Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A9 F13 I0 R1
|
203 |
11425.2 |
8793538 |
98.4% |
8652841 |
135.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
4,440,334 |
A→C |
21.1% |
Q797H (CAA→CAC) |
ftsK → |
DNA translocase FtsK |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 4,440,334 | 0 | A | C | 21.1%
| 142.2
/ 7.3
| 146 | Q797H (CAA→CAC) | ftsK | DNA translocase FtsK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (50/46); new base C (10/14); total (80/66) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.94e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
GTACAGCAGCCGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGTACCACAGCCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGC > NZ_CP022686/4440197‑4440473
|
gTACAGCAGCCGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGCACCGCTGCCGCTTTATCAGCAGACGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGGAGTATCAGCAGCCGCAATATCAACa > 5:384629/1‑140 (MQ=21)
gTACAGCAGCCGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTAGCACAGCAGCCGCAGTATCAGCACCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCAGCAATaacaacc > 2:538635/1‑139 (MQ=255)
tACAGCAGCCGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAACCGCTTGCACAGCACCCGCAGTATCACCAGCCGCAATATCACCAg > 5:823497/1‑140 (MQ=21)
agcagcCGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGc > 3:558713/1‑138 (MQ=255)
cagcCGCAACAACAGGTAGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACAGCAGCCGCAGTCTCAGCAGCCGCAACCACCGGTTGCGCCTCAGCCGCCGGAACAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGcc > 6:856465/1‑139 (MQ=18)
gcCGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTCGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGAACCTCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCCACAGCCGcc > 3:157048/1‑137 (MQ=255)
gcCGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGAACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCAGCAATATCAACAGCCGca > 3:300745/1‑138 (MQ=255)
ccGCAACAACCTGTAGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGcaaca < 5:912294/140‑1 (MQ=255)
ccGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCGGCAGTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGcaaca < 6:990093/140‑1 (MQ=255)
ccGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGcaaca < 6:939857/140‑1 (MQ=255)
ccGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCAGCAAAATCCACAGCAGcaaca > 6:663953/1‑140 (MQ=255)
cGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCCGCAATATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGCCCCACAGCCGGAGGATCCGCAGCAGCATCATCAGCAGCCGccac > 4:1048924/1‑138 (MQ=11)
gCAACAACCGGTAGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCATCAACCGGTAGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAAAATCAGCAGCCGccaca > 4:513959/1‑138 (MQ=255)
gCAACAACCGGTAGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTAGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCAGCAACAACCGGTTGCACCTCAGCCGCAGTATCAGCAGCGGCATAATCAGACGCCGccacagc > 2:76138/1‑138 (MQ=17)
aacaacCGGTAGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACATCCGGTAGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCACAGCCGCAGGATCAGCAGCAGCAAAATCAACAGACCCaacaac > 4:918676/1‑138 (MQ=18)
aacaacCGGTAGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTAGCACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACATCCGGATGAACCCCAGCCGCAGGATCAGCAGCGGCAAAATCAGCAGCAGccacatc > 4:248464/1‑136 (MQ=14)
aacaacCGGTAGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAAAAACCGGTTGCACCGCAGCCGCAGAATCAACAGCCTCAAAATCCTCAGACGcaacagc > 4:475641/1‑136 (MQ=18)
aGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGAACCTCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAAAATCACCAGCCGCAAAAACCGGAAGGACCgc > 6:974448/1‑140 (MQ=18)
aCCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACCCCCGGTTGCCCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAAAATCCGCAGCCGCAACACCCGGTAGCCCCgcagc > 6:223037/1‑140 (MQ=18)
aCCGCAGCAGCAATATCAGCACCCGCAACAACCGGAACCACCGCAGCCGCAGTCTCAGCAGCCGCAACAACCGCTATCACCGCAGCCGCAGTATCAGCATCCGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCgcagc < 8:737247/140‑1 (MQ=25)
ccGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAAGATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCgcagca > 7:114559/1‑140 (MQ=255)
gcagcagcaATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACACCCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGACGCCACAACCGGTTGCCCCgcagctgc > 7:191972/1‑140 (MQ=21)
gcagcagcaATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTAGAACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGCATTATCAGCAGCCTCAAACTCAGAAGCCGCAAAAACCGGTAGCCCCtccgcagc > 7:695164/1‑140 (MQ=18)
cagcagcaATATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTAGCACCGCAGCCGCAGTATCCGCAGCCGCAACAGCCGGTTGCACCTCAGCCGCAGGATCAGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACACCCGGATCCACCtccgcag > 4:598973/1‑138 (MQ=18)
cagcagcaATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACATCCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGAGGCACCgcagcag > 3:1075638/1‑138 (MQ=255)
cagcagcaATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCATTATCATCAGAGGCAACATCCGGTTGCACCgcagaagca > 7:325995/1‑140 (MQ=18)
gcagcaATATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTAGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCCGCTGCCGCAAGATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGGACCgcagcagca > 3:944991/1‑138 (MQ=21)
gcagcaATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCAGCAATATCACCAGCCGCCACAACCGGTGGAACCgcagctgca > 4:217899/1‑138 (MQ=18)
tatCAGCAGCCGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATcag < 4:749331/138‑1 (MQ=255)
cagcCGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCCGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAGCAGCCGCCACAACCGGTTGCACCGACGCATCAATATCAGCAGCccca > 2:155831/1‑140 (MQ=21)
agcCGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACATCCGGATGCACCTCAGCCGCAGTATCAGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGACacaa > 2:776458/1‑140 (MQ=25)
agcCGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCacaa < 5:864270/140‑1 (MQ=255)
ccGGAACTACCGCTAGCACCGCAGGCGGAGTATATGCAGCCGCATGATCCGGTGGCACCTCAGCCGCTGTATCCGCAGCCGCATTATCAACAGCCTCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCacaa < 4:1107729/138‑1 (MQ=18)
ccGGAACAACCGGTAGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCATCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCacaa < 3:827694/138‑1 (MQ=255)
ccGCATCAACCTGTAGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAACCGGAAGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCacaaca < 1:806118/140‑1 (MQ=255)
ccGCATCAACAGGAAGCTCAGCAGCCGCAGTCTCCGCAGCAGCAACAACCGGATGCACCGCAGCCGCAGCCACAGCAGCAGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCacaa < 4:595327/138‑1 (MQ=21)
cGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTTACCGCAGCCGCAAACTCAGCAGCCGCCACAGCCGGAGGCCCCGCAGCAGCAGAAGCCGCCGCCCCAACAg > 8:828373/1‑140 (MQ=12)
taatcaacCGGCACCCACGGAGCCGCAGAATCAGGAGCCGCAACTACCGGTCCCACCTGATCCGCAGTATCATCAGCAGCAATATCACCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGc < 6:384629/136‑1 (MQ=21)
gCAACAAACGGTAGCACCGCAGACGCAGTATCAGCAGGCGCAACTACCTGTTGCTCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCAACTACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGc < 1:1103412/140‑1 (MQ=37)
cgTATCACCTCAGCAGAACTATCAGCAGGCGCAACAACCGCGAGCAACGCACACTCAGTAAAACCAGCCGCAATAACACCAGCCGCAACAACCGGAATCACCGCAGCAGCAATATCATCAGCCACAACAGCCGGTTaaac < 8:473087/139‑1 (MQ=12)
gTAGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTacac > 8:115262/1‑139 (MQ=255)
gTAGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTacac < 7:115262/139‑1 (MQ=255)
cACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCCACAACCGGTTGCCCCGCAGCAGCAATATCAGCCGACACCACAGCCGGGTaccccgc > 4:387712/1‑133 (MQ=25)
aCCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAACCGCTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACagcagc < 7:913371/140‑1 (MQ=255)
ccgcagccgcagTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCACCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGcc < 8:404488/140‑1 (MQ=255)
ccgcagcagctgTCACAGCTGCCTCTCCAACCGGTAGCACCGCAGCCGCTGTATCCGCAGCCGCAATATCCACAGCCGCACAAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGcc < 1:686705/140‑1 (MQ=25)
ccgcagcagcagTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGcc < 8:404491/140‑1 (MQ=255)
cagcagcctaagTCTCTGCAGCAGCAACATCAGGTGGCACCCCATCATAAGTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCAACTACCGTTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGcc < 8:27585/138‑1 (MQ=21)
cgcagccgcagTCTCAGCAGCCGCAACAACAGCAGGCACCGCAGCCTCAGTCTCATCAGCAGCAATATCACCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCg < 8:146033/140‑1 (MQ=25)
cgcagccgcagTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCCACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCTGCCg > 1:679050/1‑140 (MQ=255)
cgcagccgcagTATCAGCAGCCGCAACAACCGGATGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCg < 1:203398/140‑1 (MQ=255)
cgcagccgcagTATCAGCAGCAGCATCAACCGGATGCACCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCAGCATTATCATCAGCCGCAACAACCGGTTGCACAGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCg < 6:437249/140‑1 (MQ=37)
cagccgcagTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAAGAGCCGCAACAACCGGTAGCACCGCAGAAGCAATATCAGCAGCCACCACAGCCGGGTACACAGCAGCCGcc > 8:434156/1‑139 (MQ=37)
cagccgcagTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCCAAGCAGCAGTATAAGCAGACGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATAACAGCAGCCACAACAGCCGGATACACAGCAGCCGCa > 6:678335/1‑140 (MQ=37)
gccgcagTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCTCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTCCACCGCAGCAGCAATATAAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCCGCCGCa > 3:917123/1‑138 (MQ=255)
gccgcagTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCGCa > 3:542329/1‑138 (MQ=255)
gccgcagTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGACACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCGCa > 3:16829/1‑138 (MQ=255)
gccgcagTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGAACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAAAATCAGCAGCGGCCACAACCGGTAGCCCCGCAGCTGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGTTTAAGCATCAGCCgga > 4:111984/1‑136 (MQ=21)
gcCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCACCAGCCGCAACAACCGGTTCCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACCACAGCCGGTTACACATCAGCCGCAGAATCCGCAGCCGCAAc > 2:1137989/1‑140 (MQ=37)
ccGCAACAACCGGTTGCACCGCTGCCGCAGTATCAGCAGCAGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCaa < 3:138740/138‑1 (MQ=255)
ccGCAACAACCGGATGCTCCGCAGCCGCAGGCTCAGCAGCAGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGCTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCaa < 3:120728/138‑1 (MQ=21)
ccGCAACAACCGCATGCACCGCAGCCGCACTATCTGCAGCCGCAATATCAACAGCCTCACCAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACa < 2:1015740/140‑1 (MQ=21)
cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCACCAGCCGCCACAACCGGTAGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGATACCCAGCAGCCGCAGGATCAGCCGCCGCAACAg > 6:450248/1‑140 (MQ=25)
cGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAg > 8:47533/1‑140 (MQ=255)
gCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCACCAACCGGTGGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACa < 3:355957/138‑1 (MQ=255)
gCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAAAATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGACACCACAGCCGGTTACACAGCAGCAGCAGTAACCGCAGCCGCAACa > 4:1069970/1‑138 (MQ=37)
caacaaCCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCACCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACCCAGCAGCCGCAGGAGCCGCAGCCGCAACAg > 4:158887/1‑138 (MQ=37)
caacaaCCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAAAATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTAAACCGCAGCGGCAGTATCAGCAGCCGCCACAg > 4:795491/1‑138 (MQ=38)
cGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACagcagc < 5:365911/108‑1 (MQ=255)
gTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGTAcc > 1:373226/1‑140 (MQ=255)
gTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGGTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGTAcc > 8:249280/1‑140 (MQ=255)
ttGCTCCGCTGCCGCAGTCTAAGTAGCATGAATATCATCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCTGTTTCACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGTACca < 8:80378/140‑1 (MQ=18)
aagaaCCGCAGCCGCAGTATAAGCAGCAGCAAGATCACCACCCGCCACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTTCACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGTAc < 4:966624/134‑1 (MQ=21)
cACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGTACCACAg < 7:226515/140‑1 (MQ=255)
cACCGCAGCAGCAGGATCAGCAGCAGCAATATCACCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGTACCACAg < 1:41814/140‑1 (MQ=255)
cgcagccgcacTCTCAGCAGCATCAATATCAACAGCCGCAACATCCGGAAGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGTACCACAGCCg < 7:905189/140‑1 (MQ=18)
cagccgcagTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGAAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCTGTTGTACCACAGCCGcc > 6:464482/1‑139 (MQ=255)
gccgcagTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGTACCACAGCCGCAgg < 5:663439/140‑1 (MQ=255)
ccgcagTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGTACCACAGCCTCAGGa < 1:557018/140‑1 (MQ=255)
agTATCAGCAGGAGCATTATCAGCAGCCTCAACAACCGGTTGCACAGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGTACCACAGCCGCAGGATa < 3:842376/138‑1 (MQ=18)
agTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCACCAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGTACCACAGCCGCAGGATAcc < 7:923378/140‑1 (MQ=255)
agTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGTACCACAGCCGCAGGATa < 4:924346/138‑1 (MQ=255)
agTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCAACGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGTACCACAGCCGCAGGATAcc < 1:1053875/140‑1 (MQ=255)
agTATCAGCAGCAGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGTACCACAGCCGCAGGATa < 3:522233/138‑1 (MQ=255)
gTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCAACACCCGGTTGAACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGTACCACAGCCGCAGGATAc > 4:238959/1‑138 (MQ=255)
tacaagcagcCGCATTATCACCAGCCGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACATCCGGTTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGTACCACAGCCGCAGGATAcc < 4:996646/134‑1 (MQ=18)
cagcCGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGTACCACAGCCGCAGGATACCCTGCTTCa > 6:304857/1‑140 (MQ=255)
tccGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGAACCGCAGCCGCAATATCAGAAGCCACAACCGCCGGTTACACCGCAGACGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGACGGTTGTACCAACGCCGAAGGCTAACCTTCTTAATc > 2:1076342/2‑140 (MQ=17)
gcCGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCCCAACAGCCGGTTGTACCACAGCCGCAGGCTCCCCTGCTTCATc > 1:1022290/1‑140 (MQ=255)
ccGCCATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGTACCACAGCCGCAGGATACCCTGCTTCATcc < 1:600675/140‑1 (MQ=255)
cGCAATATCCCCAGCCCCAACACCCGGTCGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGATGTACCACAGCCGCAGGATACCCTGCTTCATCCg < 1:219663/140‑1 (MQ=18)
cGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACCGCCGGTTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGTACCACAGCCGCAGGATACCCTGCTTCATCCg > 2:112879/1‑140 (MQ=255)
cGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACCCAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGTACCACAGCCGCAGGATACACTGCTTCATCCg > 8:1039451/1‑140 (MQ=255)
cGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGTACCACAGCCGCAGGATACCCTGCTTCATCCg > 2:823174/1‑140 (MQ=255)
cGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGTACCACAGCCGCAGGATACCCTGCTTCATCCg > 2:927133/1‑140 (MQ=255)
cGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGTACCACAGCCGCAGGATACCCTGCTTCATCCg > 1:658735/1‑140 (MQ=255)
cGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGGACCACAGCCGCAGGATACCCTGCTTCATCCg > 2:743416/1‑140 (MQ=255)
atcAAGATCAACAGGCTCAACAACTGGTTGCACCGCAGCAGCAATTTCAGCAGCCACAACTGCCGGTTTCACAGCATCAGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGTACCACAGCCGCAGGATACCCTGCTTCATCCg < 2:1122916/138‑1 (MQ=21)
agCAATATCAACAGCCGCAACACCCGGTGGCACCGCAGCAGCACTATCAGCAGCCCCAACAGCCGGTTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGTACCACAGCCGCAGGATACCCTGCTTCATCCg < 8:786223/139‑1 (MQ=255)
atCAACAGCCGAACCAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGTACCACAGCCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTg < 8:42727/140‑1 (MQ=255)
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GTACAGCAGCCGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTAGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAATATCAACAGCCGCAACAACCGGTTGCACCGCAGCAGCAATATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTACACAGCAGCCGCAGTATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGTACCACAGCCGCAGGATACCCTGCTTCATCCGCTGTTGATGC > NZ_CP022686/4440197‑4440473
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
