Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A16 F258 I0 R1
|
432 |
103.0 |
5191697 |
92.7% |
4812703 |
99.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,410,053 |
(T)9→8 |
100% |
intergenic (+47/‑80) |
rlmB → / → yjfI |
23S rRNA mG2251 2'‑O‑ribose methyltransferase, SAM‑dependent/DUF2170 family protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,410,045 | 0 | T | . | 95.9%
| 401.0
/ 9.2
| 98 | intergenic (+39/‑88) | rlmB/yjfI | 23S rRNA mG2251 2'‑O‑ribose methyltransferase, SAM‑dependent/DUF2170 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (3/1); new base . (48/46); total (51/47) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.18e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
CCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATG > NC_000913/4409946‑4410140
|
ccTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTT‑AAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGtt > 1:268687/1‑100 (MQ=255)
tGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGttt < 2:2391293/100‑1 (MQ=255)
tGAACGTGTCGGTTGCGACCGGTATTTGCTTATATGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAAATCTGGATGGctt < 1:2408755/100‑1 (MQ=255)
aaCGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGtttt > 2:2433445/1‑99 (MQ=255)
cGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGttttttt < 2:852548/100‑1 (MQ=255)
cGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGttttttt > 2:1739927/1‑100 (MQ=255)
gTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAACCATCCAAATCTGGATGGcttttcat < 2:1028889/100‑4 (MQ=37)
gTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAACTAATTTCTCAGAATTATGAAAAACCATCCAAATCTGGATGGcttttcat < 2:727954/100‑4 (MQ=37)
tttCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGttttttttg < 1:2523190/100‑2 (MQ=255)
tttCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGttttttttg < 2:2248954/100‑2 (MQ=255)
ttCGGTCGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAATCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCATAATTATGAAAAACCATCCAAATCTGGATGGcttttca < 1:1763485/97‑3 (MQ=25)
tCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGttttttttgtc < 1:2352233/100‑4 (MQ=255)
tCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGttttttttgtc < 2:2099963/100‑4 (MQ=255)
tCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGttttttttgt > 1:2180511/1‑97 (MQ=255)
cGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGttttttttgtct > 2:2114790/1‑96 (MQ=255)
cGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGttttttttgtct < 1:2561538/100‑5 (MQ=255)
cGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAACCATCCAAATCTGGATGGcttttcataatt < 1:1862933/100‑8 (MQ=25)
ggTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGTAGCTTTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAACCATCCAAATCTGGATGGcttttcataattc < 1:1730953/100‑9 (MQ=21)
ggTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCta > 2:1489052/1‑100 (MQ=255)
ggTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCta > 1:110390/1‑100 (MQ=255)
ggTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAACCATCCAAATCTGGATGGcttttcataattc < 2:1946639/100‑9 (MQ=25)
gTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCtat < 1:2088872/100‑1 (MQ=255)
ttGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCtata < 2:1492072/100‑1 (MQ=255)
tGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAg > 1:1628861/1‑100 (MQ=255)
gCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAg > 2:2046506/1‑100 (MQ=255)
cGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCt < 2:1155993/100‑1 (MQ=255)
cGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCt > 2:2517166/1‑100 (MQ=255)
cGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCt < 1:1046874/100‑1 (MQ=255)
aCCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTgg > 1:1018369/1‑100 (MQ=255)
aCCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTg > 1:709694/1‑99 (MQ=255)
aCCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGCATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTg > 1:2157929/1‑99 (MQ=255)
cGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTa < 2:1396882/100‑1 (MQ=255)
gAATTTTCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTaa < 1:1885220/99‑1 (MQ=255)
gAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCATAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAg < 1:1825361/100‑1 (MQ=255)
gAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAg < 1:463873/100‑1 (MQ=255)
aTTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGAt > 1:224775/1‑100 (MQ=255)
tttGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTa < 2:2341281/95‑1 (MQ=255)
tttGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATa > 2:2279525/1‑100 (MQ=255)
ttagCTGATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGTGAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTTGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAg < 1:1286645/94‑1 (MQ=255)
gCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAAtt < 2:1179905/100‑1 (MQ=255)
gCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAAtt > 2:704041/1‑100 (MQ=255)
catATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTa > 2:1758334/3‑100 (MQ=255)
tATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGAAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTATGATAAtt > 1:2050305/1‑97 (MQ=255)
tttGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTa > 2:2386415/1‑100 (MQ=255)
ttGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTAt > 2:565219/1‑100 (MQ=255)
aGCGTTGCGCCAACGCAACTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTTTAGCTGGTAAGGTAATTACGTAtt > 1:6616/1‑98 (MQ=255)
cGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGTaaa < 2:2558940/100‑1 (MQ=255)
cGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCaaa > 2:461620/1‑100 (MQ=255)
gTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAata < 2:518685/100‑1 (MQ=255)
tGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTTTCTAGCTGGTAAGATAATTACGCCTTGCAAatat > 1:2462434/1‑100 (MQ=255)
cgcCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTTCAAATATTc > 1:1734251/1‑100 (MQ=255)
cgcCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATAtt > 1:2385551/1‑99 (MQ=255)
gcCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCa < 1:1250472/100‑1 (MQ=255)
ccAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCAt > 1:745320/1‑100 (MQ=255)
ccAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCAt > 2:1923365/1‑100 (MQ=255)
cAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCAtt > 2:2533248/1‑100 (MQ=255)
aGCCCATCTAATTTCTCTTAATTATGAACAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCa < 1:1427796/97‑1 (MQ=255)
gcAGCTAATTTCTCATAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGAATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTttat < 1:226628/100‑1 (MQ=255)
gcAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTttat < 1:2115533/100‑1 (MQ=255)
gcAGATAATTTCGCAGAAGTATGAAAAGCCATCGAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTttat < 1:1248932/100‑1 (MQ=255)
cAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTttatt < 2:2315893/100‑1 (MQ=255)
aGCTGATTGCGCAGGATTATGAAAAGCCATCGAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTttatta < 2:1517929/100‑1 (MQ=255)
aGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATTTTTTTTTTTTTATTTACGTATTGCAAATATTCATTttatta > 1:2294716/1‑100 (MQ=255)
gCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTaa < 2:2230212/100‑1 (MQ=255)
cTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCAAGATGTGTATGG‑TTTTTTTTGTATATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATGTTTATTTTATTaa > 1:1377269/1‑99 (MQ=255)
tAATTTTTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAat < 1:2561771/99‑1 (MQ=255)
tAATTTCTCAGAATTATGAAAATCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTTTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAata < 1:1958803/100‑1 (MQ=255)
tAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAata > 2:1054780/1‑100 (MQ=255)
tAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAata < 2:2314546/100‑1 (MQ=255)
tAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAat < 1:1293795/99‑1 (MQ=255)
tttCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATAttt < 2:2165875/100‑1 (MQ=255)
tcAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAAc > 1:30211/1‑100 (MQ=255)
tcAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAAc < 2:2118822/100‑1 (MQ=255)
aGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACtt > 1:368107/1‑100 (MQ=255)
gAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTTGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACt < 1:1210026/98‑1 (MQ=255)
aTTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAAt < 2:461567/100‑1 (MQ=255)
aTTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAAt < 1:28229/100‑1 (MQ=255)
ttATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACtt < 1:1110095/96‑1 (MQ=255)
caaaaaaaACCATCCAAATCTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCt > 1:2433830/5‑100 (MQ=37)
caaaaaaaACCATCCAAATCTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTAATTTTATTAATAATTAAACTTAATCt > 1:887544/5‑100 (MQ=37)
caaaaaaaACCATCCAAATCTGGATGG‑CTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCt > 2:685078/5‑100 (MQ=25)
aaaaaaaACCATCCAAATCTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCta > 2:1172862/4‑100 (MQ=38)
aTGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTACACTTAATCta > 2:2474885/1‑100 (MQ=255)
tGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTT‑TTTTTTTTTAATAAGAAAATTAGTTATTGTATTTTTTCGTTTTATTGATTTTTAAACTTAATCttt > 1:636626/1‑98 (MQ=255)
tGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTTTATTGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCTTTTTATTAATATTTATACTTAATCt > 1:516704/1‑98 (MQ=255)
tGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATACTTAGGTATTGCAAATAGTAATTCTCTTAATATTTACACTTAATCtat > 1:2122062/1‑100 (MQ=255)
aaaaaaACCATCCAAATCTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCtat > 1:1477805/3‑100 (MQ=38)
aaaaaACCATCCAAATCTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTTGTAAGATAATTACGAATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTATACTTAATCtata > 1:1206940/2‑100 (MQ=37)
aaaaGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTatat > 1:82609/1‑100 (MQ=255)
aaaaACCATCCAAATCTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATATCTGGTAAGATAATTACGTATTTCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTatat > 1:910945/1‑100 (MQ=255)
aaGCCATCCAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATgg < 2:530181/100‑1 (MQ=255)
cctCCATATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAATATAATTACTTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGaa < 1:1670935/96‑1 (MQ=255)
tCCAAATCTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGaataat > 2:208301/1‑100 (MQ=255)
ccAGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAataata < 1:1319807/100‑1 (MQ=255)
aGATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAatata < 2:1552859/100‑1 (MQ=255)
gATTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAatatat > 2:1010532/1‑100 (MQ=255)
aTTTGGATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATg < 1:104601/100‑1 (MQ=255)
tttgATGG‑TTTTTTTTGTCTATTGATTGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAataata < 1:2088188/91‑1 (MQ=255)
ggATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACAt > 2:1677132/1‑100 (MQ=255)
gATGG‑TTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATg < 2:1122551/100‑1 (MQ=255)
|
CCTGAACGTTTCGGTTGCGACCGGAATTTGCTTATTTGAAGCGGTGCGCCAGCGCAGCTAATTTCTCAGAATTATGAAAAGCCATCCAGATTTGGATGGTTTTTTTTTGTCTATAGCTGGTAAGATAATTACGTATTGCAAATATTCATTTTATTAATATTTAAACTTAATCTATATGGAATAATATATGACATG > NC_000913/4409946‑4410140
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
