Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F309 I0 R1
|
1697 |
197.2 |
6627756 |
95.7% |
6342762 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
253,855 |
G→T |
89.1% |
R281L (CGT→CTT) |
frsA → |
fermentation‑respiration switch protein; PTS Enzyme IIA(Glc)‑binding protein; pNP‑butyrate esterase activity |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 253,855 | 0 | G | T | 89.1%
| 480.6
/ 58.3
| 192 | R281L (CGT→CTT) | frsA | fermentation‑respiration switch protein; PTS Enzyme IIA(Glc)‑binding protein; pNP‑butyrate esterase activity |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (6/15); new base T (101/70); total (107/85) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.01e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.39e-01 |
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
GGTGGGCTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCGTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGGGGATGCATGA > CP009273/253709‑253999
|
ggTGGGCTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCGt < 1:67768/148‑1 (MQ=255)
gTGGGCTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTc > 1:3087648/1‑148 (MQ=255)
gTGGGCTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTc < 2:355401/148‑1 (MQ=255)
gTGGGCTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTc < 2:355046/148‑1 (MQ=255)
gCTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGc < 2:2570836/148‑1 (MQ=255)
ttttCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGGCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCAt > 1:1708974/1‑148 (MQ=255)
tttCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATa > 2:1715578/1‑148 (MQ=255)
ttcttcAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATAc > 2:906169/1‑148 (MQ=255)
cttcAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCt > 2:811938/1‑148 (MQ=255)
cttcAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCt > 2:2470286/1‑148 (MQ=255)
tcAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTg > 1:101310/1‑148 (MQ=255)
tcAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTg > 2:3200399/1‑148 (MQ=255)
tcAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTg > 2:3200507/1‑148 (MQ=255)
cAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGa < 2:436068/148‑1 (MQ=255)
cAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGa > 1:1063917/1‑148 (MQ=255)
cAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGa > 1:2632590/1‑148 (MQ=255)
aaTGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTGTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATc > 2:2600501/1‑148 (MQ=255)
aTGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATcg > 2:1729755/1‑148 (MQ=255)
gAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCGTCTGGCATACCTTGAATcgccg < 1:956295/148‑1 (MQ=255)
aaGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCGTCTGGCATACCTTGAATcgccgc > 2:940798/1‑148 (MQ=255)
aaGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCGTCTGGCATACCTTGAATcgccgc > 2:941645/1‑148 (MQ=255)
gCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGt > 1:1118681/1‑148 (MQ=255)
aGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGc > 1:426601/1‑148 (MQ=255)
ggACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCg > 2:3051356/1‑148 (MQ=255)
ggACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCg > 2:1514035/1‑148 (MQ=255)
gACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCgg > 1:1358021/1‑148 (MQ=255)
cTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGtt < 2:2704675/148‑1 (MQ=255)
cAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGcc > 1:3271866/1‑148 (MQ=255)
ccTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGt < 2:319507/148‑1 (MQ=255)
ccTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGt > 1:595690/1‑148 (MQ=255)
cTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTc < 1:2569675/148‑1 (MQ=255)
cTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTc < 2:1003716/148‑1 (MQ=255)
gTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCtt > 1:1028501/1‑148 (MQ=255)
gTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCtt > 1:1721684/1‑148 (MQ=255)
gTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCtt > 1:3150182/1‑148 (MQ=255)
ttGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTg < 1:2482141/148‑1 (MQ=255)
gCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGt < 2:2367191/148‑1 (MQ=255)
cATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTc < 2:2254044/148‑1 (MQ=255)
cATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTc < 2:909146/148‑1 (MQ=255)
tCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCg > 1:967967/1‑148 (MQ=255)
cGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGtt < 1:2608072/148‑1 (MQ=255)
cgtAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCAt < 1:3122207/146‑1 (MQ=255)
ttAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATa < 2:3152064/148‑1 (MQ=255)
aaaGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATAcc > 1:471081/1‑148 (MQ=255)
aaGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATAccc < 1:2355549/148‑1 (MQ=255)
aaGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCGTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATAccc > 2:2474260/1‑148 (MQ=255)
aGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCt < 1:1852394/148‑1 (MQ=255)
ggCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTg > 2:2970299/1‑148 (MQ=255)
ggCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTg > 1:3166103/1‑148 (MQ=255)
gcgcTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGt > 2:1448930/1‑148 (MQ=255)
cTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGa > 2:2818512/1‑148 (MQ=255)
cTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGa > 2:63866/1‑148 (MQ=255)
gCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGt < 2:663101/148‑1 (MQ=255)
tAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGAt < 2:1682029/148‑1 (MQ=255)
tAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGAt < 2:194096/148‑1 (MQ=255)
tAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGAt > 2:1790929/1‑148 (MQ=255)
aCGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGAttt > 2:382197/1‑148 (MQ=255)
tACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTaa < 1:2440039/148‑1 (MQ=255)
tACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTaa > 2:1454478/1‑148 (MQ=255)
tACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTaa < 1:210448/148‑1 (MQ=255)
aCCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAg < 2:2365161/148‑1 (MQ=255)
aCCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCGTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAg < 1:1862475/148‑1 (MQ=255)
ccGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGt < 1:1986244/148‑1 (MQ=255)
cGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTg > 1:65306/1‑148 (MQ=255)
cGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCGTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTg < 2:1947892/148‑1 (MQ=255)
tgggtggATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGcc < 1:2292945/148‑1 (MQ=255)
ggATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCGTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCaa < 1:846087/148‑1 (MQ=255)
gATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAAc < 1:3279515/148‑1 (MQ=255)
gATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCGTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAAc < 1:2417962/148‑1 (MQ=255)
aTCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACa > 1:1295949/1‑148 (MQ=255)
aTCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTCGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACa > 1:1322756/1‑148 (MQ=255)
cacaCTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAgg > 2:1356526/1‑148 (MQ=255)
cacaCTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCGTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAgg < 2:2013984/148‑1 (MQ=255)
acacTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGt > 2:2509373/1‑148 (MQ=255)
cacTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTg > 1:3085364/1‑148 (MQ=255)
acTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGc > 1:1783299/1‑148 (MQ=255)
acTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGc > 1:1780386/1‑148 (MQ=255)
tcgcgtcgcgGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCg > 1:731446/1‑148 (MQ=255)
tcgcgtcgcgGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCg > 2:335395/1‑148 (MQ=255)
cgtcgcgGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGaa < 2:2118347/148‑1 (MQ=255)
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GGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACA > SRR19973070.1304969/1‑150 (MQ=60)
GGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTCGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACA > SRR19973070.1331900/1‑150 (MQ=60)
GGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCGTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACA < SRR19973070.851863/150‑1 (MQ=60)
GATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAG < SRR19973070.3300585/150‑1 (MQ=60)
GATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCGTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAG < SRR19973070.2433874/150‑1 (MQ=60)
ATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGG < SRR19973070.938332/150‑1 (MQ=60)
CACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTG > SRR19973070.3105206/1‑150 (MQ=60)
CACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTG > SRR19973070.3105231/1‑150 (MQ=60)
ACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGC > SRR19973070.1792709/1‑150 (MQ=60)
ACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGC > SRR19973070.1795635/1‑150 (MQ=60)
CACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCC > SRR19973070.2943813/1‑150 (MQ=60)
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GCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTAT < SRR19973070.1310600/150‑1 (MQ=60)
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CCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGGGGATGCATG > SRR19973070.2256366/1‑150 (MQ=60)
CCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGGGGATGCATG > SRR19973070.1374527/1‑150 (MQ=60)
CCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGGGGATGCATG > SRR19973070.2486519/1‑150 (MQ=60)
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CGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGGGGATGCATGA > SRR19973070.455644/1‑150 (MQ=60)
CGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTGTGGGGATGCATGA > SRR19973070.454057/1‑150 (MQ=60)
GTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGGGGATGCATGAT > SRR19973070.3259664/1‑150 (MQ=60)
TGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGGGGATGCATGATG < SRR19973070.2925445/150‑1 (MQ=60)
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CGGTGGGCTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCGTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGGGGATGCATGATG > CP009273/253708‑254001
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |