Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F434 I0 R1
|
1130 |
215.9 |
7031662 |
97.1% |
6827743 |
147.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
freq |
annotation |
gene |
description |
| RA |
CP009273 |
253,855 |
G→T |
100% |
R281L (CGT→CTT) |
frsA → |
fermentation‑respiration switch protein; PTS Enzyme IIA(Glc)‑binding protein; pNP‑butyrate esterase activity |
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | CP009273 | 253,855 | 0 | G | T | 100.0%
| 644.4
/ NA
| 195 | R281L (CGT→CTT) | frsA | fermentation‑respiration switch protein; PTS Enzyme IIA(Glc)‑binding protein; pNP‑butyrate esterase activity |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (75/120); total (75/120) |
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. |
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. |
Only 100 of 195 total aligned reads displayed.
TGGGCTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCGTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGGGGATGCATGA > CP009273/253711‑253999
|
gggCTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTg > 1:3346701/1‑148 (MQ=255)
ttcttcAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATAc > 2:791807/1‑148 (MQ=255)
ttcttcAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATAc > 2:1253363/1‑148 (MQ=255)
cttcAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCt > 1:1745170/1‑148 (MQ=255)
tcAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTg > 1:182655/1‑148 (MQ=255)
tcAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTg < 1:3009125/148‑1 (MQ=255)
cAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCTGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGa < 2:1744246/148‑1 (MQ=255)
cAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGa < 2:2474694/148‑1 (MQ=255)
aaaTGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAAt < 1:1938496/148‑1 (MQ=255)
aaaTGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAAt < 2:2187186/148‑1 (MQ=255)
aaaTGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAAt < 2:3067947/148‑1 (MQ=255)
ggAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATcgcc > 1:1533207/1‑148 (MQ=255)
gCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGt < 1:2316844/148‑1 (MQ=255)
gCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGt < 1:2316794/148‑1 (MQ=255)
tCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCt < 1:3396044/148‑1 (MQ=255)
ccAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGaaa < 1:560575/148‑1 (MQ=255)
aGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGc > 2:3481559/1‑148 (MQ=255)
ggACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCg > 1:2731986/1‑148 (MQ=255)
gACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCgg > 1:3088519/1‑148 (MQ=255)
gACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCgg > 1:2044515/1‑148 (MQ=255)
aCTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGt > 1:1288357/1‑148 (MQ=255)
aCTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGt < 1:1960397/148‑1 (MQ=255)
aCTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGt > 1:1075641/1‑148 (MQ=255)
aCTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGt > 1:2678150/1‑148 (MQ=255)
tCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTg < 2:1990649/148‑1 (MQ=255)
ccAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGc < 2:1967535/148‑1 (MQ=255)
aGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCt > 2:3392002/1‑148 (MQ=255)
aGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCt > 2:2075375/1‑148 (MQ=255)
gCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTg > 1:2365274/1‑148 (MQ=255)
ccTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTGGCCTGt > 2:2463772/1‑148 (MQ=255)
cTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTc < 2:1446512/148‑1 (MQ=255)
tGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCt < 1:2727679/148‑1 (MQ=255)
gTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCtt < 1:993772/148‑1 (MQ=255)
ttGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTg > 1:766240/1‑148 (MQ=255)
ttGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTg < 2:1917933/148‑1 (MQ=255)
aTCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTcc > 1:1844899/1‑148 (MQ=255)
tCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCg < 1:156347/148‑1 (MQ=255)
cACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAg > 1:1729261/1‑148 (MQ=255)
gTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTc < 1:2465144/148‑1 (MQ=255)
tCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCa < 1:210138/148‑1 (MQ=255)
ttAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATa < 1:364769/148‑1 (MQ=255)
tAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATAc < 1:2869360/148‑1 (MQ=255)
ggCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTg < 1:898273/148‑1 (MQ=255)
ggCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTg < 1:1471624/148‑1 (MQ=255)
ggCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTg < 2:703064/148‑1 (MQ=255)
ggCGCTGCCGAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTg < 2:421079/148‑1 (MQ=255)
gcgcTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGt > 1:481436/1‑148 (MQ=255)
gcgcTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGt < 1:2997723/148‑1 (MQ=255)
gcgcTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGt < 1:1736447/148‑1 (MQ=255)
cgcTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGtt < 1:1670249/148‑1 (MQ=255)
cgcTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCAGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGtt < 1:2391314/148‑1 (MQ=255)
gcTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTg < 1:1453299/148‑1 (MQ=255)
cTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGa < 1:1045943/148‑1 (MQ=255)
cTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGa < 2:1347086/148‑1 (MQ=255)
cTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGa < 1:1046355/148‑1 (MQ=255)
ccTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTg < 2:2210728/148‑1 (MQ=255)
ccTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTg > 2:2604667/1‑148 (MQ=255)
aaCGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGAtt < 2:683145/148‑1 (MQ=255)
aCGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGAttt > 2:2935682/1‑148 (MQ=255)
gTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTa < 2:1637121/148‑1 (MQ=255)
cGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTg > 2:2434068/1‑148 (MQ=255)
gtgggtggATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGc < 1:3238283/148‑1 (MQ=255)
tgggtggATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGcc < 2:1462527/148‑1 (MQ=255)
tggATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCa < 1:1673200/148‑1 (MQ=255)
aTCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCGGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACa > 2:888501/1‑148 (MQ=255)
cacaCTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAgg < 1:47512/148‑1 (MQ=255)
cacTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTg < 2:2688815/148‑1 (MQ=255)
cacTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTg < 2:934191/148‑1 (MQ=255)
cacTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTg < 2:1832313/148‑1 (MQ=255)
acTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGc < 2:2365274/148‑1 (MQ=255)
cTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGcc > 2:272624/1‑148 (MQ=255)
cgcgtcgcgGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCgg > 2:1204794/1‑148 (MQ=255)
gtcgcgGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGaaa < 1:1692522/148‑1 (MQ=255)
tcgcgGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAAt > 1:889125/1‑148 (MQ=255)
cgcgGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATg > 2:2333021/1‑148 (MQ=255)
ggCCTTTGGTTTCCGGTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTAt < 2:2820500/148‑1 (MQ=255)
gCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATc < 2:576172/148‑1 (MQ=255)
ccTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCt < 2:1254828/148‑1 (MQ=255)
tttGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTg < 1:3368444/148‑1 (MQ=255)
tGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGAc > 1:2504678/1‑148 (MQ=255)
ggTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACg < 1:1939066/148‑1 (MQ=255)
ggTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACg < 1:979141/148‑1 (MQ=255)
ggTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACg < 1:1208859/148‑1 (MQ=255)
tttCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGtt < 2:1464152/148‑1 (MQ=255)
ttCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTc < 2:2452590/148‑1 (MQ=255)
ttCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTATGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAACTGTATCTTGACGTTc > 2:226272/1‑148 (MQ=255)
tCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCt > 2:1346053/1‑148 (MQ=255)
tCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCt > 2:2854866/1‑148 (MQ=255)
tCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCt > 2:1810277/1‑148 (MQ=255)
cGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTgg < 1:1384704/148‑1 (MQ=255)
gcgcTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGACTCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCg < 2:2706891/148‑1 (MQ=255)
gcgcTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCg < 2:1533207/148‑1 (MQ=255)
cTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGttt > 1:2527955/1‑148 (MQ=255)
cTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGttt < 1:2036395/148‑1 (MQ=255)
cTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGttt < 1:2036351/148‑1 (MQ=255)
cTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGttt < 2:1723120/148‑1 (MQ=255)
cGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTgggg < 1:1191279/148‑1 (MQ=255)
cGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTgggg < 2:182655/148‑1 (MQ=255)
tGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGGGGATg > 1:3365563/1‑148 (MQ=255)
tGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTGTGGGGATGCatga > 2:374314/1‑148 (MQ=255)
|
TGGGCTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCGTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGGGGATGCATGA > CP009273/253711‑253999
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
BRESEQ :: bam2aln output
GGTGGGCTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCGTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGGGGATGCATGATGCTT > CP009273/253709‑254004
|
GGTGGGCTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCT > SRR19973065.1980372/1‑150 (MQ=60)
GTGGGCTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTG > SRR19973065.3367150/1‑150 (MQ=60)
GGCTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCA < SRR19973065.339074/150‑1 (MQ=60)
TTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATAC > SRR19973065.1224133/1‑150 (MQ=60)
TTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCT > SRR19973065.1756680/1‑150 (MQ=60)
TTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCT > SRR19973065.3502518/1‑150 (MQ=60)
CTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTG > SRR19973065.184099/1‑150 (MQ=60)
CTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTG > SRR19973065.184097/1‑150 (MQ=60)
TCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAA < SRR19973065.3027550/150‑1 (MQ=60)
AAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCG < SRR19973065.1951179/150‑1 (MQ=60)
AAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCG < SRR19973065.1951298/150‑1 (MQ=60)
AAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCG > SRR19973065.2352335/1‑150 (MQ=60)
ATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCC > SRR19973065.1543316/1‑150 (MQ=60)
GCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCT < SRR19973065.2331369/150‑1 (MQ=60)
GCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCT < SRR19973065.2331340/150‑1 (MQ=60)
GCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCT < SRR19973065.2331319/150‑1 (MQ=60)
GCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCT < SRR19973065.557216/150‑1 (MQ=60)
TCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGA < SRR19973065.3416808/150‑1 (MQ=60)
CCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGC < SRR19973065.564143/150‑1 (MQ=60)
CAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCG < SRR19973065.3018785/150‑1 (MQ=60)
CAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCG > SRR19973065.2748983/1‑150 (MQ=60)
AGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGG > SRR19973065.2057599/1‑150 (MQ=60)
AGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGG > SRR19973065.2057554/1‑150 (MQ=60)
AGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGG > SRR19973065.3107380/1‑150 (MQ=60)
GGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGT > SRR19973065.2694753/1‑150 (MQ=60)
GGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGT > SRR19973065.1082754/1‑150 (MQ=60)
GGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGT > SRR19973065.1296852/1‑150 (MQ=60)
GACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTT < SRR19973065.643015/150‑1 (MQ=60)
GACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTT < SRR19973065.274395/150‑1 (MQ=60)
ACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTG < SRR19973065.1973200/150‑1 (MQ=60)
CAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTG > SRR19973065.1840775/1‑150 (MQ=60)
CAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTG > SRR19973065.2380007/1‑150 (MQ=60)
AGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTAGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGT > SRR19973065.3385598/1‑150 (MQ=60)
CTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTT < SRR19973065.1207751/150‑1 (MQ=60)
TGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTG < SRR19973065.2646512/150‑1 (MQ=60)
TGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTG < SRR19973065.2744645/150‑1 (MQ=60)
TGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTG < SRR19973065.2745643/150‑1 (MQ=60)
TGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTG > SRR19973065.2540997/1‑150 (MQ=60)
TGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTG > SRR19973065.771330/1‑150 (MQ=60)
GTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGG < SRR19973065.1000379/150‑1 (MQ=60)
GTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGG > SRR19973065.2124695/1‑150 (MQ=60)
GCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCC > SRR19973065.1857063/1‑150 (MQ=60)
TCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGT < SRR19973065.902177/150‑1 (MQ=60)
TCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGT < SRR19973065.157644/150‑1 (MQ=60)
CAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTA < SRR19973065.484191/150‑1 (MQ=60)
CAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCAGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTA > SRR19973065.2468046/1‑150 (MQ=60)
AGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAG > SRR19973065.1740720/1‑150 (MQ=60)
GTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCAT < SRR19973065.2480680/150‑1 (MQ=60)
TCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATA < SRR19973065.211730/150‑1 (MQ=60)
TTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACC < SRR19973065.367327/150‑1 (MQ=60)
TTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACC < SRR19973065.3082390/150‑1 (MQ=60)
TTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACC < SRR19973065.367360/150‑1 (MQ=60)
TAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCC < SRR19973065.2886958/150‑1 (MQ=60)
AGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGT > SRR19973065.484713/1‑150 (MQ=60)
GGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTT < SRR19973065.2508477/150‑1 (MQ=60)
GGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTT < SRR19973065.1481051/150‑1 (MQ=60)
GGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTT < SRR19973065.904024/150‑1 (MQ=60)
GGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTATGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTT < SRR19973065.1480925/150‑1 (MQ=60)
GCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTG < SRR19973065.1748494/150‑1 (MQ=60)
GCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTG < SRR19973065.3016085/150‑1 (MQ=60)
GCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTG < SRR19973065.1747926/150‑1 (MQ=60)
GCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTG < SRR19973065.1747932/150‑1 (MQ=60)
CGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGA < SRR19973065.1681422/150‑1 (MQ=60)
CGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCAGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGA < SRR19973065.2406333/150‑1 (MQ=60)
GCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAG < SRR19973065.1462666/150‑1 (MQ=60)
CTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGT < SRR19973065.1052861/150‑1 (MQ=60)
CTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGT < SRR19973065.1053275/150‑1 (MQ=60)
TAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTT > SRR19973065.1546347/1‑150 (MQ=60)
ACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTA < SRR19973065.1943479/150‑1 (MQ=60)
GTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCA < SRR19973065.3257783/150‑1 (MQ=60)
TGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAAC < SRR19973065.1684358/150‑1 (MQ=60)
TGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAAC < SRR19973065.1684388/150‑1 (MQ=60)
TGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAAC < SRR19973065.2384433/150‑1 (MQ=60)
TCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGT < SRR19973065.2113642/150‑1 (MQ=60)
CACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTG < SRR19973065.48056/150‑1 (MQ=60)
ACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCG < SRR19973065.797051/150‑1 (MQ=60)
ACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCG > SRR19973065.1734560/1‑150 (MQ=60)
CGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTTCTTCTTGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTTTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAA < SRR19973065.1493971/150‑1 (MQ=60)
CGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAA > SRR19973065.1701832/1‑150 (MQ=60)
CGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAAT > SRR19973065.894770/1‑150 (MQ=60)
CGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAAT > SRR19973065.1661367/1‑150 (MQ=60)
GTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATG < SRR19973065.1703823/150‑1 (MQ=60)
GCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTT < SRR19973065.1300089/150‑1 (MQ=60)
TTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGAC < SRR19973065.2880221/150‑1 (MQ=60)
TTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGAC > SRR19973065.2520422/1‑150 (MQ=60)
TTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGAC < SRR19973065.3389042/150‑1 (MQ=60)
TTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGGTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGAC < SRR19973065.3389056/150‑1 (MQ=60)
GGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTT < SRR19973065.1951753/150‑1 (MQ=60)
GGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTT < SRR19973065.1216648/150‑1 (MQ=60)
GGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTT < SRR19973065.985745/150‑1 (MQ=60)
GGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTT < SRR19973065.985637/150‑1 (MQ=60)
CGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCC < SRR19973065.1393812/150‑1 (MQ=60)
CGCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTT > SRR19973065.2543823/1‑150 (MQ=60)
GCTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTG > SRR19973065.1457/1‑150 (MQ=60)
CTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGG < SRR19973065.2049402/150‑1 (MQ=60)
CTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGG < SRR19973065.2049422/150‑1 (MQ=60)
CTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGG < SRR19973065.1079834/150‑1 (MQ=60)
CTAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGG < SRR19973065.2049446/150‑1 (MQ=60)
TAACGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGGG > SRR19973065.312269/1‑150 (MQ=60)
CGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGGGGAT < SRR19973065.1198827/150‑1 (MQ=60)
CGTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGGGGAT > SRR19973065.974965/1‑150 (MQ=60)
GTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGGGGATG > SRR19973065.3386142/1‑150 (MQ=60)
GTTGCCGTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGGGGATG > SRR19973065.1114492/1‑150 (MQ=60)
GTGCTTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGGGGATGCATGAT < SRR19973065.2907436/150‑1 (MQ=60)
TTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGGGGATGCATGATGCTT < SRR19973065.1143693/150‑1 (MQ=60)
|
GGTGGGCTTTTCTTCAAAATGGAAGCTCACCCAGGACTCCAGCCTGTTGCATCAGCACGTCTTAAAGGCGCTGCCTAACGTACCGTGGGTGGATCACACTCGCGTCGCGGCCTTTGGTTTCCGTTTCGGCGCTAACGTTGCCGTGCGTCTGGCATACCTTGAATCGCCGCGTCTGAAAGCGGTTGCCTGTCTTGGTCCGGTAGTTCATACCCTGTTGAGTGATTTTAAGTGCCAGCAACAGGTGCCGGAAATGTATCTTGACGTTCTGGCCAGTCGTTTGGGGATGCATGATGCTT > CP009273/253709‑254004
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 0 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |