Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A26 F12 I0 R1
|
131 |
9881.0 |
7547414 |
98.3% |
7419107 |
134.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NZ_CP022686 |
2,148,122 |
T→G |
15.1% |
S128R (AGT→AGG) |
panF → |
sodium/pantothenate symporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NZ_CP022686 | 2,148,122 | 0 | T | G | 15.1%
| 269.8
/ 10.2
| 160 | S128R (AGT→AGG) | panF | sodium/pantothenate symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (45/86); new base G (22/6); total (68/92) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.13e-05 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 166 total aligned reads displayed.
TGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGTATACC > NZ_CP022686/2147993‑2148257
|
tGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCGGGTGTGGGGGGCgagtttgagttt > 7:278579/1‑138 (MQ=255)
aggcTGGCTTGCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCt < 8:478177/135‑1 (MQ=255)
tGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTGTGGTGTGGGTGGCGAGTTTTAGTTTGGTGGtt > 1:118286/1‑138 (MQ=255)
tGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTATGGTGTGGCTGGCGAGATTGAGTTTTCTGGTTGc > 4:553434/1‑140 (MQ=255)
ggCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTg < 7:221050/138‑1 (MQ=255)
ggCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcg < 3:829646/140‑1 (MQ=255)
gCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGGGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGCTTCGTGTTCTGTTGTGGGTGGCTGGTTTGAGGTTggtgggtgg > 7:852172/1‑137 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGTCTAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGATACAATTCGTTGACGCTGAACGATATTCTGGTTGACCTCTACCAGAGTCGGCTTATGGTGTGTCTGGCGAGTGTGAGTTTGCTGGTGTcgttcg < 8:260443/138‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGTCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGGCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGATGGCGAGTTTGAGTGTGCTGGTTGcgttcg < 1:627000/138‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCTGTGACGCTGATCGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGGCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcg < 5:295591/138‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcg < 1:23313/138‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcg < 5:190195/138‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcg < 5:631884/138‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcg < 6:329009/138‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcg < 2:964901/138‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcg < 7:594218/138‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcg < 1:859821/138‑1 (MQ=255)
cGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTATGGTGTGGCTGGGGTGTTTGATTTTTGTGGTTggggtgg > 2:23313/1‑132 (MQ=255)
cTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGcgttcgtt < 7:6802/138‑1 (MQ=255)
tCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGCACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGGCGTCGTATGGGTTGGCGGGCGAGGTTGACTTTGCTGGTTGcgttaggtg > 6:515679/1‑133 (MQ=255)
tCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTGCGGGGGTTGCTGGGGTGGTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTg > 2:499154/1‑138 (MQ=255)
ggTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTGCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGt < 7:420701/138‑1 (MQ=255)
ggTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGGCTGGGGTGGCTGGCGTGGTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTgg > 4:929658/1‑139 (MQ=255)
ggTAATCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGt < 7:420700/138‑1 (MQ=255)
tcttCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACACTGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGa < 4:110541/138‑1 (MQ=255)
taaagaagTTCGCAATTCTTGCGCTCCTCTACAATGCGTTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCTCTAACAGAGTCGTCTTCTGTTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTGCGTTTGTTCGATGACCg < 1:330541/136‑1 (MQ=255)
gCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGGTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCg < 1:354742/138‑1 (MQ=255)
cAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGt < 1:739855/138‑1 (MQ=255)
aagaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGTGGTGTGGCGGGCGAGTTTGAGTTTTGTGGTTGCGTTAGTTGGTGCGATGCCCGTggt > 4:426242/1‑138 (MQ=255)
gaagTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGTGGTTGGGGTGGCGAGTTTGAGTTTTGTGGTTGCGGTGGTTGGTGGGGTGGCCGGGcc > 2:204492/1‑137 (MQ=255)
gCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATc < 2:705508/138‑1 (MQ=255)
gCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATc < 6:682259/138‑1 (MQ=255)
cAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTCTGGTGTGGCGGGCGAGTTTTAGTTTTCTGGGTGGGGTCGGTGGTGGGGTTGCCGGGGAGTTTTTcg > 6:39499/1‑138 (MQ=255)
tCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATcggcgg < 1:392301/138‑1 (MQ=255)
cTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTCTGGTGTGGCGGGGGCGTTTGAGGTTGGGGGGTGGGGTGGTTGGGGCGATGACCGGGCAGGTTATAGGCGGTGCGCGCctgcg > 1:906050/1‑137 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcgcg < 3:436619/140‑1 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcg < 8:6292/138‑1 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcg < 7:108667/138‑1 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTGGGGTGTGGGTGGGGAGTTTGAGGTTGCTGGTTGGGTTCGTTGGGGCGATGCCCGTGGAGTTTATAGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcgcg > 3:43555/1‑140 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCTGGTGTGGCGGGGGAGTTTGTGTTTTGTGGGTGGGGTGGTTGGGGGGATGACCGGGGAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGTAACcgcg > 4:544350/1‑140 (MQ=255)
cGGTGACGCTGAAAGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTGCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACcg < 2:180833/138‑1 (MQ=255)
gTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTGTGGGGTGGGTGGCGGGGTTGAGTTTGGTGGTTGCGTTGGTTGTTGCGATGACCGGGCAGTTTTTGGGCGGTGCGCGCCTGCTGGCAACcccg > 6:748881/1‑138 (MQ=255)
gTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTCTGGTGTGGCTGGGGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGGGTTCGTTGGTGCGTTGACCGGGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCGGCAGGAAAACgcggc > 3:697062/1‑140 (MQ=255)
gTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTCGGGTGTGGCGGGCGAGTTTGTGGTTTCGGGGTGCGGTCGTTGGGGCCATGACCGTGGAGTTTATAGGCGGTGCGCGCCGGCGGGAAACcggg > 8:594151/1‑136 (MQ=255)
gTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGGGTGGCTGGGGGGGTTGATTTTTGTGGTTGCGGTCGTTGGGGGGCTGGCCGTTCAGTTTATAGGCGGTGCGCGCCTGCTGGGAACcgcc > 2:952658/1‑137 (MQ=255)
gTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCGGGTGTGGCTGGCGCGGGTGAGGTTGGGGGTTGCGGTCGGTGGGGGGCAGACCGGGCTGATTAACGGGGGGGCGCGCCGGCGGGTGACcgcg > 6:520676/1‑138 (MQ=255)
gTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTGTGGTGGGGCTGGGGTGTTTGGGTTTTTGGGTTGGGTTGGTTGGTTCGGTGGCCGGTCAGGTTTTAGGCGGTGGGCGGCTGCTGGAAAAcgcg > 8:278420/1‑138 (MQ=255)
gTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCTGGGGTGGGGGGCGAGGTTGAGTTTTCTGGTTGGGGTGGTTGGTGAGATGACCGGGCCGGTTATCTGCGGTGGTCCCCGGCTGGaacacccg > 6:290064/1‑132 (MQ=255)
gTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTATGGGGTGGCTGGCGAGGTTGAGTTTTCGGGGTGCGTTGGTTGGTGCGATGGCCGTGGATTTTATAGGGGGTGCGCCCCTGCTTGaaaaacgg > 8:289045/1‑133 (MQ=255)
aCGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTGTGGTGTGGGGGGCGAGGTTGGGTTTGCTGGTTGGGTTGGTTGGTGGGGTGGCCGGGCCGGTTTTAGGGGGGGCGCGCCGGCAGGTAACCGCGGCggg > 4:912787/1‑140 (MQ=255)
aCGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTGTGGTGTGGGTTGGGTCGTTGATTTTTGTGGGTGAGGTGGTTTGGGGGTTGACCGTGCAGTTTTTAGGCGGTGCGCGCCGGCTGGAAACCccggcg > 6:203950/1‑138 (MQ=255)
aCGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTCTGGTGTGGCTGGGGAGTTTGAGTTTGGTGGTTGGGTTCGTTGGTGGGATGACCCGGCAGTTTATAGGCGGTGCGCGCCAGCTTGAAAACgcggcg > 8:786630/1‑138 (MQ=255)
cGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGt < 4:334251/140‑1 (MQ=255)
ccTGAACGATAGGCTGTTTGCACGCTACCAGAGTCGTCTGCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTGGCTGGGTGCGTGCGGGGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCggg < 5:78177/137‑1 (MQ=255)
cGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGGGGGGTGGGGGGGGGGTTTTAGTTTGGTGGGTGGGGTGGGTGGGGGGAGGGCCGGGCAGTTTTTAGGGGGGGCGCGCCGGCGGGAAACCGCGGCggggtttac > 5:466350/1‑132 (MQ=255)
tatGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGGTGTGGTTTGGCTGGGGAGGTTGAGTTTGCTGGGTGGGTTGCGTGGGGCGATTGCCGGGCAGTTTATCGGGGGGGCGCGCCGGCTTGTAACCCCCGCGGGGTTTCCTTAtt > 4:134553/1‑139 (MQ=255)
gCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTGTTCTGGTGTGGCTGGCGAGGTTGAGTTTGGTGGTTGGGTTAGGTGGTGCGATGACCGGGCAGTTTATCGGCGGGGCGCGCCGGGTGGAAACCGCGGCGGGGTTTACGTATGa > 6:170527/1‑138 (MQ=255)
ttGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCg < 6:596718/138‑1 (MQ=255)
ttGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTGTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTTGTGGTTGCGTTAGGTGGTGCGCTGACCGGGGAGTTTATAGGCGGTGCGCGCCTGCAGGAAACCGCGGCGGGGTTTGCTTATTAAAACggg > 4:68364/1‑140 (MQ=255)
ttGCCCGCTACCAGAGTCGGCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCggg < 4:793429/140‑1 (MQ=255)
tGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTGTGGTGTGGGTGGCGAGTTTTAGTTTGGGGGTTGGGTTCGTTGGTGGGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCAGCTGGAAACCGCGGCGGGGATTCCTTATGAAAACgg > 2:884750/1‑138 (MQ=255)
tGCCCGCTACCAGAGTCGTCGTGTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTTGGTTATGTTGTGCGATGACCGGGAGGTTTTAAGGCGGTTCTCGCCTGCTGGAAACACAGGCGGGTTTTCAATATTaaaactt > 2:263504/1‑134 (MQ=255)
ccGCTACCAGAGTCGTCGTCTGGGGTGGGTGGGGAGGTTGAGTTTGCTGGTTGCGGTCGGTTGTGCGATGACCGTGGAGTTTATCTGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGGGGGGATTACTGTTTAAACCGGgct > 8:330026/1‑138 (MQ=255)
cAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGGGCGATGACCGTGCAGTTTCTCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGAtt < 7:153797/138‑1 (MQ=255)
tcgtcTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCgg < 2:504063/138‑1 (MQ=255)
cgtcTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGt < 7:103468/138‑1 (MQ=255)
cgtcTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGGTGGTGCGAGGACCGAGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTAt < 3:540657/140‑1 (MQ=255)
cgtcTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGGTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTAt < 4:848231/140‑1 (MQ=255)
cggcttctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGGTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGt < 1:523738/135‑1 (MQ=255)
gtcTTGTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGTGTTTTGTGGTTTGGGTCGGTGGTGCGCTGACCCTGCCGTTTATAGGCGGTGCGCGCCAGAGGGAAACCCCGGCGGGTATTGCTTATGAAACCCCGCTGGAGATTTTAgggt > 2:127166/1‑136 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCTGTTTATCGGCGGTTCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTTTTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAg < 2:451131/138‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAg < 7:853314/138‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAg < 5:514848/138‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGGTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 3:248074/140‑1 (MQ=255)
tctGGTGTGGCTGGCGAGGTTGAGTTTGCTGGTGGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 4:775973/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 8:434614/138‑1 (MQ=255)
tGGGGTGGCTGGCGAGTTTGAGGTTGCTGGGTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 2:351796/138‑1 (MQ=255)
gggTGTGGCTGGCGAGGTTGAGGTTGCTGGTGGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCa < 2:750609/137‑1 (MQ=255)
gtgtGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGATACCGGGCAGCTGATTTTCGGTATCAGCAATGc > 3:371951/1‑140 (MQ=255)
gtgtGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGc > 4:433143/1‑140 (MQ=255)
tgtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTg < 5:87235/138‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGGTGGTGCGATGACCTTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTg < 1:564137/138‑1 (MQ=255)
tgtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGATGGTTGCGTTCGTTGGTGAGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTg < 2:597727/138‑1 (MQ=255)
ggtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCTGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTg < 8:188602/137‑1 (MQ=255)
ggtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTg < 2:940660/137‑1 (MQ=255)
gtgGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGGTGGTTCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGc < 7:345283/138‑1 (MQ=255)
gtgGCGGGCGAGTTTGAGCTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGc < 2:486993/138‑1 (MQ=255)
tggctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGtt > 4:843263/1‑140 (MQ=255)
tggctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGtt < 3:912787/140‑1 (MQ=255)
tggctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGtt > 4:455686/1‑140 (MQ=255)
ggctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGt > 8:553717/1‑138 (MQ=255)
gctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGTTGCGATGACCGTGCAGTTTATCTGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCAttaagtt > 6:864269/1‑133 (MQ=255)
gctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGtt > 8:350178/1‑138 (MQ=255)
gctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGt > 3:126217/1‑140 (MQ=255)
gctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGACTGCTGGAAACCGCGGCGTGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGtt > 6:395429/1‑138 (MQ=255)
gctggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGATTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTATCGGTATCAGCATTGCGtt > 8:703495/1‑138 (MQ=255)
tggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAATCCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGt > 6:740938/1‑138 (MQ=255)
tggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGATCGATGACCTTGAAGTTTATCGGCGATGCGCGCCTGCTGGAAAAATAGGAGTGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGAATTTCGTTATAAGCATTGCGTTGt > 7:736787/1‑138 (MQ=255)
gggcGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGt < 1:693759/137‑1 (MQ=255)
agtttgagtttgCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGTATAcc > 7:78614/1‑138 (MQ=255)
|
TGCAGTCTGGCTTTCGCTCGGTATTCTCGGCAAGAAGTTCGCAATTCTTGCGCGCCGCTACAATGCGGTGACGCTGAACGATATGCTGTTTGCCCGCTACCAGAGTCGTCTTCTGGTGTGGCTGGCGAGTTTGAGTTTGCTGGTTGCGTTCGTTGGTGCGATGACCGTGCAGTTTATCGGCGGTGCGCGCCTGCTGGAAACCGCGGCGGGTATTCCTTATGAAACCGGGCTGCTGATTTTCGGTATCAGCATTGCGTTGTATACC > NZ_CP022686/2147993‑2148257
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
