Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A10 F2 I0 R1
|
233 |
6461.8 |
9239822 |
98.3% |
9082745 |
135.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
4,712,763 |
A→C |
13.5% |
A52A (GCT→GCG) |
yceB ← |
lipoprotein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 4,712,763 | 0 | A | C | 13.5%
| 189.4
/ 4.2
| 110 | A52A (GCT→GCG) | yceB | lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (68/21); new base C (2/16); total (70/40) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.78e-07 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
AGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGGCTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAA > NZ_CP022686/4712626‑4712902
|
aGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGGCTACCGAACAGGGAGTTAATGTCCAGATTGGCGTCTACGTGTAGGGTAACCTTATTAGGCTATTAGAGACCAATTTTGCTGGGAAGGTTTGTAAGAACAATATTTGCGTCa > 5:1029905/1‑138 (MQ=255)
ttCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGGCTACCGCACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCGCTTAGCGACCAAATTTGCTGGGCGGTTTTGTAATAAAAAAATTGGCGTAAGCCAc > 7:899507/1‑140 (MQ=255)
tCATTTTCATGGTCGGTTTCTGGATACCGAACTGGGTTTTCATGTCCTGTTTGGCGTCTCCGGTTAGGGAAACCTTATTCGGCTCTTCGCTACCATTTTGGCTGGTCAGTTTTGACACAAAAATATGGGCTTCAGCCa < 6:490644/138‑1 (MQ=255)
cAGTTTCATGGTCGCTTTCTGGCTACCGAACAGGGAGTTCATGTGCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTAGGCTCTTCGCGACCAATTTGGGTGGTCAGGTTTGTAAGAACAATATGGGCGTCCGCCACGc > 8:746910/1‑140 (MQ=255)
gTTTCATGGTCGCTTTCTGGCTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCCGCCACGc > 6:587980/1‑138 (MQ=255)
aTGGTCGCTTTCTGGCTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGAGTATCCGGTTAGGGTAACCATATTCGGCTATTAGCGACCAATTTTGATGGTCAGGTTTGTATGAAAAATATGTGCGTCAGCCCCGCCGGGTaa > 7:711313/1‑140 (MQ=255)
tttCTGGCTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTATCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTGGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGat > 5:915756/1‑138 (MQ=255)
ccGACCACGGAGTTAATCTCCAGATTGGCGTCTCCGGTAAGCGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGCACAATTTTGCTGGTCAGGTTTATCAGCACAATATGCGCGTCAGCCACGCAGGGAAAACCTAAATCATATGAGaa > 2:946344/1‑140 (MQ=255)
cagAACAGTGAGTTAATGTCCAGATTGTCGTCTCAGGTTAGGGTAACCTTATTCTGCTCTTAGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTTTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGCTAAACCGATATCTTTTGACaa > 2:922975/3‑140 (MQ=255)
aGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAattttt > 3:972032/1‑140 (MQ=255)
ggAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGTTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTAAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTAGAGAAATtattat > 7:322407/1‑140 (MQ=255)
gTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGtt > 1:393970/1‑140 (MQ=255)
tCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTc > 1:666728/1‑140 (MQ=255)
aTGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGCCCAATTTGTCTGGTCAGGTTTGTCAGCACAATATGGGCGTCAGCCACGCCCGGTAAACCGATAACATATGAGCAATTATTATGttta > 5:19696/1‑137 (MQ=255)
tGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTAGGCTCTTCGCGCCCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCa > 8:830923/1‑140 (MQ=255)
tacAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCATCGCGACCAATTTGTCTGGTCAGGTGTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACCCCGGGTAAACCGATATCTATTTATAAATTATTATTTTTCGCaaa > 7:143289/3‑139 (MQ=255)
tCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAAATTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCATTTGAGAAATTATTATGTTTCGCTAg > 8:107478/1‑140 (MQ=255)
cAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAg > 6:644639/1‑138 (MQ=255)
cAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTAGCAAGCg > 7:279674/1‑140 (MQ=255)
cAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCAGGGTAAACCGATATCTTTTTAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCg > 7:1058367/1‑140 (MQ=255)
cAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACATTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTACTCAAg > 5:1106957/1‑138 (MQ=255)
gATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAgag > 5:1102669/1‑136 (MQ=255)
gATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATATGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGAc > 2:637069/1‑140 (MQ=255)
aTTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACt > 3:1101936/1‑140 (MQ=255)
gCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTAAGCGACCAAATTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACTCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAACTTATTATGTTTCGGAAGCGACTGGtt > 4:600075/1‑140 (MQ=255)
tctcCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAAGCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTa > 5:910249/1‑138 (MQ=255)
ccGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAAACGATATATTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAATCGACTGGGTAAtttg > 4:573506/1‑139 (MQ=255)
gtaaatcTTATTCGGGACTGCGCCACCATTTTGGCTGGGCAGGTTTGCCATAAAAATTTGGCCGGCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGATTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCgg < 2:1131535/134‑1 (MQ=255)
ggTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTAgg > 3:90576/1‑140 (MQ=255)
ggTAACCTTATTCGGCCTTTCGCGCCCATTTGGGCTGGCCAGGTTTGTCATAACAATATGGGCCGCCCCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCgg < 2:429058/140‑1 (MQ=255)
ggTAACCTTATGTGGCTCGTCGCGACAAATTTGGAGGGTCTGGTTTGTCAGAACAATATGGCCGCCACCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTc < 6:840232/138‑1 (MQ=255)
gTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCTGTACAATATGGGCGTCAGCCCCGCCGGGTACACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGTCTGGTTAATTTCTTGTTCGGt > 2:146782/1‑140 (MQ=255)
gTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGt > 8:414321/1‑140 (MQ=255)
aatcattATTCGGCTCTGCGCCACAAATTTGGCTGGGCTGGTTGGGCACAAAAATCGGGGCGGCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTg < 4:121340/135‑1 (MQ=255)
aCCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGAt > 2:1201460/1‑140 (MQ=255)
ccTTATTCGGCTGTTCGGGCCAAATTTGGCTGGGCTGGTTTGTCAGAAAAATTTGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATg < 4:62876/140‑1 (MQ=255)
ccTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGTTCAGGTTGGTCATAAAAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATg < 2:1071576/140‑1 (MQ=255)
ccTTATTCGGCTCTGCGCCACAAATTTGGCTGGTCAGGTTTGCCCGAAAATTATGGGCGTCCGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATg < 4:715842/140‑1 (MQ=255)
attttttCGGGTCTTCGGGACCATTTGGGGTGGTGTTGTTTGTCTTAAAACTTTGGGCGTCCGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGa < 5:1108210/133‑1 (MQ=255)
attttttCGGCTTTTCGCTAAAAATTTGGCTGGTCTGGTTTGAAAAAAAAATATGGGCTCCACCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATg < 2:843972/135‑1 (MQ=255)
acTTATTCGTATCTTCGCCAACAATTTGGGTTGTCAGGTTGGTCAAAAAAATTTGTGCTGCACCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATg < 7:531917/139‑1 (MQ=255)
tttATTCGGTTCTTCGCGACCTTTTTGGGTGGTCTGGTTTGTCAGAAAATTTTGGGCGCCACCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTCTTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGAt < 5:347550/137‑1 (MQ=255)
cTTTTTCGGCTCTTCGCGAACATTTTGGCTGGTATGGTTTGGCAAAAAAAATTGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATgg < 8:67063/140‑1 (MQ=255)
cTTATGCGGCGATTCGCGACCAATTTGGGTGGTCTGGTTTGTCAGAAAAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATgg < 2:852522/140‑1 (MQ=255)
attATTCGGCTGAGCGCTACAAATTTGGCGGGGCTGGTTTGTAACAAAAATTGGGGCGCCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGAt < 6:1092911/137‑1 (MQ=255)
tttCTGCTCTGCGCACCCATTTTGGGTGGTCTGTGTTTTCACAAAAATTGGGGGGCCTCCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGgt < 5:1057633/137‑1 (MQ=255)
ttCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGgggtt > 1:96975/1‑139 (MQ=255)
ttCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTa > 1:624454/1‑140 (MQ=255)
ttCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTa > 2:850233/1‑140 (MQ=255)
tCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTAt > 4:93397/1‑140 (MQ=255)
gctgCTCTTCGCTCCCAATTTGGCTGGGCTGTTTTGTCAGAAAAATATGGGCGTCACCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGgtgt < 6:1039598/135‑1 (MQ=255)
cGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTa > 6:507636/1‑138 (MQ=255)
cGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTa > 6:65029/1‑138 (MQ=255)
gCTCTTCGCGACAAATTTGGCTGGTCTGGTTTGTCATAAAAATTTGGGCGCCCGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTAtt < 6:732205/138‑1 (MQ=255)
ctctTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGgtgctgtcta > 7:547061/1‑133 (MQ=255)
ctctTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTggg > 1:546254/1‑140 (MQ=255)
ctctTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTggg > 2:598695/1‑140 (MQ=255)
ctctTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTggg > 1:546649/1‑140 (MQ=255)
atctTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCTCAACCGTCGGGTTATTTTCTGTTTCGTTGATGTTGTTTTggg > 2:727684/2‑140 (MQ=255)
tctTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGt > 4:468915/1‑140 (MQ=255)
tctTCGCCACAAATTGGGCGGGGCCGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCCGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGt < 8:797468/140‑1 (MQ=255)
ctTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTggg > 5:854167/1‑138 (MQ=255)
ctTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTggg > 5:732205/1‑138 (MQ=255)
ctTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTggg > 5:278798/1‑138 (MQ=255)
ttCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGa > 7:237715/1‑140 (MQ=255)
ttGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACa > 6:1140472/1‑138 (MQ=255)
gtaagttttGTCATAAATATAGGGGCGTCCCCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAg < 8:124341/134‑1 (MQ=255)
gtaaGGTTGCTCATAACATTATGGCCGCATTCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAg < 8:117436/137‑1 (MQ=255)
gTCAGGTGTGACAAAAAAATTGGGGCGTCCGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACg < 5:955261/138‑1 (MQ=255)
cAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAg > 5:681502/1‑138 (MQ=255)
cAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAg > 5:337542/1‑138 (MQ=255)
cAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAg > 5:177079/1‑138 (MQ=255)
gttgtgtaGAAAAATTTGGGCGGCCCCCTCGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGAGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGGGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGc < 1:765190/133‑1 (MQ=255)
tCATAAAAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGCTTACAGCCAACGAGCAGGCCACTg < 3:871932/140‑1 (MQ=255)
caaGAACAATAGGGGCGTCCCCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCAc < 6:854167/136‑1 (MQ=255)
aatttctGGGCGCCCCCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTTAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACg < 5:330351/132‑1 (MQ=255)
aaattgtGGGCGCCCCCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGAt < 7:227737/134‑1 (MQ=255)
aCAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTAATATGTATCGCAAGCGACTGGTTAATTTCGTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCCACGCGCAGGCCACTgcag > 6:422506/1‑135 (MQ=255)
tatGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAAt > 1:46120/1‑140 (MQ=255)
tatGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAAt > 3:364551/1‑140 (MQ=255)
tatGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAAt > 4:1019043/1‑140 (MQ=255)
tatGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAAt > 4:461824/1‑140 (MQ=255)
tGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAAt > 6:1059705/1‑138 (MQ=255)
tGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAAt > 5:326278/1‑138 (MQ=255)
ggggGTCATCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGATAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTTTTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGTTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATg < 6:11234/138‑1 (MQ=255)
gggCCTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATg < 6:11235/138‑1 (MQ=255)
gCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGc > 3:594531/1‑140 (MQ=255)
gTCTGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCgg < 4:246986/140‑1 (MQ=255)
gTCCGCCACTCCGGGCAAACCGATATCTCTTGAGAAATTATTATGTTTCGCACGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGc < 6:542401/138‑1 (MQ=255)
gTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGc < 6:566437/138‑1 (MQ=255)
gTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCgg < 8:828169/140‑1 (MQ=255)
tCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGc > 2:180383/1‑140 (MQ=255)
tCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGc > 4:1152723/1‑140 (MQ=255)
tCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGc > 7:25727/1‑140 (MQ=255)
tCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGAGCAATGCAGCGGc > 3:297240/1‑140 (MQ=255)
tCAGCCACGCCGGGTAAACCGAGATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGc > 4:24367/1‑140 (MQ=255)
aGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCACCGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGc > 6:1104481/1‑138 (MQ=255)
aGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGCCGATCAATGCAGCGGCaa > 4:883535/1‑140 (MQ=255)
aGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGc > 6:280899/1‑138 (MQ=255)
aGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTAGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGATTTGATTACAGCCAACGAGAAGGCCACTGCCGATCAATGCAGCGGc > 6:854801/1‑138 (MQ=255)
|
AGCTTCAGTTTCATGGTCGCTTTCTGGCTACCGAACAGGGAGTTCATGTCCAGATTGGCGTCTCCGGTTAGGGTAACCTTATTCGGCTCTTCGCGACCAATTTGGCTGGTCAGGTTTGTCAGAACAATATGGGCGTCAGCCACGCCGGGTAAACCGATATCTTTTGAGAAATTATTATGTTTCGCAAGCGACTGGTTAATTTCTTGTTCGGTGATGGTGTATTGGGTGAGTTGATTACAGCCAACGAGCAGGCCACTGACGATCAATGCAGCGGCAA > NZ_CP022686/4712626‑4712902
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
