑1 (MQ=255)
cAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTTGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAataata < 1:503880/100‑1 (MQ=255)
aGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAGTAatata < 1:2054309/100‑1 (MQ=255)
gATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAatatat > 1:594680/1‑100 (MQ=255)
tttGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGa < 1:1894921/100‑1 (MQ=255)
ggATGGTTTTTTTTT‑TCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACAt > 2:2383582/1‑100 (MQ=255)
ggATGGTTTTTTTTT‑TCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACAt > 2:424427/1‑100 (MQ=255)
ggATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACAt < 1:3222995/100‑1 (MQ=255)
ggATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACAt > 1:1585356/1‑100 (MQ=255)
|
CCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATG > NC_000913/4409946‑4410140
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
