Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F36 I0 R1
|
179 |
8076.5 |
8499890 |
98.3% |
8355391 |
135.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
4,712,763 |
A→C |
22.9% |
A52A (GCT→GCG) |
yceB ← |
lipoprotein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 4,712,763 | 0 | A | C | 22.9%
| 133.1
/ 10.4
| 99 | A52A (GCT→GCG) | yceB | lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (57/14); new base C (2/23); total (59/40) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.42e-10 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
AGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGGCTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAA > NZ_CP022686/4712626‑4712902
|
aGCTTCAGTGTCATGGTCGCTTTCTGGCTACCGACCAGGGCGGTCAAGTACAGAGTGGCGGCGCCGGTGAGGGTAGACTTATTAGGGTCTTCGCCACCAATTTGGCTGTTCATGTATGTATGAAAAATATGGGCGTCa > 8:945152/1‑138 (MQ=255)
ttCAGTTTCATGGTCGCTTTATGGCTACCGACCAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTACGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGCCCAATTTGTCTGGTAAGGTTTGGCAGAACAATATGGGCGACAGcccc > 6:208938/1‑138 (MQ=255)
cAGTTTCATGGTCGCTTTCTGGCTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTAAGAACAATATGGGCGTCAGCCAc > 8:135624/1‑138 (MQ=255)
cAGTTTCATGGTCGCTTTCTGGCTACCGAACAGGGAGGTAATGTCCAGATTGGCGTATACGGGTAGGGTAACCTTATTAGTCTGTTCGCCACCAATATGGCGGGTAAGGTTTGTAATAACAATATTGGCGTAAGCCACGc > 6:25792/1‑140 (MQ=255)
tgggggCTTTCTGGCAACCTAACTGGGTTTTCTTCGCCCTTTGGGCGTCTCGGGTGTGGTTAACTTTATCCGGCTCGCCGCCACAATTTTGGGTGGGCTGGTTGGTCAGAACAATAGGGGCGTCAGCCACGCCGGGTa < 8:254768/133‑1 (MQ=255)
cccGAACAGGGAGGTCAGGTCCAGATTGGCGGCTCGGGTTAGGGCAACCTTATTGGGAGCTTCGCGACCATTTTGGCTGGTCAGGTTTGGCCCAAAAATATGGGCGTCCCCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTga < 8:609650/137‑1 (MQ=255)
ccGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTGAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGaa > 3:661068/1‑140 (MQ=255)
ccGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAATCCGATATCTTTTGAGaa > 2:107158/1‑140 (MQ=255)
aGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCGTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAattatt > 3:723736/1‑140 (MQ=255)
aGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGCCCAAATTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACCCCGGGGAAACCGCAATCATTTGAGAAATTATTATGt > 5:488454/1‑140 (MQ=255)
aGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCATGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAGCCGATATCTTTTGAGAtattattat > 8:940375/1‑138 (MQ=255)
aGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATtattat > 8:203302/1‑138 (MQ=255)
aGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGt > 5:457907/1‑140 (MQ=255)
tCCAGATTGGAGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCTACCAATTTGGATTTTCAGGTTTGTCAGCACAATATTGGAGTCAGCCACGCCGCGTAAACCGATATATGTTGACAAATTATTATGTTTCGCAAg > 6:828104/1‑140 (MQ=255)
cAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTATTCGCGACCAATTTGGCTGGTCATGTTTGTCTGAACAATATGGGCCTCAGCCAAGCCGGCTAAAACGATAACTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAATCg > 3:568283/1‑140 (MQ=255)
ttttGGCTTCTCGTTTTAGTGTAACATTTTTGGGCTCTTCGCTACAAATTTGGCTGGTCTTGTTTGTCATAAAAATTTGGGCGCCCGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGAc < 2:474616/138‑1 (MQ=255)
gATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATTGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATATTTCGCAAGCGag > 3:392709/1‑139 (MQ=255)
gATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCg > 7:883215/1‑138 (MQ=255)
gATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGAc > 4:913424/1‑140 (MQ=255)
gATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACAGATATCTATTGAGAAATTATTATTTTTCTCAAGCGAc > 4:578684/1‑140 (MQ=255)
ttGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCATCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGAc > 7:528360/1‑138 (MQ=255)
tGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGAAAGCGCCTgg > 3:972626/1‑140 (MQ=255)
tGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCCGCTCTTCGCGACAAATTTGGCTGGTCAGGGTTGTCAGAACAATATGCGCGTCATCCACGCCGCGAAAACCGAGATATGATGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGAATgg > 1:696337/1‑140 (MQ=255)
gggCGTCTCCGGTTCGGGTAACATTATTCGCCTCTTCGCCACAATTTTGGCTGGGCAGGTTTGTCACAAAAATATGGGCGACCGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTgg < 2:512237/139‑1 (MQ=255)
gCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTATACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTgg > 7:165965/1‑138 (MQ=255)
cgcctcCGTTTAGGTTACCCTTATTCGGCGCTGCGCCACCATTTTGGGTGGTCTGGTGTGTCATAAAAATCTGGCGGCCCCCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGt < 8:940045/135‑1 (MQ=255)
tctcCGGTTAGGGTACCCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCTGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGGAAGCGACTgggtt > 7:808383/1‑135 (MQ=255)
ccGTTTATGTTAACATTATTCGGCACTCAGCTACCAATTTGGCTGGACCGGGTTGACAGAAAAATCGGGCCGTCCGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTc < 4:74463/140‑1 (MQ=255)
ccGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTGTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTTAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGATAAtttg > 4:544869/1‑139 (MQ=255)
gTTATGTTAACCTTATTCTGCTCTTCTCGAAAATTTTGGCTGGTCATGTTTGTCATAACAATATGGGCGACAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCt < 8:792013/138‑1 (MQ=255)
ttgggTACCATTATTCGGGCCTTCGCGACAAATTTGGCTGGTCTTGTTTGTCACAACAATTTGGGGGTCCGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGtt < 4:127752/138‑1 (MQ=255)
gtcaaCCTTATTCGGGTTTGGGCTACATTTTGGGCGGGTCTTGTTTGTAATAAAAATAGGGGCGCCCCCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCgg < 2:110581/137‑1 (MQ=255)
taccattATTCGGCTCTTCGCTACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTg < 4:801139/135‑1 (MQ=255)
agattATTCGGCTCTTCGCCACCAATTTGGGTGGGCCGGTTTGTCATAAAAATATGGCCGGCACCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGAt < 5:790358/137‑1 (MQ=255)
acattATTCGGCTCTTCGCTACAAATTTGGCTGGTCTGGTTTTTCAAAAAAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGAt < 6:803989/137‑1 (MQ=255)
aCCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGAt > 2:994650/1‑140 (MQ=255)
aCCTTATTCGGCGATCCGCGACAATTTTGGGTTTGCTGGTTTGTCATAAAAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTg < 8:954336/138‑1 (MQ=255)
ccTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTTGGTGATg > 5:117460/1‑140 (MQ=255)
ccTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATg > 5:201404/1‑140 (MQ=255)
atttATTCGGCTCTATGCTACCATTTTGGCTGTTCTGTTTTTTATTAAAATTATGGTGGTCTGCCACGCCGTGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATg < 5:78195/138‑1 (MQ=255)
tttATTCGGCTGTGCGCGACCATTTTGTCGGTTCTGGTTTGTCATAAAAATTTGGGCGGCCGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATgg < 6:933689/139‑1 (MQ=255)
tttATGCGGCTCTTCCCAACAAATTTGGCGGGTATGTTTTGTAACAACAATTTGGCCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATgg < 2:449951/139‑1 (MQ=255)
tttATGCGGCTCTCGCCGAAAAATTTGGCGGCTCTGGTTTCTCTCAAAAATCTGGGCGCCTCCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATgg < 5:42816/139‑1 (MQ=255)
attttagggCTCTGGGCCACAAATTTGGGGGGTCTGTTTTGTCATAAAATTTGGGGCGTCCCCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATgg < 6:981048/133‑1 (MQ=255)
ttCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCCGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTa > 5:359292/1‑140 (MQ=255)
ttCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGgtgtt > 2:547183/1‑139 (MQ=255)
ttCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTa > 5:803989/1‑140 (MQ=255)
ttCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTa > 1:788487/1‑140 (MQ=255)
ttCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTa > 2:1068733/1‑140 (MQ=255)
ttCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGAGATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTa > 2:47140/1‑140 (MQ=255)
ttCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGAAATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTa > 5:197287/1‑140 (MQ=255)
cGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGgtgtt > 8:25940/1‑137 (MQ=255)
ctctTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTATACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTggg > 3:1014655/1‑140 (MQ=255)
ctctTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTAGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTggg > 1:682072/1‑140 (MQ=255)
tgtgggcgACTATTTTGGGTGTTCTGTTTTGTAGTAAAATTATGGGCGTCCGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGt < 5:3838/135‑1 (MQ=255)
tctTCGCGACCAATTTGGCTGGTGAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGACCGCCACGCCGGGTAAACCGATATATTTTGTGAAATTATTTTTATTCGCAAGCGACTGGGTATTTAATTGTTCTGTGATGGTTTATTGGGt > 3:667178/1‑140 (MQ=255)
tattgccgACCAATTTGTCGGTTCTGGTTTTTCAGAACAATATGGGCGCCCGCCAAGCAGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGAAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTgg < 8:569726/132‑1 (MQ=255)
cctTCCCTACAAATTGGGCGGGTCTGGTTTTTAAGAAAAATTTGGGCGTCCGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGt < 6:671843/139‑1 (MQ=255)
ctTCGCGCCCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTCAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGGTAAGTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTggg > 8:127443/1‑138 (MQ=255)
ctTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTggg > 8:164497/1‑138 (MQ=255)
ttCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCCCGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGCCTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGAGGGTGTATTGGGTgt > 5:811608/1‑139 (MQ=255)
ttCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGa > 3:723983/1‑140 (MQ=255)
tctcgACCATTTGGGCTGGTCTGTTTTTCCAAAAAATTTGGGGCGTCCCCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAg < 5:183017/137‑1 (MQ=255)
tCGCGACAATTTTGGTTGGGCTGTTTTGTAACAAAATTAGGGGCGTCCGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAg < 2:682072/140‑1 (MQ=255)
cgACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGt > 7:272017/1‑138 (MQ=255)
cgACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGt > 7:900773/1‑138 (MQ=255)
aTTTTGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGAATACa > 1:493489/1‑140 (MQ=255)
aTTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTGAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACa > 5:207439/1‑140 (MQ=255)
gtggggTCCGGTTTGTCCAAACAATATGGGCGTCACCCACGCCGGTTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCa < 4:995559/136‑1 (MQ=255)
ttactgTTTGTAATAAAAATATGGGCGTCCGACACGCAGGGTAAACAGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCTAAAGCGACTGTTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGTGTGAGTTGATTACAGCCAACGAg < 6:978340/135‑1 (MQ=255)
gattttttttTCAAAACATTTTGGGCTTACGCCACGCCGGGTAAAGCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGAGTGGTTAATTTCTTGTTTGGTGATGGTGTTTTGGGTTAGTTGATTACAGCCAACg < 7:805502/132‑1 (MQ=255)
gTCTGGTTTGTCCAAAAAATTTGGGCGCTACACACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAg < 4:1057257/140‑1 (MQ=255)
gTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAg > 2:314160/1‑140 (MQ=255)
gTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATAATGTTTCGCACGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAg > 2:487660/1‑140 (MQ=255)
gTCAGGTTTGTCAGAAAAATAGGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAg < 2:404882/140‑1 (MQ=255)
gTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGTTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGc > 5:2911/1‑140 (MQ=255)
taataaaaaTTTGGGCGTCACCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTg < 1:107158/133‑1 (MQ=255)
taaGAAAAATAGGGGCGCCCGCCACGACGGGTAAACCGATATCTTTTGATAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTg < 6:110196/138‑1 (MQ=255)
tCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTg > 3:885873/1‑140 (MQ=255)
tCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGATAATTTCTTGTTCGGTGAGGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTg > 4:263463/1‑140 (MQ=255)
acacaaaaaTTTGGGCGACCGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTg < 3:249539/133‑1 (MQ=255)
acaaaaaaaTTTGGGCGGCCCCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTg < 1:62877/133‑1 (MQ=255)
ataaaaaTATGGGCGTCCGCAACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGAc < 5:733972/135‑1 (MQ=255)
aaTATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGAt > 8:915227/1‑138 (MQ=255)
tatGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAAt > 6:180088/1‑140 (MQ=255)
tatGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAAt > 5:648171/1‑140 (MQ=255)
tatGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAAt > 5:658891/1‑140 (MQ=255)
tatGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAAt > 2:747213/1‑140 (MQ=255)
tatGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATCACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAAt > 2:767126/1‑140 (MQ=255)
gCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGc < 6:935508/121‑1 (MQ=255)
gCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGc > 5:935508/1‑121 (MQ=255)
gCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGc > 5:368069/1‑140 (MQ=255)
gTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGc < 7:135624/138‑1 (MQ=255)
gTCACCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTTGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTTTATTGGTTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGATGATCAATGCAGCgg < 4:328351/140‑1 (MQ=255)
tCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGc > 3:1020257/1‑140 (MQ=255)
aGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGCCTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGCCGATCAATGAAGCGGCaa > 2:806221/1‑140 (MQ=255)
aGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCaa > 3:512920/1‑140 (MQ=255)
aGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCaa > 6:1027641/1‑140 (MQ=255)
aGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCaa > 1:1071467/1‑140 (MQ=255)
aGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCaa > 1:243531/1‑140 (MQ=255)
|
AGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGGCTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAA > NZ_CP022686/4712626‑4712902
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
